Doublet Group distance statistics: 55376

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, -0.002, 0.008, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.008 std_dev=0.010
C1'	A	0, -0.002, 0.011, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.011 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.003, 0.013, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.013 std_dev=0.016
N1	A	0, -0.005, 0.012, 0.030, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.012 std_dev=0.017
N3	A	0, -0.007, 0.013, 0.034, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.013 std_dev=0.021
N2	A	0, -0.003, 0.019, 0.041, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.019 std_dev=0.022
C4	A	0, -0.008, 0.019, 0.046, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.019 std_dev=0.027
O6	A	0, -0.005, 0.024, 0.053, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.024 std_dev=0.029
N9	A	0, -0.008, 0.022, 0.051, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.022 std_dev=0.029
N7	A	0, -0.005, 0.029, 0.063, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.029 std_dev=0.034
C8	A	0, -0.009, 0.038, 0.086, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.038 std_dev=0.048
O4'	A	0, -0.014, 0.140, 0.295, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.140 std_dev=0.155
C4'	A	0, 0.010, 0.210, 0.411, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.210 std_dev=0.200
C3'	A	0, 0.015, 0.241, 0.466, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.241 std_dev=0.225
C2'	A	0, -0.053, 0.180, 0.414, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.180 std_dev=0.233
O4'	B	0, 0.085, 0.322, 0.559, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.322 std_dev=0.237
N9	B	0, 0.015, 0.264, 0.513, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.264 std_dev=0.249
C8	B	0, 0.053, 0.313, 0.573, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.313 std_dev=0.260
C4	B	0, 0.007, 0.282, 0.556, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.282 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.026, 0.307, 0.588, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.307 std_dev=0.281
C5	B	0, 0.010, 0.295, 0.579, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.295 std_dev=0.285
N7	B	0, 0.052, 0.342, 0.633, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.342 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.039, 0.359, 0.678, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.359 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.023, 0.343, 0.664, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.343 std_dev=0.321
N3	B	0, 0.052, 0.378, 0.705, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.378 std_dev=0.326
N1	B	0, 0.076, 0.422, 0.769, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.422 std_dev=0.346
C4'	B	0, 0.045, 0.393, 0.741, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.393 std_dev=0.348
N6	B	0, 0.072, 0.428, 0.784, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.428 std_dev=0.356
C2	B	0, 0.081, 0.437, 0.794, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.437 std_dev=0.357
C5'	B	0, 0.048, 0.438, 0.827, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.438 std_dev=0.389
O3'	A	0, 0.011, 0.404, 0.797, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.404 std_dev=0.393
C3'	B	0, -0.038, 0.388, 0.815, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.388 std_dev=0.427
C2'	B	0, -0.093, 0.420, 0.932, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.420 std_dev=0.513
O2'	A	0, -0.209, 0.321, 0.851, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.321 std_dev=0.530
O3'	B	0, -0.105, 0.486, 1.077, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.486 std_dev=0.591
O2'	B	0, -0.142, 0.594, 1.330, 2.325 max_d=2.325 avg_d=0.594 std_dev=0.736
OP1	B	0, -0.017, 0.744, 1.504, 2.728 max_d=2.728 avg_d=0.744 std_dev=0.760
P	B	0, -0.126, 0.657, 1.439, 2.784 max_d=2.784 avg_d=0.657 std_dev=0.782
O5'	B	0, -0.233, 0.589, 1.411, 2.865 max_d=2.865 avg_d=0.589 std_dev=0.822
O5'	A	0, -0.362, 0.607, 1.576, 3.247 max_d=3.247 avg_d=0.607 std_dev=0.969
P	A	0, -0.441, 0.686, 1.814, 3.787 max_d=3.787 avg_d=0.686 std_dev=1.128
OP2	A	0, -0.413, 0.718, 1.849, 3.818 max_d=3.818 avg_d=0.718 std_dev=1.131
OP2	B	0, -0.441, 0.950, 2.342, 4.795 max_d=4.795 avg_d=0.950 std_dev=1.391
OP1	A	0, -0.746, 0.919, 2.584, 5.555 max_d=5.555 avg_d=0.919 std_dev=1.665

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.10	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.15	0.08	0.26	0.00	0.14	0.32	0.13
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.12	0.07	0.13	0.09	0.16	0.13	0.11	0.04	0.00	0.02	0.00	0.25	0.08	0.27	0.10	0.13
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.12	0.14	0.10	0.09	0.08	0.14	0.09	0.01	0.00	0.03	0.28	0.13	0.41	0.07	0.19
C4	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.07	0.04	0.36	0.01	0.14	0.34	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.07	0.04	0.19	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.19	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.06	0.02	0.48	0.01	0.25	0.50	0.29
C5'	0.05	0.11	0.12	0.01	0.13	0.00	0.17	0.00	0.17	0.18	0.14	0.09	0.10	0.19	0.12	0.07	0.12	0.01	0.01	0.19	0.26	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.07	0.03	0.47	0.00	0.23	0.53	0.28
C8	0.00	0.00	0.13	0.14	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.11	0.06	0.59	0.01	0.40	0.48	0.39
N1	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.11	0.06	0.36	0.00	0.16	0.43	0.19
N2	0.01	0.00	0.16	0.09	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.20	0.10	0.18	0.00	0.20	0.27	0.14
N3	0.01	0.00	0.13	0.08	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.15	0.08	0.23	0.01	0.10	0.25	0.10
N7	0.00	0.00	0.11	0.14	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.11	0.04	0.61	0.01	0.41	0.61	0.43
N9	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.00	0.39	0.01	0.20	0.29	0.19
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.13	0.19	0.22	0.07	0.23	0.24	0.17	0.16	0.12	0.27	0.13	0.00	0.04	0.12	0.22	0.26	0.27	0.09	0.17
O3'	0.12	0.15	0.02	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.07	0.11	0.11	0.20	0.15	0.11	0.04	0.04	0.00	0.09	0.17	0.08	0.45	0.15	0.19
O4'	0.00	0.08	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.10	0.08	0.04	0.00	0.12	0.09	0.00	0.08	0.03	0.07	0.23	0.16
O5'	0.20	0.26	0.25	0.28	0.36	0.02	0.48	0.01	0.47	0.59	0.36	0.18	0.23	0.61	0.39	0.22	0.17	0.08	0.00	0.52	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.08	0.03	0.52	0.00	0.30	0.63	0.35
OP1	0.10	0.14	0.27	0.41	0.14	0.14	0.25	0.26	0.23	0.40	0.16	0.20	0.10	0.41	0.20	0.27	0.45	0.07	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.32	0.10	0.07	0.34	0.19	0.50	0.29	0.53	0.48	0.43	0.27	0.25	0.61	0.29	0.09	0.15	0.23	0.01	0.63	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.13	0.13	0.19	0.17	0.05	0.29	0.01	0.28	0.39	0.19	0.14	0.10	0.43	0.19	0.17	0.19	0.16	0.00	0.35	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.25	0.27	0.38	0.18	0.24	0.23	0.29	0.29	0.20	0.31	0.17	0.33	0.23	0.16	0.21	0.25	0.14	0.49	0.29	0.81	0.46
C2	0.05	0.24	0.09	0.39	0.10	0.27	0.10	0.34	0.12	0.14	0.20	0.20	0.12	0.15	0.06	0.47	0.30	0.12	0.63	0.26	0.97	0.56
C2'	0.29	0.39	0.38	0.41	0.33	0.33	0.35	0.34	0.40	0.30	0.44	0.33	0.43	0.33	0.30	0.38	0.39	0.30	0.41	0.44	0.61	0.39
C3'	0.27	0.41	0.31	0.34	0.35	0.29	0.39	0.31	0.45	0.33	0.48	0.34	0.48	0.37	0.31	0.30	0.31	0.30	0.37	0.49	0.56	0.36
C4	0.10	0.14	0.16	0.38	0.11	0.25	0.16	0.31	0.16	0.18	0.16	0.10	0.19	0.20	0.12	0.34	0.25	0.14	0.55	0.30	0.90	0.51
C4'	0.17	0.33	0.29	0.36	0.24	0.23	0.28	0.27	0.35	0.21	0.39	0.25	0.39	0.25	0.20	0.20	0.24	0.18	0.42	0.32	0.71	0.40
C5	0.10	0.12	0.10	0.35	0.09	0.23	0.12	0.30	0.07	0.17	0.08	0.10	0.11	0.20	0.12	0.40	0.24	0.15	0.54	0.33	0.93	0.52
C5'	0.10	0.29	0.20	0.30	0.19	0.13	0.23	0.17	0.31	0.15	0.35	0.21	0.36	0.20	0.14	0.21	0.16	0.13	0.33	0.30	0.65	0.31
C6	0.09	0.19	0.07	0.33	0.09	0.23	0.07	0.31	0.12	0.13	0.19	0.15	0.14	0.14	0.08	0.49	0.25	0.13	0.58	0.32	1.01	0.55
C8	0.15	0.11	0.18	0.36	0.16	0.24	0.22	0.29	0.23	0.22	0.15	0.12	0.29	0.25	0.17	0.31	0.23	0.17	0.49	0.35	0.84	0.47
N1	0.07	0.21	0.07	0.35	0.10	0.25	0.09	0.33	0.14	0.12	0.19	0.18	0.15	0.15	0.04	0.54	0.28	0.11	0.64	0.28	1.03	0.58
N2	0.12	0.30	0.14	0.40	0.18	0.29	0.15	0.35	0.16	0.17	0.23	0.28	0.14	0.18	0.13	0.53	0.34	0.14	0.67	0.25	0.96	0.57
N3	0.07	0.24	0.18	0.39	0.11	0.26	0.14	0.32	0.16	0.16	0.22	0.17	0.16	0.17	0.10	0.34	0.28	0.13	0.58	0.27	0.90	0.52
N7	0.14	0.14	0.13	0.34	0.14	0.23	0.18	0.29	0.15	0.21	0.11	0.13	0.20	0.23	0.16	0.37	0.22	0.17	0.50	0.36	0.88	0.49
N9	0.12	0.15	0.21	0.37	0.15	0.24	0.21	0.30	0.24	0.20	0.22	0.11	0.28	0.23	0.15	0.28	0.24	0.15	0.51	0.31	0.85	0.48
O2'	0.26	0.53	0.41	0.40	0.39	0.29	0.46	0.31	0.56	0.34	0.62	0.40	0.61	0.41	0.32	0.30	0.38	0.26	0.42	0.32	0.66	0.41
O3'	0.27	0.44	0.31	0.30	0.36	0.27	0.40	0.27	0.46	0.33	0.49	0.36	0.49	0.37	0.31	0.25	0.28	0.30	0.30	0.46	0.46	0.31
O4'	0.09	0.25	0.26	0.39	0.16	0.23	0.22	0.28	0.29	0.17	0.32	0.16	0.34	0.21	0.13	0.18	0.24	0.11	0.51	0.23	0.86	0.48
O5'	0.42	0.66	0.16	0.12	0.57	0.27	0.66	0.27	0.78	0.54	0.79	0.56	0.88	0.63	0.51	0.47	0.15	0.48	0.17	0.66	0.30	0.21
O6	0.11	0.24	0.14	0.29	0.14	0.20	0.14	0.29	0.24	0.11	0.27	0.19	0.29	0.12	0.10	0.52	0.24	0.13	0.57	0.35	1.04	0.56
OP1	0.30	0.63	0.09	0.26	0.48	0.13	0.57	0.13	0.72	0.41	0.76	0.49	0.84	0.51	0.39	0.31	0.20	0.36	0.21	0.43	0.50	0.22
OP2	0.58	0.65	0.37	0.28	0.67	0.46	0.78	0.48	0.85	0.72	0.77	0.60	0.97	0.80	0.65	0.64	0.30	0.65	0.38	0.91	0.35	0.44
P	0.31	0.53	0.14	0.25	0.44	0.19	0.53	0.20	0.64	0.42	0.65	0.43	0.76	0.50	0.39	0.37	0.20	0.36	0.24	0.53	0.50	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.00	0.04	0.37	0.13	0.04
C2	0.01	0.00	0.14	0.11	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.22	0.05	0.13	0.37	0.37	0.12
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.11	0.06	0.06	0.11	0.14	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.46	0.09	0.12
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.20	0.02	0.20	0.24	0.15	0.09	0.23	0.26	0.14	0.01	0.01	0.01	0.23	0.08	0.29	0.11
C4	0.00	0.00	0.07	0.14	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.10	0.03	0.16	0.37	0.37	0.13
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.05	0.12	0.02	0.02	0.07	0.11	0.06	0.19	0.02	0.00	0.00	0.10	0.02	0.02
C5	0.00	0.00	0.04	0.20	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.02	0.02	0.23	0.37	0.49	0.21
C5'	0.02	0.03	0.11	0.02	0.06	0.00	0.11	0.00	0.10	0.14	0.06	0.02	0.13	0.15	0.07	0.07	0.10	0.01	0.01	0.05	0.03	0.03
C6	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.04	0.03	0.22	0.36	0.52	0.22
C8	0.01	0.01	0.06	0.24	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.13	0.02	0.26	0.38	0.45	0.20
N1	0.01	0.00	0.11	0.15	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.13	0.05	0.18	0.37	0.46	0.18
N3	0.01	0.00	0.14	0.09	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.24	0.05	0.10	0.37	0.31	0.09
N6	0.01	0.00	0.04	0.23	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.05	0.03	0.26	0.35	0.59	0.27
N7	0.00	0.00	0.04	0.26	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.13	0.01	0.28	0.36	0.56	0.26
N9	0.00	0.00	0.01	0.14	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.01	0.16	0.37	0.31	0.10
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.16	0.19	0.20	0.07	0.22	0.17	0.20	0.14	0.24	0.21	0.13	0.00	0.03	0.13	0.13	0.34	0.14	0.03
O3'	0.19	0.22	0.01	0.01	0.10	0.02	0.02	0.10	0.04	0.13	0.13	0.24	0.05	0.13	0.05	0.03	0.00	0.12	0.28	0.25	0.36	0.24
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.12	0.00	0.08	0.29	0.06	0.07
O5'	0.04	0.13	0.03	0.23	0.16	0.00	0.23	0.01	0.22	0.26	0.18	0.10	0.26	0.28	0.16	0.13	0.28	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.37	0.37	0.46	0.08	0.37	0.10	0.37	0.05	0.36	0.38	0.37	0.37	0.35	0.36	0.37	0.34	0.25	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.37	0.09	0.29	0.37	0.02	0.49	0.03	0.52	0.45	0.46	0.31	0.59	0.56	0.31	0.14	0.36	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.12	0.12	0.11	0.13	0.02	0.21	0.03	0.22	0.20	0.18	0.09	0.27	0.26	0.10	0.03	0.24	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00