Doublet Group distance statistics: 55423

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, -0.001, 0.007, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.005, 0.025, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.010, 0.048, 0.087, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.048 std_dev=0.038
O4'	B	0, 0.084, 0.323, 0.562, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.323 std_dev=0.239
O3'	B	0, 0.027, 0.384, 0.740, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.384 std_dev=0.357
C1'	B	0, 0.037, 0.482, 0.927, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.482 std_dev=0.445
C4	B	0, -0.020, 0.454, 0.927, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.454 std_dev=0.474
N9	B	0, 0.011, 0.493, 0.975, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.493 std_dev=0.482
O4'	A	0, -0.076, 0.410, 0.897, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.410 std_dev=0.487
C2'	A	0, -0.130, 0.371, 0.872, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.371 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.026, 0.532, 1.037, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.532 std_dev=0.506
N1	B	0, -0.064, 0.479, 1.022, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.479 std_dev=0.543
N3	B	0, -0.056, 0.490, 1.035, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.490 std_dev=0.546
C2	B	0, -0.082, 0.497, 1.075, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.497 std_dev=0.579
OP2	A	0, -0.097, 0.499, 1.095, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.499 std_dev=0.596
C3'	B	0, -0.028, 0.637, 1.301, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.637 std_dev=0.665
C5	B	0, -0.075, 0.590, 1.255, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.590 std_dev=0.665
C6	B	0, -0.105, 0.596, 1.297, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.596 std_dev=0.701
C8	B	0, -0.049, 0.693, 1.435, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.693 std_dev=0.742
O2'	A	0, -0.206, 0.572, 1.351, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.572 std_dev=0.779
C4'	A	0, -0.185, 0.602, 1.389, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.602 std_dev=0.787
N2	B	0, -0.156, 0.658, 1.472, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.658 std_dev=0.814
O5'	A	0, -0.137, 0.678, 1.493, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.678 std_dev=0.815
P	A	0, -0.180, 0.650, 1.480, 1.821 max_d=1.821 avg_d=0.650 std_dev=0.830
C3'	A	0, -0.232, 0.603, 1.438, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.603 std_dev=0.835
N7	B	0, -0.120, 0.786, 1.692, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.786 std_dev=0.906
O6	B	0, -0.166, 0.781, 1.727, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.781 std_dev=0.947
C5'	A	0, -0.183, 0.783, 1.748, 2.143 max_d=2.143 avg_d=0.783 std_dev=0.966
C5'	B	0, -0.104, 0.918, 1.940, 2.343 max_d=2.343 avg_d=0.918 std_dev=1.022
C2'	B	0, -0.166, 1.007, 2.181, 2.653 max_d=2.653 avg_d=1.007 std_dev=1.173
OP1	A	0, -0.296, 0.916, 2.128, 2.629 max_d=2.629 avg_d=0.916 std_dev=1.212
O3'	A	0, -0.290, 0.976, 2.242, 2.764 max_d=2.764 avg_d=0.976 std_dev=1.266
O5'	B	0, -0.152, 1.126, 2.405, 2.914 max_d=2.914 avg_d=1.126 std_dev=1.279
P	B	0, -0.177, 1.511, 3.199, 3.867 max_d=3.867 avg_d=1.511 std_dev=1.688
OP2	B	0, -0.126, 1.650, 3.425, 4.114 max_d=4.114 avg_d=1.650 std_dev=1.776
O2'	B	0, -0.367, 1.441, 3.249, 3.991 max_d=3.991 avg_d=1.441 std_dev=1.808
OP1	B	0, -0.245, 1.633, 3.511, 4.263 max_d=4.263 avg_d=1.633 std_dev=1.878

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.24	0.01	0.20	0.02	0.26	0.32	0.24
C2	0.01	0.00	0.28	0.28	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.15	0.06	0.00	0.03	0.10	0.07
C2'	0.00	0.28	0.00	0.01	0.14	0.02	0.07	0.20	0.13	0.14	0.21	0.34	0.27	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.42	0.11	0.56	0.68	0.54
C3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.30	0.00	0.39	0.01	0.41	0.35	0.35	0.24	0.23	0.42	0.25	0.02	0.01	0.02	0.02	0.46	0.14	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.14	0.30	0.00	0.08	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.06	0.06	0.05	0.01	0.04	0.14	0.08
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.13	0.23	0.06	0.05	0.02	0.24	0.11	0.29	0.03	0.00	0.03	0.18	0.09	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.39	0.00	0.15	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.21	0.01	0.08	0.01	0.11	0.04	0.04
C5'	0.07	0.05	0.20	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.10	0.17	0.04	0.09	0.07	0.19	0.04	0.09	0.18	0.01	0.02	0.15	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.41	0.00	0.13	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.22	0.03	0.10	0.00	0.16	0.06	0.07
C8	0.01	0.02	0.14	0.35	0.01	0.23	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.38	0.25	0.16	0.09	0.02	0.02	0.15	0.03
N1	0.01	0.00	0.21	0.35	0.00	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.10	0.10	0.04	0.01	0.09	0.03	0.02
N2	0.03	0.00	0.34	0.24	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.15	0.19	0.09	0.02	0.05	0.11	0.09
N3	0.01	0.00	0.27	0.23	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.15	0.10	0.01	0.08	0.16	0.12
N7	0.02	0.01	0.07	0.42	0.00	0.24	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.41	0.32	0.12	0.16	0.02	0.15	0.04	0.09
N9	0.00	0.02	0.01	0.25	0.01	0.11	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.24	0.05	0.03	0.07	0.02	0.11	0.22	0.13
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.20	0.29	0.32	0.09	0.30	0.38	0.19	0.04	0.03	0.41	0.24	0.00	0.04	0.18	0.28	0.34	0.47	0.74	0.46
O3'	0.24	0.07	0.03	0.01	0.06	0.03	0.21	0.18	0.22	0.25	0.10	0.15	0.12	0.32	0.05	0.04	0.00	0.20	0.22	0.32	0.30	0.18	0.26
O4'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.16	0.10	0.19	0.15	0.12	0.03	0.18	0.20	0.00	0.06	0.01	0.09	0.07	0.05
O5'	0.20	0.06	0.42	0.02	0.05	0.03	0.08	0.02	0.10	0.09	0.04	0.09	0.10	0.16	0.07	0.28	0.22	0.06	0.00	0.17	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.11	0.46	0.01	0.18	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.34	0.32	0.01	0.17	0.00	0.27	0.15	0.15
OP1	0.26	0.03	0.56	0.14	0.04	0.09	0.11	0.07	0.16	0.02	0.09	0.05	0.08	0.15	0.11	0.47	0.30	0.09	0.02	0.27	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.10	0.68	0.09	0.14	0.06	0.04	0.02	0.06	0.15	0.03	0.11	0.16	0.04	0.22	0.74	0.18	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.07	0.54	0.06	0.08	0.03	0.04	0.01	0.07	0.03	0.02	0.09	0.12	0.09	0.13	0.46	0.26	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.01	0.61	0.57	0.34	0.28	0.62	0.44	0.66	0.63	0.35	0.46	0.01	0.77	0.39	0.03	0.05	0.10	0.67	0.86	0.80	1.01	0.82
C2	0.07	0.36	0.28	0.55	0.20	0.41	0.62	0.68	0.53	0.76	0.04	0.72	0.32	0.94	0.35	0.62	0.05	0.22	0.92	0.74	1.04	1.25	1.10
C2'	0.64	0.48	1.03	0.93	0.73	0.63	0.89	0.73	0.90	0.90	0.71	0.10	0.51	0.97	0.76	0.56	0.41	0.47	0.90	0.98	0.98	1.14	1.00
C3'	0.57	0.62	0.91	0.76	0.80	0.49	1.08	0.64	1.21	0.99	1.01	0.26	0.54	1.16	0.78	0.43	0.16	0.39	0.88	1.42	0.97	1.25	1.04
C4	0.11	0.28	0.37	0.55	0.23	0.36	0.61	0.59	0.62	0.66	0.13	0.74	0.20	0.85	0.34	0.42	0.05	0.17	0.83	0.89	0.97	1.19	1.01
C4'	0.33	0.38	0.68	0.55	0.57	0.29	0.86	0.46	0.99	0.78	0.76	0.04	0.30	0.97	0.56	0.15	0.04	0.18	0.72	1.23	0.82	1.11	0.88
C5	0.03	0.38	0.17	0.50	0.12	0.38	0.51	0.64	0.50	0.60	0.02	0.77	0.29	0.80	0.24	0.68	0.04	0.19	0.88	0.84	1.06	1.29	1.10
C5'	0.30	0.32	0.60	0.53	0.53	0.30	0.83	0.48	0.95	0.76	0.70	0.01	0.25	0.95	0.52	0.04	0.06	0.19	0.75	1.22	0.87	1.17	0.94
C6	0.05	0.47	0.01	0.45	0.04	0.41	0.43	0.72	0.38	0.59	0.14	0.78	0.39	0.81	0.18	0.94	0.02	0.22	0.96	0.73	1.16	1.41	1.22
C8	0.10	0.22	0.34	0.53	0.20	0.34	0.52	0.56	0.55	0.57	0.13	0.64	0.15	0.73	0.29	0.41	0.04	0.15	0.78	0.85	0.96	1.18	0.99
N1	0.05	0.46	0.03	0.48	0.07	0.44	0.50	0.75	0.40	0.69	0.12	0.76	0.41	0.91	0.23	0.95	0.03	0.24	1.01	0.69	1.17	1.41	1.24
N2	0.09	0.31	0.34	0.59	0.21	0.45	0.58	0.70	0.45	0.80	0.06	0.61	0.31	0.91	0.39	0.60	0.07	0.24	0.94	0.62	1.02	1.19	1.08
N3	0.14	0.25	0.46	0.58	0.29	0.37	0.66	0.59	0.63	0.73	0.18	0.70	0.19	0.89	0.39	0.32	0.06	0.18	0.82	0.83	0.94	1.14	0.98
N7	0.03	0.34	0.18	0.49	0.11	0.35	0.45	0.61	0.46	0.53	0.03	0.72	0.25	0.71	0.22	0.64	0.04	0.16	0.83	0.80	1.04	1.26	1.07
N9	0.15	0.16	0.46	0.56	0.28	0.33	0.60	0.53	0.64	0.63	0.23	0.63	0.10	0.79	0.35	0.24	0.05	0.14	0.76	0.90	0.91	1.13	0.94
O2'	0.26	0.05	0.75	0.58	0.20	0.21	0.23	0.23	0.17	0.31	0.05	0.31	0.08	0.30	0.26	0.46	0.15	0.04	0.33	0.19	0.40	0.47	0.37
O3'	0.30	0.59	0.62	0.36	0.62	0.10	0.92	0.23	1.12	0.75	0.99	0.32	0.40	0.95	0.55	0.23	0.28	0.07	0.50	1.34	0.54	0.88	0.65
O4'	0.10	0.05	0.47	0.41	0.32	0.15	0.64	0.34	0.74	0.60	0.45	0.34	0.02	0.78	0.34	0.14	0.15	0.03	0.60	1.00	0.73	1.00	0.78
O5'	0.22	0.15	0.48	0.51	0.42	0.30	0.74	0.51	0.85	0.70	0.53	0.23	0.12	0.89	0.44	0.18	0.06	0.17	0.77	1.15	0.93	1.22	0.99
O6	0.11	0.49	0.18	0.38	0.06	0.41	0.31	0.75	0.25	0.49	0.23	0.76	0.42	0.70	0.09	1.14	0.01	0.23	0.98	0.59	1.22	1.48	1.28
OP1	0.30	0.23	0.52	0.55	0.47	0.35	0.76	0.56	0.86	0.74	0.57	0.10	0.20	0.91	0.50	0.09	0.03	0.24	0.81	1.15	0.98	1.27	1.04
OP2	0.04	0.21	0.23	0.42	0.15	0.24	0.45	0.48	0.49	0.50	0.11	0.58	0.17	0.66	0.22	0.49	0.10	0.07	0.73	0.80	0.96	1.22	0.99
P	0.17	0.05	0.40	0.48	0.34	0.29	0.64	0.51	0.72	0.63	0.40	0.31	0.04	0.81	0.37	0.28	0.07	0.15	0.77	1.03	0.95	1.23	1.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.00	0.00	0.02	0.29	0.00	0.18	0.01	0.20	0.27	0.18
C2	0.03	0.00	0.22	0.16	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.29	0.10	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.09	0.01	0.01	0.20	0.05	0.17	0.15	0.30	0.22	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.40	0.02	0.49	0.61	0.48
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.20	0.00	0.29	0.01	0.29	0.32	0.23	0.13	0.12	0.35	0.20	0.01	0.01	0.02	0.05	0.33	0.08	0.04	0.02
C4	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.16	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.04
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.11	0.25	0.04	0.05	0.03	0.23	0.11	0.28	0.01	0.00	0.01	0.14	0.05	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.29	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.38	0.01	0.02	0.12	0.00	0.11	0.10	0.13
C5'	0.06	0.03	0.20	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.12	0.23	0.06	0.05	0.04	0.24	0.07	0.06	0.19	0.00	0.00	0.17	0.03	0.03	0.00
C6	0.01	0.01	0.05	0.29	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.36	0.04	0.01	0.13	0.00	0.14	0.16	0.16
C8	0.00	0.01	0.17	0.32	0.00	0.25	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.43	0.14	0.15	0.16	0.02	0.10	0.03	0.12
N1	0.02	0.00	0.15	0.23	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.22	0.17	0.07	0.07	0.01	0.08	0.11	0.10
N2	0.06	0.01	0.30	0.13	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.36	0.12	0.04	0.02	0.04	0.04	0.03
N3	0.03	0.01	0.22	0.12	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.32	0.11	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05
N7	0.00	0.01	0.11	0.35	0.01	0.23	0.01	0.24	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.48	0.15	0.11	0.21	0.02	0.19	0.15	0.20
N9	0.00	0.02	0.03	0.20	0.01	0.11	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.26	0.09	0.04	0.03	0.01	0.05	0.12	0.04
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.23	0.28	0.38	0.06	0.36	0.43	0.22	0.07	0.03	0.48	0.26	0.00	0.02	0.20	0.28	0.42	0.38	0.70	0.41
O3'	0.29	0.29	0.01	0.01	0.16	0.01	0.01	0.19	0.04	0.14	0.17	0.36	0.32	0.15	0.09	0.02	0.00	0.18	0.23	0.04	0.30	0.21	0.27
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.15	0.07	0.12	0.11	0.11	0.04	0.20	0.18	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.05
O5'	0.18	0.03	0.40	0.05	0.03	0.01	0.12	0.00	0.13	0.16	0.07	0.04	0.06	0.21	0.03	0.28	0.23	0.08	0.00	0.19	0.02	0.03	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.33	0.00	0.14	0.00	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.42	0.04	0.01	0.19	0.00	0.22	0.25	0.22
OP1	0.20	0.02	0.49	0.08	0.02	0.05	0.11	0.03	0.14	0.10	0.08	0.04	0.06	0.19	0.05	0.38	0.30	0.07	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.04	0.61	0.04	0.04	0.05	0.10	0.03	0.16	0.03	0.11	0.04	0.06	0.15	0.12	0.70	0.21	0.11	0.03	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.04	0.48	0.02	0.04	0.01	0.13	0.00	0.16	0.12	0.10	0.03	0.05	0.20	0.04	0.41	0.27	0.05	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00