Doublet Group distance statistics: 55373

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 1, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.017, 0.027, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.027 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.023, 0.038, 0.053, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.038 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.017, 0.033, 0.048, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.021, 0.041, 0.061, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.041 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.042, 0.066, 0.091, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.066 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.022, 0.063, 0.104, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.063 std_dev=0.041
O2'	A	0, 0.094, 0.174, 0.254, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.174 std_dev=0.080
O4'	A	0, 0.040, 0.121, 0.203, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.121 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.041, 0.130, 0.220, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.130 std_dev=0.089
C3'	A	0, 0.082, 0.222, 0.363, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.222 std_dev=0.141
O5'	A	0, 0.117, 0.261, 0.404, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.261 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.071, 0.216, 0.361, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.216 std_dev=0.145
N6	B	0, 0.134, 0.283, 0.432, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.283 std_dev=0.149
C6	B	0, 0.077, 0.233, 0.389, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.233 std_dev=0.156
C5	B	0, 0.125, 0.292, 0.459, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.292 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.074, 0.250, 0.426, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.250 std_dev=0.176
O3'	A	0, 0.149, 0.325, 0.502, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.325 std_dev=0.177
N7	B	0, 0.160, 0.344, 0.527, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.344 std_dev=0.184
P	A	0, 0.107, 0.307, 0.507, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.307 std_dev=0.200
OP1	A	0, 0.130, 0.341, 0.552, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.341 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.134, 0.350, 0.567, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.350 std_dev=0.216
C5'	A	0, 0.137, 0.355, 0.573, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.355 std_dev=0.218
C2	B	0, 0.103, 0.325, 0.547, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.325 std_dev=0.222
C8	B	0, 0.158, 0.394, 0.630, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.394 std_dev=0.236
N3	B	0, 0.133, 0.383, 0.634, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.383 std_dev=0.251
N9	B	0, 0.147, 0.401, 0.656, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.401 std_dev=0.255
OP2	A	0, 0.139, 0.402, 0.664, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.402 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.150, 0.474, 0.798, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.474 std_dev=0.324
C2'	B	0, 0.131, 0.473, 0.815, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.473 std_dev=0.342
C3'	B	0, 0.141, 0.500, 0.859, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.500 std_dev=0.359
O4'	B	0, 0.194, 0.559, 0.923, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.559 std_dev=0.365
O3'	B	0, 0.190, 0.579, 0.969, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.579 std_dev=0.389
OP1	B	0, 0.210, 0.619, 1.029, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.619 std_dev=0.410
P	B	0, 0.209, 0.619, 1.029, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.619 std_dev=0.410
C4'	B	0, 0.166, 0.577, 0.987, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.577 std_dev=0.411
O2'	B	0, 0.124, 0.536, 0.949, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.536 std_dev=0.412
C5'	B	0, 0.203, 0.638, 1.072, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.638 std_dev=0.435
OP2	B	0, 0.200, 0.719, 1.238, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.719 std_dev=0.519
O5'	B	0, 0.207, 0.775, 1.343, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.775 std_dev=0.568

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.09	0.04
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.13	0.03	0.06	0.01	0.07	0.12	0.06
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.09	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.09	0.04
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.09	0.12	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.07	0.09	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.12	0.05
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02
C5	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.06	0.11	0.06
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.11	0.06
C8	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.11	0.05
N1	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.01	0.07	0.12	0.06
N2	0.05	0.00	0.12	0.12	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.04	0.07	0.02	0.08	0.13	0.07
N3	0.04	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.06	0.01	0.07	0.12	0.06
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.11	0.06
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.11	0.05
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.02	0.10	0.14	0.09	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.05	0.07	0.07	0.09	0.05
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.09	0.05	0.11	0.16	0.11	0.06	0.04	0.05	0.00	0.02	0.07	0.08	0.10	0.10	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.09	0.06
O5'	0.03	0.06	0.03	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.05	0.04	0.05	0.07	0.04	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02	0.06	0.00	0.07	0.11	0.07
OP1	0.03	0.07	0.06	0.07	0.05	0.02	0.06	0.03	0.07	0.05	0.07	0.08	0.07	0.06	0.04	0.07	0.10	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.12	0.09	0.09	0.12	0.06	0.11	0.03	0.11	0.11	0.12	0.13	0.12	0.11	0.11	0.09	0.10	0.09	0.03	0.11	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.02	0.06	0.01	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.05	0.08	0.06	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.14	0.09	0.07	0.08	0.05	0.05	0.10	0.07	0.06	0.13	0.12	0.07	0.07	0.06	0.13	0.07	0.06	0.16	0.14	0.24	0.13
C2	0.16	0.16	0.16	0.12	0.14	0.13	0.14	0.13	0.10	0.19	0.08	0.16	0.18	0.20	0.16	0.21	0.12	0.16	0.20	0.19	0.24	0.16
C2'	0.07	0.16	0.09	0.05	0.08	0.04	0.06	0.10	0.09	0.06	0.15	0.13	0.05	0.06	0.06	0.14	0.06	0.06	0.15	0.17	0.25	0.15
C3'	0.09	0.19	0.11	0.07	0.11	0.06	0.10	0.10	0.14	0.07	0.19	0.15	0.13	0.07	0.08	0.15	0.07	0.08	0.14	0.18	0.28	0.15
C4	0.09	0.16	0.11	0.08	0.10	0.07	0.07	0.10	0.07	0.09	0.13	0.14	0.12	0.11	0.08	0.15	0.08	0.08	0.17	0.14	0.23	0.12
C4'	0.08	0.17	0.10	0.07	0.10	0.06	0.08	0.11	0.11	0.06	0.16	0.14	0.09	0.06	0.07	0.13	0.08	0.07	0.16	0.18	0.26	0.14
C5	0.10	0.19	0.12	0.09	0.12	0.07	0.08	0.10	0.11	0.08	0.17	0.17	0.12	0.09	0.09	0.14	0.09	0.09	0.19	0.14	0.23	0.12
C5'	0.10	0.17	0.10	0.09	0.12	0.09	0.11	0.13	0.14	0.09	0.18	0.14	0.13	0.08	0.10	0.13	0.09	0.10	0.19	0.23	0.26	0.15
C6	0.14	0.21	0.15	0.11	0.15	0.10	0.09	0.11	0.09	0.14	0.17	0.20	0.11	0.15	0.13	0.18	0.10	0.13	0.22	0.19	0.24	0.15
C8	0.09	0.18	0.11	0.10	0.12	0.09	0.10	0.13	0.13	0.06	0.17	0.16	0.14	0.07	0.09	0.12	0.11	0.08	0.18	0.14	0.25	0.12
N1	0.17	0.19	0.17	0.13	0.15	0.13	0.12	0.13	0.06	0.19	0.12	0.19	0.14	0.20	0.16	0.21	0.12	0.16	0.23	0.22	0.25	0.17
N2	0.20	0.15	0.19	0.15	0.18	0.16	0.19	0.15	0.16	0.22	0.09	0.18	0.22	0.23	0.20	0.25	0.14	0.19	0.22	0.21	0.24	0.17
N3	0.13	0.15	0.13	0.09	0.11	0.09	0.11	0.11	0.08	0.14	0.10	0.14	0.17	0.16	0.12	0.18	0.09	0.12	0.18	0.16	0.23	0.14
N7	0.11	0.20	0.12	0.11	0.14	0.10	0.12	0.13	0.15	0.06	0.19	0.19	0.15	0.08	0.10	0.14	0.12	0.10	0.19	0.12	0.24	0.11
N9	0.07	0.16	0.09	0.07	0.09	0.06	0.06	0.11	0.09	0.06	0.14	0.14	0.10	0.07	0.06	0.12	0.08	0.06	0.17	0.13	0.24	0.12
O2'	0.09	0.17	0.11	0.08	0.10	0.07	0.08	0.10	0.10	0.08	0.15	0.14	0.08	0.09	0.08	0.16	0.09	0.09	0.15	0.17	0.25	0.15
O3'	0.09	0.21	0.11	0.07	0.12	0.07	0.11	0.11	0.17	0.07	0.22	0.16	0.17	0.08	0.08	0.15	0.07	0.08	0.14	0.18	0.29	0.17
O4'	0.07	0.15	0.09	0.08	0.09	0.06	0.06	0.11	0.08	0.05	0.14	0.13	0.07	0.05	0.07	0.12	0.09	0.07	0.17	0.15	0.25	0.12
O5'	0.12	0.18	0.12	0.11	0.14	0.12	0.13	0.15	0.16	0.11	0.19	0.16	0.16	0.11	0.12	0.13	0.11	0.12	0.20	0.25	0.27	0.17
O6	0.18	0.24	0.17	0.14	0.19	0.13	0.13	0.13	0.13	0.17	0.19	0.24	0.11	0.16	0.17	0.19	0.11	0.17	0.26	0.24	0.27	0.18
OP1	0.16	0.21	0.15	0.14	0.17	0.16	0.18	0.19	0.20	0.16	0.22	0.18	0.22	0.17	0.16	0.16	0.13	0.17	0.25	0.33	0.28	0.23
OP2	0.17	0.23	0.16	0.14	0.19	0.15	0.19	0.18	0.22	0.16	0.24	0.21	0.23	0.17	0.17	0.17	0.14	0.17	0.24	0.31	0.27	0.20
P	0.14	0.19	0.13	0.13	0.15	0.14	0.15	0.18	0.18	0.13	0.20	0.17	0.18	0.13	0.14	0.14	0.14	0.15	0.23	0.29	0.27	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.18	0.25	0.10
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.04	0.13	0.17	0.20	0.12
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.12	0.21	0.23	0.08
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.08	0.08	0.09	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.25	0.22	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.11	0.16	0.20	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.23	0.24	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.12	0.15	0.19	0.13
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.26	0.24	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.14	0.15	0.20	0.13
C8	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.11	0.13	0.20	0.12
N1	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.04	0.13	0.16	0.19	0.13
N3	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.11	0.18	0.21	0.12
N6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.15	0.16	0.22	0.14
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.13	0.14	0.20	0.13
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.09	0.15	0.22	0.11
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.08	0.09	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.21	0.24	0.06
O3'	0.02	0.12	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.09	0.11	0.11	0.09	0.09	0.04	0.03	0.00	0.02	0.21	0.27	0.21	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.11	0.19	0.27	0.11
O5'	0.06	0.13	0.12	0.19	0.11	0.01	0.12	0.00	0.14	0.11	0.13	0.11	0.15	0.13	0.09	0.06	0.21	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.17	0.21	0.25	0.16	0.23	0.15	0.26	0.15	0.13	0.16	0.18	0.16	0.14	0.15	0.21	0.27	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.20	0.23	0.22	0.20	0.24	0.19	0.24	0.20	0.20	0.19	0.21	0.22	0.20	0.22	0.24	0.21	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.08	0.08	0.12	0.04	0.13	0.01	0.13	0.12	0.13	0.12	0.14	0.13	0.11	0.06	0.09	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00