Doublet Group distance statistics: 55363

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 11, 8, 9, 3, 6, 2, 4, 0, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.012 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.001, 0.016, 0.032, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.013, 0.037, 0.060, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.037 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.013, 0.037, 0.060, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.015, 0.041, 0.068, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.041 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.003, 0.027, 0.057, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.027 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.019, 0.115, 0.210, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.115 std_dev=0.095
C2'	A	0, 0.020, 0.144, 0.267, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.144 std_dev=0.124
C4'	A	0, 0.041, 0.193, 0.345, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.193 std_dev=0.152
O2'	A	0, 0.033, 0.196, 0.358, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.196 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.044, 0.219, 0.394, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.219 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.137, 0.373, 0.610, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.373 std_dev=0.236
C4	B	0, 0.119, 0.367, 0.615, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.367 std_dev=0.248
O3'	A	0, 0.058, 0.308, 0.558, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.308 std_dev=0.250
C5	B	0, 0.075, 0.327, 0.579, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.327 std_dev=0.252
N1	B	0, 0.084, 0.341, 0.598, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.341 std_dev=0.257
N3	B	0, 0.150, 0.407, 0.665, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.407 std_dev=0.257
O5'	A	0, 0.069, 0.342, 0.616, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.342 std_dev=0.274
C5'	A	0, 0.055, 0.334, 0.614, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.334 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.023, 0.310, 0.596, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.310 std_dev=0.286
N7	B	0, 0.066, 0.394, 0.722, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.394 std_dev=0.328
N9	B	0, 0.105, 0.434, 0.762, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.434 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.077, 0.440, 0.803, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.440 std_dev=0.363
N6	B	0, -0.019, 0.381, 0.780, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.381 std_dev=0.400
C1'	B	0, 0.108, 0.517, 0.926, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.517 std_dev=0.409
P	A	0, 0.095, 0.514, 0.934, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.514 std_dev=0.420
OP2	A	0, 0.083, 0.572, 1.060, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.572 std_dev=0.488
OP1	A	0, 0.124, 0.646, 1.167, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.646 std_dev=0.522
C2'	B	0, 0.072, 0.660, 1.247, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.660 std_dev=0.588
O2'	B	0, 0.029, 0.637, 1.245, 2.769 max_d=2.769 avg_d=0.637 std_dev=0.608
O4'	B	0, 0.143, 0.755, 1.367, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.755 std_dev=0.612
C3'	B	0, 0.094, 0.786, 1.478, 2.356 max_d=2.356 avg_d=0.786 std_dev=0.692
O3'	B	0, 0.075, 0.768, 1.461, 2.588 max_d=2.588 avg_d=0.768 std_dev=0.693
C4'	B	0, 0.092, 0.885, 1.679, 2.607 max_d=2.607 avg_d=0.885 std_dev=0.793
C5'	B	0, 0.070, 1.114, 2.158, 3.517 max_d=3.517 avg_d=1.114 std_dev=1.044
O5'	B	0, -0.092, 1.871, 3.835, 4.997 max_d=4.997 avg_d=1.871 std_dev=1.964
OP2	B	0, -0.188, 2.198, 4.584, 6.624 max_d=6.624 avg_d=2.198 std_dev=2.386
P	B	0, -0.179, 2.213, 4.605, 6.070 max_d=6.070 avg_d=2.213 std_dev=2.392
OP1	B	0, -0.232, 2.484, 5.199, 6.504 max_d=6.504 avg_d=2.484 std_dev=2.716

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.05
C2	0.04	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.11	0.02	0.14	0.20	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.11	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.07	0.07	0.10	0.08	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.07	0.10	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.11	0.02	0.13	0.18	0.13
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.14	0.01	0.18	0.23	0.17
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.10	0.08	0.07	0.13	0.08	0.06	0.05	0.02	0.01	0.13	0.07	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.03	0.15	0.01	0.20	0.25	0.19
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.03	0.14	0.02	0.16	0.17	0.14
N1	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.04	0.13	0.02	0.17	0.23	0.17
N2	0.05	0.01	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.05	0.11	0.03	0.13	0.19	0.14
N3	0.04	0.01	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.04	0.10	0.02	0.12	0.17	0.12
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.16	0.02	0.21	0.23	0.19
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.02	0.11	0.13	0.10
O2'	0.02	0.11	0.01	0.03	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.03	0.08	0.13	0.10	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.04	0.05	0.09	0.06	0.04
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.06	0.03	0.06	0.05	0.07	0.08	0.08	0.13	0.10	0.08	0.04	0.05	0.00	0.02	0.06	0.08	0.15	0.10	0.08
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.07	0.07	0.07
O5'	0.04	0.11	0.03	0.04	0.11	0.01	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.11	0.10	0.16	0.10	0.04	0.06	0.05	0.00	0.16	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.07	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.08	0.04	0.16	0.00	0.24	0.28	0.21
OP1	0.05	0.14	0.08	0.10	0.13	0.06	0.18	0.07	0.20	0.16	0.17	0.13	0.12	0.21	0.11	0.09	0.15	0.07	0.03	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.20	0.06	0.07	0.18	0.03	0.23	0.02	0.25	0.17	0.23	0.19	0.17	0.23	0.13	0.06	0.10	0.07	0.02	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.14	0.04	0.05	0.13	0.02	0.17	0.01	0.19	0.14	0.17	0.14	0.12	0.19	0.10	0.04	0.08	0.07	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.33	0.27	0.32	0.24	0.46	0.21	0.71	0.25	0.22	0.31	0.30	0.24	0.21	0.21	0.47	0.21	0.37	1.71	2.58	1.92	2.18
C2	0.13	0.27	0.17	0.19	0.12	0.24	0.13	0.41	0.11	0.24	0.24	0.21	0.16	0.27	0.14	0.30	0.14	0.21	1.14	2.12	1.44	1.60
C2'	0.25	0.34	0.27	0.30	0.29	0.47	0.28	0.69	0.32	0.24	0.34	0.32	0.31	0.24	0.25	0.45	0.21	0.41	1.66	2.62	1.84	2.16
C3'	0.26	0.30	0.28	0.32	0.26	0.53	0.25	0.78	0.27	0.23	0.29	0.29	0.27	0.24	0.24	0.49	0.25	0.44	1.84	2.55	1.91	2.27
C4	0.16	0.30	0.21	0.25	0.15	0.32	0.10	0.52	0.13	0.23	0.26	0.26	0.15	0.24	0.14	0.35	0.13	0.25	1.36	2.25	1.56	1.78
C4'	0.26	0.29	0.29	0.37	0.24	0.56	0.22	0.85	0.24	0.23	0.27	0.28	0.24	0.22	0.22	0.51	0.30	0.44	1.93	2.56	2.14	2.36
C5	0.17	0.28	0.24	0.27	0.14	0.30	0.14	0.49	0.08	0.26	0.20	0.25	0.18	0.28	0.17	0.30	0.14	0.24	1.26	2.08	1.42	1.63
C5'	0.25	0.24	0.29	0.41	0.20	0.58	0.18	0.85	0.19	0.22	0.21	0.25	0.20	0.21	0.21	0.51	0.35	0.43	1.90	2.33	2.08	2.20
C6	0.16	0.25	0.23	0.24	0.14	0.25	0.19	0.42	0.15	0.27	0.15	0.21	0.29	0.31	0.18	0.25	0.15	0.21	1.10	1.95	1.30	1.48
C8	0.23	0.30	0.29	0.35	0.19	0.42	0.13	0.64	0.13	0.27	0.23	0.29	0.14	0.25	0.21	0.41	0.19	0.34	1.53	2.21	1.59	1.85
N1	0.14	0.25	0.19	0.21	0.13	0.23	0.18	0.39	0.14	0.26	0.18	0.20	0.27	0.31	0.16	0.25	0.15	0.20	1.07	1.99	1.33	1.49
N2	0.13	0.25	0.16	0.17	0.11	0.22	0.13	0.37	0.12	0.25	0.23	0.19	0.16	0.27	0.14	0.29	0.15	0.21	1.06	2.07	1.41	1.54
N3	0.13	0.29	0.19	0.21	0.13	0.28	0.10	0.47	0.15	0.21	0.27	0.23	0.16	0.22	0.13	0.35	0.13	0.23	1.29	2.26	1.56	1.75
N7	0.21	0.28	0.30	0.32	0.15	0.36	0.13	0.55	0.08	0.27	0.18	0.26	0.16	0.27	0.20	0.33	0.17	0.29	1.33	2.04	1.41	1.64
N9	0.20	0.31	0.25	0.30	0.20	0.40	0.15	0.63	0.18	0.23	0.27	0.29	0.17	0.22	0.18	0.42	0.17	0.32	1.55	2.38	1.70	1.96
O2'	0.27	0.35	0.27	0.30	0.30	0.49	0.31	0.71	0.36	0.26	0.37	0.33	0.38	0.28	0.26	0.45	0.23	0.43	1.64	2.71	1.98	2.22
O3'	0.26	0.30	0.27	0.28	0.28	0.55	0.30	0.80	0.31	0.27	0.31	0.29	0.33	0.29	0.26	0.46	0.26	0.46	1.80	2.60	1.96	2.38
O4'	0.24	0.31	0.30	0.36	0.23	0.50	0.19	0.78	0.22	0.21	0.27	0.30	0.22	0.21	0.21	0.53	0.27	0.39	1.85	2.57	2.07	2.29
O5'	0.25	0.22	0.30	0.42	0.18	0.55	0.16	0.79	0.15	0.23	0.18	0.23	0.17	0.21	0.20	0.51	0.33	0.41	1.78	2.13	1.81	1.97
O6	0.18	0.21	0.27	0.26	0.17	0.24	0.23	0.39	0.23	0.27	0.14	0.20	0.36	0.31	0.20	0.24	0.17	0.21	1.00	1.80	1.19	1.35
OP1	0.25	0.21	0.24	0.42	0.20	0.55	0.19	0.74	0.18	0.24	0.19	0.22	0.20	0.23	0.21	0.38	0.42	0.42	1.45	1.63	1.48	1.52
OP2	0.15	0.17	0.21	0.30	0.11	0.32	0.14	0.48	0.14	0.20	0.14	0.17	0.18	0.21	0.12	0.41	0.27	0.22	1.24	1.49	1.22	1.33
P	0.20	0.19	0.24	0.38	0.14	0.48	0.14	0.69	0.14	0.21	0.15	0.19	0.16	0.21	0.16	0.44	0.31	0.34	1.53	1.79	1.56	1.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.39	0.92	0.32	0.48
C2	0.04	0.00	0.15	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.35	0.10	0.49	1.15	0.61	0.71
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.04	0.10	0.07	0.09	0.12	0.15	0.06	0.07	0.03	0.00	0.05	0.03	0.64	0.93	0.50	0.63
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.10	0.05	0.07	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.38	0.56	0.32	0.33
C4	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.25	0.06	0.57	1.27	0.63	0.78
C4'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.13	0.05	0.09	0.07	0.12	0.04	0.08	0.04	0.01	0.02	0.38	0.10	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.20	0.04	0.69	1.53	0.81	0.97
C5'	0.05	0.09	0.10	0.02	0.13	0.01	0.21	0.00	0.20	0.26	0.14	0.07	0.24	0.28	0.15	0.06	0.09	0.01	0.01	0.34	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.23	0.05	0.68	1.51	0.86	0.99
C8	0.02	0.02	0.09	0.10	0.01	0.13	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.11	0.09	0.78	1.64	0.78	1.01
N1	0.03	0.00	0.12	0.05	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.30	0.08	0.59	1.34	0.75	0.86
N3	0.04	0.00	0.15	0.07	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.23	0.34	0.10	0.45	1.06	0.52	0.63
N6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.20	0.05	0.75	1.65	0.98	1.10
N7	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.12	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.13	0.07	0.80	1.74	0.92	1.11
N9	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.17	0.03	0.59	1.27	0.57	0.75
O2'	0.03	0.23	0.00	0.02	0.13	0.08	0.15	0.06	0.16	0.20	0.19	0.23	0.17	0.21	0.10	0.00	0.07	0.06	0.63	0.93	0.55	0.65
O3'	0.20	0.35	0.05	0.01	0.25	0.04	0.20	0.09	0.23	0.11	0.30	0.34	0.20	0.13	0.17	0.07	0.00	0.14	0.19	0.36	0.28	0.18
O4'	0.01	0.10	0.03	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.08	0.10	0.05	0.07	0.03	0.06	0.14	0.00	0.07	0.70	0.17	0.26
O5'	0.39	0.49	0.64	0.38	0.57	0.02	0.69	0.01	0.68	0.78	0.59	0.45	0.75	0.80	0.59	0.63	0.19	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.92	1.15	0.93	0.56	1.27	0.38	1.53	0.34	1.51	1.64	1.34	1.06	1.65	1.74	1.27	0.93	0.36	0.70	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.61	0.50	0.32	0.63	0.10	0.81	0.19	0.86	0.78	0.75	0.52	0.98	0.92	0.57	0.55	0.28	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.48	0.71	0.63	0.33	0.78	0.09	0.97	0.02	0.99	1.01	0.86	0.63	1.10	1.11	0.75	0.65	0.18	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00