Doublet Group distance statistics: 55374

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 2, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.016, 0.029, 0.043, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.029, 0.057, 0.085, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.057 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.025, 0.058, 0.091, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.058 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.095, 0.163, 0.231, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.163 std_dev=0.068
C2'	A	0, 0.032, 0.100, 0.168, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.100 std_dev=0.068
O2'	A	0, 0.070, 0.172, 0.273, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.172 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.080, 0.185, 0.290, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.185 std_dev=0.105
C3'	A	0, 0.062, 0.173, 0.284, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.173 std_dev=0.111
C5'	A	0, 0.101, 0.259, 0.417, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.259 std_dev=0.158
O3'	A	0, 0.181, 0.370, 0.559, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.370 std_dev=0.189
O5'	A	0, 0.100, 0.341, 0.582, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.341 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.335, 0.591, 0.847, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.591 std_dev=0.256
N1	B	0, 0.314, 0.573, 0.832, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.573 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.304, 0.583, 0.862, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.583 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.296, 0.595, 0.894, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.595 std_dev=0.299
P	A	0, 0.292, 0.657, 1.022, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.657 std_dev=0.365
N6	B	0, 0.462, 0.850, 1.238, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.850 std_dev=0.388
N9	B	0, 0.269, 0.662, 1.056, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.662 std_dev=0.394
N7	B	0, 0.390, 0.796, 1.202, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.796 std_dev=0.406
C8	B	0, 0.323, 0.735, 1.148, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.735 std_dev=0.412
C2	B	0, 0.283, 0.702, 1.121, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.702 std_dev=0.419
O5'	B	0, 0.291, 0.717, 1.143, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.717 std_dev=0.426
N3	B	0, 0.340, 0.772, 1.204, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.772 std_dev=0.432
P	B	0, 0.463, 0.896, 1.329, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.896 std_dev=0.433
OP2	A	0, 0.411, 0.853, 1.295, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.853 std_dev=0.442
C5'	B	0, 0.285, 0.782, 1.279, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.782 std_dev=0.497
OP1	A	0, 0.444, 0.944, 1.445, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.944 std_dev=0.501
C2'	B	0, 0.350, 0.859, 1.368, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.859 std_dev=0.509
C1'	B	0, 0.406, 0.923, 1.439, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.923 std_dev=0.517
C3'	B	0, 0.471, 1.012, 1.554, 1.725 max_d=1.725 avg_d=1.012 std_dev=0.542
C4'	B	0, 0.449, 1.040, 1.630, 1.832 max_d=1.832 avg_d=1.040 std_dev=0.590
O4'	B	0, 0.575, 1.206, 1.837, 1.929 max_d=1.929 avg_d=1.206 std_dev=0.631
OP1	B	0, 0.994, 1.652, 2.309, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.652 std_dev=0.657
OP2	B	0, 0.971, 1.652, 2.333, 2.407 max_d=2.407 avg_d=1.652 std_dev=0.681
O3'	B	0, 0.733, 1.448, 2.163, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.448 std_dev=0.715
O2'	B	0, 0.442, 1.302, 2.162, 3.113 max_d=3.113 avg_d=1.302 std_dev=0.860

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.07	0.19	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.08	0.03	0.09	0.02	0.07	0.28	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.05	0.09	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.17	0.09	0.06
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.21	0.08	0.09
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.09	0.02	0.07	0.27	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.07	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.14	0.08	0.03
C5	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.12	0.02	0.13	0.31	0.16
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.04	0.04	0.13	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.13	0.13	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.06	0.04	0.13	0.01	0.15	0.32	0.17
C8	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.12	0.03	0.12	0.27	0.15
N1	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.06	0.04	0.11	0.01	0.11	0.31	0.15
N2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.14	0.11	0.03	0.08	0.03	0.06	0.28	0.13
N3	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.07	0.02	0.06	0.26	0.13
N7	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.05	0.14	0.03	0.17	0.32	0.18
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.07	0.03	0.05	0.24	0.12
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.09	0.14	0.10	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.06	0.19	0.09	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.11	0.08	0.08	0.03	0.04	0.00	0.02	0.12	0.07	0.31	0.15	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.07	0.05	0.09	0.22	0.13
O5'	0.04	0.09	0.05	0.08	0.09	0.01	0.12	0.01	0.13	0.12	0.11	0.08	0.07	0.14	0.07	0.06	0.12	0.07	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.07	0.05	0.15	0.00	0.19	0.33	0.19
OP1	0.07	0.07	0.17	0.21	0.07	0.14	0.13	0.13	0.15	0.12	0.11	0.06	0.06	0.17	0.05	0.19	0.31	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.28	0.09	0.08	0.27	0.08	0.31	0.03	0.32	0.27	0.31	0.28	0.26	0.32	0.24	0.09	0.15	0.22	0.02	0.33	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.06	0.09	0.13	0.03	0.16	0.01	0.17	0.15	0.15	0.13	0.13	0.18	0.12	0.06	0.15	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.27	0.31	0.16	0.18	0.10	0.21	0.07	0.23	0.24	0.25	0.24	0.27	0.31	0.13	0.65	0.18	0.15	0.09	0.29	0.05	0.07
C2	0.18	0.32	0.27	0.14	0.21	0.14	0.22	0.11	0.24	0.26	0.30	0.27	0.27	0.31	0.19	0.61	0.24	0.21	0.16	0.38	0.14	0.15
C2'	0.16	0.22	0.36	0.16	0.17	0.13	0.21	0.08	0.24	0.19	0.23	0.20	0.29	0.26	0.14	0.61	0.17	0.21	0.09	0.30	0.10	0.11
C3'	0.09	0.17	0.35	0.14	0.13	0.08	0.20	0.07	0.21	0.25	0.18	0.15	0.27	0.30	0.10	0.59	0.19	0.14	0.08	0.15	0.05	0.02
C4	0.14	0.32	0.27	0.14	0.18	0.10	0.18	0.07	0.21	0.22	0.28	0.28	0.23	0.30	0.13	0.65	0.20	0.14	0.12	0.35	0.07	0.10
C4'	0.08	0.20	0.31	0.19	0.14	0.12	0.21	0.12	0.20	0.29	0.19	0.17	0.25	0.33	0.13	0.63	0.30	0.14	0.09	0.11	0.18	0.05
C5	0.16	0.36	0.25	0.15	0.18	0.11	0.16	0.08	0.17	0.20	0.28	0.32	0.21	0.29	0.12	0.63	0.28	0.12	0.12	0.36	0.07	0.10
C5'	0.13	0.20	0.29	0.26	0.14	0.20	0.20	0.20	0.18	0.34	0.17	0.18	0.22	0.34	0.17	0.62	0.41	0.17	0.14	0.07	0.32	0.12
C6	0.17	0.38	0.24	0.16	0.18	0.13	0.16	0.09	0.17	0.20	0.30	0.32	0.25	0.27	0.14	0.59	0.33	0.14	0.13	0.37	0.09	0.12
C8	0.17	0.33	0.29	0.18	0.22	0.14	0.21	0.11	0.20	0.27	0.25	0.32	0.22	0.33	0.16	0.70	0.23	0.12	0.11	0.33	0.09	0.11
N1	0.18	0.35	0.25	0.15	0.20	0.14	0.21	0.09	0.23	0.24	0.31	0.29	0.28	0.30	0.18	0.59	0.30	0.18	0.14	0.38	0.12	0.13
N2	0.20	0.31	0.28	0.14	0.22	0.17	0.24	0.14	0.26	0.29	0.30	0.26	0.30	0.32	0.22	0.60	0.23	0.25	0.18	0.39	0.17	0.17
N3	0.16	0.30	0.28	0.13	0.19	0.12	0.20	0.10	0.23	0.24	0.29	0.26	0.26	0.29	0.17	0.63	0.18	0.19	0.15	0.36	0.12	0.14
N7	0.18	0.37	0.26	0.18	0.20	0.14	0.17	0.12	0.17	0.22	0.26	0.36	0.21	0.30	0.13	0.66	0.29	0.12	0.12	0.35	0.09	0.12
N9	0.13	0.30	0.29	0.15	0.19	0.09	0.20	0.06	0.21	0.24	0.26	0.27	0.23	0.32	0.12	0.67	0.18	0.12	0.10	0.33	0.05	0.09
O2'	0.19	0.24	0.37	0.16	0.19	0.17	0.23	0.12	0.28	0.17	0.27	0.21	0.35	0.24	0.16	0.59	0.17	0.26	0.10	0.28	0.20	0.16
O3'	0.12	0.14	0.39	0.13	0.12	0.08	0.20	0.04	0.22	0.18	0.18	0.13	0.30	0.27	0.08	0.55	0.19	0.14	0.04	0.01	0.01	0.01
O4'	0.09	0.24	0.28	0.21	0.17	0.13	0.22	0.12	0.21	0.30	0.22	0.22	0.25	0.34	0.14	0.65	0.28	0.13	0.11	0.20	0.12	0.02
O5'	0.16	0.20	0.31	0.23	0.14	0.16	0.19	0.14	0.17	0.33	0.16	0.19	0.21	0.32	0.17	0.66	0.34	0.14	0.13	0.19	0.28	0.13
O6	0.18	0.40	0.22	0.18	0.17	0.14	0.14	0.10	0.15	0.18	0.29	0.33	0.27	0.25	0.13	0.55	0.40	0.14	0.13	0.37	0.10	0.12
OP1	0.18	0.21	0.24	0.25	0.16	0.25	0.20	0.30	0.17	0.31	0.16	0.21	0.21	0.31	0.18	0.50	0.49	0.22	0.33	0.33	0.42	0.31
OP2	0.21	0.23	0.28	0.43	0.12	0.40	0.21	0.40	0.21	0.33	0.19	0.21	0.28	0.34	0.16	0.61	0.59	0.28	0.31	0.28	0.38	0.24
P	0.15	0.21	0.24	0.25	0.13	0.22	0.18	0.22	0.15	0.32	0.15	0.20	0.20	0.32	0.15	0.60	0.45	0.17	0.19	0.23	0.30	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.26	0.01	0.06	0.35	0.06	0.14
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.22	0.45	0.06	0.13	0.29	0.07	0.09
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.16	0.05	0.06	0.06	0.08	0.06	0.06	0.02	0.00	0.05	0.03	0.28	0.51	0.26	0.37
C3'	0.03	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.02	0.07	0.18	0.06	0.10	0.10	0.16	0.08	0.03	0.01	0.01	0.07	0.22	0.10	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.30	0.03	0.16	0.31	0.07	0.09
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.04	0.06	0.08	0.10	0.04	0.10	0.03	0.01	0.03	0.18	0.06	0.07
C5	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.21	0.03	0.25	0.30	0.13	0.13
C5'	0.03	0.05	0.16	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.14	0.17	0.10	0.04	0.18	0.19	0.09	0.09	0.15	0.03	0.01	0.10	0.08	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.26	0.27	0.04	0.25	0.28	0.15	0.15
C8	0.02	0.02	0.06	0.18	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.18	0.07	0.05	0.29	0.36	0.12	0.12
N1	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.25	0.37	0.05	0.20	0.28	0.11	0.12
N3	0.04	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.45	0.06	0.10	0.31	0.06	0.10
N6	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.28	0.22	0.05	0.30	0.28	0.20	0.21
N7	0.02	0.03	0.06	0.16	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.23	0.09	0.04	0.32	0.32	0.17	0.18
N9	0.00	0.02	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.19	0.01	0.17	0.35	0.06	0.09
O2'	0.01	0.22	0.00	0.03	0.19	0.10	0.24	0.09	0.26	0.18	0.25	0.19	0.28	0.23	0.14	0.00	0.05	0.07	0.30	0.54	0.29	0.41
O3'	0.26	0.45	0.05	0.01	0.30	0.03	0.21	0.15	0.27	0.07	0.37	0.45	0.22	0.09	0.19	0.05	0.00	0.18	0.12	0.18	0.31	0.13
O4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.04	0.01	0.07	0.18	0.00	0.12	0.29	0.15	0.16
O5'	0.06	0.13	0.28	0.07	0.16	0.03	0.25	0.01	0.25	0.29	0.20	0.10	0.30	0.32	0.17	0.30	0.12	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.35	0.29	0.51	0.22	0.31	0.18	0.30	0.10	0.28	0.36	0.28	0.31	0.28	0.32	0.35	0.54	0.18	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.07	0.26	0.10	0.07	0.06	0.13	0.08	0.15	0.12	0.11	0.06	0.20	0.17	0.06	0.29	0.31	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.09	0.37	0.09	0.09	0.07	0.13	0.01	0.15	0.12	0.12	0.10	0.21	0.18	0.09	0.41	0.13	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00