Doublet Group distance statistics: 55389

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, -0.001, 0.011, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.002, 0.020, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N9	A	0, -0.002, 0.017, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C1'	A	0, -0.007, 0.020, 0.048, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.027
N1	A	0, -0.005, 0.024, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.029
C2	A	0, -0.005, 0.025, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.014, 0.048, 0.083, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.048 std_dev=0.034
N2	A	0, -0.007, 0.043, 0.092, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.043 std_dev=0.049
C4'	A	0, 0.018, 0.070, 0.122, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.070 std_dev=0.052
C5'	A	0, 0.031, 0.109, 0.187, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.109 std_dev=0.078
C3'	A	0, 0.025, 0.107, 0.190, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.107 std_dev=0.082
P	A	0, 0.041, 0.147, 0.252, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.147 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.003, 0.108, 0.213, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.108 std_dev=0.105
N1	B	0, 0.055, 0.194, 0.332, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.194 std_dev=0.139
OP2	A	0, 0.033, 0.174, 0.314, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.174 std_dev=0.141
O3'	A	0, 0.039, 0.180, 0.320, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.180 std_dev=0.141
C6	B	0, 0.059, 0.208, 0.357, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.208 std_dev=0.149
C4	B	0, 0.061, 0.212, 0.363, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.212 std_dev=0.151
C5	B	0, 0.063, 0.217, 0.370, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.217 std_dev=0.153
N9	B	0, 0.065, 0.225, 0.384, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.225 std_dev=0.160
O3'	B	0, 0.044, 0.208, 0.371, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.208 std_dev=0.164
C2'	B	0, 0.066, 0.231, 0.397, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.231 std_dev=0.165
C3'	B	0, 0.030, 0.197, 0.364, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.197 std_dev=0.167
O5'	A	0, 0.066, 0.235, 0.404, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.235 std_dev=0.169
C2	B	0, 0.061, 0.234, 0.407, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.234 std_dev=0.173
N3	B	0, 0.070, 0.248, 0.426, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.248 std_dev=0.178
C8	B	0, 0.074, 0.256, 0.439, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.256 std_dev=0.182
C1'	B	0, 0.076, 0.260, 0.443, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.260 std_dev=0.184
O2'	A	0, 0.013, 0.210, 0.407, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.210 std_dev=0.197
N7	B	0, 0.070, 0.269, 0.468, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.269 std_dev=0.199
O4'	B	0, 0.080, 0.281, 0.481, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.281 std_dev=0.201
OP1	A	0, 0.056, 0.259, 0.462, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.259 std_dev=0.203
N6	B	0, 0.048, 0.253, 0.458, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.253 std_dev=0.205
C4'	B	0, 0.024, 0.233, 0.443, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.233 std_dev=0.209
O2'	B	0, 0.088, 0.319, 0.549, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.319 std_dev=0.231
O5'	B	0, 0.053, 0.288, 0.524, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.288 std_dev=0.236
C5'	B	0, 0.020, 0.265, 0.510, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.265 std_dev=0.245
P	B	0, 0.111, 0.391, 0.672, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.391 std_dev=0.281
OP2	B	0, 0.133, 0.466, 0.798, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.466 std_dev=0.332
OP1	B	0, 0.103, 0.464, 0.825, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.464 std_dev=0.361

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.13	0.04	0.03
C2	0.05	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.07	0.21	0.02	0.11	0.03	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.07	0.02	0.06	0.04	0.07	0.04	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.10	0.08	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.02	0.11	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.04	0.19	0.01	0.10	0.03	0.05
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.08	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.02	0.19	0.01	0.06	0.04	0.04
C5'	0.04	0.10	0.00	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.10	0.10	0.09	0.06	0.07	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.11	0.01	0.01
C6	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.03	0.20	0.01	0.04	0.05	0.03
C8	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.03	0.01	0.19	0.03	0.08	0.03	0.05
N1	0.05	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.12	0.07	0.22	0.01	0.08	0.03	0.05
N2	0.05	0.00	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.08	0.21	0.03	0.12	0.03	0.06
N3	0.04	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.06	0.20	0.02	0.12	0.03	0.06
N7	0.00	0.01	0.07	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.03	0.02	0.19	0.02	0.04	0.04	0.04
N9	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.02	0.18	0.01	0.11	0.03	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.14	0.04	0.07	0.04	0.14	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.12	0.07	0.13	0.07
O3'	0.05	0.14	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.04	0.06	0.03	0.12	0.18	0.13	0.03	0.04	0.06	0.00	0.04	0.12	0.04	0.08	0.08	0.05
O4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.07	0.08	0.06	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.11	0.02	0.10	0.06	0.02
O5'	0.11	0.21	0.05	0.12	0.19	0.01	0.19	0.00	0.20	0.19	0.22	0.21	0.20	0.19	0.18	0.10	0.12	0.11	0.00	0.18	0.02	0.00	0.00
O6	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.12	0.04	0.02	0.18	0.00	0.01	0.07	0.01
OP1	0.13	0.11	0.10	0.11	0.10	0.13	0.06	0.11	0.04	0.08	0.08	0.12	0.12	0.04	0.11	0.07	0.08	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.04	0.03	0.08	0.07	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.13	0.08	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.05	0.04	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.05	0.06	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.10	0.09	0.05	0.09	0.08	0.08	0.09	0.09	0.07	0.10	0.09	0.08	0.06	0.09	0.10	0.04	0.09	0.11	0.07	0.08	0.11
C2	0.10	0.13	0.10	0.04	0.10	0.06	0.09	0.05	0.08	0.07	0.10	0.13	0.07	0.07	0.09	0.11	0.02	0.08	0.08	0.01	0.01	0.07
C2'	0.06	0.07	0.06	0.03	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.04	0.06	0.06	0.05	0.03	0.06	0.08	0.01	0.07	0.08	0.06	0.09	0.09
C3'	0.09	0.08	0.09	0.05	0.07	0.08	0.05	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.04	0.08	0.11	0.04	0.09	0.10	0.06	0.09	0.10
C4	0.04	0.05	0.05	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.06	0.00	0.04	0.07	0.04	0.05	0.07
C4'	0.10	0.10	0.12	0.07	0.08	0.09	0.06	0.09	0.06	0.06	0.08	0.10	0.04	0.04	0.09	0.14	0.07	0.10	0.10	0.07	0.08	0.10
C5	0.04	0.05	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.07	0.04	0.04	0.03	0.03	0.06	0.06	0.07	0.06
C5'	0.11	0.09	0.13	0.08	0.08	0.10	0.06	0.11	0.06	0.05	0.07	0.10	0.03	0.03	0.09	0.15	0.08	0.10	0.12	0.10	0.11	0.12
C6	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.04	0.06	0.08	0.09	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05
C8	0.04	0.07	0.03	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.04	0.03	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.07
N1	0.03	0.06	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.04	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04
N2	0.16	0.18	0.15	0.08	0.15	0.10	0.12	0.08	0.11	0.11	0.14	0.19	0.08	0.09	0.14	0.18	0.05	0.13	0.09	0.04	0.02	0.08
N3	0.09	0.14	0.09	0.04	0.11	0.06	0.09	0.06	0.10	0.08	0.12	0.12	0.08	0.07	0.09	0.10	0.02	0.08	0.08	0.03	0.04	0.08
N7	0.08	0.10	0.05	0.07	0.10	0.06	0.12	0.06	0.13	0.10	0.11	0.10	0.14	0.12	0.08	0.05	0.06	0.07	0.07	0.09	0.10	0.07
N9	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.05	0.00	0.03	0.07	0.05	0.07	0.08
O2'	0.04	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.09	0.08
O3'	0.18	0.16	0.18	0.14	0.15	0.16	0.12	0.16	0.11	0.13	0.13	0.16	0.09	0.11	0.16	0.20	0.14	0.18	0.17	0.13	0.10	0.16
O4'	0.11	0.12	0.12	0.07	0.09	0.09	0.07	0.09	0.07	0.06	0.09	0.11	0.05	0.05	0.09	0.15	0.07	0.11	0.11	0.06	0.07	0.10
O5'	0.14	0.08	0.19	0.16	0.10	0.16	0.08	0.18	0.06	0.10	0.05	0.10	0.04	0.08	0.12	0.19	0.18	0.14	0.19	0.17	0.17	0.19
O6	0.10	0.09	0.07	0.09	0.11	0.08	0.13	0.08	0.12	0.14	0.09	0.10	0.13	0.16	0.11	0.07	0.06	0.10	0.08	0.09	0.08	0.07
OP1	0.06	0.08	0.10	0.04	0.05	0.06	0.02	0.06	0.03	0.01	0.06	0.08	0.02	0.02	0.05	0.13	0.04	0.05	0.07	0.09	0.13	0.09
OP2	0.08	0.08	0.05	0.09	0.09	0.07	0.10	0.08	0.10	0.10	0.09	0.08	0.11	0.11	0.08	0.04	0.07	0.08	0.08	0.12	0.14	0.10
P	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.07	0.02	0.03	0.07	0.09	0.12	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02
C2	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.04	0.09	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.08	0.06
C4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02
C5	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.09	0.07
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.10	0.07
C8	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.07
N1	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.05	0.10	0.08
N3	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.05	0.03	0.08	0.07
N6	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.10	0.07
N7	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.09	0.08
N9	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.05
O2'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01
O3'	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.06	0.07	0.03
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01
O5'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.03	0.05	0.06	0.02	0.04	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.09	0.04	0.06	0.08	0.03	0.09	0.02	0.10	0.07	0.10	0.08	0.10	0.09	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00