Doublet Group distance statistics: 55415

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.017, 0.035, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.035 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.011, 0.040, 0.069, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.040 std_dev=0.029
C5	B	0, 0.265, 0.549, 0.834, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.549 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.201, 0.496, 0.791, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.496 std_dev=0.295
O6	B	0, 0.190, 0.500, 0.809, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.500 std_dev=0.309
N7	B	0, 0.367, 0.709, 1.051, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.709 std_dev=0.342
C4	B	0, 0.271, 0.648, 1.024, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.648 std_dev=0.376
N9	B	0, 0.483, 0.860, 1.237, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.860 std_dev=0.377
C8	B	0, 0.467, 0.892, 1.317, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.892 std_dev=0.425
N3	B	0, 0.284, 0.730, 1.176, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.730 std_dev=0.446
C1'	B	0, 0.605, 1.066, 1.528, 1.446 max_d=1.446 avg_d=1.066 std_dev=0.462
C2'	A	0, -0.138, 0.326, 0.791, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.326 std_dev=0.464
N1	B	0, 0.112, 0.603, 1.094, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.603 std_dev=0.491
O4'	A	0, -0.197, 0.300, 0.796, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.300 std_dev=0.497
C2	B	0, 0.237, 0.739, 1.241, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.739 std_dev=0.502
C2'	B	0, 0.654, 1.171, 1.689, 1.631 max_d=1.631 avg_d=1.171 std_dev=0.518
O4'	B	0, 0.680, 1.206, 1.731, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.206 std_dev=0.526
C3'	B	0, 0.701, 1.292, 1.884, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.292 std_dev=0.591
O2'	B	0, 0.743, 1.362, 1.980, 1.911 max_d=1.911 avg_d=1.362 std_dev=0.619
C4'	B	0, 0.755, 1.382, 2.009, 2.192 max_d=2.192 avg_d=1.382 std_dev=0.627
N2	B	0, 0.318, 0.982, 1.646, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.982 std_dev=0.664
C3'	A	0, -0.176, 0.488, 1.153, 2.094 max_d=2.094 avg_d=0.488 std_dev=0.664
O5'	B	0, 0.685, 1.370, 2.055, 2.451 max_d=2.451 avg_d=1.370 std_dev=0.685
O3'	B	0, 0.777, 1.474, 2.170, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.474 std_dev=0.697
C5'	B	0, 0.770, 1.483, 2.196, 2.583 max_d=2.583 avg_d=1.483 std_dev=0.713
OP2	B	0, 0.517, 1.238, 1.958, 2.506 max_d=2.506 avg_d=1.238 std_dev=0.720
C4'	A	0, -0.280, 0.487, 1.254, 2.348 max_d=2.348 avg_d=0.487 std_dev=0.767
P	B	0, 0.656, 1.429, 2.202, 2.797 max_d=2.797 avg_d=1.429 std_dev=0.773
O2'	A	0, -0.267, 0.517, 1.300, 2.417 max_d=2.417 avg_d=0.517 std_dev=0.783
O3'	A	0, -0.091, 0.706, 1.502, 2.609 max_d=2.609 avg_d=0.706 std_dev=0.797
OP1	B	0, 0.827, 1.738, 2.649, 3.174 max_d=3.174 avg_d=1.738 std_dev=0.911
C5'	A	0, -0.393, 0.750, 1.892, 3.516 max_d=3.516 avg_d=0.750 std_dev=1.143
O5'	A	0, -0.779, 1.048, 2.875, 5.502 max_d=5.502 avg_d=1.048 std_dev=1.827
P	A	0, -1.263, 1.468, 4.200, 8.145 max_d=8.145 avg_d=1.468 std_dev=2.731
OP1	A	0, -1.385, 1.574, 4.533, 8.807 max_d=8.807 avg_d=1.574 std_dev=2.959
OP2	A	0, -1.576, 1.704, 4.983, 9.725 max_d=9.725 avg_d=1.704 std_dev=3.279

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.10	0.01	0.29	0.24	0.05
C2	0.02	0.00	0.29	0.16	0.01	0.17	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.16	0.29	0.19	0.00	0.54	0.14	0.36
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.16	0.02	0.08	0.12	0.13	0.14	0.23	0.35	0.28	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.10	0.27	0.23	0.04
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.20	0.00	0.29	0.02	0.29	0.30	0.23	0.12	0.12	0.34	0.19	0.03	0.01	0.02	0.30	0.33	0.22	0.30	0.10
C4	0.01	0.01	0.16	0.20	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.15	0.12	0.01	0.16	0.47	0.10
C4'	0.00	0.17	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.04	0.25	0.08	0.25	0.17	0.22	0.08	0.26	0.02	0.00	0.01	0.09	0.42	0.08	0.20
C5	0.00	0.00	0.08	0.29	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.11	0.05	0.35	0.01	0.24	0.89	0.43
C5'	0.04	0.22	0.12	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.05	0.29	0.11	0.32	0.22	0.27	0.06	0.12	0.16	0.01	0.01	0.12	0.08	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.29	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.10	0.10	0.27	0.00	0.17	0.82	0.34
C8	0.01	0.00	0.14	0.30	0.00	0.25	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.42	0.19	0.18	0.70	0.01	0.58	1.21	0.83
N1	0.01	0.00	0.23	0.23	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.21	0.06	0.00	0.24	0.43	0.11
N2	0.02	0.00	0.35	0.12	0.01	0.25	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.24	0.35	0.36	0.01	0.82	0.26	0.64
N3	0.01	0.00	0.28	0.12	0.00	0.17	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.19	0.29	0.19	0.00	0.57	0.11	0.37
N7	0.00	0.00	0.07	0.34	0.00	0.22	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.22	0.11	0.67	0.01	0.65	1.34	0.87
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.06	0.01	0.29	0.01	0.06	0.61	0.27
O2'	0.01	0.18	0.00	0.03	0.06	0.26	0.23	0.12	0.17	0.42	0.06	0.32	0.20	0.41	0.18	0.00	0.07	0.18	0.25	0.25	0.15	0.29	0.11
O3'	0.20	0.16	0.02	0.01	0.07	0.02	0.11	0.16	0.10	0.19	0.08	0.24	0.19	0.22	0.06	0.07	0.00	0.13	0.32	0.16	0.26	0.26	0.11
O4'	0.00	0.29	0.01	0.02	0.15	0.00	0.05	0.01	0.10	0.18	0.21	0.35	0.29	0.11	0.01	0.18	0.13	0.00	0.04	0.06	0.35	0.05	0.16
O5'	0.10	0.19	0.12	0.30	0.12	0.01	0.35	0.01	0.27	0.70	0.06	0.36	0.19	0.67	0.29	0.25	0.32	0.04	0.00	0.39	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.10	0.33	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.16	0.06	0.39	0.00	0.38	1.07	0.54
OP1	0.29	0.54	0.27	0.22	0.16	0.42	0.24	0.08	0.17	0.58	0.24	0.82	0.57	0.65	0.06	0.15	0.26	0.35	0.01	0.38	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.14	0.23	0.30	0.47	0.08	0.89	0.07	0.82	1.21	0.43	0.26	0.11	1.34	0.61	0.29	0.26	0.05	0.02	1.07	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.36	0.04	0.10	0.10	0.20	0.43	0.01	0.34	0.83	0.11	0.64	0.37	0.87	0.27	0.11	0.11	0.16	0.00	0.54	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.30	0.33	0.31	0.27	0.30	0.28	0.29	0.34	0.29	0.37	0.31	0.25	0.28	0.28	0.38	0.31	0.30	0.32	0.39	0.27	0.32	0.27
C2	0.18	0.27	0.25	0.25	0.07	0.23	0.13	0.20	0.28	0.21	0.34	0.32	0.14	0.16	0.14	0.28	0.28	0.20	0.18	0.33	0.18	0.23	0.16
C2'	0.49	0.30	0.55	0.47	0.38	0.46	0.29	0.36	0.18	0.37	0.18	0.29	0.39	0.29	0.42	0.63	0.48	0.45	0.30	0.19	0.22	0.26	0.19
C3'	0.47	0.35	0.46	0.40	0.42	0.43	0.40	0.36	0.35	0.44	0.32	0.29	0.40	0.41	0.45	0.52	0.38	0.46	0.33	0.30	0.25	0.29	0.23
C4	0.26	0.17	0.32	0.31	0.17	0.29	0.16	0.28	0.20	0.25	0.23	0.20	0.14	0.21	0.23	0.35	0.32	0.27	0.29	0.26	0.26	0.29	0.24
C4'	0.33	0.24	0.37	0.35	0.29	0.33	0.28	0.30	0.24	0.32	0.22	0.24	0.27	0.30	0.31	0.43	0.38	0.32	0.32	0.22	0.25	0.27	0.22
C5	0.27	0.10	0.33	0.33	0.17	0.32	0.16	0.31	0.12	0.28	0.13	0.12	0.13	0.23	0.25	0.34	0.35	0.29	0.35	0.18	0.32	0.32	0.30
C5'	0.35	0.28	0.38	0.35	0.33	0.33	0.33	0.30	0.31	0.36	0.28	0.25	0.31	0.36	0.35	0.43	0.40	0.35	0.32	0.32	0.25	0.25	0.21
C6	0.24	0.10	0.30	0.32	0.09	0.30	0.07	0.30	0.14	0.24	0.16	0.14	0.07	0.17	0.20	0.31	0.36	0.27	0.32	0.23	0.31	0.30	0.28
C8	0.32	0.18	0.36	0.35	0.27	0.34	0.29	0.35	0.25	0.34	0.20	0.14	0.23	0.33	0.31	0.38	0.35	0.34	0.39	0.29	0.35	0.37	0.34
N1	0.19	0.20	0.26	0.28	0.06	0.25	0.12	0.23	0.25	0.22	0.26	0.24	0.10	0.18	0.14	0.28	0.32	0.21	0.22	0.32	0.23	0.23	0.18
N2	0.17	0.36	0.21	0.22	0.18	0.20	0.24	0.18	0.34	0.27	0.40	0.42	0.23	0.24	0.18	0.24	0.24	0.19	0.17	0.36	0.17	0.25	0.18
N3	0.21	0.26	0.28	0.27	0.09	0.25	0.10	0.22	0.25	0.20	0.33	0.32	0.13	0.13	0.17	0.32	0.29	0.22	0.22	0.30	0.20	0.25	0.18
N7	0.31	0.14	0.35	0.36	0.24	0.35	0.25	0.36	0.18	0.33	0.13	0.10	0.19	0.31	0.30	0.37	0.36	0.34	0.41	0.18	0.37	0.38	0.36
N9	0.30	0.21	0.34	0.32	0.24	0.31	0.25	0.31	0.27	0.30	0.26	0.20	0.21	0.28	0.28	0.37	0.33	0.30	0.34	0.32	0.29	0.32	0.28
O2'	0.32	0.19	0.42	0.36	0.29	0.34	0.41	0.32	0.54	0.37	0.41	0.11	0.21	0.45	0.31	0.54	0.42	0.32	0.38	0.76	0.35	0.49	0.40
O3'	0.36	0.32	0.42	0.37	0.32	0.35	0.27	0.29	0.23	0.29	0.26	0.35	0.35	0.26	0.33	0.51	0.42	0.34	0.29	0.19	0.18	0.26	0.15
O4'	0.36	0.36	0.42	0.42	0.34	0.39	0.32	0.39	0.32	0.33	0.36	0.39	0.35	0.32	0.34	0.45	0.46	0.36	0.42	0.30	0.38	0.39	0.36
O5'	0.42	0.37	0.37	0.32	0.46	0.35	0.54	0.31	0.57	0.54	0.46	0.30	0.39	0.60	0.47	0.42	0.38	0.44	0.33	0.67	0.23	0.28	0.25
O6	0.24	0.08	0.31	0.35	0.10	0.32	0.08	0.34	0.13	0.24	0.13	0.11	0.07	0.17	0.19	0.31	0.39	0.28	0.37	0.23	0.38	0.34	0.33
OP1	0.45	0.48	0.64	0.59	0.41	0.47	0.42	0.38	0.45	0.41	0.41	0.60	0.48	0.47	0.40	0.78	0.78	0.41	0.37	0.58	0.22	0.22	0.19
OP2	0.66	0.57	0.41	0.37	0.78	0.56	0.98	0.63	1.02	1.01	0.77	0.39	0.59	1.13	0.81	0.38	0.26	0.76	0.71	1.25	0.69	0.87	0.80
P	0.35	0.33	0.44	0.40	0.38	0.33	0.50	0.28	0.54	0.50	0.38	0.37	0.34	0.60	0.39	0.56	0.58	0.37	0.31	0.73	0.22	0.32	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.00	0.09	0.26	0.07
C2	0.01	0.00	0.10	0.12	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.05	0.18	0.00	0.13	0.32	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.09	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.10	0.22	0.07
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.12	0.13	0.10	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.12	0.16	0.07
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.19	0.00	0.12	0.31	0.13
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.16	0.04
C5	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.22	0.01	0.17	0.32	0.16
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.06	0.04	0.03	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.21	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.02	0.23	0.00	0.19	0.33	0.18
C8	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.22	0.01	0.13	0.31	0.14
N1	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.04	0.21	0.00	0.17	0.33	0.16
N2	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.06	0.18	0.01	0.12	0.31	0.12
N3	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.05	0.17	0.00	0.11	0.30	0.12
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.23	0.01	0.18	0.32	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.18	0.01	0.10	0.29	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.07	0.08	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.06	0.13	0.21	0.07
O3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.15	0.04	0.17	0.17	0.13	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.14	0.16	0.15	0.13	0.07
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.12	0.02	0.12	0.24	0.05
O5'	0.11	0.18	0.03	0.06	0.19	0.01	0.22	0.00	0.23	0.22	0.21	0.18	0.17	0.23	0.18	0.03	0.14	0.12	0.00	0.24	0.01	0.02	0.01
O6	0.00	0.00	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.24	0.00	0.23	0.33	0.20
OP1	0.09	0.13	0.10	0.12	0.12	0.17	0.17	0.21	0.19	0.13	0.17	0.12	0.11	0.18	0.10	0.13	0.15	0.12	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.32	0.22	0.16	0.31	0.16	0.32	0.08	0.33	0.31	0.33	0.31	0.30	0.32	0.29	0.21	0.13	0.24	0.02	0.33	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.13	0.07	0.07	0.13	0.04	0.16	0.01	0.18	0.14	0.16	0.12	0.12	0.17	0.11	0.07	0.07	0.05	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00