Doublet Group distance statistics: 55382

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.021, 0.044, 0.067, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.044 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.017, 0.043, 0.069, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.043 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.016, 0.045, 0.075, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.045 std_dev=0.029
N2	A	0, -0.001, 0.029, 0.059, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.029 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.043, 0.105, 0.167, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.105 std_dev=0.062
C2'	A	0, 0.005, 0.074, 0.144, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.074 std_dev=0.070
O2'	A	0, 0.010, 0.097, 0.185, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.097 std_dev=0.088
N9	B	0, 0.056, 0.154, 0.252, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.154 std_dev=0.098
C4	B	0, 0.082, 0.182, 0.282, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.182 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.021, 0.122, 0.223, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.122 std_dev=0.101
C3'	A	0, 0.003, 0.120, 0.237, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.120 std_dev=0.117
C1'	B	0, 0.075, 0.199, 0.323, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.199 std_dev=0.124
C5	B	0, 0.072, 0.199, 0.325, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.199 std_dev=0.127
P	B	0, 0.061, 0.190, 0.318, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.190 std_dev=0.128
C2'	B	0, 0.097, 0.249, 0.401, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.249 std_dev=0.152
O4'	B	0, 0.063, 0.217, 0.372, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.217 std_dev=0.155
O5'	B	0, 0.078, 0.235, 0.393, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.235 std_dev=0.157
OP1	B	0, 0.112, 0.270, 0.428, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.270 std_dev=0.158
P	A	0, 0.019, 0.178, 0.337, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.178 std_dev=0.159
OP1	A	0, 0.062, 0.222, 0.381, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.222 std_dev=0.160
C8	B	0, 0.067, 0.232, 0.397, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.232 std_dev=0.165
C5'	A	0, 0.023, 0.190, 0.356, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.190 std_dev=0.167
N7	B	0, 0.066, 0.236, 0.407, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.236 std_dev=0.170
C5'	B	0, 0.070, 0.249, 0.427, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.249 std_dev=0.178
C4'	B	0, 0.025, 0.203, 0.382, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.203 std_dev=0.179
O3'	A	0, -0.001, 0.180, 0.361, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.180 std_dev=0.181
N3	B	0, 0.066, 0.256, 0.447, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.256 std_dev=0.190
O5'	A	0, 0.010, 0.205, 0.400, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.205 std_dev=0.195
C6	B	0, 0.055, 0.259, 0.463, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.259 std_dev=0.204
C3'	B	0, 0.038, 0.243, 0.447, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.243 std_dev=0.204
O2'	B	0, 0.121, 0.348, 0.575, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.348 std_dev=0.227
OP2	B	0, 0.058, 0.303, 0.549, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.303 std_dev=0.246
N6	B	0, 0.031, 0.279, 0.527, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.279 std_dev=0.248
OP2	A	0, 0.015, 0.265, 0.515, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.265 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.078, 0.336, 0.593, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.336 std_dev=0.258
N1	B	0, 0.081, 0.340, 0.599, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.340 std_dev=0.259
O3'	B	0, 0.015, 0.366, 0.717, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.366 std_dev=0.351

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.08	0.11	0.03
C2	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.06	0.14	0.02	0.09	0.20	0.10
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.03	0.08	0.09	0.05
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.04	0.11	0.07	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.07	0.18	0.08
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.09	0.01	0.04	0.21	0.08
C5'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.05	0.10	0.15	0.11	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.07	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.11	0.01	0.05	0.23	0.10
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.04	0.18	0.05
N1	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.12	0.02	0.05	0.22	0.10
N2	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.09	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.08	0.16	0.03	0.11	0.19	0.12
N3	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.06	0.12	0.02	0.10	0.17	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.02	0.04	0.21	0.07
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.15	0.04
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.07	0.02	0.03	0.02	0.06	0.06	0.03
O3'	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.07	0.00	0.03	0.15	0.05	0.15	0.12	0.14
O4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.12	0.05	0.10	0.13	0.08
O5'	0.05	0.14	0.06	0.12	0.10	0.01	0.09	0.01	0.11	0.04	0.12	0.16	0.12	0.06	0.06	0.03	0.15	0.12	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.11	0.00	0.07	0.26	0.12
OP1	0.08	0.09	0.08	0.11	0.07	0.06	0.04	0.07	0.05	0.04	0.05	0.11	0.10	0.04	0.06	0.06	0.15	0.10	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00
OP2	0.11	0.20	0.09	0.07	0.18	0.05	0.21	0.08	0.23	0.18	0.22	0.19	0.17	0.21	0.15	0.06	0.12	0.13	0.01	0.26	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.10	0.05	0.09	0.08	0.02	0.08	0.02	0.10	0.05	0.10	0.12	0.09	0.07	0.04	0.03	0.14	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.21	0.10	0.10	0.08	0.14	0.08	0.21	0.12	0.13	0.18	0.17	0.11	0.12	0.06	0.17	0.14	0.12	0.14	0.15	0.07	0.05
C2	0.06	0.12	0.07	0.04	0.04	0.06	0.04	0.14	0.04	0.12	0.10	0.09	0.04	0.12	0.06	0.10	0.05	0.07	0.07	0.14	0.04	0.03
C2'	0.11	0.22	0.11	0.14	0.10	0.16	0.10	0.23	0.13	0.12	0.19	0.18	0.12	0.11	0.09	0.18	0.18	0.11	0.16	0.12	0.06	0.03
C3'	0.10	0.24	0.11	0.14	0.09	0.16	0.08	0.24	0.13	0.11	0.21	0.19	0.13	0.10	0.07	0.18	0.19	0.11	0.19	0.10	0.09	0.08
C4	0.09	0.19	0.08	0.04	0.06	0.09	0.07	0.18	0.12	0.10	0.18	0.14	0.12	0.10	0.05	0.12	0.06	0.08	0.10	0.14	0.03	0.05
C4'	0.10	0.23	0.12	0.12	0.08	0.15	0.07	0.22	0.12	0.14	0.20	0.18	0.11	0.12	0.06	0.20	0.18	0.11	0.17	0.13	0.11	0.06
C5	0.09	0.21	0.06	0.04	0.06	0.07	0.09	0.17	0.15	0.08	0.21	0.13	0.17	0.09	0.05	0.11	0.05	0.07	0.10	0.15	0.05	0.07
C5'	0.09	0.25	0.11	0.11	0.09	0.14	0.10	0.22	0.15	0.14	0.23	0.19	0.15	0.13	0.06	0.20	0.16	0.11	0.17	0.13	0.10	0.07
C6	0.09	0.18	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.15	0.14	0.07	0.19	0.12	0.16	0.09	0.06	0.09	0.07	0.07	0.10	0.15	0.05	0.08
C8	0.10	0.26	0.07	0.07	0.09	0.10	0.11	0.21	0.17	0.08	0.24	0.18	0.18	0.10	0.05	0.13	0.09	0.07	0.12	0.14	0.07	0.08
N1	0.07	0.14	0.06	0.04	0.04	0.04	0.03	0.13	0.06	0.07	0.13	0.10	0.08	0.09	0.04	0.09	0.04	0.05	0.07	0.15	0.02	0.05
N2	0.05	0.11	0.07	0.05	0.07	0.06	0.09	0.13	0.08	0.13	0.10	0.09	0.09	0.16	0.06	0.10	0.06	0.08	0.07	0.14	0.05	0.03
N3	0.09	0.15	0.10	0.06	0.06	0.09	0.06	0.16	0.07	0.14	0.12	0.12	0.06	0.13	0.07	0.13	0.08	0.10	0.08	0.14	0.06	0.02
N7	0.10	0.25	0.07	0.06	0.09	0.08	0.11	0.19	0.19	0.07	0.25	0.15	0.20	0.09	0.06	0.12	0.08	0.08	0.12	0.15	0.08	0.09
N9	0.09	0.23	0.08	0.07	0.08	0.11	0.09	0.21	0.14	0.10	0.21	0.18	0.14	0.10	0.04	0.14	0.10	0.09	0.12	0.14	0.05	0.06
O2'	0.12	0.20	0.14	0.17	0.12	0.18	0.11	0.20	0.13	0.14	0.18	0.17	0.12	0.13	0.11	0.19	0.22	0.14	0.16	0.17	0.13	0.07
O3'	0.15	0.23	0.17	0.18	0.10	0.18	0.09	0.24	0.13	0.15	0.20	0.18	0.12	0.13	0.11	0.25	0.22	0.13	0.22	0.16	0.16	0.14
O4'	0.10	0.22	0.13	0.10	0.08	0.14	0.08	0.20	0.12	0.15	0.19	0.18	0.11	0.13	0.07	0.21	0.15	0.12	0.14	0.15	0.10	0.03
O5'	0.04	0.30	0.05	0.10	0.14	0.13	0.13	0.22	0.21	0.04	0.29	0.22	0.21	0.07	0.05	0.14	0.14	0.10	0.14	0.17	0.10	0.07
O6	0.10	0.18	0.07	0.09	0.09	0.08	0.10	0.15	0.16	0.08	0.20	0.13	0.20	0.11	0.08	0.09	0.11	0.09	0.12	0.15	0.08	0.10
OP1	0.15	0.20	0.17	0.09	0.02	0.11	0.02	0.19	0.08	0.18	0.18	0.13	0.07	0.14	0.10	0.27	0.13	0.07	0.14	0.16	0.12	0.07
OP2	0.08	0.45	0.09	0.20	0.25	0.21	0.26	0.33	0.36	0.10	0.45	0.35	0.36	0.16	0.14	0.07	0.23	0.18	0.23	0.10	0.12	0.12
P	0.06	0.30	0.06	0.10	0.12	0.13	0.12	0.23	0.21	0.05	0.30	0.22	0.21	0.05	0.04	0.15	0.14	0.10	0.16	0.14	0.08	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.17	0.07	0.07
C2	0.04	0.00	0.07	0.07	0.03	0.12	0.02	0.24	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.08	0.06	0.20	0.16	0.22	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.14	0.07	0.06
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.08	0.07	0.07	0.08	0.07	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.12	0.08
C4	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.10	0.10	0.10	0.09
C4'	0.02	0.12	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.03	0.11	0.11	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03
C5	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.08	0.03	0.09	0.11	0.09	0.08
C5'	0.01	0.24	0.02	0.02	0.14	0.00	0.14	0.00	0.18	0.05	0.23	0.21	0.19	0.08	0.07	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.08	0.04	0.14	0.10	0.14	0.14
C8	0.01	0.04	0.05	0.08	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.00	0.05	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.03	0.17	0.06	0.06
N1	0.03	0.01	0.05	0.07	0.02	0.11	0.02	0.23	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.09	0.05	0.19	0.14	0.20	0.20
N3	0.04	0.00	0.06	0.07	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.06	0.17	0.14	0.18	0.18
N6	0.04	0.02	0.05	0.08	0.02	0.08	0.03	0.19	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.06	0.05	0.05	0.11	0.05	0.14	0.10	0.14	0.13
N7	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.09	0.02	0.04	0.14	0.05	0.04
N9	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.07	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.04	0.14	0.05	0.05
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.11	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.00	0.05	0.03	0.14	0.27	0.17	0.19
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.08	0.09	0.07	0.11	0.09	0.04	0.05	0.00	0.02	0.07	0.12	0.19	0.14
O4'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.12	0.05	0.06
O5'	0.05	0.20	0.05	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.14	0.03	0.19	0.17	0.14	0.04	0.04	0.14	0.07	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.17	0.16	0.14	0.04	0.10	0.05	0.11	0.01	0.10	0.17	0.14	0.14	0.10	0.14	0.14	0.27	0.12	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.22	0.07	0.12	0.10	0.05	0.09	0.03	0.14	0.06	0.20	0.18	0.14	0.05	0.05	0.17	0.19	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.22	0.06	0.08	0.09	0.03	0.08	0.01	0.14	0.06	0.20	0.18	0.13	0.04	0.05	0.19	0.14	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00