Doublet Group distance statistics: 55344

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 5, 3, 1, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.011, 0.020, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.020 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.027 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.044 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.030, 0.051, 0.072, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.051 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N1	B	0, 0.278, 0.500, 0.721, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.500 std_dev=0.221
N3	B	0, 0.268, 0.490, 0.713, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.490 std_dev=0.222
C2	B	0, 0.264, 0.487, 0.709, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.487 std_dev=0.223
O4'	A	0, 0.502, 0.729, 0.956, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.729 std_dev=0.227
C6	B	0, 0.234, 0.469, 0.704, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.469 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.233, 0.469, 0.705, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.469 std_dev=0.236
C2'	A	0, 0.546, 0.788, 1.030, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.788 std_dev=0.242
O2	B	0, 0.287, 0.537, 0.786, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.537 std_dev=0.249
C5	B	0, 0.197, 0.448, 0.699, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.448 std_dev=0.251
C1'	B	0, 0.386, 0.641, 0.897, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.641 std_dev=0.255
N4	B	0, 0.246, 0.508, 0.771, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.508 std_dev=0.263
C4'	B	0, 0.585, 0.856, 1.127, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.856 std_dev=0.271
O4'	B	0, 0.428, 0.707, 0.987, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.707 std_dev=0.279
C3'	B	0, 0.492, 0.788, 1.084, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.788 std_dev=0.296
O5'	B	0, 0.359, 0.660, 0.961, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.660 std_dev=0.301
P	A	0, 0.586, 0.958, 1.331, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.958 std_dev=0.372
P	B	0, 0.663, 1.049, 1.435, 1.546 max_d=1.546 avg_d=1.049 std_dev=0.386
O3'	B	0, 0.374, 0.774, 1.175, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.774 std_dev=0.401
C4'	A	0, 0.802, 1.208, 1.615, 1.503 max_d=1.503 avg_d=1.208 std_dev=0.406
O5'	A	0, 0.710, 1.122, 1.533, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.122 std_dev=0.412
OP2	A	0, 0.443, 0.856, 1.269, 2.194 max_d=2.194 avg_d=0.856 std_dev=0.413
OP2	B	0, 0.858, 1.287, 1.715, 1.713 max_d=1.713 avg_d=1.287 std_dev=0.428
O2'	A	0, 1.041, 1.482, 1.924, 1.793 max_d=1.793 avg_d=1.482 std_dev=0.441
C5'	A	0, 0.946, 1.389, 1.833, 1.806 max_d=1.806 avg_d=1.389 std_dev=0.444
C3'	A	0, 0.934, 1.389, 1.845, 1.669 max_d=1.669 avg_d=1.389 std_dev=0.456
OP1	A	0, 0.798, 1.292, 1.785, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.292 std_dev=0.494
C2'	B	0, 0.584, 1.093, 1.602, 2.050 max_d=2.050 avg_d=1.093 std_dev=0.509
OP1	B	0, 0.675, 1.208, 1.740, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.208 std_dev=0.533
C5'	B	0, 0.740, 1.473, 2.206, 2.340 max_d=2.340 avg_d=1.473 std_dev=0.733
O3'	A	0, 1.498, 2.280, 3.063, 2.756 max_d=2.756 avg_d=2.280 std_dev=0.783
O2'	B	0, 0.910, 1.885, 2.860, 3.496 max_d=3.496 avg_d=1.885 std_dev=0.975

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.12	0.02	0.13	0.53	0.17
C2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.13	0.07	0.28	0.01	0.08	0.29	0.07
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.07	0.11	0.09	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.05	0.31	0.68	0.33
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.17	0.22	0.12	0.06	0.06	0.22	0.13	0.01	0.01	0.01	0.04	0.20	0.17	0.46	0.20
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.04	0.04	0.32	0.01	0.07	0.30	0.06
C4'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.13	0.04	0.08	0.05	0.12	0.06	0.15	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.43	0.14
C5	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.09	0.02	0.43	0.01	0.08	0.18	0.13
C5'	0.03	0.08	0.03	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.17	0.24	0.12	0.08	0.07	0.25	0.13	0.12	0.05	0.02	0.00	0.21	0.20	0.19	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.17	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.08	0.03	0.43	0.00	0.10	0.14	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.22	0.00	0.13	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.04	0.46	0.02	0.07	0.24	0.11
N1	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.06	0.36	0.01	0.08	0.20	0.10
N2	0.04	0.00	0.11	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.19	0.09	0.24	0.01	0.10	0.32	0.08
N3	0.03	0.00	0.09	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.14	0.07	0.24	0.01	0.09	0.35	0.08
N7	0.01	0.00	0.03	0.22	0.00	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.18	0.03	0.50	0.02	0.11	0.14	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.05	0.01	0.31	0.02	0.07	0.37	0.06
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.12	0.15	0.16	0.12	0.17	0.14	0.15	0.11	0.10	0.17	0.10	0.00	0.04	0.11	0.05	0.18	0.26	0.66	0.27
O3'	0.08	0.13	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.05	0.08	0.18	0.07	0.19	0.14	0.18	0.05	0.04	0.00	0.04	0.05	0.12	0.17	0.35	0.13
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.06	0.09	0.07	0.03	0.01	0.11	0.04	0.00	0.11	0.03	0.07	0.52	0.17
O5'	0.12	0.28	0.08	0.04	0.32	0.02	0.43	0.00	0.43	0.46	0.36	0.24	0.24	0.50	0.31	0.05	0.05	0.11	0.00	0.49	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.20	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.12	0.03	0.49	0.00	0.13	0.14	0.21
OP1	0.13	0.08	0.31	0.17	0.07	0.07	0.08	0.20	0.10	0.07	0.08	0.10	0.09	0.11	0.07	0.26	0.17	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.53	0.29	0.68	0.46	0.30	0.43	0.18	0.19	0.14	0.24	0.20	0.32	0.35	0.14	0.37	0.66	0.35	0.52	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.07	0.33	0.20	0.06	0.14	0.13	0.02	0.15	0.11	0.10	0.08	0.08	0.18	0.06	0.27	0.13	0.17	0.01	0.21	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.16	0.20	0.21	0.18	0.19	0.22	0.61	0.22	0.19	0.17	0.21	0.18	0.62	0.20	0.17	0.22	0.23	0.35	0.23
C2	0.16	0.13	0.16	0.23	0.12	0.20	0.13	0.60	0.13	0.13	0.12	0.15	0.18	0.59	0.19	0.12	0.19	0.22	0.41	0.23
C2'	0.19	0.17	0.19	0.18	0.21	0.19	0.26	0.57	0.24	0.20	0.18	0.23	0.17	0.55	0.18	0.20	0.23	0.21	0.31	0.21
C3'	0.25	0.19	0.27	0.20	0.28	0.31	0.38	0.69	0.35	0.26	0.20	0.32	0.16	0.61	0.17	0.31	0.37	0.42	0.51	0.44
C4	0.18	0.14	0.22	0.22	0.14	0.21	0.16	0.64	0.18	0.16	0.14	0.18	0.16	0.67	0.20	0.15	0.21	0.23	0.39	0.24
C4'	0.18	0.15	0.22	0.20	0.21	0.23	0.27	0.67	0.25	0.19	0.16	0.25	0.16	0.63	0.19	0.20	0.28	0.35	0.45	0.35
C5	0.19	0.13	0.30	0.21	0.13	0.23	0.12	0.69	0.15	0.14	0.13	0.20	0.16	0.75	0.23	0.16	0.21	0.25	0.41	0.26
C5'	0.24	0.18	0.29	0.22	0.26	0.34	0.34	0.78	0.33	0.24	0.19	0.30	0.15	0.69	0.20	0.30	0.40	0.51	0.61	0.52
C6	0.19	0.13	0.32	0.22	0.13	0.26	0.09	0.73	0.09	0.12	0.13	0.19	0.16	0.79	0.24	0.16	0.20	0.25	0.45	0.27
C8	0.19	0.14	0.31	0.22	0.15	0.21	0.17	0.65	0.19	0.17	0.15	0.21	0.16	0.73	0.25	0.17	0.22	0.25	0.36	0.25
N1	0.17	0.13	0.21	0.23	0.11	0.23	0.10	0.66	0.09	0.12	0.12	0.16	0.18	0.72	0.19	0.13	0.19	0.23	0.44	0.25
N2	0.15	0.13	0.20	0.26	0.13	0.19	0.13	0.54	0.12	0.12	0.13	0.16	0.18	0.46	0.22	0.12	0.18	0.20	0.41	0.22
N3	0.17	0.15	0.16	0.23	0.14	0.19	0.17	0.60	0.17	0.16	0.14	0.17	0.18	0.58	0.19	0.13	0.20	0.22	0.40	0.23
N7	0.19	0.13	0.35	0.22	0.14	0.23	0.13	0.69	0.16	0.15	0.14	0.22	0.15	0.78	0.27	0.18	0.22	0.27	0.39	0.27
N9	0.18	0.15	0.24	0.21	0.16	0.20	0.19	0.64	0.20	0.17	0.15	0.20	0.17	0.67	0.21	0.16	0.22	0.24	0.37	0.24
O2'	0.25	0.25	0.21	0.32	0.24	0.22	0.26	0.46	0.25	0.25	0.25	0.24	0.27	0.44	0.32	0.23	0.31	0.24	0.29	0.22
O3'	0.15	0.11	0.18	0.15	0.23	0.21	0.35	0.60	0.30	0.17	0.13	0.29	0.15	0.50	0.15	0.22	0.33	0.39	0.48	0.41
O4'	0.19	0.16	0.23	0.22	0.17	0.21	0.20	0.65	0.20	0.18	0.16	0.20	0.18	0.67	0.23	0.16	0.22	0.27	0.37	0.26
O5'	0.45	0.32	0.49	0.40	0.38	0.58	0.50	0.97	0.52	0.43	0.30	0.38	0.27	0.84	0.36	0.54	0.63	0.76	0.82	0.76
O6	0.20	0.13	0.41	0.22	0.16	0.31	0.13	0.79	0.07	0.12	0.14	0.21	0.16	0.84	0.30	0.20	0.21	0.28	0.48	0.30
OP1	0.12	0.15	0.28	0.23	0.18	0.29	0.13	0.71	0.13	0.11	0.20	0.27	0.17	0.72	0.28	0.19	0.25	0.42	0.40	0.37
OP2	0.12	0.29	0.28	0.26	0.33	0.32	0.18	0.75	0.12	0.16	0.37	0.46	0.33	0.71	0.34	0.18	0.27	0.52	0.52	0.46
P	0.17	0.11	0.30	0.22	0.16	0.35	0.18	0.79	0.19	0.13	0.16	0.25	0.13	0.75	0.25	0.26	0.35	0.53	0.55	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.29	0.00	0.18	0.15	0.26	0.16
C2	0.02	0.00	0.14	0.11	0.01	0.04	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.27	0.07	0.17	0.12	0.28	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.03	0.11	0.19	0.14	0.03	0.11	0.06	0.25	0.00	0.09	0.04	0.51	0.45	0.43	0.46
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.22	0.01	0.27	0.04	0.25	0.13	0.16	0.24	0.11	0.02	0.01	0.02	0.37	0.34	0.27	0.31
C4	0.02	0.01	0.05	0.22	0.00	0.14	0.00	0.43	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.18	0.03	0.25	0.22	0.35	0.21
C4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.14	0.00	0.20	0.01	0.19	0.09	0.08	0.15	0.05	0.20	0.06	0.00	0.02	0.16	0.23	0.04
C5	0.02	0.01	0.11	0.27	0.00	0.20	0.00	0.47	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.22	0.07	0.27	0.24	0.34	0.22
C5'	0.13	0.27	0.19	0.04	0.43	0.01	0.47	0.00	0.43	0.29	0.35	0.46	0.19	0.07	0.17	0.01	0.01	0.11	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.14	0.25	0.01	0.19	0.00	0.43	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.21	0.09	0.22	0.17	0.30	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.09	0.01	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.02	0.17	0.12	0.27	0.12
N3	0.02	0.00	0.11	0.16	0.00	0.08	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.22	0.06	0.20	0.16	0.32	0.16
N4	0.02	0.01	0.06	0.24	0.00	0.15	0.01	0.46	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.18	0.04	0.27	0.27	0.38	0.25
O2	0.03	0.00	0.25	0.11	0.01	0.05	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.33	0.39	0.11	0.16	0.12	0.27	0.12
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.24	0.20	0.28	0.07	0.26	0.14	0.22	0.26	0.33	0.00	0.15	0.12	0.50	0.49	0.53	0.49
O3'	0.29	0.27	0.09	0.01	0.18	0.06	0.22	0.17	0.21	0.20	0.22	0.18	0.39	0.15	0.00	0.19	0.26	0.40	0.34	0.28
O4'	0.00	0.07	0.04	0.02	0.03	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.06	0.04	0.11	0.12	0.19	0.00	0.13	0.15	0.30	0.16
O5'	0.18	0.17	0.51	0.37	0.25	0.02	0.27	0.01	0.22	0.17	0.20	0.27	0.16	0.50	0.26	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.12	0.45	0.34	0.22	0.16	0.24	0.11	0.17	0.12	0.16	0.27	0.12	0.49	0.40	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.28	0.43	0.27	0.35	0.23	0.34	0.37	0.30	0.27	0.32	0.38	0.27	0.53	0.34	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.13	0.46	0.31	0.21	0.04	0.22	0.02	0.15	0.12	0.16	0.25	0.12	0.49	0.28	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00