Doublet Group distance statistics: 55393

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N3	A	0, 0.000, 0.055, 0.110, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.055 std_dev=0.055
N1	A	0, 0.000, 0.058, 0.115, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.058 std_dev=0.058
C5	A	0, 0.000, 0.064, 0.128, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.064 std_dev=0.064
C4	A	0, 0.000, 0.068, 0.136, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.068 std_dev=0.068
O6	A	0, 0.000, 0.089, 0.178, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.089 std_dev=0.089
N9	A	0, 0.000, 0.091, 0.183, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.091 std_dev=0.091
N7	A	0, 0.000, 0.158, 0.317, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.158 std_dev=0.158
C8	A	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.182 std_dev=0.182
C6	B	0, 0.000, 0.308, 0.616, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.308 std_dev=0.308
N1	B	0, 0.000, 0.369, 0.739, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.369 std_dev=0.369
N6	B	0, 0.000, 0.408, 0.815, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.408 std_dev=0.408
C2	B	0, 0.000, 0.414, 0.829, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.414 std_dev=0.414
C5	B	0, 0.000, 0.419, 0.838, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.419 std_dev=0.419
N3	B	0, 0.000, 0.474, 0.948, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.474 std_dev=0.474
C4	B	0, 0.000, 0.499, 0.998, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.499 std_dev=0.499
N7	B	0, 0.000, 0.655, 1.309, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.655 std_dev=0.655
N9	B	0, 0.000, 0.828, 1.656, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.828 std_dev=0.828
C8	B	0, 0.000, 0.841, 1.682, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.841 std_dev=0.841
C1'	B	0, 0.000, 1.126, 2.253, 2.253 max_d=2.253 avg_d=1.126 std_dev=1.126
O4'	A	0, 0.000, 1.271, 2.542, 2.542 max_d=2.542 avg_d=1.271 std_dev=1.271
C2'	A	0, 0.000, 1.487, 2.973, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.487 std_dev=1.487
O2'	B	0, 0.000, 1.725, 3.451, 3.451 max_d=3.451 avg_d=1.725 std_dev=1.725
O2'	A	0, 0.000, 1.883, 3.765, 3.765 max_d=3.765 avg_d=1.883 std_dev=1.883
C4'	A	0, 0.000, 1.997, 3.995, 3.995 max_d=3.995 avg_d=1.997 std_dev=1.997
C2'	B	0, 0.000, 2.128, 4.257, 4.257 max_d=4.257 avg_d=2.128 std_dev=2.128
C3'	A	0, 0.000, 2.235, 4.470, 4.470 max_d=4.470 avg_d=2.235 std_dev=2.235
O4'	B	0, 0.000, 2.276, 4.551, 4.551 max_d=4.551 avg_d=2.276 std_dev=2.276
C4'	B	0, 0.000, 3.181, 6.363, 6.363 max_d=6.363 avg_d=3.181 std_dev=3.181
C5'	A	0, 0.000, 3.381, 6.761, 6.761 max_d=6.761 avg_d=3.381 std_dev=3.381
C3'	B	0, 0.000, 3.382, 6.763, 6.763 max_d=6.763 avg_d=3.382 std_dev=3.382
O3'	A	0, 0.000, 3.400, 6.800, 6.800 max_d=6.800 avg_d=3.400 std_dev=3.400
O5'	A	0, 0.000, 4.201, 8.402, 8.402 max_d=8.402 avg_d=4.201 std_dev=4.201
O3'	B	0, 0.000, 4.417, 8.834, 8.834 max_d=8.834 avg_d=4.417 std_dev=4.417
C5'	B	0, 0.000, 4.548, 9.096, 9.096 max_d=9.096 avg_d=4.548 std_dev=4.548
O5'	B	0, 0.000, 5.159, 10.318, 10.318 max_d=10.318 avg_d=5.159 std_dev=5.159
P	A	0, 0.000, 5.330, 10.661, 10.661 max_d=10.661 avg_d=5.330 std_dev=5.330
OP1	B	0, 0.000, 5.482, 10.963, 10.963 max_d=10.963 avg_d=5.482 std_dev=5.482
P	B	0, 0.000, 5.656, 11.312, 11.312 max_d=11.312 avg_d=5.656 std_dev=5.656
OP1	A	0, 0.000, 5.714, 11.428, 11.428 max_d=11.428 avg_d=5.714 std_dev=5.714
OP2	A	0, 0.000, 6.041, 12.082, 12.082 max_d=12.082 avg_d=6.041 std_dev=6.041
OP2	B	0, 0.000, 6.438, 12.875, 12.875 max_d=12.875 avg_d=6.438 std_dev=6.438

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.02	0.76	0.28	0.23
C2	0.02	0.00	0.25	0.35	0.00	0.70	0.00	1.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.49	0.25	0.59	1.06	0.00	0.63	2.10	1.18
C2'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.16	0.01	0.15	0.03	0.20	0.01	0.25	0.25	0.21	0.07	0.06	0.00	0.00	0.01	0.22	0.20	0.66	0.10	0.34
C3'	0.02	0.35	0.00	0.00	0.12	0.00	0.03	0.01	0.05	0.30	0.21	0.48	0.36	0.25	0.07	0.01	0.01	0.03	0.38	0.03	0.63	0.04	0.45
C4	0.00	0.00	0.16	0.12	0.00	0.32	0.01	0.57	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.25	0.04	0.31	0.25	0.01	0.45	0.89	0.13
C4'	0.00	0.70	0.01	0.00	0.32	0.00	0.13	0.00	0.28	0.33	0.52	0.89	0.68	0.20	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.19	0.41	0.24	0.08
C5	0.01	0.00	0.15	0.03	0.01	0.13	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.13	0.14	0.13	0.02	0.89	0.47	0.32
C5'	0.02	1.28	0.03	0.01	0.57	0.00	0.30	0.00	0.58	0.44	1.00	1.64	1.16	0.24	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.44	0.29	0.26	0.00
C6	0.01	0.00	0.20	0.05	0.01	0.28	0.01	0.58	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.30	0.07	0.27	0.14	0.00	0.50	0.89	0.03
C8	0.01	0.01	0.01	0.30	0.01	0.33	0.01	0.44	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.31	0.28	0.86	0.03	1.79	0.54	1.21
N1	0.01	0.00	0.25	0.21	0.00	0.52	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.44	0.10	0.45	0.67	0.00	0.19	1.64	0.72
N2	0.02	0.00	0.25	0.48	0.00	0.89	0.01	1.64	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.57	0.40	0.71	1.54	0.01	1.32	2.84	1.84
N3	0.01	0.00	0.21	0.36	0.01	0.68	0.00	1.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.42	0.27	0.59	0.95	0.01	0.38	1.78	0.97
N7	0.01	0.01	0.07	0.25	0.02	0.20	0.00	0.24	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.15	0.74	0.03	1.66	0.37	1.10
N9	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.23	0.03	1.02	0.22	0.44
O2'	0.00	0.49	0.00	0.01	0.25	0.02	0.19	0.01	0.30	0.12	0.44	0.57	0.42	0.00	0.04	0.00	0.03	0.04	0.06	0.28	0.41	0.16	0.15
O3'	0.02	0.25	0.00	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.07	0.31	0.10	0.40	0.27	0.31	0.09	0.03	0.00	0.02	0.45	0.17	0.43	0.23	0.48
O4'	0.00	0.59	0.01	0.03	0.31	0.00	0.14	0.01	0.27	0.28	0.45	0.71	0.59	0.15	0.00	0.04	0.02	0.00	0.07	0.21	0.65	0.38	0.07
O5'	0.08	1.06	0.22	0.38	0.25	0.00	0.13	0.01	0.14	0.86	0.67	1.54	0.95	0.74	0.23	0.06	0.45	0.07	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.20	0.03	0.01	0.19	0.02	0.44	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.28	0.17	0.21	0.05	0.00	0.72	0.64	0.21
OP1	0.76	0.63	0.66	0.63	0.45	0.41	0.89	0.29	0.50	1.79	0.19	1.32	0.38	1.66	1.02	0.41	0.43	0.65	0.01	0.72	0.00	0.04	0.00
OP2	0.28	2.10	0.10	0.04	0.89	0.24	0.47	0.26	0.89	0.54	1.64	2.84	1.78	0.37	0.22	0.16	0.23	0.38	0.01	0.64	0.04	0.00	0.00
P	0.23	1.18	0.34	0.45	0.13	0.08	0.32	0.00	0.03	1.21	0.72	1.84	0.97	1.10	0.44	0.15	0.48	0.07	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.18	0.76	0.48	0.22	0.36	0.25	0.76	0.22	0.26	0.19	0.20	0.21	0.29	0.21	0.84	0.88	0.73	0.84	2.07	1.74	1.84
C2	0.44	0.08	1.13	1.34	0.13	0.69	0.00	0.64	0.18	0.21	0.19	0.07	0.27	0.05	0.29	0.89	1.66	0.24	1.06	0.04	0.82	0.36
C2'	1.05	0.95	0.15	0.40	1.14	1.26	1.06	1.62	0.93	1.12	0.86	1.14	0.83	1.08	1.16	0.04	0.10	1.71	1.64	2.76	2.31	2.57
C3'	0.79	1.04	0.10	0.20	0.88	1.16	0.73	1.65	0.72	0.65	0.85	1.11	0.59	0.62	0.80	0.27	0.33	1.56	1.75	2.57	2.46	2.64
C4	0.22	0.15	0.96	0.85	0.01	0.10	0.09	0.19	0.17	0.01	0.20	0.05	0.18	0.07	0.08	0.89	1.18	0.28	0.03	1.08	0.50	0.80
C4'	0.01	0.42	0.91	0.64	0.14	0.36	0.04	0.85	0.12	0.11	0.29	0.37	0.04	0.08	0.01	1.01	1.13	0.72	1.13	2.09	2.26	2.13
C5	0.17	0.19	0.81	0.66	0.01	0.04	0.04	0.37	0.13	0.04	0.22	0.08	0.12	0.01	0.07	0.78	0.95	0.34	0.08	1.06	0.47	0.82
C5'	0.48	0.28	1.36	1.16	0.27	0.12	0.43	0.41	0.25	0.74	0.08	0.14	0.36	0.68	0.50	1.36	1.67	0.23	0.73	1.39	1.94	1.60
C6	0.24	0.17	0.82	0.79	0.04	0.17	0.01	0.06	0.13	0.13	0.24	0.04	0.16	0.07	0.15	0.74	1.06	0.14	0.36	0.57	0.19	0.28
C8	0.00	0.16	0.68	0.33	0.10	0.46	0.09	0.96	0.09	0.08	0.13	0.15	0.06	0.10	0.07	0.77	0.63	0.70	0.89	1.88	1.59	1.75
N1	0.36	0.12	0.95	1.09	0.10	0.50	0.03	0.41	0.16	0.21	0.23	0.02	0.25	0.10	0.25	0.78	1.38	0.12	0.89	0.09	0.79	0.27
N2	0.57	0.04	1.24	1.67	0.19	1.08	0.04	1.18	0.16	0.32	0.16	0.13	0.30	0.11	0.40	0.92	2.00	0.55	1.66	0.60	1.55	1.03
N3	0.38	0.08	1.17	1.25	0.07	0.51	0.06	0.36	0.17	0.09	0.18	0.05	0.23	0.05	0.21	0.98	1.60	0.05	0.62	0.55	0.15	0.19
N7	0.05	0.18	0.68	0.38	0.05	0.36	0.04	0.81	0.07	0.01	0.15	0.13	0.03	0.03	0.01	0.73	0.66	0.58	0.61	1.54	1.12	1.38
N9	0.06	0.16	0.83	0.57	0.11	0.24	0.14	0.64	0.15	0.11	0.17	0.13	0.14	0.15	0.06	0.86	0.91	0.57	0.57	1.70	1.30	1.49
O2'	1.48	0.87	0.61	0.80	1.33	1.59	1.28	1.84	1.05	1.53	0.86	1.13	1.00	1.43	1.52	0.40	0.27	2.04	1.93	3.24	2.60	2.86
O3'	1.36	1.40	0.55	0.91	1.33	1.88	1.13	2.44	1.08	1.09	1.19	1.54	0.93	1.03	1.30	0.28	0.33	2.20	2.54	3.04	2.95	3.28
O4'	0.54	0.04	1.43	1.11	0.33	0.19	0.31	0.28	0.21	0.45	0.07	0.17	0.22	0.38	0.44	1.47	1.50	0.16	0.49	1.64	1.62	1.52
O5'	0.66	0.63	1.55	1.39	0.15	0.42	0.26	0.20	0.04	0.80	0.46	0.35	0.04	0.63	0.54	1.70	2.02	0.01	0.56	0.90	1.63	1.30
O6	0.19	0.18	0.70	0.65	0.03	0.08	0.02	0.16	0.10	0.13	0.23	0.07	0.11	0.10	0.13	0.65	0.89	0.18	0.31	0.52	0.25	0.25
OP1	0.94	0.96	1.83	2.05	0.11	1.21	0.21	0.85	0.27	1.06	0.84	0.51	0.20	0.76	0.71	1.91	2.86	0.56	0.51	0.36	0.55	0.13
OP2	1.59	0.05	2.30	2.32	1.12	1.38	1.35	0.86	0.91	2.07	0.29	0.42	1.04	1.90	1.62	2.19	2.70	1.03	0.70	0.58	0.09	0.19
P	1.19	0.60	2.04	2.13	0.47	1.20	0.58	0.68	0.12	1.37	0.44	0.17	0.20	1.10	1.03	2.09	2.82	0.69	0.40	0.19	0.59	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.05	0.12	0.07	0.03	0.08	0.03	0.08	0.05	0.07	0.06	0.09	0.06	0.04	0.02	0.19	0.00	0.25	0.91	0.05	0.37
C2	0.06	0.00	0.36	0.01	0.00	0.42	0.01	0.81	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.46	0.14	0.48	0.48	1.39	0.74	1.12
C2'	0.05	0.36	0.00	0.04	0.29	0.02	0.25	0.02	0.29	0.09	0.33	0.36	0.27	0.15	0.16	0.00	0.13	0.00	0.22	0.71	0.10	0.24
C3'	0.12	0.01	0.04	0.00	0.21	0.01	0.33	0.03	0.26	0.52	0.11	0.02	0.32	0.49	0.30	0.05	0.05	0.05	0.27	0.27	0.29	0.00
C4	0.07	0.00	0.29	0.21	0.00	0.07	0.00	0.20	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.25	0.31	0.19	0.23	0.85	0.06	0.40
C4'	0.03	0.42	0.02	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.02	0.50	0.26	0.39	0.08	0.40	0.16	0.01	0.08	0.02	0.01	0.61	0.20	0.37
C5	0.08	0.01	0.25	0.33	0.00	0.12	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.42	0.00	0.65	0.38	0.66	0.12
C5'	0.03	0.81	0.02	0.03	0.20	0.01	0.09	0.00	0.14	0.72	0.55	0.73	0.03	0.58	0.17	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05
C6	0.08	0.01	0.29	0.26	0.01	0.02	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.25	0.36	0.12	0.40	0.54	0.44	0.11
C8	0.05	0.02	0.09	0.52	0.03	0.50	0.00	0.72	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.13	0.54	0.37	1.31	0.15	1.28	0.79
N1	0.07	0.01	0.33	0.11	0.01	0.26	0.00	0.55	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.38	0.23	0.33	0.11	1.01	0.23	0.69
N3	0.06	0.00	0.36	0.02	0.00	0.39	0.01	0.73	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.44	0.16	0.49	0.43	1.42	0.72	1.11
N6	0.09	0.00	0.27	0.32	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.19	0.41	0.03	0.65	0.23	0.84	0.23
N7	0.06	0.02	0.15	0.49	0.03	0.40	0.01	0.58	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.54	0.25	1.23	0.17	1.38	0.78
N9	0.04	0.00	0.16	0.30	0.01	0.16	0.04	0.17	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.36	0.06	0.59	0.57	0.40	0.02
O2'	0.02	0.46	0.00	0.05	0.25	0.01	0.15	0.00	0.25	0.13	0.38	0.44	0.19	0.05	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	1.04	0.28	0.51
O3'	0.19	0.14	0.13	0.05	0.31	0.08	0.42	0.02	0.36	0.54	0.23	0.16	0.41	0.54	0.36	0.18	0.00	0.12	0.17	0.04	0.30	0.09
O4'	0.00	0.48	0.00	0.05	0.19	0.02	0.00	0.00	0.12	0.37	0.33	0.49	0.03	0.25	0.06	0.01	0.12	0.00	0.09	0.92	0.27	0.51
O5'	0.25	0.48	0.22	0.27	0.23	0.01	0.65	0.00	0.40	1.31	0.11	0.43	0.65	1.23	0.59	0.01	0.17	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.91	1.39	0.71	0.27	0.85	0.61	0.38	0.03	0.54	0.15	1.01	1.42	0.23	0.17	0.57	1.04	0.04	0.92	0.02	0.00	0.04	0.00
OP2	0.05	0.74	0.10	0.29	0.06	0.20	0.66	0.02	0.44	1.28	0.23	0.72	0.84	1.38	0.40	0.28	0.30	0.27	0.02	0.04	0.00	0.00
P	0.37	1.12	0.24	0.00	0.40	0.37	0.12	0.05	0.11	0.79	0.69	1.11	0.23	0.78	0.02	0.51	0.09	0.51	0.01	0.00	0.00	0.00