Doublet Group distance statistics: 55416

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.012, 0.029, 0.047, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.021, 0.039, 0.058, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.039 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.019, 0.049, 0.079, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.049 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.030, 0.065, 0.101, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.065 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.028, 0.072, 0.116, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.072 std_dev=0.044
O2'	A	0, 0.051, 0.123, 0.195, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.123 std_dev=0.072
N1	B	0, 0.090, 0.177, 0.264, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.177 std_dev=0.087
C3'	A	0, 0.041, 0.129, 0.218, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.129 std_dev=0.088
C4'	A	0, 0.032, 0.122, 0.213, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.122 std_dev=0.091
O5'	A	0, 0.056, 0.156, 0.255, 0.279 max_d=0.279 avg_d=0.156 std_dev=0.100
P	A	0, 0.122, 0.227, 0.332, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.227 std_dev=0.105
C6	B	0, 0.089, 0.195, 0.302, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.195 std_dev=0.107
C5'	A	0, 0.024, 0.145, 0.265, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.145 std_dev=0.121
C2	B	0, 0.112, 0.253, 0.394, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.253 std_dev=0.141
OP2	A	0, 0.163, 0.305, 0.446, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.305 std_dev=0.141
C3'	B	0, 0.146, 0.287, 0.429, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.287 std_dev=0.141
O6	B	0, 0.103, 0.250, 0.398, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.250 std_dev=0.148
C5	B	0, 0.097, 0.245, 0.393, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.245 std_dev=0.148
O3'	A	0, 0.071, 0.220, 0.369, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.220 std_dev=0.149
O3'	B	0, 0.171, 0.321, 0.471, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.321 std_dev=0.150
O5'	B	0, 0.096, 0.249, 0.403, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.249 std_dev=0.154
OP1	A	0, 0.129, 0.292, 0.455, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.292 std_dev=0.163
C4	B	0, 0.110, 0.280, 0.450, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.280 std_dev=0.170
N2	B	0, 0.148, 0.318, 0.489, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.318 std_dev=0.170
P	B	0, 0.095, 0.272, 0.449, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.272 std_dev=0.177
C2'	B	0, 0.147, 0.329, 0.510, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.329 std_dev=0.181
N3	B	0, 0.126, 0.310, 0.493, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.310 std_dev=0.184
N9	B	0, 0.127, 0.313, 0.499, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.313 std_dev=0.186
C1'	B	0, 0.145, 0.331, 0.517, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.331 std_dev=0.186
N7	B	0, 0.101, 0.288, 0.476, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.288 std_dev=0.187
C8	B	0, 0.125, 0.329, 0.533, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.329 std_dev=0.204
OP1	B	0, 0.126, 0.349, 0.573, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.349 std_dev=0.223
O4'	B	0, 0.143, 0.367, 0.592, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.367 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.138, 0.377, 0.615, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.377 std_dev=0.239
OP2	B	0, 0.082, 0.349, 0.615, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.349 std_dev=0.267
O2'	B	0, 0.214, 0.515, 0.815, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.515 std_dev=0.300
C5'	B	0, 0.106, 0.516, 0.927, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.516 std_dev=0.411

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.02	0.07	0.13	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.12	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.14	0.08
C5'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.02	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.06	0.00	0.10	0.14	0.09
C8	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.12	0.07
N1	0.02	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.02	0.06	0.02	0.09	0.14	0.08
N2	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.13	0.08
N3	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.12	0.07
N7	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.09	0.15	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.11	0.06
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02
O3'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.08	0.05	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.02	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.04
O5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.04	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.08	0.03	0.07	0.00	0.11	0.15	0.10
OP1	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.10	0.06	0.09	0.08	0.05	0.09	0.04	0.03	0.05	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.13	0.05	0.03	0.12	0.04	0.14	0.02	0.14	0.12	0.14	0.13	0.12	0.15	0.11	0.04	0.02	0.07	0.03	0.15	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.02	0.02	0.07	0.02	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.06	0.02	0.04	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.02	0.03	0.14	0.06	0.16	0.08	0.33	0.08	0.10	0.04	0.05	0.02	0.10	0.08	0.10	0.15	0.06	0.11	0.09	0.04	0.07	0.02
C2	0.06	0.07	0.03	0.11	0.05	0.21	0.08	0.27	0.08	0.09	0.05	0.10	0.09	0.10	0.06	0.03	0.09	0.18	0.03	0.11	0.02	0.17	0.06
C2'	0.06	0.02	0.04	0.16	0.06	0.16	0.07	0.35	0.06	0.09	0.03	0.05	0.03	0.08	0.08	0.09	0.18	0.06	0.10	0.06	0.07	0.04	0.03
C3'	0.04	0.03	0.07	0.19	0.05	0.13	0.04	0.29	0.03	0.06	0.03	0.05	0.04	0.05	0.06	0.06	0.22	0.05	0.07	0.03	0.01	0.04	0.01
C4	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.18	0.07	0.27	0.07	0.08	0.03	0.09	0.06	0.09	0.05	0.05	0.12	0.13	0.06	0.10	0.01	0.15	0.05
C4'	0.04	0.03	0.06	0.19	0.05	0.14	0.05	0.31	0.04	0.07	0.03	0.06	0.03	0.06	0.06	0.08	0.22	0.05	0.07	0.04	0.03	0.06	0.02
C5	0.04	0.08	0.05	0.13	0.03	0.17	0.04	0.22	0.05	0.03	0.02	0.12	0.10	0.06	0.01	0.03	0.12	0.15	0.04	0.09	0.04	0.18	0.07
C5'	0.04	0.05	0.08	0.20	0.05	0.13	0.05	0.25	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.23	0.06	0.06	0.05	0.09	0.08	0.05
C6	0.09	0.11	0.07	0.12	0.08	0.18	0.02	0.20	0.04	0.01	0.04	0.13	0.14	0.03	0.06	0.06	0.12	0.18	0.02	0.09	0.05	0.20	0.09
C8	0.02	0.04	0.03	0.12	0.04	0.13	0.07	0.21	0.08	0.07	0.04	0.08	0.04	0.08	0.05	0.04	0.13	0.08	0.09	0.09	0.03	0.14	0.04
N1	0.09	0.10	0.04	0.11	0.08	0.20	0.05	0.22	0.06	0.04	0.05	0.12	0.13	0.07	0.06	0.04	0.10	0.19	0.02	0.10	0.03	0.19	0.08
N2	0.08	0.08	0.06	0.10	0.06	0.22	0.09	0.28	0.09	0.11	0.06	0.10	0.09	0.12	0.08	0.06	0.08	0.18	0.03	0.12	0.03	0.16	0.06
N3	0.04	0.05	0.04	0.12	0.04	0.21	0.08	0.30	0.08	0.10	0.04	0.09	0.06	0.11	0.07	0.07	0.11	0.15	0.06	0.11	0.03	0.14	0.04
N7	0.03	0.07	0.05	0.13	0.03	0.14	0.04	0.19	0.06	0.04	0.03	0.12	0.08	0.06	0.02	0.03	0.13	0.11	0.06	0.09	0.06	0.18	0.07
N9	0.03	0.02	0.01	0.13	0.04	0.16	0.08	0.28	0.08	0.08	0.04	0.08	0.02	0.09	0.06	0.06	0.14	0.09	0.09	0.10	0.01	0.12	0.02
O2'	0.05	0.02	0.03	0.17	0.05	0.17	0.06	0.41	0.04	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.19	0.04	0.08	0.05	0.10	0.02	0.05
O3'	0.04	0.05	0.11	0.22	0.05	0.12	0.04	0.27	0.04	0.05	0.05	0.06	0.06	0.04	0.06	0.06	0.26	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00
O4'	0.05	0.02	0.03	0.16	0.06	0.15	0.08	0.32	0.07	0.09	0.04	0.05	0.03	0.09	0.07	0.09	0.18	0.06	0.09	0.08	0.02	0.07	0.02
O5'	0.05	0.07	0.11	0.21	0.06	0.13	0.06	0.20	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.06	0.06	0.06	0.24	0.08	0.06	0.06	0.13	0.15	0.09
O6	0.12	0.12	0.10	0.13	0.12	0.17	0.05	0.16	0.03	0.06	0.06	0.13	0.16	0.02	0.10	0.11	0.12	0.18	0.02	0.07	0.07	0.22	0.10
OP1	0.07	0.10	0.14	0.22	0.09	0.11	0.09	0.14	0.10	0.08	0.11	0.11	0.09	0.09	0.08	0.08	0.26	0.07	0.08	0.12	0.19	0.14	0.12
OP2	0.07	0.07	0.13	0.18	0.07	0.10	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.20	0.08	0.07	0.09	0.14	0.14	0.09
P	0.05	0.08	0.12	0.20	0.07	0.11	0.07	0.15	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.23	0.07	0.08	0.08	0.16	0.15	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.07	0.03
C2	0.04	0.00	0.10	0.09	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.10	0.04	0.06	0.01	0.08	0.14	0.07
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.03	0.16	0.09
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.06	0.12	0.07	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.21	0.05	0.09	0.20	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.06	0.10	0.05
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.01
C5	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.06	0.01	0.03	0.12	0.05
C5'	0.03	0.11	0.01	0.01	0.14	0.00	0.17	0.00	0.17	0.14	0.15	0.07	0.11	0.17	0.11	0.04	0.02	0.02	0.01	0.19	0.14	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.06	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.04	0.00	0.06	0.14	0.06
C8	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04
N1	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.04	0.01	0.09	0.15	0.08
N2	0.05	0.01	0.11	0.12	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.05	0.05	0.01	0.11	0.16	0.09
N3	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.08	0.04	0.10	0.01	0.07	0.11	0.07
N7	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02	0.05	0.01	0.03	0.12	0.04
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.09	0.04
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.07	0.05	0.00	0.02	0.03	0.02	0.07	0.11	0.07	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.08	0.07	0.14	0.08	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.26	0.06	0.13	0.21	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.11	0.03	0.15	0.04	0.06
O5'	0.06	0.06	0.10	0.21	0.08	0.01	0.06	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.10	0.05	0.07	0.02	0.26	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.02	0.00	0.09	0.16	0.08
OP1	0.09	0.08	0.03	0.09	0.06	0.13	0.03	0.14	0.06	0.06	0.09	0.11	0.07	0.03	0.07	0.11	0.13	0.15	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.14	0.16	0.20	0.10	0.05	0.12	0.05	0.14	0.09	0.15	0.16	0.11	0.12	0.09	0.07	0.21	0.04	0.02	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.09	0.17	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.08	0.09	0.07	0.04	0.04	0.03	0.21	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00