Doublet Group distance statistics: 55378

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.006, 0.030, 0.055, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.030 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.005, 0.032, 0.058, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.032 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.008, 0.038, 0.069, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.038 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.016, 0.048, 0.080, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.048 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.014, 0.049, 0.083, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.049 std_dev=0.035
N2	A	0, 0.009, 0.048, 0.087, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.048 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.002, 0.049, 0.096, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.049 std_dev=0.047
C8	A	0, 0.003, 0.056, 0.109, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.056 std_dev=0.053
N1	B	0, 0.077, 0.368, 0.660, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.368 std_dev=0.292
C6	B	0, 0.099, 0.392, 0.685, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.392 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.168, 0.469, 0.771, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.469 std_dev=0.302
C2	B	0, 0.132, 0.444, 0.756, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.444 std_dev=0.312
C4	B	0, 0.205, 0.535, 0.865, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.535 std_dev=0.330
O4'	A	0, -0.092, 0.240, 0.571, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.240 std_dev=0.332
N6	B	0, 0.071, 0.413, 0.755, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.413 std_dev=0.342
N3	B	0, 0.195, 0.541, 0.887, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.541 std_dev=0.346
N7	B	0, 0.206, 0.554, 0.901, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.554 std_dev=0.347
C2'	A	0, -0.055, 0.295, 0.645, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.295 std_dev=0.350
N9	B	0, 0.250, 0.642, 1.034, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.642 std_dev=0.392
C8	B	0, 0.242, 0.636, 1.030, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.636 std_dev=0.394
O2'	A	0, 0.169, 0.575, 0.981, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.575 std_dev=0.406
C4'	A	0, -0.059, 0.452, 0.964, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.452 std_dev=0.512
C1'	B	0, 0.302, 0.816, 1.331, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.816 std_dev=0.515
P	A	0, 0.315, 0.835, 1.356, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.835 std_dev=0.520
C3'	A	0, -0.075, 0.465, 1.005, 1.816 max_d=1.816 avg_d=0.465 std_dev=0.540
OP2	A	0, 0.318, 0.859, 1.399, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.859 std_dev=0.541
O4'	B	0, 0.288, 0.898, 1.509, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.898 std_dev=0.610
C3'	B	0, 0.384, 1.002, 1.619, 1.870 max_d=1.870 avg_d=1.002 std_dev=0.618
C4'	B	0, 0.359, 0.979, 1.600, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.979 std_dev=0.621
OP1	A	0, 0.264, 0.905, 1.546, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.905 std_dev=0.641
C2'	B	0, 0.223, 0.891, 1.559, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.891 std_dev=0.668
O5'	B	0, 0.350, 1.030, 1.710, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.030 std_dev=0.680
C5'	B	0, 0.355, 1.067, 1.779, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.067 std_dev=0.712
O3'	A	0, -0.086, 0.652, 1.391, 2.472 max_d=2.472 avg_d=0.652 std_dev=0.738
O3'	B	0, 0.492, 1.243, 1.994, 2.197 max_d=2.197 avg_d=1.243 std_dev=0.751
O5'	A	0, 0.483, 1.253, 2.024, 2.175 max_d=2.175 avg_d=1.253 std_dev=0.770
P	B	0, 0.402, 1.189, 1.976, 2.191 max_d=2.191 avg_d=1.189 std_dev=0.787
OP2	B	0, 0.430, 1.266, 2.102, 2.344 max_d=2.344 avg_d=1.266 std_dev=0.836
C5'	A	0, -0.109, 0.727, 1.564, 2.810 max_d=2.810 avg_d=0.727 std_dev=0.836
O2'	B	0, 0.241, 1.106, 1.972, 2.467 max_d=2.467 avg_d=1.106 std_dev=0.865
OP1	B	0, 0.521, 1.495, 2.468, 2.708 max_d=2.708 avg_d=1.495 std_dev=0.973

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.06	0.09	0.06	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.22	0.04	0.27	0.30	0.18
C2	0.07	0.00	0.29	0.26	0.03	0.07	0.02	0.19	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.32	0.29	0.12	0.29	0.02	0.23	0.22	0.16
C2'	0.01	0.29	0.00	0.01	0.14	0.03	0.08	0.03	0.14	0.14	0.23	0.35	0.27	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.15	0.12	0.23	0.28	0.10
C3'	0.03	0.26	0.01	0.00	0.17	0.02	0.15	0.03	0.18	0.13	0.23	0.31	0.24	0.12	0.10	0.04	0.01	0.03	0.27	0.17	0.27	0.29	0.21
C4	0.03	0.03	0.14	0.17	0.00	0.05	0.01	0.18	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.15	0.16	0.06	0.34	0.02	0.25	0.21	0.17
C4'	0.01	0.07	0.03	0.02	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.10	0.06	0.09	0.06	0.11	0.05	0.16	0.04	0.00	0.03	0.08	0.23	0.28	0.06
C5	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.12	0.16	0.03	0.44	0.01	0.27	0.16	0.22
C5'	0.06	0.19	0.03	0.03	0.18	0.01	0.22	0.00	0.23	0.19	0.21	0.19	0.17	0.23	0.15	0.14	0.12	0.03	0.02	0.25	0.27	0.28	0.03
C6	0.04	0.02	0.14	0.18	0.02	0.07	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.18	0.21	0.04	0.44	0.01	0.27	0.15	0.23
C8	0.01	0.04	0.14	0.13	0.02	0.10	0.01	0.19	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.12	0.13	0.10	0.48	0.02	0.29	0.18	0.22
N1	0.06	0.01	0.23	0.23	0.03	0.06	0.02	0.21	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.27	0.27	0.09	0.37	0.01	0.25	0.18	0.19
N2	0.09	0.01	0.35	0.31	0.03	0.09	0.03	0.19	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.41	0.35	0.14	0.25	0.03	0.22	0.24	0.15
N3	0.06	0.01	0.27	0.24	0.02	0.06	0.02	0.17	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.30	0.24	0.12	0.26	0.02	0.23	0.25	0.16
N7	0.01	0.03	0.08	0.12	0.01	0.11	0.00	0.23	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.11	0.13	0.07	0.52	0.02	0.29	0.14	0.25
N9	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.05	0.02	0.15	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.34	0.03	0.27	0.23	0.18
O2'	0.03	0.32	0.01	0.04	0.15	0.16	0.12	0.14	0.18	0.12	0.27	0.41	0.30	0.11	0.05	0.00	0.05	0.11	0.12	0.17	0.32	0.22	0.14
O3'	0.03	0.29	0.02	0.01	0.16	0.04	0.16	0.12	0.21	0.13	0.27	0.35	0.24	0.13	0.08	0.05	0.00	0.03	0.33	0.21	0.32	0.29	0.26
O4'	0.01	0.12	0.02	0.03	0.06	0.00	0.03	0.03	0.04	0.10	0.09	0.14	0.12	0.07	0.01	0.11	0.03	0.00	0.33	0.02	0.38	0.44	0.32
O5'	0.22	0.29	0.15	0.27	0.34	0.03	0.44	0.02	0.44	0.48	0.37	0.25	0.26	0.52	0.34	0.12	0.33	0.33	0.00	0.50	0.02	0.02	0.02
O6	0.04	0.02	0.12	0.17	0.02	0.08	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.17	0.21	0.02	0.50	0.00	0.29	0.15	0.26
OP1	0.27	0.23	0.23	0.27	0.25	0.23	0.27	0.27	0.27	0.29	0.25	0.22	0.23	0.29	0.27	0.32	0.32	0.38	0.02	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.22	0.28	0.29	0.21	0.28	0.16	0.28	0.15	0.18	0.18	0.24	0.25	0.14	0.23	0.22	0.29	0.44	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.16	0.10	0.21	0.17	0.06	0.22	0.03	0.23	0.22	0.19	0.15	0.16	0.25	0.18	0.14	0.26	0.32	0.02	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.18	0.34	0.24	0.21	0.24	0.20	0.46	0.21	0.25	0.20	0.20	0.29	0.22	0.26	0.63	0.38	0.27	0.19	0.47	0.63	0.39
C2	0.13	0.09	0.14	0.10	0.09	0.09	0.08	0.28	0.09	0.11	0.07	0.10	0.16	0.12	0.11	0.29	0.36	0.16	0.24	0.29	0.56	0.31
C2'	0.32	0.24	0.36	0.29	0.27	0.33	0.25	0.55	0.20	0.30	0.22	0.26	0.14	0.27	0.30	0.60	0.38	0.32	0.31	0.57	0.76	0.51
C3'	0.47	0.37	0.53	0.35	0.42	0.25	0.40	0.28	0.33	0.46	0.34	0.40	0.25	0.43	0.46	0.79	0.45	0.40	0.09	0.36	0.49	0.25
C4	0.20	0.13	0.17	0.13	0.14	0.13	0.09	0.37	0.13	0.12	0.12	0.15	0.21	0.10	0.17	0.42	0.36	0.17	0.23	0.39	0.61	0.37
C4'	0.49	0.24	0.58	0.42	0.35	0.31	0.30	0.28	0.19	0.45	0.19	0.31	0.10	0.36	0.44	0.87	0.53	0.44	0.21	0.36	0.38	0.23
C5	0.19	0.14	0.13	0.10	0.12	0.11	0.09	0.38	0.12	0.09	0.10	0.17	0.19	0.13	0.13	0.37	0.35	0.14	0.31	0.44	0.63	0.42
C5'	0.60	0.30	0.71	0.56	0.41	0.44	0.34	0.32	0.23	0.53	0.24	0.38	0.11	0.42	0.52	0.99	0.64	0.55	0.41	0.42	0.36	0.35
C6	0.16	0.16	0.18	0.12	0.13	0.10	0.14	0.33	0.14	0.16	0.13	0.17	0.18	0.18	0.13	0.27	0.34	0.17	0.37	0.42	0.61	0.43
C8	0.30	0.16	0.32	0.22	0.18	0.25	0.14	0.51	0.15	0.16	0.14	0.20	0.24	0.15	0.23	0.67	0.40	0.26	0.29	0.55	0.68	0.47
N1	0.15	0.13	0.19	0.13	0.11	0.11	0.12	0.29	0.14	0.14	0.12	0.13	0.18	0.15	0.12	0.30	0.36	0.19	0.33	0.35	0.58	0.37
N2	0.13	0.09	0.16	0.12	0.10	0.11	0.12	0.25	0.12	0.13	0.08	0.10	0.18	0.14	0.12	0.30	0.38	0.18	0.23	0.25	0.53	0.27
N3	0.16	0.13	0.15	0.11	0.12	0.10	0.10	0.31	0.12	0.13	0.13	0.13	0.18	0.12	0.15	0.36	0.35	0.16	0.19	0.32	0.58	0.31
N7	0.26	0.16	0.22	0.17	0.15	0.20	0.11	0.48	0.13	0.12	0.11	0.19	0.22	0.16	0.18	0.57	0.39	0.20	0.34	0.53	0.67	0.48
N9	0.27	0.16	0.28	0.20	0.19	0.20	0.15	0.43	0.16	0.18	0.15	0.19	0.25	0.15	0.23	0.58	0.38	0.23	0.22	0.46	0.64	0.40
O2'	0.36	0.30	0.38	0.38	0.33	0.49	0.34	0.71	0.32	0.38	0.30	0.31	0.33	0.38	0.35	0.56	0.42	0.44	0.52	0.71	0.85	0.67
O3'	0.51	0.43	0.58	0.41	0.47	0.28	0.46	0.22	0.41	0.50	0.41	0.46	0.35	0.48	0.50	0.81	0.48	0.45	0.20	0.31	0.40	0.22
O4'	0.41	0.19	0.49	0.36	0.25	0.25	0.20	0.29	0.19	0.34	0.20	0.23	0.26	0.24	0.35	0.79	0.51	0.35	0.21	0.44	0.50	0.32
O5'	0.49	0.31	0.57	0.45	0.36	0.40	0.31	0.53	0.25	0.41	0.27	0.36	0.21	0.33	0.43	0.85	0.54	0.41	0.40	0.52	0.49	0.43
O6	0.25	0.22	0.31	0.19	0.20	0.16	0.20	0.34	0.18	0.25	0.18	0.23	0.20	0.24	0.22	0.37	0.35	0.25	0.45	0.48	0.62	0.48
OP1	0.44	0.26	0.56	0.41	0.31	0.28	0.27	0.36	0.25	0.36	0.25	0.29	0.24	0.30	0.37	0.88	0.53	0.35	0.23	0.37	0.19	0.17
OP2	0.45	0.27	0.54	0.40	0.32	0.33	0.28	0.47	0.24	0.35	0.25	0.31	0.23	0.28	0.37	0.89	0.53	0.39	0.18	0.48	0.22	0.21
P	0.41	0.17	0.51	0.36	0.24	0.27	0.18	0.43	0.12	0.30	0.13	0.23	0.09	0.21	0.32	0.84	0.49	0.33	0.19	0.43	0.26	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.22	0.01	0.14	0.17	0.21	0.14
C2	0.04	0.00	0.08	0.03	0.02	0.17	0.02	0.28	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.23	0.32	0.21	0.22	0.22	0.33	0.18
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.11	0.04	0.11	0.05	0.09	0.05	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.33	0.29	0.27	0.29
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.09	0.15	0.05	0.03	0.11	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.30	0.36	0.30	0.31
C4	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.21	0.10	0.22	0.21	0.35	0.20
C4'	0.01	0.17	0.03	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.14	0.19	0.16	0.15	0.15	0.17	0.10	0.03	0.04	0.01	0.02	0.11	0.13	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.13	0.00	0.33	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.17	0.13	0.05	0.26	0.24	0.43	0.25
C5'	0.09	0.28	0.11	0.02	0.26	0.01	0.33	0.00	0.34	0.39	0.32	0.23	0.38	0.40	0.25	0.09	0.06	0.03	0.01	0.11	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.14	0.01	0.34	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.09	0.27	0.24	0.45	0.25
C8	0.03	0.03	0.11	0.15	0.01	0.19	0.02	0.39	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.24	0.08	0.11	0.30	0.31	0.43	0.30
N1	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.16	0.03	0.32	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.20	0.25	0.17	0.24	0.22	0.38	0.20
N3	0.04	0.01	0.09	0.03	0.01	0.15	0.01	0.23	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.23	0.32	0.20	0.20	0.21	0.31	0.17
N6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02	0.15	0.02	0.38	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.19	0.12	0.05	0.29	0.28	0.53	0.31
N7	0.03	0.02	0.09	0.15	0.01	0.17	0.01	0.40	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.23	0.07	0.07	0.31	0.30	0.49	0.32
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.02	0.25	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.14	0.03	0.22	0.23	0.33	0.21
O2'	0.01	0.23	0.01	0.02	0.15	0.03	0.17	0.09	0.18	0.24	0.20	0.23	0.19	0.23	0.12	0.00	0.07	0.07	0.35	0.33	0.36	0.34
O3'	0.22	0.32	0.07	0.01	0.21	0.04	0.13	0.06	0.16	0.08	0.25	0.32	0.12	0.07	0.14	0.07	0.00	0.13	0.24	0.51	0.40	0.37
O4'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.10	0.01	0.05	0.03	0.09	0.11	0.17	0.20	0.05	0.07	0.03	0.07	0.13	0.00	0.16	0.09	0.28	0.18
O5'	0.14	0.22	0.33	0.30	0.22	0.02	0.26	0.01	0.27	0.30	0.24	0.20	0.29	0.31	0.22	0.35	0.24	0.16	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.17	0.22	0.29	0.36	0.21	0.11	0.24	0.11	0.24	0.31	0.22	0.21	0.28	0.30	0.23	0.33	0.51	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.33	0.27	0.30	0.35	0.13	0.43	0.24	0.45	0.43	0.38	0.31	0.53	0.49	0.33	0.36	0.40	0.28	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.14	0.18	0.29	0.31	0.20	0.03	0.25	0.02	0.25	0.30	0.20	0.17	0.31	0.32	0.21	0.34	0.37	0.18	0.01	0.01	0.02	0.00