Doublet Group distance statistics: 55404

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 13, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.023, 0.036, 0.048, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.036 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.023, 0.036, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.022, 0.035, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.049, 0.067, 0.085, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.067 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.029, 0.049, 0.068, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.049 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.070, 0.103, 0.135, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.103 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.075, 0.108, 0.142, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.108 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.068, 0.110, 0.152, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.110 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.072, 0.119, 0.166, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.119 std_dev=0.047
C4'	A	0, 0.080, 0.140, 0.201, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.140 std_dev=0.061
C3'	A	0, 0.082, 0.144, 0.206, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.144 std_dev=0.062
O3'	A	0, 0.068, 0.144, 0.219, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.144 std_dev=0.075
O4'	B	0, 0.054, 0.150, 0.245, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.150 std_dev=0.095
P	B	0, 0.097, 0.194, 0.291, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.194 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.167, 0.265, 0.363, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.265 std_dev=0.098
C8	B	0, 0.090, 0.191, 0.292, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.191 std_dev=0.101
N7	B	0, 0.100, 0.202, 0.303, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.202 std_dev=0.102
O5'	A	0, 0.177, 0.279, 0.381, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.279 std_dev=0.102
C5	B	0, 0.115, 0.218, 0.322, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.218 std_dev=0.104
C5'	A	0, 0.153, 0.261, 0.368, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.261 std_dev=0.108
OP2	B	0, 0.211, 0.326, 0.441, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.326 std_dev=0.115
C6	B	0, 0.183, 0.300, 0.416, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.300 std_dev=0.116
C4	B	0, 0.083, 0.201, 0.320, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.201 std_dev=0.119
N9	B	0, 0.074, 0.195, 0.317, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.195 std_dev=0.122
O5'	B	0, 0.095, 0.224, 0.352, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.224 std_dev=0.129
N1	B	0, 0.198, 0.327, 0.456, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.327 std_dev=0.129
O6	B	0, 0.244, 0.381, 0.518, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.381 std_dev=0.137
OP2	A	0, 0.261, 0.400, 0.539, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.400 std_dev=0.139
C4'	B	0, 0.035, 0.175, 0.316, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.175 std_dev=0.140
P	A	0, 0.222, 0.364, 0.506, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.364 std_dev=0.142
N3	B	0, 0.084, 0.230, 0.377, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.230 std_dev=0.147
C2	B	0, 0.142, 0.290, 0.437, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.290 std_dev=0.147
OP1	B	0, 0.092, 0.245, 0.399, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.245 std_dev=0.153
O3'	B	0, 0.088, 0.260, 0.431, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.260 std_dev=0.172
N2	B	0, 0.191, 0.369, 0.548, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.369 std_dev=0.179
C1'	B	0, 0.030, 0.213, 0.397, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.213 std_dev=0.184
OP1	A	0, 0.282, 0.470, 0.658, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.470 std_dev=0.188
C3'	B	0, 0.023, 0.233, 0.443, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.233 std_dev=0.210
C5'	B	0, -0.038, 0.238, 0.515, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.238 std_dev=0.276
C2'	B	0, -0.100, 0.322, 0.744, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.322 std_dev=0.422
O2'	B	0, -0.188, 0.499, 1.185, 3.591 max_d=3.591 avg_d=0.499 std_dev=0.686

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.05
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.05	0.01	0.06	0.11	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.11	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.12	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.06	0.01	0.09	0.13	0.09
C8	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.11	0.08
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.02	0.06	0.01	0.08	0.12	0.08
N2	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.06	0.02	0.06	0.01	0.07	0.11	0.07
N3	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.10	0.06
N7	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.12	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.10	0.06
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.05
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.04	0.05	0.08	0.05	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.08	0.05
O5'	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.04	0.04	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.03	0.07	0.00	0.10	0.13	0.09
OP1	0.04	0.06	0.05	0.06	0.06	0.04	0.08	0.04	0.09	0.07	0.08	0.07	0.06	0.09	0.05	0.07	0.08	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.11	0.05	0.04	0.11	0.03	0.12	0.02	0.13	0.11	0.12	0.11	0.10	0.12	0.10	0.05	0.05	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.03	0.03	0.07	0.02	0.08	0.02	0.09	0.08	0.08	0.07	0.06	0.09	0.06	0.05	0.05	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.14	0.09	0.09	0.06	0.12	0.06	0.21	0.09	0.09	0.11	0.19	0.12	0.09	0.05	0.09	0.16	0.06	0.10	0.10	0.04	0.05	0.03
C2	0.18	0.17	0.22	0.09	0.13	0.11	0.09	0.16	0.11	0.07	0.14	0.19	0.18	0.08	0.12	0.37	0.17	0.08	0.15	0.11	0.10	0.08	0.08
C2'	0.06	0.16	0.13	0.12	0.09	0.13	0.09	0.23	0.11	0.09	0.14	0.21	0.14	0.10	0.07	0.09	0.16	0.06	0.12	0.12	0.06	0.06	0.05
C3'	0.07	0.12	0.23	0.14	0.05	0.11	0.05	0.17	0.07	0.09	0.10	0.19	0.08	0.08	0.07	0.10	0.14	0.08	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01
C4	0.10	0.16	0.06	0.05	0.08	0.10	0.06	0.15	0.09	0.06	0.13	0.19	0.15	0.08	0.05	0.16	0.16	0.06	0.12	0.10	0.06	0.07	0.05
C4'	0.06	0.09	0.21	0.14	0.05	0.11	0.06	0.18	0.06	0.09	0.07	0.15	0.06	0.09	0.07	0.09	0.14	0.07	0.05	0.08	0.04	0.07	0.03
C5	0.08	0.14	0.06	0.06	0.07	0.08	0.05	0.10	0.09	0.06	0.12	0.17	0.13	0.08	0.05	0.09	0.14	0.06	0.11	0.11	0.06	0.08	0.05
C5'	0.10	0.07	0.28	0.16	0.09	0.12	0.09	0.15	0.08	0.12	0.07	0.11	0.08	0.12	0.10	0.20	0.14	0.09	0.06	0.10	0.08	0.11	0.07
C6	0.12	0.15	0.14	0.10	0.10	0.08	0.07	0.10	0.10	0.04	0.13	0.17	0.14	0.06	0.07	0.15	0.14	0.07	0.12	0.11	0.07	0.08	0.06
C8	0.06	0.12	0.12	0.06	0.06	0.08	0.07	0.11	0.08	0.11	0.10	0.16	0.10	0.11	0.07	0.10	0.14	0.08	0.09	0.10	0.06	0.10	0.06
N1	0.16	0.16	0.22	0.11	0.12	0.09	0.09	0.13	0.11	0.05	0.14	0.18	0.16	0.07	0.11	0.30	0.15	0.08	0.14	0.12	0.09	0.08	0.07
N2	0.21	0.18	0.29	0.11	0.15	0.12	0.11	0.18	0.12	0.09	0.15	0.21	0.19	0.09	0.14	0.50	0.18	0.09	0.17	0.12	0.13	0.09	0.10
N3	0.15	0.17	0.15	0.07	0.11	0.12	0.08	0.19	0.10	0.06	0.14	0.20	0.17	0.07	0.09	0.31	0.18	0.07	0.15	0.11	0.09	0.07	0.07
N7	0.07	0.13	0.08	0.06	0.07	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.11	0.15	0.11	0.11	0.06	0.10	0.13	0.07	0.10	0.11	0.06	0.10	0.07
N9	0.06	0.14	0.06	0.05	0.06	0.10	0.06	0.15	0.08	0.09	0.11	0.18	0.12	0.09	0.04	0.07	0.15	0.06	0.11	0.10	0.04	0.07	0.04
O2'	0.12	0.17	0.13	0.17	0.12	0.18	0.11	0.30	0.12	0.13	0.14	0.21	0.16	0.13	0.12	0.19	0.19	0.12	0.14	0.13	0.09	0.08	0.08
O3'	0.08	0.10	0.26	0.18	0.04	0.11	0.05	0.18	0.07	0.08	0.10	0.17	0.06	0.07	0.07	0.11	0.13	0.08	0.01	0.08	0.02	0.03	0.00
O4'	0.04	0.11	0.14	0.10	0.04	0.11	0.05	0.19	0.07	0.09	0.09	0.17	0.08	0.09	0.05	0.05	0.15	0.06	0.07	0.10	0.02	0.06	0.01
O5'	0.13	0.08	0.31	0.15	0.12	0.12	0.12	0.12	0.11	0.15	0.08	0.09	0.10	0.14	0.13	0.28	0.15	0.11	0.08	0.12	0.07	0.10	0.07
O6	0.11	0.14	0.14	0.12	0.09	0.08	0.07	0.09	0.10	0.04	0.13	0.15	0.13	0.05	0.07	0.11	0.12	0.08	0.12	0.12	0.07	0.09	0.07
OP1	0.17	0.16	0.37	0.16	0.17	0.11	0.17	0.09	0.17	0.17	0.17	0.16	0.17	0.17	0.17	0.40	0.13	0.13	0.09	0.18	0.11	0.12	0.09
OP2	0.17	0.15	0.35	0.13	0.18	0.11	0.19	0.10	0.19	0.20	0.16	0.13	0.16	0.20	0.18	0.42	0.14	0.13	0.10	0.19	0.08	0.10	0.08
P	0.15	0.13	0.34	0.14	0.16	0.11	0.16	0.10	0.16	0.17	0.13	0.12	0.14	0.17	0.16	0.36	0.14	0.12	0.08	0.16	0.08	0.10	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.05	0.01	0.05	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.23	0.09	0.00	0.14	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.06	0.12	0.12	0.01	0.08	0.08	0.09
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.06	0.08	0.11	0.10	0.18	0.27	0.22	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.27	0.08	0.25	0.31	0.28
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.14	0.14	0.12	0.07	0.07	0.16	0.10	0.02	0.01	0.01	0.16	0.16	0.15	0.07	0.14
C4	0.01	0.00	0.12	0.11	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.03	0.06	0.07	0.01	0.05	0.07	0.05
C4'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.13	0.15	0.13	0.05	0.05	0.14	0.03	0.00	0.01	0.11	0.05	0.08	0.02
C5	0.00	0.01	0.06	0.14	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.03	0.03	0.08	0.01	0.06	0.07	0.05
C5'	0.02	0.22	0.08	0.01	0.14	0.01	0.15	0.00	0.18	0.06	0.21	0.24	0.19	0.10	0.08	0.06	0.07	0.02	0.00	0.19	0.04	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.14	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.31	0.05	0.05	0.10	0.00	0.07	0.08	0.07
C8	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.05	0.06	0.01	0.05	0.08	0.05
N1	0.01	0.00	0.18	0.12	0.01	0.13	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.06	0.09	0.12	0.01	0.09	0.08	0.09
N2	0.02	0.00	0.27	0.07	0.01	0.15	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.07	0.14	0.14	0.01	0.10	0.09	0.12
N3	0.02	0.00	0.22	0.07	0.00	0.13	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.04	0.12	0.10	0.01	0.06	0.07	0.06
N7	0.00	0.01	0.05	0.16	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.03	0.03	0.07	0.01	0.05	0.07	0.05
N9	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05
O2'	0.01	0.34	0.00	0.02	0.25	0.14	0.25	0.06	0.31	0.08	0.35	0.36	0.30	0.16	0.13	0.00	0.03	0.09	0.14	0.31	0.12	0.28	0.17
O3'	0.17	0.06	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.07	0.05	0.06	0.06	0.07	0.04	0.03	0.07	0.03	0.00	0.11	0.08	0.06	0.07	0.06	0.04
O4'	0.00	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.09	0.14	0.12	0.03	0.01	0.09	0.11	0.00	0.10	0.05	0.10	0.12	0.09
O5'	0.05	0.12	0.27	0.16	0.07	0.01	0.08	0.00	0.10	0.06	0.12	0.14	0.10	0.07	0.05	0.14	0.08	0.10	0.00	0.10	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.06	0.05	0.10	0.00	0.08	0.08	0.08
OP1	0.05	0.08	0.25	0.15	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.09	0.10	0.06	0.05	0.05	0.12	0.07	0.10	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.08	0.31	0.07	0.07	0.08	0.07	0.14	0.08	0.08	0.08	0.09	0.07	0.07	0.08	0.28	0.06	0.12	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.28	0.14	0.05	0.02	0.05	0.01	0.07	0.05	0.09	0.12	0.06	0.05	0.05	0.17	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00