Doublet Group distance statistics: 55419

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.011, 0.028, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.008, 0.025, 0.043, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, -0.001, 0.018, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.006, 0.027, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.007, 0.041, 0.075, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.041 std_dev=0.034
O6	A	0, 0.026, 0.067, 0.108, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.067 std_dev=0.041
N2	A	0, 0.024, 0.074, 0.124, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.074 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.049, 0.129, 0.209, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.129 std_dev=0.080
O4'	A	0, 0.021, 0.141, 0.261, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.141 std_dev=0.120
C3'	A	0, 0.078, 0.199, 0.320, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.199 std_dev=0.121
C4'	A	0, 0.066, 0.198, 0.329, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.198 std_dev=0.132
O3'	A	0, 0.095, 0.264, 0.432, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.264 std_dev=0.168
O2'	A	0, 0.072, 0.274, 0.476, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.274 std_dev=0.202
P	A	0, 0.125, 0.375, 0.624, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.375 std_dev=0.250
C5'	A	0, 0.071, 0.355, 0.638, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.355 std_dev=0.283
C6	B	0, 0.235, 0.560, 0.884, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.560 std_dev=0.325
N1	B	0, 0.232, 0.560, 0.888, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.560 std_dev=0.328
O6	B	0, 0.217, 0.559, 0.901, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.559 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.223, 0.605, 0.988, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.605 std_dev=0.383
C5	B	0, 0.206, 0.595, 0.985, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.595 std_dev=0.389
O5'	A	0, 0.097, 0.507, 0.917, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.507 std_dev=0.410
N2	B	0, 0.236, 0.659, 1.082, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.659 std_dev=0.423
OP1	A	0, 0.012, 0.452, 0.893, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.452 std_dev=0.441
N7	B	0, 0.177, 0.626, 1.075, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.626 std_dev=0.449
P	B	0, 0.097, 0.558, 1.019, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.558 std_dev=0.461
C4	B	0, 0.150, 0.612, 1.075, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.612 std_dev=0.462
OP1	B	0, 0.177, 0.641, 1.104, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.641 std_dev=0.464
N3	B	0, 0.162, 0.630, 1.097, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.630 std_dev=0.468
OP2	A	0, 0.102, 0.590, 1.078, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.590 std_dev=0.488
C8	B	0, 0.091, 0.641, 1.191, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.641 std_dev=0.550
O5'	B	0, 0.225, 0.790, 1.355, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.790 std_dev=0.565
N9	B	0, 0.053, 0.622, 1.192, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.622 std_dev=0.570
O4'	B	0, 0.085, 0.675, 1.265, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.675 std_dev=0.590
C3'	B	0, 0.140, 0.733, 1.326, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.733 std_dev=0.593
OP2	B	0, 0.280, 0.898, 1.516, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.898 std_dev=0.618
O3'	B	0, 0.165, 0.798, 1.432, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.798 std_dev=0.634
C5'	B	0, 0.180, 0.821, 1.462, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.821 std_dev=0.641
C4'	B	0, 0.056, 0.710, 1.365, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.710 std_dev=0.655
C1'	B	0, -0.034, 0.645, 1.323, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.645 std_dev=0.678
C2'	B	0, 0.065, 0.805, 1.545, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.805 std_dev=0.740
O2'	B	0, -0.043, 1.063, 2.169, 2.904 max_d=2.904 avg_d=1.063 std_dev=1.106

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.03	0.11	0.55	0.14
C2	0.06	0.00	0.07	0.07	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.16	0.08	0.09	0.39	0.03	0.19	0.38	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.07	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.27	0.05	0.14	0.54	0.11
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.08	0.07	0.08	0.06	0.06	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.29	0.07	0.15	0.52	0.10
C4	0.02	0.02	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.04	0.39	0.03	0.20	0.40	0.15
C4'	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.11	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.54	0.12
C5	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.44	0.03	0.24	0.32	0.18
C5'	0.05	0.08	0.02	0.03	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.11	0.08	0.09	0.08	0.10	0.09	0.09	0.12	0.05	0.02	0.07	0.09	0.39	0.04
C6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.10	0.03	0.44	0.01	0.24	0.29	0.17
C8	0.02	0.03	0.03	0.07	0.02	0.03	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.09	0.04	0.44	0.04	0.22	0.38	0.17
N1	0.05	0.01	0.06	0.08	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.14	0.10	0.07	0.43	0.03	0.23	0.33	0.17
N2	0.09	0.00	0.07	0.06	0.03	0.04	0.02	0.09	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.20	0.07	0.12	0.37	0.05	0.17	0.39	0.12
N3	0.06	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.15	0.07	0.08	0.36	0.03	0.17	0.42	0.13
N7	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.46	0.05	0.26	0.28	0.20
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.37	0.03	0.18	0.46	0.14
O2'	0.01	0.16	0.00	0.04	0.11	0.11	0.10	0.09	0.11	0.03	0.14	0.20	0.15	0.05	0.05	0.00	0.11	0.08	0.20	0.11	0.18	0.54	0.14
O3'	0.02	0.08	0.05	0.00	0.07	0.03	0.09	0.12	0.10	0.09	0.10	0.07	0.07	0.10	0.05	0.11	0.00	0.01	0.18	0.10	0.10	0.51	0.08
O4'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.07	0.12	0.08	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.04	0.09	0.60	0.18
O5'	0.20	0.39	0.27	0.29	0.39	0.05	0.44	0.02	0.44	0.44	0.43	0.37	0.36	0.46	0.37	0.20	0.18	0.06	0.00	0.44	0.03	0.03	0.01
O6	0.03	0.03	0.05	0.07	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.11	0.10	0.04	0.44	0.00	0.24	0.22	0.15
OP1	0.11	0.19	0.14	0.15	0.20	0.07	0.24	0.09	0.24	0.22	0.23	0.17	0.17	0.26	0.18	0.18	0.10	0.09	0.03	0.24	0.00	0.04	0.01
OP2	0.55	0.38	0.54	0.52	0.40	0.54	0.32	0.39	0.29	0.38	0.33	0.39	0.42	0.28	0.46	0.54	0.51	0.60	0.03	0.22	0.04	0.00	0.01
P	0.14	0.14	0.11	0.10	0.15	0.12	0.18	0.04	0.17	0.17	0.17	0.12	0.13	0.20	0.14	0.14	0.08	0.18	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.12	0.34	0.17	0.19	0.09	0.19	0.17	0.17	0.24	0.11	0.13	0.17	0.23	0.22	0.39	0.05	0.16	0.32	0.18	0.27	0.12	0.14
C2	0.16	0.16	0.09	0.12	0.10	0.25	0.07	0.33	0.13	0.02	0.12	0.21	0.20	0.10	0.10	0.21	0.15	0.29	0.50	0.21	0.28	0.28	0.25
C2'	0.25	0.06	0.32	0.13	0.15	0.10	0.13	0.21	0.09	0.20	0.04	0.09	0.14	0.17	0.20	0.44	0.05	0.19	0.35	0.10	0.27	0.11	0.16
C3'	0.22	0.08	0.29	0.11	0.11	0.11	0.12	0.25	0.14	0.16	0.13	0.09	0.11	0.14	0.16	0.46	0.08	0.18	0.39	0.19	0.28	0.08	0.18
C4	0.09	0.12	0.12	0.09	0.07	0.13	0.10	0.25	0.12	0.09	0.09	0.19	0.13	0.12	0.07	0.09	0.08	0.17	0.42	0.17	0.27	0.16	0.18
C4'	0.24	0.06	0.33	0.11	0.13	0.08	0.13	0.21	0.12	0.20	0.09	0.09	0.12	0.17	0.19	0.47	0.04	0.16	0.36	0.15	0.25	0.06	0.14
C5	0.06	0.14	0.07	0.08	0.04	0.12	0.04	0.24	0.08	0.04	0.09	0.22	0.12	0.07	0.03	0.06	0.07	0.15	0.41	0.14	0.25	0.16	0.17
C5'	0.24	0.10	0.31	0.12	0.13	0.13	0.12	0.30	0.11	0.19	0.08	0.14	0.14	0.16	0.18	0.47	0.09	0.20	0.44	0.14	0.29	0.10	0.22
C6	0.10	0.15	0.06	0.07	0.09	0.16	0.06	0.26	0.07	0.10	0.11	0.21	0.14	0.10	0.10	0.16	0.09	0.18	0.43	0.14	0.24	0.20	0.18
C8	0.15	0.14	0.20	0.13	0.10	0.08	0.09	0.19	0.10	0.10	0.09	0.23	0.15	0.11	0.11	0.23	0.04	0.13	0.33	0.13	0.25	0.07	0.12
N1	0.18	0.17	0.13	0.11	0.15	0.22	0.06	0.31	0.10	0.11	0.13	0.20	0.20	0.07	0.15	0.26	0.13	0.26	0.48	0.19	0.25	0.26	0.23
N2	0.28	0.18	0.18	0.18	0.16	0.32	0.08	0.38	0.15	0.02	0.12	0.22	0.25	0.13	0.17	0.36	0.21	0.37	0.53	0.24	0.30	0.34	0.29
N3	0.09	0.12	0.10	0.08	0.07	0.19	0.12	0.29	0.14	0.11	0.10	0.18	0.14	0.16	0.06	0.06	0.12	0.23	0.47	0.20	0.29	0.22	0.23
N7	0.09	0.14	0.11	0.10	0.05	0.08	0.05	0.21	0.07	0.05	0.09	0.24	0.13	0.08	0.04	0.12	0.05	0.12	0.36	0.12	0.24	0.09	0.13
N9	0.17	0.13	0.23	0.12	0.12	0.09	0.13	0.20	0.13	0.15	0.10	0.18	0.15	0.15	0.14	0.24	0.04	0.15	0.36	0.15	0.26	0.10	0.15
O2'	0.34	0.13	0.42	0.22	0.22	0.19	0.18	0.25	0.11	0.27	0.07	0.13	0.21	0.22	0.28	0.53	0.14	0.29	0.34	0.08	0.34	0.19	0.21
O3'	0.25	0.13	0.33	0.09	0.14	0.07	0.16	0.19	0.19	0.19	0.20	0.16	0.11	0.17	0.19	0.57	0.06	0.13	0.32	0.23	0.22	0.04	0.13
O4'	0.26	0.09	0.36	0.16	0.16	0.08	0.16	0.18	0.12	0.23	0.06	0.12	0.15	0.21	0.21	0.44	0.04	0.15	0.33	0.14	0.25	0.10	0.13
O5'	0.52	0.45	0.58	0.39	0.49	0.30	0.51	0.17	0.51	0.52	0.48	0.43	0.46	0.52	0.50	0.67	0.28	0.33	0.06	0.52	0.24	0.23	0.16
O6	0.11	0.14	0.10	0.05	0.11	0.13	0.11	0.23	0.08	0.16	0.12	0.22	0.13	0.16	0.13	0.20	0.06	0.15	0.41	0.14	0.21	0.20	0.16
OP1	0.19	0.17	0.25	0.10	0.19	0.07	0.28	0.16	0.35	0.24	0.30	0.09	0.12	0.29	0.19	0.41	0.13	0.06	0.30	0.44	0.15	0.09	0.06
OP2	0.35	0.39	0.31	0.44	0.39	0.52	0.39	0.67	0.39	0.38	0.38	0.39	0.41	0.39	0.38	0.22	0.52	0.51	0.84	0.41	0.63	0.54	0.62
P	0.13	0.09	0.19	0.05	0.13	0.08	0.21	0.23	0.24	0.19	0.19	0.04	0.07	0.23	0.14	0.30	0.11	0.10	0.39	0.31	0.23	0.07	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.01	0.08	0.10	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.06	0.36	0.19	0.23
C2	0.09	0.00	0.08	0.02	0.04	0.08	0.04	0.22	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.15	0.05	0.06	0.40	0.02	0.08	0.23	0.15
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.06	0.04	0.02	0.06	0.09	0.07	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.10	0.04	0.50	0.30	0.35
C3'	0.05	0.02	0.01	0.00	0.11	0.01	0.17	0.07	0.14	0.24	0.06	0.09	0.02	0.23	0.16	0.04	0.01	0.04	0.05	0.16	0.17	0.21	0.06
C4	0.04	0.04	0.03	0.11	0.00	0.04	0.01	0.13	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.08	0.10	0.02	0.25	0.02	0.22	0.13	0.10
C4'	0.05	0.08	0.09	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.05	0.13	0.05	0.16	0.06	0.11	0.08	0.26	0.06	0.00	0.05	0.06	0.12	0.17	0.08
C5	0.04	0.04	0.04	0.17	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.10	0.19	0.03	0.25	0.02	0.23	0.14	0.10
C5'	0.02	0.22	0.06	0.07	0.13	0.01	0.13	0.00	0.18	0.09	0.21	0.28	0.17	0.11	0.06	0.32	0.13	0.03	0.02	0.18	0.06	0.21	0.06
C6	0.06	0.02	0.04	0.14	0.02	0.05	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.10	0.15	0.01	0.32	0.01	0.16	0.18	0.09
C8	0.01	0.06	0.02	0.24	0.02	0.13	0.02	0.09	0.03	0.00	0.05	0.06	0.05	0.00	0.01	0.15	0.29	0.07	0.10	0.04	0.36	0.18	0.21
N1	0.08	0.01	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.21	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.12	0.04	0.03	0.39	0.01	0.09	0.23	0.14
N2	0.10	0.01	0.09	0.09	0.04	0.16	0.04	0.28	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.05	0.07	0.18	0.16	0.10	0.49	0.03	0.17	0.34	0.28
N3	0.08	0.01	0.07	0.02	0.02	0.06	0.02	0.17	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.05	0.14	0.04	0.05	0.32	0.02	0.13	0.15	0.08
N7	0.02	0.04	0.02	0.23	0.01	0.11	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.14	0.28	0.05	0.18	0.04	0.30	0.16	0.15
N9	0.01	0.06	0.02	0.16	0.02	0.08	0.03	0.06	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.09	0.16	0.04	0.13	0.04	0.32	0.16	0.18
O2'	0.04	0.15	0.01	0.04	0.08	0.26	0.10	0.32	0.10	0.15	0.12	0.18	0.14	0.14	0.09	0.00	0.06	0.12	0.45	0.10	0.85	0.72	0.74
O3'	0.02	0.05	0.06	0.01	0.10	0.06	0.19	0.13	0.15	0.29	0.04	0.16	0.04	0.28	0.16	0.06	0.00	0.04	0.11	0.19	0.15	0.26	0.08
O4'	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.05	0.04	0.12	0.04	0.00	0.15	0.02	0.20	0.17	0.13
O5'	0.06	0.40	0.10	0.05	0.25	0.05	0.25	0.02	0.32	0.10	0.39	0.49	0.32	0.18	0.13	0.45	0.11	0.15	0.00	0.33	0.04	0.03	0.01
O6	0.06	0.02	0.04	0.16	0.02	0.06	0.02	0.18	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.10	0.19	0.02	0.33	0.00	0.16	0.20	0.09
OP1	0.36	0.08	0.50	0.17	0.22	0.12	0.23	0.06	0.16	0.36	0.09	0.17	0.13	0.30	0.32	0.85	0.15	0.20	0.04	0.16	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.23	0.30	0.21	0.13	0.17	0.14	0.21	0.18	0.18	0.23	0.34	0.15	0.16	0.16	0.72	0.26	0.17	0.03	0.20	0.02	0.00	0.01
P	0.23	0.15	0.35	0.06	0.10	0.08	0.10	0.06	0.09	0.21	0.14	0.28	0.08	0.15	0.18	0.74	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00