Doublet Group distance statistics: 55370

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 3, 3, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.019, 0.030, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.030 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.022, 0.037, 0.051, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.037 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.024, 0.040, 0.056, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.040 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.020, 0.038, 0.055, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.038 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.028, 0.047, 0.067, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.047 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.015, 0.036, 0.057, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.036 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.010, 0.032, 0.055, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.032 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.030, 0.058, 0.086, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.058 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.045, 0.073, 0.101, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.073 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.042, 0.075, 0.107, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.075 std_dev=0.033
N2	A	0, 0.015, 0.049, 0.082, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.049 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.046, 0.116, 0.186, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.116 std_dev=0.070
C2'	A	0, 0.044, 0.142, 0.241, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.142 std_dev=0.098
C4'	A	0, 0.078, 0.196, 0.314, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.196 std_dev=0.118
C3'	A	0, 0.091, 0.223, 0.356, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.223 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.121, 0.256, 0.390, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.256 std_dev=0.134
N9	B	0, 0.223, 0.369, 0.515, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.369 std_dev=0.146
C1'	B	0, 0.293, 0.452, 0.610, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.452 std_dev=0.159
C4	B	0, 0.187, 0.351, 0.514, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.351 std_dev=0.164
C5	B	0, 0.157, 0.334, 0.511, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.334 std_dev=0.177
C6	B	0, 0.178, 0.355, 0.532, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.355 std_dev=0.177
C5'	A	0, 0.113, 0.296, 0.479, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.296 std_dev=0.183
N6	B	0, 0.213, 0.397, 0.581, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.397 std_dev=0.184
C3'	B	0, 0.229, 0.423, 0.617, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.423 std_dev=0.194
OP2	A	0, 0.316, 0.516, 0.717, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.516 std_dev=0.200
O3'	A	0, 0.199, 0.402, 0.605, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.402 std_dev=0.203
N1	B	0, 0.234, 0.446, 0.658, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.446 std_dev=0.212
N3	B	0, 0.232, 0.446, 0.659, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.446 std_dev=0.213
N7	B	0, 0.195, 0.410, 0.624, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.410 std_dev=0.214
O5'	A	0, 0.363, 0.586, 0.808, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.586 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.256, 0.488, 0.719, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.488 std_dev=0.231
C8	B	0, 0.185, 0.416, 0.648, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.416 std_dev=0.232
O4'	B	0, 0.462, 0.704, 0.947, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.704 std_dev=0.243
P	A	0, 0.289, 0.538, 0.787, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.538 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.425, 0.683, 0.941, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.683 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.331, 0.618, 0.904, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.618 std_dev=0.287
OP1	A	0, 0.361, 0.663, 0.965, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.663 std_dev=0.302
O3'	B	0, 0.421, 0.740, 1.059, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.740 std_dev=0.319
C5'	B	0, 0.522, 1.047, 1.572, 1.705 max_d=1.705 avg_d=1.047 std_dev=0.525
O2'	B	0, 0.584, 1.205, 1.826, 2.155 max_d=2.155 avg_d=1.205 std_dev=0.621
O5'	B	0, -0.044, 0.820, 1.684, 3.981 max_d=3.981 avg_d=0.820 std_dev=0.864
OP2	B	0, 0.055, 1.078, 2.101, 4.591 max_d=4.591 avg_d=1.078 std_dev=1.023
P	B	0, -0.327, 0.791, 1.909, 5.029 max_d=5.029 avg_d=0.791 std_dev=1.118
OP1	B	0, -0.464, 0.992, 2.448, 6.385 max_d=6.385 avg_d=0.992 std_dev=1.456

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.03	0.09	0.13	0.07
C2	0.06	0.00	0.14	0.12	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.15	0.05	0.08	0.02	0.11	0.15	0.08
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.05	0.12	0.16	0.14	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.17	0.16	0.10
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.09	0.09	0.13	0.11	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.07	0.20	0.17	0.12
C4	0.03	0.02	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.03	0.08	0.03	0.11	0.15	0.08
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.03	0.05	0.04	0.01	0.02	0.06	0.09	0.06	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.04	0.10	0.03	0.11	0.15	0.09
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.06	0.08	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.08	0.06	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.09	0.06	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.11	0.09	0.04	0.10	0.01	0.12	0.16	0.10
C8	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.05	0.10	0.05	0.10	0.14	0.09
N1	0.05	0.01	0.12	0.09	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.15	0.13	0.05	0.09	0.01	0.11	0.16	0.09
N2	0.06	0.01	0.16	0.13	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.20	0.19	0.05	0.08	0.03	0.11	0.15	0.08
N3	0.06	0.01	0.14	0.11	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.16	0.14	0.05	0.08	0.03	0.11	0.15	0.08
N7	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.11	0.05	0.12	0.15	0.10
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.08	0.04	0.10	0.14	0.08
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.05	0.11	0.04	0.15	0.20	0.16	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.05	0.11	0.16	0.14	0.07
O3'	0.04	0.15	0.04	0.02	0.07	0.04	0.06	0.04	0.09	0.09	0.13	0.19	0.14	0.08	0.04	0.06	0.00	0.04	0.11	0.09	0.28	0.22	0.17
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.04	0.04	0.00	0.07	0.06	0.07	0.10	0.08
O5'	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.02	0.10	0.01	0.10	0.10	0.09	0.08	0.08	0.11	0.08	0.05	0.11	0.07	0.00	0.12	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.02	0.09	0.07	0.03	0.06	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.11	0.09	0.06	0.12	0.00	0.15	0.18	0.13
OP1	0.09	0.11	0.17	0.20	0.11	0.09	0.11	0.06	0.12	0.10	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.16	0.28	0.07	0.02	0.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.15	0.16	0.17	0.15	0.06	0.15	0.02	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.15	0.14	0.14	0.22	0.10	0.03	0.18	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.10	0.12	0.08	0.03	0.09	0.01	0.10	0.09	0.09	0.08	0.08	0.10	0.08	0.07	0.17	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.29	0.26	0.18	0.17	0.35	0.18	0.60	0.24	0.19	0.29	0.24	0.27	0.19	0.13	0.52	0.15	0.31	0.94	1.54	1.01	1.19
C2	0.16	0.28	0.20	0.18	0.14	0.25	0.12	0.40	0.19	0.24	0.29	0.21	0.22	0.23	0.16	0.35	0.19	0.24	0.69	1.40	0.89	0.95
C2'	0.13	0.22	0.27	0.19	0.15	0.36	0.17	0.56	0.23	0.16	0.24	0.18	0.26	0.17	0.12	0.48	0.16	0.33	0.91	1.57	1.05	1.21
C3'	0.13	0.24	0.29	0.17	0.18	0.38	0.20	0.63	0.24	0.17	0.25	0.21	0.26	0.19	0.13	0.51	0.14	0.34	0.98	1.43	0.97	1.21
C4	0.14	0.31	0.20	0.17	0.15	0.27	0.11	0.48	0.21	0.21	0.31	0.25	0.23	0.20	0.12	0.42	0.18	0.23	0.79	1.44	0.86	1.01
C4'	0.16	0.28	0.29	0.19	0.19	0.41	0.18	0.70	0.23	0.17	0.27	0.25	0.25	0.18	0.14	0.56	0.15	0.35	1.01	1.38	0.98	1.19
C5	0.14	0.34	0.18	0.17	0.14	0.23	0.08	0.45	0.17	0.23	0.32	0.27	0.15	0.24	0.12	0.39	0.21	0.19	0.74	1.33	0.73	0.90
C5'	0.19	0.27	0.28	0.23	0.19	0.45	0.17	0.75	0.20	0.19	0.25	0.25	0.21	0.18	0.16	0.56	0.19	0.38	1.00	1.20	0.87	1.07
C6	0.16	0.33	0.18	0.18	0.13	0.21	0.11	0.39	0.13	0.26	0.31	0.25	0.10	0.28	0.15	0.32	0.22	0.19	0.67	1.28	0.70	0.83
C8	0.16	0.35	0.23	0.18	0.20	0.30	0.16	0.56	0.21	0.23	0.31	0.31	0.20	0.22	0.14	0.51	0.21	0.23	0.85	1.34	0.75	0.97
N1	0.17	0.29	0.19	0.18	0.14	0.23	0.13	0.38	0.16	0.26	0.29	0.22	0.15	0.27	0.17	0.31	0.21	0.21	0.65	1.32	0.78	0.87
N2	0.18	0.25	0.21	0.19	0.15	0.25	0.14	0.37	0.19	0.24	0.27	0.19	0.22	0.23	0.18	0.34	0.20	0.25	0.65	1.38	0.94	0.94
N3	0.15	0.28	0.21	0.18	0.14	0.27	0.11	0.45	0.22	0.21	0.30	0.22	0.26	0.19	0.13	0.40	0.18	0.25	0.76	1.46	0.94	1.03
N7	0.15	0.37	0.19	0.17	0.18	0.24	0.11	0.49	0.17	0.22	0.31	0.32	0.15	0.23	0.12	0.44	0.23	0.18	0.77	1.26	0.66	0.87
N9	0.14	0.32	0.23	0.17	0.17	0.31	0.15	0.55	0.23	0.21	0.30	0.27	0.24	0.20	0.12	0.49	0.17	0.26	0.87	1.46	0.88	1.07
O2'	0.14	0.21	0.28	0.20	0.15	0.36	0.18	0.53	0.24	0.16	0.25	0.17	0.28	0.18	0.12	0.48	0.17	0.34	0.88	1.57	1.19	1.24
O3'	0.11	0.18	0.27	0.18	0.15	0.41	0.19	0.60	0.22	0.17	0.21	0.15	0.26	0.21	0.12	0.45	0.17	0.38	0.95	1.36	1.05	1.25
O4'	0.16	0.31	0.29	0.20	0.19	0.38	0.17	0.67	0.23	0.18	0.30	0.27	0.25	0.18	0.14	0.58	0.18	0.32	1.00	1.46	0.98	1.20
O5'	0.21	0.26	0.26	0.26	0.18	0.46	0.16	0.76	0.18	0.22	0.23	0.25	0.19	0.21	0.17	0.55	0.22	0.38	0.94	1.14	0.74	0.95
O6	0.18	0.33	0.19	0.19	0.15	0.20	0.16	0.36	0.11	0.27	0.29	0.25	0.13	0.30	0.18	0.28	0.25	0.18	0.63	1.19	0.61	0.75
OP1	0.30	0.16	0.18	0.41	0.20	0.67	0.23	0.95	0.18	0.36	0.15	0.17	0.21	0.32	0.28	0.28	0.30	0.55	0.78	0.91	0.53	0.74
OP2	0.24	0.20	0.24	0.35	0.20	0.49	0.22	0.74	0.18	0.35	0.16	0.19	0.20	0.32	0.25	0.35	0.24	0.39	0.63	0.91	0.43	0.63
P	0.21	0.21	0.18	0.33	0.16	0.55	0.17	0.85	0.15	0.29	0.18	0.19	0.17	0.26	0.20	0.39	0.21	0.43	0.79	1.00	0.58	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.34	0.64	0.20	0.27
C2	0.06	0.00	0.14	0.09	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.20	0.19	0.11	0.41	0.75	0.25	0.33
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.11	0.14	0.07	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.60	0.54	0.46	0.38
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.07	0.09	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.39	0.35	0.47	0.23
C4	0.03	0.02	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.12	0.06	0.41	0.80	0.28	0.37
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.07	0.09	0.06	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.33	0.23	0.09
C5	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.11	0.04	0.42	0.90	0.39	0.45
C5'	0.03	0.05	0.05	0.03	0.07	0.01	0.13	0.00	0.12	0.16	0.08	0.05	0.16	0.18	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.18	0.42	0.03
C6	0.04	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.13	0.06	0.42	0.89	0.41	0.45
C8	0.01	0.03	0.08	0.06	0.01	0.08	0.02	0.16	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.00	0.00	0.13	0.08	0.05	0.42	0.96	0.39	0.49
N1	0.06	0.01	0.11	0.07	0.03	0.07	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.15	0.17	0.10	0.42	0.82	0.33	0.39
N3	0.06	0.01	0.14	0.09	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.20	0.17	0.10	0.41	0.72	0.22	0.31
N6	0.04	0.01	0.07	0.06	0.02	0.06	0.03	0.16	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.09	0.12	0.06	0.42	0.94	0.49	0.50
N7	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.08	0.00	0.18	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.11	0.08	0.03	0.42	0.99	0.47	0.52
N9	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.40	0.81	0.27	0.38
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.08	0.02	0.07	0.05	0.09	0.13	0.15	0.20	0.09	0.11	0.05	0.00	0.06	0.02	0.63	0.56	0.50	0.43
O3'	0.08	0.19	0.03	0.01	0.12	0.02	0.11	0.04	0.13	0.08	0.17	0.17	0.12	0.08	0.09	0.06	0.00	0.05	0.20	0.31	0.36	0.12
O4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.10	0.10	0.06	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.11	0.58	0.17	0.26
O5'	0.34	0.41	0.60	0.39	0.41	0.02	0.42	0.01	0.42	0.42	0.42	0.41	0.42	0.42	0.40	0.63	0.20	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.64	0.75	0.54	0.35	0.80	0.33	0.90	0.18	0.89	0.96	0.82	0.72	0.94	0.99	0.81	0.56	0.31	0.58	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.20	0.25	0.46	0.47	0.28	0.23	0.39	0.42	0.41	0.39	0.33	0.22	0.49	0.47	0.27	0.50	0.36	0.17	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.27	0.33	0.38	0.23	0.37	0.09	0.45	0.03	0.45	0.49	0.39	0.31	0.50	0.52	0.38	0.43	0.12	0.26	0.01	0.01	0.02	0.00