Doublet Group distance statistics: 55426

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C5	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N3	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N1	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.000, 0.038, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.000, 0.048, 0.095, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.048 std_dev=0.048
C1'	A	0, 0.000, 0.062, 0.124, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.062 std_dev=0.062
N2	A	0, 0.000, 0.071, 0.143, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.071 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.000, 0.075, 0.150, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.075 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.000, 0.094, 0.187, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.094 std_dev=0.094
C3'	A	0, 0.000, 0.102, 0.205, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.102 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.000, 0.107, 0.213, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.107 std_dev=0.107
C5'	A	0, 0.000, 0.114, 0.229, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.114 std_dev=0.114
O5'	A	0, 0.000, 0.146, 0.291, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.146 std_dev=0.146
O2'	A	0, 0.000, 0.170, 0.341, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.170 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.000, 0.174, 0.349, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.174 std_dev=0.174
N3	B	0, 0.000, 0.196, 0.393, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.196 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.000, 0.227, 0.453, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.227 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.000, 0.328, 0.656, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.328 std_dev=0.328
P	A	0, 0.000, 0.333, 0.666, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.333 std_dev=0.333
O2'	B	0, 0.000, 0.349, 0.699, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.349 std_dev=0.349
N9	B	0, 0.000, 0.366, 0.732, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.366 std_dev=0.366
C5	B	0, 0.000, 0.370, 0.739, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.370 std_dev=0.370
C2'	B	0, 0.000, 0.407, 0.813, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.407 std_dev=0.407
OP2	A	0, 0.000, 0.427, 0.855, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.427 std_dev=0.427
C1'	B	0, 0.000, 0.432, 0.863, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.432 std_dev=0.432
N1	B	0, 0.000, 0.448, 0.896, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.448 std_dev=0.448
OP1	A	0, 0.000, 0.450, 0.900, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.450 std_dev=0.450
N2	B	0, 0.000, 0.453, 0.905, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.453 std_dev=0.453
C8	B	0, 0.000, 0.490, 0.981, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.490 std_dev=0.490
N7	B	0, 0.000, 0.502, 1.005, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.502 std_dev=0.502
C6	B	0, 0.000, 0.509, 1.019, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.509 std_dev=0.509
C3'	B	0, 0.000, 0.518, 1.036, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.518 std_dev=0.518
O4'	B	0, 0.000, 0.523, 1.046, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.523 std_dev=0.523
O3'	B	0, 0.000, 0.547, 1.095, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.547 std_dev=0.547
C4'	B	0, 0.000, 0.588, 1.176, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.588 std_dev=0.588
C5'	B	0, 0.000, 0.646, 1.293, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.646 std_dev=0.646
P	B	0, 0.000, 0.733, 1.466, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.733 std_dev=0.733
O5'	B	0, 0.000, 0.762, 1.523, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.762 std_dev=0.762
OP1	B	0, 0.000, 0.773, 1.545, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.773 std_dev=0.773
OP2	B	0, 0.000, 0.791, 1.581, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.791 std_dev=0.791
O6	B	0, 0.000, 0.849, 1.698, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.849 std_dev=0.849

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01
C2	0.06	0.00	0.08	0.07	0.01	0.07	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.12	0.09	0.06	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.09	0.07	0.06
C4	0.04	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01
C4'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.07	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00
C5	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01
C5'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.05	0.08	0.07	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00
C6	0.06	0.00	0.07	0.04	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02
C8	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01
N1	0.06	0.00	0.08	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00
N2	0.08	0.00	0.10	0.09	0.01	0.09	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.12	0.08	0.07	0.01	0.09	0.02	0.03
N3	0.06	0.00	0.08	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.09	0.06	0.06	0.02	0.07	0.02	0.03
N7	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03
N9	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01
O2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.12	0.16	0.11	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.06	0.03	0.01
O3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.12	0.09	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.12	0.09	0.07
O4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05
O5'	0.02	0.05	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
O6	0.05	0.01	0.07	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.06	0.04
OP1	0.02	0.06	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.07	0.01	0.04	0.06	0.12	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.09	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.15	0.08	0.08	0.06	0.08	0.15	0.11	0.26	0.01	0.21	0.15	0.07	0.12	0.02	0.06	0.05	0.06	0.06	0.39	0.04	0.04	0.04
C2	0.09	0.23	0.12	0.11	0.00	0.10	0.06	0.14	0.08	0.18	0.24	0.30	0.13	0.19	0.10	0.12	0.06	0.09	0.10	0.04	0.09	0.09	0.09
C2'	0.12	0.14	0.14	0.15	0.02	0.15	0.14	0.18	0.28	0.06	0.22	0.14	0.03	0.11	0.09	0.11	0.11	0.13	0.13	0.47	0.10	0.11	0.11
C3'	0.06	0.14	0.09	0.11	0.08	0.11	0.21	0.14	0.31	0.06	0.23	0.13	0.05	0.22	0.01	0.06	0.08	0.08	0.09	0.49	0.07	0.07	0.08
C4	0.06	0.18	0.11	0.10	0.05	0.08	0.08	0.11	0.19	0.07	0.21	0.20	0.10	0.01	0.05	0.11	0.06	0.06	0.06	0.23	0.04	0.06	0.06
C4'	0.00	0.14	0.02	0.04	0.10	0.04	0.21	0.08	0.29	0.11	0.22	0.13	0.06	0.23	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.45	0.01	0.01	0.01
C5	0.01	0.16	0.06	0.05	0.07	0.02	0.06	0.04	0.11	0.01	0.14	0.18	0.12	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01	0.00
C5'	0.05	0.11	0.03	0.00	0.11	0.01	0.22	0.02	0.28	0.18	0.19	0.09	0.05	0.27	0.08	0.05	0.02	0.03	0.04	0.43	0.05	0.05	0.05
C6	0.01	0.17	0.06	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.07	0.09	0.23	0.14	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.13	0.02	0.01	0.00
C8	0.05	0.14	0.02	0.02	0.13	0.01	0.19	0.01	0.22	0.14	0.17	0.13	0.11	0.20	0.09	0.05	0.00	0.05	0.03	0.28	0.04	0.01	0.03
N1	0.06	0.22	0.10	0.08	0.00	0.06	0.09	0.08	0.04	0.15	0.16	0.29	0.14	0.18	0.07	0.11	0.04	0.05	0.05	0.16	0.04	0.05	0.05
N2	0.12	0.25	0.14	0.13	0.02	0.13	0.09	0.17	0.07	0.23	0.26	0.34	0.13	0.25	0.13	0.13	0.08	0.12	0.14	0.00	0.14	0.13	0.13
N3	0.11	0.21	0.14	0.13	0.01	0.13	0.01	0.16	0.18	0.16	0.25	0.25	0.10	0.12	0.10	0.13	0.08	0.11	0.12	0.24	0.11	0.11	0.11
N7	0.06	0.12	0.01	0.00	0.12	0.04	0.14	0.02	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.13	0.10	0.05	0.03	0.07	0.06	0.14	0.07	0.03	0.05
N9	0.04	0.16	0.09	0.09	0.08	0.07	0.16	0.09	0.24	0.03	0.21	0.16	0.09	0.12	0.00	0.09	0.05	0.04	0.04	0.33	0.02	0.05	0.04
O2'	0.14	0.12	0.14	0.15	0.01	0.17	0.08	0.21	0.25	0.12	0.21	0.14	0.01	0.02	0.12	0.09	0.12	0.16	0.16	0.44	0.14	0.12	0.13
O3'	0.08	0.14	0.09	0.12	0.06	0.13	0.19	0.17	0.32	0.03	0.24	0.13	0.04	0.20	0.04	0.05	0.09	0.10	0.12	0.51	0.10	0.10	0.10
O4'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.10	0.02	0.19	0.05	0.26	0.10	0.20	0.13	0.08	0.20	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.39	0.01	0.02	0.02
O5'	0.06	0.08	0.04	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.24	0.20	0.15	0.05	0.03	0.27	0.09	0.07	0.03	0.04	0.05	0.37	0.05	0.04	0.05
O6	0.02	0.11	0.03	0.00	0.02	0.03	0.08	0.02	0.15	0.04	0.04	0.19	0.14	0.10	0.01	0.07	0.03	0.05	0.04	0.26	0.06	0.03	0.04
OP1	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.03	0.16	0.08	0.19	0.16	0.09	0.02	0.03	0.22	0.05	0.10	0.03	0.00	0.01	0.32	0.05	0.02	0.03
OP2	0.05	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.15	0.06	0.14	0.18	0.04	0.05	0.04	0.21	0.08	0.10	0.01	0.01	0.01	0.24	0.03	0.04	0.03
P	0.05	0.03	0.04	0.00	0.09	0.01	0.18	0.05	0.20	0.19	0.10	0.00	0.00	0.24	0.08	0.10	0.02	0.02	0.01	0.32	0.02	0.02	0.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.04	0.10	0.09	0.12	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.03
C2	0.11	0.00	0.12	0.16	0.00	0.12	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.16	0.21	0.08	0.09	0.05	0.02	0.09	0.04
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.08	0.13	0.13	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.06	0.08	0.06	0.07
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.12	0.17	0.16	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.03	0.06	0.03	0.05
C4	0.05	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.09	0.12	0.12	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01
C5	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.13	0.08	0.10
C5'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.06	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.03	0.00	0.00
C6	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04	0.02	0.15	0.08	0.10
C8	0.04	0.02	0.09	0.08	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.11	0.09	0.02	0.08	0.09	0.11	0.11	0.11
N1	0.10	0.01	0.08	0.12	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.17	0.08	0.04	0.07	0.08	0.03	0.01
N2	0.09	0.01	0.13	0.17	0.03	0.12	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.17	0.24	0.06	0.10	0.07	0.02	0.12	0.06
N3	0.12	0.00	0.13	0.16	0.00	0.12	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.16	0.18	0.09	0.10	0.03	0.01	0.10	0.07
N7	0.02	0.03	0.08	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.01	0.09	0.10	0.16	0.14	0.15
N9	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.04
O2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.17	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.05	0.09	0.08	0.08
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.17	0.24	0.18	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.05	0.01	0.03
O4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.06	0.09	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
O5'	0.02	0.09	0.06	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.08	0.04	0.10	0.10	0.09	0.02	0.08	0.05	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00
O6	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.10	0.02	0.09	0.07	0.07	0.03	0.10	0.03	0.05	0.03	0.01	0.12	0.00	0.27	0.18	0.21
OP1	0.05	0.02	0.08	0.06	0.06	0.03	0.13	0.03	0.15	0.11	0.08	0.02	0.01	0.16	0.06	0.09	0.05	0.03	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.09	0.06	0.03	0.00	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.03	0.12	0.10	0.14	0.03	0.08	0.01	0.01	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.01	0.06	0.07	0.15	0.04	0.08	0.03	0.01	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00