Doublet Group distance statistics: 55349

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.004, 0.007, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.008
O6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.076, 0.291, 0.506, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.291 std_dev=0.215
C4'	A	0, 0.079, 0.295, 0.511, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.295 std_dev=0.216
C2'	A	0, 0.087, 0.319, 0.552, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.319 std_dev=0.233
OP1	A	0, 0.073, 0.312, 0.551, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.312 std_dev=0.239
P	A	0, 0.113, 0.360, 0.608, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.360 std_dev=0.247
OP2	A	0, 0.066, 0.353, 0.640, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.353 std_dev=0.287
O4'	B	0, 0.143, 0.435, 0.728, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.435 std_dev=0.293
C3'	A	0, 0.135, 0.431, 0.727, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.431 std_dev=0.296
C1'	B	0, 0.042, 0.383, 0.724, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.383 std_dev=0.341
N1	B	0, 0.121, 0.484, 0.847, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.484 std_dev=0.363
O2'	A	0, 0.146, 0.521, 0.896, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.521 std_dev=0.375
C4'	B	0, 0.181, 0.563, 0.946, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.563 std_dev=0.382
O3'	A	0, 0.164, 0.557, 0.951, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.557 std_dev=0.393
O2'	B	0, 0.093, 0.502, 0.910, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.502 std_dev=0.408
C6	B	0, 0.177, 0.590, 1.004, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.590 std_dev=0.413
O5'	B	0, 0.176, 0.595, 1.015, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.595 std_dev=0.419
O5'	A	0, 0.104, 0.532, 0.960, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.532 std_dev=0.428
C2'	B	0, 0.119, 0.555, 0.990, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.555 std_dev=0.436
C2	B	0, 0.187, 0.639, 1.092, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.639 std_dev=0.453
C5'	A	0, 0.174, 0.636, 1.098, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.636 std_dev=0.462
C3'	B	0, 0.198, 0.664, 1.129, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.664 std_dev=0.466
C5	B	0, 0.215, 0.725, 1.235, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.725 std_dev=0.510
P	B	0, 0.201, 0.712, 1.223, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.712 std_dev=0.511
N3	B	0, 0.216, 0.734, 1.253, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.734 std_dev=0.519
C4	B	0, 0.218, 0.738, 1.258, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.738 std_dev=0.520
OP2	B	0, 0.201, 0.730, 1.258, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.730 std_dev=0.529
O3'	B	0, 0.239, 0.771, 1.303, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.771 std_dev=0.532
C5'	B	0, 0.214, 0.749, 1.284, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.749 std_dev=0.535
O2	B	0, 0.237, 0.783, 1.328, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.783 std_dev=0.545
OP1	B	0, 0.217, 0.819, 1.421, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.819 std_dev=0.602
N4	B	0, 0.261, 0.872, 1.482, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.872 std_dev=0.610

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.13
C2	0.01	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.08	0.07	0.11	0.00	0.03	0.08	0.04
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.08	0.08	0.16	0.13	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.16	0.12	0.07
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.07	0.10	0.18	0.13	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.21	0.16	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03	0.08	0.00	0.06	0.11	0.09
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.07	0.10
C5	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.02	0.09	0.00	0.05	0.10	0.08
C5'	0.02	0.10	0.04	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.09	0.04	0.10	0.12	0.08	0.06	0.04	0.03	0.05	0.01	0.00	0.09	0.04	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.10	0.00	0.04	0.08	0.05
C8	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.15	0.05	0.07	0.01	0.07	0.12	0.12
N1	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.05	0.11	0.00	0.03	0.07	0.04
N2	0.02	0.00	0.16	0.18	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.13	0.09	0.12	0.01	0.03	0.04	0.05
N3	0.01	0.00	0.13	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.07	0.07	0.09	0.00	0.04	0.11	0.07
N7	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.13	0.04	0.08	0.01	0.06	0.11	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.06	0.01	0.07	0.12	0.12
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.06	0.17	0.09	0.19	0.14	0.15	0.06	0.00	0.03	0.01	0.09	0.07	0.22	0.17	0.10
O3'	0.08	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.05	0.05	0.15	0.04	0.13	0.07	0.13	0.09	0.03	0.00	0.04	0.11	0.06	0.22	0.13	0.08
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.09	0.07	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.02	0.16	0.23	0.23
O5'	0.04	0.11	0.08	0.11	0.08	0.01	0.09	0.00	0.10	0.07	0.11	0.12	0.09	0.08	0.06	0.09	0.11	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.11	0.00	0.04	0.08	0.05
OP1	0.07	0.03	0.16	0.21	0.06	0.04	0.05	0.04	0.04	0.07	0.03	0.03	0.04	0.06	0.07	0.22	0.22	0.16	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.08	0.12	0.16	0.11	0.07	0.10	0.01	0.08	0.12	0.07	0.04	0.11	0.11	0.12	0.17	0.13	0.23	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.04	0.07	0.10	0.09	0.10	0.08	0.02	0.05	0.12	0.04	0.05	0.07	0.10	0.12	0.10	0.08	0.23	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.11	0.08	0.32	0.23	0.27	0.33	0.36	0.29	0.13	0.12	0.25	0.28	0.13	0.38	0.18	0.27	0.39	0.32	0.32
C2	0.16	0.32	0.22	0.13	0.15	0.23	0.15	0.37	0.17	0.17	0.32	0.13	0.42	0.24	0.11	0.21	0.31	0.42	0.38	0.38
C2'	0.09	0.16	0.10	0.14	0.14	0.12	0.23	0.23	0.16	0.05	0.11	0.18	0.33	0.26	0.20	0.04	0.11	0.23	0.19	0.17
C3'	0.13	0.15	0.12	0.10	0.14	0.08	0.19	0.16	0.14	0.09	0.11	0.18	0.29	0.29	0.16	0.06	0.04	0.18	0.12	0.10
C4	0.04	0.21	0.07	0.23	0.12	0.25	0.31	0.37	0.26	0.05	0.18	0.14	0.40	0.18	0.25	0.18	0.31	0.40	0.36	0.36
C4'	0.12	0.18	0.09	0.19	0.12	0.13	0.18	0.24	0.14	0.09	0.13	0.14	0.34	0.29	0.30	0.05	0.12	0.29	0.20	0.19
C5	0.05	0.22	0.08	0.21	0.10	0.23	0.33	0.34	0.25	0.03	0.20	0.14	0.40	0.17	0.22	0.16	0.31	0.39	0.37	0.36
C5'	0.33	0.34	0.34	0.07	0.14	0.09	0.07	0.08	0.10	0.25	0.26	0.11	0.47	0.53	0.08	0.20	0.07	0.18	0.07	0.05
C6	0.08	0.29	0.12	0.14	0.06	0.19	0.24	0.31	0.18	0.08	0.31	0.06	0.41	0.19	0.14	0.15	0.30	0.37	0.37	0.35
C8	0.09	0.09	0.10	0.30	0.26	0.26	0.39	0.35	0.31	0.12	0.07	0.31	0.32	0.15	0.32	0.18	0.31	0.39	0.35	0.35
N1	0.12	0.33	0.18	0.10	0.17	0.19	0.14	0.32	0.14	0.15	0.36	0.17	0.42	0.21	0.09	0.17	0.30	0.38	0.38	0.37
N2	0.24	0.34	0.30	0.18	0.21	0.25	0.12	0.39	0.17	0.24	0.33	0.20	0.41	0.29	0.13	0.26	0.31	0.44	0.38	0.40
N3	0.12	0.27	0.16	0.19	0.10	0.26	0.22	0.39	0.22	0.12	0.24	0.09	0.41	0.23	0.20	0.20	0.31	0.42	0.35	0.36
N7	0.09	0.15	0.09	0.25	0.22	0.24	0.37	0.33	0.29	0.10	0.09	0.27	0.36	0.16	0.27	0.17	0.31	0.38	0.36	0.35
N9	0.05	0.12	0.06	0.30	0.21	0.27	0.35	0.37	0.30	0.10	0.10	0.24	0.34	0.15	0.33	0.18	0.30	0.40	0.35	0.35
O2'	0.02	0.07	0.03	0.17	0.25	0.16	0.33	0.25	0.25	0.09	0.11	0.31	0.22	0.19	0.20	0.11	0.16	0.23	0.24	0.21
O3'	0.07	0.11	0.08	0.22	0.29	0.17	0.33	0.23	0.27	0.15	0.18	0.34	0.09	0.12	0.25	0.12	0.12	0.22	0.18	0.16
O4'	0.07	0.19	0.04	0.34	0.14	0.26	0.24	0.37	0.22	0.09	0.14	0.15	0.39	0.22	0.44	0.13	0.27	0.43	0.33	0.34
O5'	0.34	0.38	0.40	0.13	0.19	0.06	0.10	0.11	0.13	0.29	0.32	0.16	0.50	0.51	0.01	0.17	0.08	0.20	0.11	0.08
O6	0.09	0.28	0.12	0.12	0.11	0.17	0.20	0.27	0.15	0.09	0.33	0.11	0.40	0.18	0.13	0.13	0.29	0.34	0.35	0.33
OP1	0.04	0.10	0.12	0.01	0.04	0.15	0.08	0.28	0.08	0.04	0.09	0.05	0.17	0.17	0.02	0.09	0.08	0.26	0.14	0.16
OP2	0.01	0.10	0.12	0.04	0.05	0.25	0.12	0.41	0.13	0.03	0.10	0.06	0.16	0.13	0.01	0.19	0.18	0.33	0.21	0.25
P	0.09	0.13	0.17	0.02	0.05	0.11	0.07	0.23	0.06	0.07	0.11	0.05	0.20	0.21	0.00	0.04	0.06	0.20	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.03
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.12	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.13	0.09
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.07	0.04	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.14	0.06	0.12	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.04	0.05	0.13	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.05	0.05	0.10	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.11	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.05
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.09	0.04
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.03	0.05	0.14	0.08
N4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.04	0.07	0.14	0.09
O2	0.03	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.04	0.03	0.04	0.12	0.05
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.09	0.05
O3'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.06	0.03	0.07	0.09	0.05	0.02	0.00	0.03	0.18	0.10	0.14	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.10	0.12	0.06	0.07
O5'	0.03	0.03	0.09	0.14	0.04	0.02	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.18	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.11	0.04	0.03	0.05	0.07	0.04	0.04	0.10	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.12	0.13	0.12	0.13	0.02	0.10	0.02	0.07	0.09	0.14	0.14	0.12	0.09	0.14	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.09	0.11	0.08	0.01	0.07	0.02	0.05	0.04	0.08	0.09	0.05	0.05	0.14	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00