Doublet Group distance statistics: 55410

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 5, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.023 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.003, 0.028, 0.053, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.028 std_dev=0.025
N7	A	0, -0.003, 0.029, 0.061, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.029 std_dev=0.032
C8	A	0, -0.002, 0.037, 0.075, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.037 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.013, 0.066, 0.119, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.066 std_dev=0.053
C4'	A	0, 0.026, 0.113, 0.199, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.113 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.029, 0.122, 0.215, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.122 std_dev=0.093
C3'	A	0, 0.041, 0.164, 0.286, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.164 std_dev=0.123
O2'	A	0, 0.081, 0.213, 0.345, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.213 std_dev=0.132
C5'	A	0, 0.057, 0.225, 0.393, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.225 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.212, 0.387, 0.561, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.387 std_dev=0.174
C5	B	0, 0.247, 0.427, 0.607, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.427 std_dev=0.180
C2	B	0, 0.243, 0.428, 0.613, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.428 std_dev=0.185
N3	B	0, 0.147, 0.337, 0.527, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.337 std_dev=0.190
C6	B	0, 0.184, 0.386, 0.588, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.386 std_dev=0.202
N9	B	0, 0.381, 0.588, 0.795, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.588 std_dev=0.207
O6	B	0, 0.279, 0.488, 0.696, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.488 std_dev=0.208
O5'	A	0, 0.099, 0.309, 0.520, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.309 std_dev=0.211
N1	B	0, 0.215, 0.430, 0.645, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.430 std_dev=0.215
P	A	0, 0.145, 0.363, 0.581, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.363 std_dev=0.218
O3'	A	0, 0.058, 0.292, 0.527, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.292 std_dev=0.235
N7	B	0, 0.395, 0.639, 0.883, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.639 std_dev=0.244
OP2	A	0, 0.149, 0.401, 0.654, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.401 std_dev=0.253
C8	B	0, 0.477, 0.737, 0.998, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.737 std_dev=0.260
OP1	A	0, 0.155, 0.426, 0.698, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.426 std_dev=0.271
C1'	B	0, 0.392, 0.665, 0.939, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.665 std_dev=0.274
N2	B	0, 0.339, 0.616, 0.893, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.616 std_dev=0.277
C3'	B	0, 0.254, 0.636, 1.018, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.636 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.372, 0.764, 1.156, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.764 std_dev=0.392
O5'	B	0, 0.296, 0.759, 1.223, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.759 std_dev=0.463
C4'	B	0, 0.218, 0.748, 1.278, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.748 std_dev=0.530
O4'	B	0, 0.322, 0.855, 1.388, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.855 std_dev=0.533
OP2	B	0, 0.388, 0.926, 1.463, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.926 std_dev=0.537
P	B	0, 0.088, 0.640, 1.191, 2.271 max_d=2.271 avg_d=0.640 std_dev=0.551
C5'	B	0, 0.399, 1.016, 1.633, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.016 std_dev=0.617
O3'	B	0, 0.705, 1.402, 2.099, 2.611 max_d=2.611 avg_d=1.402 std_dev=0.697
O2'	B	0, 0.916, 1.920, 2.924, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.920 std_dev=1.004
OP1	B	0, 0.226, 1.320, 2.413, 4.279 max_d=4.279 avg_d=1.320 std_dev=1.093

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.01	0.12	0.01	0.15	0.26	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.08	0.05	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.05	0.06	0.05	0.10	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.08	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.12	0.00	0.15	0.24	0.19
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.03	0.02	0.02	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.15	0.00	0.20	0.29	0.23
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.05	0.12	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.11	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.02	0.16	0.00	0.22	0.31	0.25
C8	0.00	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.01	0.15	0.01	0.18	0.23	0.20
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.14	0.01	0.19	0.30	0.23
N2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.10	0.01	0.12	0.01	0.14	0.26	0.19
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.07	0.01	0.11	0.01	0.12	0.23	0.17
N7	0.00	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.17	0.01	0.23	0.30	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.01	0.12	0.19	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.08	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.03	0.07	0.12	0.04	0.03
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.03	0.07	0.12	0.05	0.10	0.07	0.13	0.05	0.06	0.00	0.02	0.07	0.10	0.23	0.19	0.15
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.09	0.07
O5'	0.05	0.12	0.03	0.02	0.12	0.01	0.15	0.01	0.16	0.15	0.14	0.12	0.11	0.17	0.11	0.03	0.07	0.02	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.17	0.00	0.26	0.34	0.27
OP1	0.05	0.15	0.08	0.12	0.15	0.08	0.20	0.05	0.22	0.18	0.19	0.14	0.12	0.23	0.12	0.12	0.23	0.03	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.26	0.05	0.08	0.24	0.02	0.29	0.01	0.31	0.23	0.30	0.26	0.23	0.30	0.19	0.04	0.19	0.09	0.01	0.34	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.20	0.03	0.05	0.19	0.01	0.23	0.01	0.25	0.20	0.23	0.19	0.17	0.25	0.15	0.03	0.15	0.07	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.28	0.26	0.24	0.24	0.41	0.19	0.46	0.20	0.24	0.22	0.39	0.30	0.21	0.27	0.20	0.55	0.52	0.38	0.26	0.33	0.68	0.20
C2	0.31	0.18	0.36	0.25	0.12	0.35	0.10	0.36	0.17	0.16	0.20	0.23	0.15	0.11	0.19	0.37	0.53	0.45	0.35	0.20	0.48	0.61	0.24
C2'	0.28	0.23	0.26	0.24	0.21	0.43	0.18	0.51	0.20	0.22	0.18	0.36	0.27	0.20	0.24	0.29	0.57	0.52	0.40	0.27	0.31	0.72	0.18
C3'	0.28	0.32	0.20	0.24	0.25	0.42	0.22	0.52	0.23	0.23	0.25	0.47	0.32	0.22	0.25	0.17	0.57	0.51	0.38	0.30	0.29	0.70	0.19
C4	0.33	0.24	0.25	0.21	0.19	0.35	0.14	0.39	0.17	0.21	0.22	0.31	0.25	0.15	0.25	0.14	0.50	0.46	0.32	0.22	0.33	0.65	0.20
C4'	0.31	0.35	0.21	0.24	0.28	0.41	0.25	0.49	0.27	0.27	0.30	0.47	0.34	0.26	0.28	0.12	0.54	0.51	0.38	0.32	0.28	0.68	0.18
C5	0.30	0.24	0.17	0.15	0.16	0.26	0.13	0.30	0.20	0.20	0.25	0.29	0.21	0.14	0.23	0.19	0.41	0.37	0.25	0.24	0.25	0.64	0.19
C5'	0.36	0.43	0.20	0.26	0.35	0.43	0.33	0.52	0.35	0.33	0.39	0.53	0.41	0.33	0.35	0.12	0.55	0.53	0.40	0.37	0.27	0.62	0.19
C6	0.26	0.22	0.17	0.12	0.10	0.18	0.14	0.22	0.23	0.15	0.26	0.25	0.15	0.12	0.16	0.29	0.34	0.28	0.21	0.26	0.26	0.63	0.19
C8	0.31	0.32	0.16	0.17	0.24	0.31	0.19	0.37	0.21	0.26	0.28	0.41	0.30	0.22	0.27	0.16	0.44	0.42	0.28	0.25	0.24	0.65	0.19
N1	0.27	0.20	0.30	0.18	0.10	0.25	0.13	0.26	0.20	0.14	0.23	0.24	0.13	0.12	0.15	0.17	0.42	0.34	0.26	0.23	0.38	0.61	0.21
N2	0.29	0.17	0.43	0.30	0.11	0.39	0.10	0.39	0.16	0.16	0.19	0.23	0.12	0.11	0.18	0.60	0.56	0.46	0.40	0.19	0.63	0.58	0.30
N3	0.33	0.19	0.33	0.26	0.17	0.39	0.12	0.42	0.16	0.19	0.20	0.26	0.21	0.13	0.23	0.33	0.55	0.50	0.37	0.20	0.44	0.63	0.24
N7	0.29	0.29	0.12	0.13	0.20	0.24	0.16	0.31	0.22	0.24	0.28	0.35	0.25	0.19	0.24	0.29	0.38	0.34	0.24	0.26	0.23	0.65	0.19
N9	0.32	0.29	0.22	0.21	0.24	0.36	0.18	0.42	0.19	0.24	0.24	0.39	0.30	0.20	0.27	0.11	0.50	0.48	0.33	0.24	0.29	0.66	0.19
O2'	0.28	0.16	0.31	0.26	0.20	0.45	0.18	0.53	0.20	0.22	0.16	0.23	0.23	0.20	0.24	0.42	0.58	0.54	0.44	0.27	0.35	0.75	0.18
O3'	0.24	0.26	0.20	0.24	0.20	0.43	0.18	0.54	0.21	0.18	0.20	0.40	0.27	0.19	0.20	0.23	0.59	0.50	0.39	0.30	0.33	0.72	0.20
O4'	0.32	0.32	0.22	0.22	0.26	0.39	0.23	0.45	0.24	0.26	0.27	0.44	0.32	0.25	0.28	0.12	0.52	0.50	0.36	0.30	0.30	0.68	0.18
O5'	0.40	0.48	0.23	0.30	0.40	0.45	0.37	0.54	0.38	0.37	0.44	0.55	0.45	0.36	0.39	0.24	0.55	0.54	0.42	0.39	0.26	0.56	0.20
O6	0.21	0.23	0.10	0.11	0.12	0.08	0.20	0.13	0.28	0.14	0.28	0.25	0.15	0.17	0.10	0.58	0.22	0.14	0.15	0.31	0.23	0.62	0.21
OP1	0.44	0.46	0.30	0.34	0.44	0.48	0.44	0.60	0.43	0.46	0.44	0.51	0.45	0.46	0.44	0.37	0.58	0.55	0.45	0.45	0.28	0.52	0.20
OP2	0.49	0.49	0.38	0.38	0.47	0.49	0.44	0.58	0.42	0.48	0.46	0.52	0.49	0.45	0.48	0.56	0.60	0.54	0.47	0.39	0.26	0.46	0.23
P	0.46	0.49	0.31	0.34	0.44	0.47	0.42	0.57	0.41	0.44	0.46	0.54	0.48	0.43	0.45	0.42	0.58	0.55	0.45	0.40	0.25	0.50	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.00	0.00	0.03	0.28	0.00	0.08	0.02	0.30	0.84	0.38
C2	0.04	0.00	0.22	0.04	0.01	0.18	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.34	0.41	0.25	0.22	0.00	0.49	0.99	0.41
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.01	0.06	0.19	0.11	0.12	0.18	0.28	0.21	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.18	0.08	0.24	0.45	0.13
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.14	0.03	0.12	0.21	0.07	0.07	0.04	0.21	0.10	0.01	0.01	0.02	0.20	0.15	0.36	0.32	0.17
C4	0.02	0.01	0.12	0.07	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.27	0.14	0.09	0.01	0.44	0.86	0.37
C4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.13	0.14	0.22	0.17	0.09	0.03	0.22	0.03	0.00	0.01	0.08	0.14	0.49	0.19
C5	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.17	0.07	0.11	0.01	0.51	0.78	0.36
C5'	0.07	0.32	0.19	0.03	0.21	0.01	0.20	0.00	0.26	0.14	0.30	0.35	0.28	0.16	0.12	0.07	0.17	0.01	0.01	0.26	0.16	0.14	0.03
C6	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.09	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.22	0.12	0.15	0.00	0.55	0.81	0.36
C8	0.01	0.01	0.12	0.21	0.00	0.13	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.04	0.12	0.18	0.01	0.47	0.68	0.38
N1	0.03	0.00	0.18	0.07	0.01	0.14	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.33	0.20	0.20	0.00	0.53	0.91	0.39
N2	0.05	0.00	0.28	0.07	0.01	0.22	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.49	0.49	0.29	0.28	0.01	0.50	1.07	0.44
N3	0.03	0.01	0.21	0.04	0.00	0.17	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.34	0.41	0.25	0.17	0.01	0.43	0.98	0.39
N7	0.00	0.00	0.07	0.21	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.03	0.06	0.16	0.01	0.52	0.67	0.36
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.17	0.01	0.08	0.01	0.40	0.80	0.37
O2'	0.03	0.34	0.00	0.01	0.10	0.22	0.12	0.07	0.09	0.38	0.20	0.49	0.34	0.33	0.12	0.00	0.05	0.14	0.25	0.12	0.32	0.74	0.39
O3'	0.28	0.41	0.03	0.01	0.27	0.03	0.17	0.17	0.22	0.04	0.33	0.49	0.41	0.03	0.17	0.05	0.00	0.19	0.08	0.17	0.45	0.47	0.21
O4'	0.00	0.25	0.02	0.02	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.12	0.20	0.29	0.25	0.06	0.01	0.14	0.19	0.00	0.15	0.09	0.42	0.87	0.44
O5'	0.08	0.22	0.18	0.20	0.09	0.01	0.11	0.01	0.15	0.18	0.20	0.28	0.17	0.16	0.08	0.25	0.08	0.15	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.00	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.09	0.16	0.00	0.58	0.75	0.36
OP1	0.30	0.49	0.24	0.36	0.44	0.14	0.51	0.16	0.55	0.47	0.53	0.50	0.43	0.52	0.40	0.32	0.45	0.42	0.02	0.58	0.00	0.01	0.01
OP2	0.84	0.99	0.45	0.32	0.86	0.49	0.78	0.14	0.81	0.68	0.91	1.07	0.98	0.67	0.80	0.74	0.47	0.87	0.02	0.75	0.01	0.00	0.00
P	0.38	0.41	0.13	0.17	0.37	0.19	0.36	0.03	0.36	0.38	0.39	0.44	0.39	0.36	0.37	0.39	0.21	0.44	0.01	0.36	0.01	0.00	0.00