Doublet Group distance statistics: 55350

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.005, 0.022, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.006, 0.030, 0.054, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.030 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.031 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.003, 0.029, 0.055, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.003, 0.031, 0.059, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.034 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.008, 0.066, 0.124, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.066 std_dev=0.058
O4'	A	0, 0.011, 0.105, 0.199, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.105 std_dev=0.094
O3'	A	0, 0.059, 0.181, 0.302, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.181 std_dev=0.122
C2'	A	0, -0.001, 0.127, 0.255, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.127 std_dev=0.128
C3'	A	0, 0.039, 0.187, 0.335, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.187 std_dev=0.148
O2'	A	0, -0.018, 0.172, 0.362, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.172 std_dev=0.190
C4'	A	0, 0.018, 0.208, 0.398, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.208 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.146, 0.398, 0.649, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.398 std_dev=0.251
N3	B	0, 0.101, 0.359, 0.618, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.359 std_dev=0.258
C5	B	0, 0.130, 0.430, 0.729, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.430 std_dev=0.300
C5'	A	0, 0.045, 0.360, 0.675, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.360 std_dev=0.315
C2	B	0, 0.195, 0.527, 0.858, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.527 std_dev=0.331
C6	B	0, 0.098, 0.444, 0.791, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.444 std_dev=0.347
N4	B	0, 0.126, 0.510, 0.895, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.510 std_dev=0.385
N1	B	0, 0.180, 0.576, 0.973, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.576 std_dev=0.396
O2	B	0, 0.295, 0.713, 1.131, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.713 std_dev=0.418
O5'	A	0, 0.013, 0.484, 0.955, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.484 std_dev=0.471
C3'	B	0, 0.297, 0.796, 1.294, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.796 std_dev=0.498
C2'	B	0, 0.210, 0.710, 1.209, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.710 std_dev=0.500
C1'	B	0, 0.317, 0.881, 1.446, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.881 std_dev=0.564
P	A	0, 0.048, 0.620, 1.192, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.620 std_dev=0.572
OP2	A	0, 0.104, 0.677, 1.250, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.677 std_dev=0.573
OP1	A	0, 0.106, 0.742, 1.378, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.742 std_dev=0.636
C4'	B	0, 0.324, 1.067, 1.810, 2.101 max_d=2.101 avg_d=1.067 std_dev=0.743
O3'	B	0, 0.446, 1.195, 1.945, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.195 std_dev=0.749
O5'	B	0, 0.204, 1.012, 1.820, 2.260 max_d=2.260 avg_d=1.012 std_dev=0.808
O4'	B	0, 0.298, 1.177, 2.056, 2.442 max_d=2.442 avg_d=1.177 std_dev=0.879
C5'	B	0, 0.263, 1.170, 2.077, 2.546 max_d=2.546 avg_d=1.170 std_dev=0.907
OP2	B	0, 0.154, 1.100, 2.045, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.100 std_dev=0.946
P	B	0, 0.226, 1.184, 2.142, 2.673 max_d=2.673 avg_d=1.184 std_dev=0.958
OP1	B	0, 0.366, 1.354, 2.342, 2.792 max_d=2.792 avg_d=1.354 std_dev=0.988
O2'	B	0, 0.551, 1.754, 2.957, 3.163 max_d=3.163 avg_d=1.754 std_dev=1.203

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.06	0.11	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.02	0.08	0.26	0.15
C2	0.08	0.00	0.14	0.12	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.20	0.15	0.06	0.21	0.01	0.28	0.36	0.26
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.03	0.06	0.05	0.10	0.18	0.13	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.05	0.16	0.08
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.08	0.18	0.12	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.21	0.07	0.06
C4	0.03	0.02	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02	0.22	0.01	0.28	0.34	0.26
C4'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.04	0.13	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.09	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.02	0.23	0.00	0.36	0.35	0.30
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.09	0.14	0.05	0.08	0.05	0.15	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.12	0.17	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.21	0.00	0.37	0.34	0.29
C8	0.03	0.02	0.05	0.06	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.04	0.29	0.01	0.36	0.37	0.34
N1	0.06	0.00	0.10	0.08	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.16	0.11	0.04	0.20	0.01	0.33	0.35	0.27
N2	0.11	0.00	0.18	0.18	0.02	0.13	0.00	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.25	0.21	0.09	0.22	0.02	0.27	0.37	0.26
N3	0.08	0.01	0.13	0.12	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.18	0.13	0.06	0.21	0.01	0.25	0.35	0.25
N7	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.27	0.01	0.42	0.37	0.35
N9	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.23	0.00	0.25	0.34	0.26
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.10	0.04	0.16	0.25	0.18	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.12	0.09	0.08	0.16	0.07
O3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.05	0.11	0.21	0.13	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.28	0.04	0.11
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.09	0.06	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.12	0.03	0.06	0.24	0.12
O5'	0.16	0.21	0.13	0.03	0.22	0.01	0.23	0.01	0.21	0.29	0.20	0.22	0.21	0.27	0.23	0.12	0.03	0.12	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.03	0.03	0.20	0.00	0.41	0.33	0.30
OP1	0.08	0.28	0.05	0.21	0.28	0.16	0.36	0.17	0.37	0.36	0.33	0.27	0.25	0.42	0.25	0.08	0.28	0.06	0.02	0.41	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.36	0.16	0.07	0.34	0.09	0.35	0.03	0.34	0.37	0.35	0.37	0.35	0.37	0.34	0.16	0.04	0.24	0.02	0.33	0.00	0.00	0.01
P	0.15	0.26	0.08	0.06	0.26	0.03	0.30	0.01	0.29	0.34	0.27	0.26	0.25	0.35	0.26	0.07	0.11	0.12	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.30	0.27	0.20	0.23	0.22	0.17	0.08	0.12	0.17	0.29	0.26	0.83	0.21	0.23	0.17	0.11	0.14	0.14
C2	0.16	0.07	0.18	0.25	0.25	0.16	0.34	0.20	0.29	0.16	0.10	0.29	0.17	0.32	0.13	0.16	0.22	0.30	0.43	0.32
C2'	0.19	0.17	0.36	0.28	0.12	0.27	0.14	0.21	0.09	0.16	0.13	0.18	0.22	0.80	0.25	0.30	0.21	0.12	0.15	0.15
C3'	0.23	0.18	0.45	0.31	0.13	0.29	0.12	0.26	0.10	0.17	0.13	0.21	0.23	0.91	0.29	0.32	0.26	0.16	0.22	0.22
C4	0.13	0.15	0.13	0.22	0.17	0.11	0.28	0.08	0.20	0.05	0.13	0.23	0.28	0.63	0.12	0.06	0.10	0.18	0.25	0.18
C4'	0.30	0.22	0.52	0.34	0.14	0.31	0.12	0.29	0.08	0.20	0.16	0.25	0.30	1.05	0.34	0.30	0.28	0.19	0.27	0.25
C5	0.22	0.21	0.12	0.20	0.09	0.08	0.25	0.08	0.23	0.14	0.13	0.14	0.36	0.65	0.13	0.09	0.12	0.16	0.25	0.18
C5'	0.45	0.32	0.71	0.45	0.07	0.41	0.04	0.39	0.19	0.33	0.20	0.12	0.41	1.24	0.46	0.38	0.37	0.29	0.38	0.35
C6	0.27	0.18	0.18	0.21	0.14	0.14	0.28	0.19	0.31	0.22	0.08	0.14	0.35	0.36	0.16	0.24	0.22	0.23	0.36	0.28
C8	0.26	0.27	0.37	0.27	0.10	0.23	0.14	0.19	0.05	0.18	0.20	0.14	0.37	0.96	0.23	0.21	0.17	0.09	0.14	0.13
N1	0.22	0.11	0.24	0.24	0.21	0.18	0.33	0.24	0.32	0.22	0.05	0.21	0.22	0.26	0.16	0.25	0.26	0.29	0.44	0.34
N2	0.17	0.13	0.23	0.26	0.29	0.19	0.35	0.25	0.30	0.19	0.17	0.34	0.13	0.25	0.14	0.20	0.26	0.35	0.49	0.38
N3	0.10	0.10	0.11	0.24	0.25	0.13	0.32	0.12	0.23	0.08	0.14	0.32	0.21	0.48	0.11	0.09	0.15	0.25	0.34	0.25
N7	0.30	0.28	0.29	0.22	0.06	0.15	0.16	0.11	0.14	0.19	0.19	0.09	0.41	0.94	0.18	0.15	0.09	0.07	0.12	0.09
N9	0.17	0.21	0.26	0.25	0.16	0.18	0.22	0.13	0.10	0.11	0.18	0.23	0.31	0.81	0.18	0.17	0.12	0.11	0.15	0.11
O2'	0.14	0.13	0.24	0.27	0.14	0.24	0.18	0.14	0.13	0.14	0.11	0.19	0.14	0.60	0.19	0.31	0.15	0.14	0.14	0.11
O3'	0.17	0.16	0.36	0.29	0.21	0.27	0.19	0.23	0.12	0.14	0.17	0.32	0.19	0.81	0.26	0.31	0.23	0.16	0.19	0.19
O4'	0.24	0.21	0.41	0.29	0.18	0.26	0.18	0.23	0.04	0.15	0.18	0.28	0.30	0.99	0.28	0.24	0.22	0.13	0.20	0.19
O5'	0.45	0.24	0.71	0.29	0.17	0.23	0.27	0.19	0.29	0.31	0.12	0.24	0.31	1.34	0.30	0.18	0.16	0.19	0.16	0.15
O6	0.37	0.24	0.25	0.21	0.14	0.20	0.27	0.24	0.32	0.29	0.14	0.12	0.40	0.26	0.21	0.37	0.26	0.24	0.36	0.30
OP1	0.54	0.31	0.84	0.40	0.15	0.30	0.24	0.23	0.35	0.39	0.19	0.13	0.35	1.44	0.36	0.23	0.20	0.28	0.38	0.27
OP2	0.51	0.26	0.73	0.35	0.23	0.29	0.31	0.24	0.33	0.35	0.16	0.31	0.31	1.41	0.35	0.23	0.20	0.32	0.31	0.28
P	0.50	0.27	0.78	0.35	0.16	0.28	0.26	0.22	0.33	0.35	0.15	0.21	0.33	1.42	0.33	0.22	0.19	0.25	0.28	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.20	0.00	0.15	0.15	0.18	0.13
C2	0.01	0.00	0.13	0.07	0.01	0.11	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.15	0.16	0.29	0.32	0.44	0.35
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.03	0.01	0.14	0.19	0.18	0.02	0.08	0.03	0.25	0.00	0.01	0.01	0.37	0.44	0.44	0.41
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.03	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.05	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.05	0.01	0.27	0.39	0.50	0.38
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.03	0.11	0.05	0.15	0.17	0.02	0.00	0.01	0.09	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.14	0.12	0.00	0.02	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.03	0.11	0.19	0.31	0.38	0.27
C5'	0.09	0.29	0.19	0.01	0.26	0.00	0.17	0.00	0.12	0.18	0.31	0.27	0.31	0.04	0.19	0.00	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.00	0.00	0.18	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.04	0.15	0.16	0.22	0.27	0.19
N1	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01	0.21	0.23	0.31	0.23
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.11	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.11	0.12	0.31	0.39	0.52	0.42
N4	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.03	0.01	0.27	0.44	0.54	0.41
O2	0.02	0.00	0.25	0.06	0.01	0.15	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.39	0.22	0.26	0.29	0.31	0.43	0.36
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.18	0.17	0.34	0.04	0.35	0.11	0.11	0.20	0.39	0.00	0.03	0.10	0.33	0.45	0.54	0.40
O3'	0.20	0.15	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.19	0.04	0.11	0.11	0.03	0.22	0.03	0.00	0.16	0.14	0.20	0.12	0.14
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.12	0.01	0.26	0.10	0.16	0.00	0.06	0.10	0.15	0.12
O5'	0.15	0.29	0.37	0.02	0.27	0.01	0.19	0.01	0.16	0.21	0.31	0.27	0.29	0.33	0.14	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.32	0.44	0.14	0.39	0.09	0.31	0.09	0.22	0.23	0.39	0.44	0.31	0.45	0.20	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.44	0.44	0.03	0.50	0.03	0.38	0.03	0.27	0.31	0.52	0.54	0.43	0.54	0.12	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.35	0.41	0.06	0.38	0.01	0.27	0.01	0.19	0.23	0.42	0.41	0.36	0.40	0.14	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00