Doublet Group distance statistics: 55436

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 7, 14, 7, 8, 7, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.016, 0.026, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.019, 0.036, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.011, 0.029, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.011, 0.034, 0.056, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.013, 0.037, 0.060, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.021, 0.049, 0.078, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.049 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.018, 0.051, 0.083, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.051 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.028, 0.078, 0.128, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.078 std_dev=0.050
C8	A	0, 0.036, 0.092, 0.148, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.092 std_dev=0.056
N1	B	0, 0.424, 0.594, 0.763, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.594 std_dev=0.170
N3	B	0, 0.613, 0.796, 0.979, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.796 std_dev=0.183
C4	B	0, 0.507, 0.691, 0.876, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.691 std_dev=0.185
C1'	B	0, 0.504, 0.694, 0.884, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.694 std_dev=0.190
O4	B	0, 0.565, 0.762, 0.958, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.762 std_dev=0.196
C2	B	0, 0.660, 0.867, 1.074, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.867 std_dev=0.207
C6	B	0, 0.423, 0.741, 1.059, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.741 std_dev=0.318
O2	B	0, 0.869, 1.270, 1.672, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.270 std_dev=0.401
C5	B	0, 0.428, 0.854, 1.281, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.854 std_dev=0.427
C4'	B	0, 0.491, 0.957, 1.424, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.957 std_dev=0.466
O4'	B	0, 0.536, 1.005, 1.475, 2.079 max_d=2.079 avg_d=1.005 std_dev=0.469
C2'	B	0, 0.555, 1.067, 1.578, 1.922 max_d=1.922 avg_d=1.067 std_dev=0.512
C3'	B	0, 0.513, 1.162, 1.810, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.162 std_dev=0.649
O3'	A	0, 0.266, 0.978, 1.690, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.978 std_dev=0.712
O2'	B	0, 0.686, 1.519, 2.351, 2.752 max_d=2.752 avg_d=1.519 std_dev=0.832
O3'	B	0, 0.597, 1.580, 2.562, 2.859 max_d=2.859 avg_d=1.580 std_dev=0.982
C3'	A	0, 0.164, 1.339, 2.514, 2.679 max_d=2.679 avg_d=1.339 std_dev=1.175
O4'	A	0, 0.083, 1.335, 2.588, 2.604 max_d=2.604 avg_d=1.335 std_dev=1.252
C5'	B	0, 0.459, 1.754, 3.050, 3.822 max_d=3.822 avg_d=1.754 std_dev=1.296
C2'	A	0, 0.179, 1.492, 2.804, 2.833 max_d=2.833 avg_d=1.492 std_dev=1.313
C4'	A	0, 0.084, 1.585, 3.086, 3.171 max_d=3.171 avg_d=1.585 std_dev=1.501
O5'	B	0, 0.441, 2.358, 4.274, 4.904 max_d=4.904 avg_d=2.358 std_dev=1.916
O2'	A	0, 0.276, 2.475, 4.674, 4.721 max_d=4.721 avg_d=2.475 std_dev=2.199
C5'	A	0, 0.183, 3.096, 6.009, 6.088 max_d=6.088 avg_d=3.096 std_dev=2.913
P	B	0, 0.468, 3.632, 6.797, 7.515 max_d=7.515 avg_d=3.632 std_dev=3.164
O5'	A	0, 0.332, 3.586, 6.841, 7.014 max_d=7.014 avg_d=3.586 std_dev=3.255
OP1	B	0, 0.629, 4.222, 7.816, 8.611 max_d=8.611 avg_d=4.222 std_dev=3.593
OP2	B	0, 0.534, 4.261, 7.988, 8.598 max_d=8.598 avg_d=4.261 std_dev=3.727
P	A	0, 0.549, 5.091, 9.633, 9.759 max_d=9.759 avg_d=5.091 std_dev=4.542
OP2	A	0, 0.606, 5.241, 9.876, 10.195 max_d=10.195 avg_d=5.241 std_dev=4.635
OP1	A	0, 0.734, 6.227, 11.719, 11.887 max_d=11.887 avg_d=6.227 std_dev=5.492

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.13	0.26	0.19
C2	0.03	0.00	0.54	0.53	0.00	0.53	0.00	1.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.06	0.23	1.41	0.01	1.73	1.95	1.72
C2'	0.00	0.54	0.00	0.00	0.25	0.01	0.09	0.03	0.20	0.32	0.40	0.67	0.54	0.19	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.10	0.10	0.07
C3'	0.01	0.53	0.00	0.00	0.22	0.00	0.07	0.02	0.18	0.30	0.38	0.68	0.50	0.20	0.03	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.20	0.16	0.14
C4	0.02	0.00	0.25	0.22	0.00	0.22	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.04	0.11	0.40	0.01	0.39	0.35	0.38
C4'	0.01	0.53	0.01	0.00	0.22	0.00	0.05	0.01	0.16	0.33	0.37	0.69	0.51	0.23	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.14	0.01	0.27	0.43	0.27
C5'	0.04	1.07	0.03	0.02	0.38	0.01	0.07	0.00	0.29	0.71	0.75	1.44	0.99	0.53	0.13	0.03	0.03	0.02	0.00	0.14	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.20	0.18	0.00	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.04	0.07	0.27	0.00	0.26	0.24	0.26
C8	0.01	0.00	0.32	0.30	0.00	0.33	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.15	1.17	0.01	1.41	1.74	1.46
N1	0.02	0.00	0.40	0.38	0.00	0.37	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.05	0.16	0.93	0.01	1.13	1.24	1.12
N2	0.04	0.00	0.67	0.68	0.01	0.69	0.01	1.44	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.08	0.28	1.96	0.01	2.57	2.95	2.51
N3	0.03	0.00	0.54	0.50	0.00	0.51	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.06	0.24	1.30	0.01	1.46	1.59	1.47
N7	0.01	0.00	0.19	0.20	0.00	0.23	0.00	0.53	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.10	0.93	0.01	1.26	1.60	1.27
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.31	0.01	0.39	0.56	0.43
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.11	0.01	0.07	0.03	0.12	0.08	0.18	0.25	0.19	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.12	0.15	0.16	0.11
O3'	0.04	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.03	0.03	0.00	0.03	0.12	0.05	0.23	0.14	0.12
O4'	0.00	0.23	0.01	0.00	0.11	0.00	0.03	0.02	0.07	0.15	0.16	0.28	0.24	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.12	0.04	0.13	0.25	0.20
O5'	0.13	1.41	0.06	0.12	0.40	0.01	0.14	0.00	0.27	1.17	0.93	1.96	1.30	0.93	0.31	0.09	0.12	0.12	0.00	0.11	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.14	0.12	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.04	0.11	0.00	0.20	0.30	0.18
OP1	0.13	1.73	0.10	0.20	0.39	0.06	0.27	0.04	0.26	1.41	1.13	2.57	1.46	1.26	0.39	0.15	0.23	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	1.95	0.10	0.16	0.35	0.05	0.43	0.02	0.24	1.74	1.24	2.95	1.59	1.60	0.56	0.16	0.14	0.25	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.19	1.72	0.07	0.14	0.38	0.03	0.27	0.01	0.26	1.46	1.12	2.51	1.47	1.27	0.43	0.11	0.12	0.20	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.16	0.46	0.85	0.25	0.40	0.32	0.60	0.26	0.10	0.16	0.37	0.17	1.04	0.28	0.10	0.85	1.10	0.71	0.79
C2	0.15	0.18	0.24	0.54	0.33	0.62	0.50	1.09	0.41	0.16	0.18	0.33	0.65	0.42	0.35	0.42	1.57	1.94	2.12	1.88
C2'	0.56	0.70	0.23	0.79	0.23	0.16	0.13	0.42	0.13	0.42	0.54	1.13	0.33	1.16	0.22	0.49	0.70	1.08	0.51	0.62
C3'	0.10	0.31	0.73	1.28	0.15	0.63	0.31	0.87	0.30	0.09	0.26	0.66	0.35	1.74	0.17	0.09	1.09	1.50	0.76	0.96
C4	0.11	0.16	0.25	0.71	0.33	0.50	0.45	0.79	0.37	0.15	0.18	0.36	0.30	0.71	0.35	0.23	1.10	1.30	1.22	1.18
C4'	0.98	0.56	1.70	2.17	0.60	1.67	0.87	1.83	1.00	0.86	0.46	0.40	1.45	2.59	0.49	1.09	1.92	2.23	1.45	1.76
C5	0.13	0.17	0.21	0.54	0.37	0.42	0.47	0.67	0.36	0.16	0.20	0.33	0.26	0.53	0.40	0.23	0.94	1.04	1.11	1.03
C5'	1.70	0.79	2.56	3.23	0.76	2.72	1.25	2.90	1.54	1.37	0.55	0.53	2.40	3.86	0.53	1.94	2.85	3.19	2.16	2.63
C6	0.14	0.18	0.17	0.37	0.39	0.42	0.51	0.73	0.36	0.15	0.19	0.31	0.39	0.30	0.42	0.30	1.05	1.17	1.48	1.28
C8	0.13	0.15	0.44	0.69	0.32	0.37	0.37	0.51	0.31	0.16	0.20	0.32	0.22	0.78	0.35	0.14	0.69	0.74	0.55	0.61
N1	0.15	0.18	0.27	0.36	0.36	0.51	0.53	0.94	0.40	0.15	0.18	0.31	0.57	0.26	0.38	0.40	1.38	1.64	2.05	1.73
N2	0.18	0.19	0.38	0.49	0.31	0.70	0.48	1.30	0.40	0.17	0.18	0.32	0.81	0.33	0.33	0.52	1.88	2.46	2.64	2.35
N3	0.13	0.17	0.16	0.75	0.32	0.61	0.46	1.00	0.38	0.15	0.18	0.36	0.51	0.71	0.33	0.33	1.40	1.73	1.66	1.56
N7	0.14	0.17	0.32	0.56	0.36	0.36	0.41	0.51	0.32	0.18	0.22	0.31	0.18	0.60	0.39	0.17	0.70	0.71	0.67	0.68
N9	0.11	0.15	0.41	0.78	0.30	0.43	0.38	0.64	0.31	0.13	0.18	0.36	0.18	0.88	0.33	0.13	0.88	1.05	0.81	0.85
O2'	1.69	1.45	0.96	0.43	0.72	1.14	0.66	0.82	0.91	1.33	1.07	1.88	1.52	0.16	0.54	1.70	0.42	0.12	0.51	0.46
O3'	0.54	0.42	0.16	0.53	0.15	0.16	0.15	0.16	0.18	0.34	0.28	0.66	0.39	0.87	0.17	0.58	0.42	0.82	0.29	0.33
O4'	1.04	0.80	1.60	1.93	0.77	1.53	0.94	1.67	1.04	0.99	0.70	0.70	1.29	2.13	0.65	1.12	1.80	1.99	1.44	1.66
O5'	1.42	0.34	2.35	3.26	0.42	2.67	1.05	2.96	1.37	1.07	0.17	0.26	2.05	3.97	0.21	1.76	2.94	3.35	2.25	2.75
O6	0.15	0.18	0.20	0.25	0.37	0.34	0.46	0.62	0.31	0.15	0.20	0.28	0.37	0.20	0.44	0.28	0.88	0.94	1.38	1.14
OP1	1.98	0.42	2.90	4.10	0.40	3.74	1.27	4.20	1.76	1.40	0.16	0.21	2.75	5.17	0.21	2.55	3.94	4.63	3.01	3.78
OP2	1.58	0.14	2.39	3.68	0.20	3.28	1.09	3.85	1.56	1.09	0.41	0.54	2.03	4.36	0.38	2.18	3.84	4.44	3.15	3.75
P	2.00	0.52	2.88	4.09	0.50	3.66	1.35	4.07	1.82	1.47	0.17	0.20	2.60	5.00	0.19	2.55	3.91	4.42	3.07	3.73

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.44	0.18
C2	0.01	0.00	0.16	0.07	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.10	0.01	0.15	0.25	0.47	0.76	0.46
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.21	0.02	0.10	0.30	0.00	0.01	0.05	0.01	0.08	0.16	0.16	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.21	0.05	0.04	0.16	0.01	0.00	0.10	0.01	0.14	0.29	0.15	0.14
C4	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.02	0.16	0.51	0.37	0.25
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.07	0.11	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.17	0.22	0.06
C5	0.01	0.00	0.18	0.20	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.25	0.00	0.12	0.14	0.33	0.25	0.21
C5'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.13	0.04	0.14	0.22	0.03	0.02	0.10	0.01	0.01	0.21	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.21	0.21	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.25	0.01	0.16	0.16	0.21	0.23	0.21
N1	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.10	0.24	0.44	0.22
N3	0.01	0.00	0.10	0.04	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.05	0.00	0.11	0.25	0.57	0.70	0.44
O2	0.01	0.00	0.30	0.16	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.34	0.24	0.01	0.26	0.33	0.54	0.98	0.62
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.03	0.03	0.14	0.03	0.17	0.02	0.13	0.34	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.20	0.24	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.11	0.01	0.25	0.02	0.25	0.05	0.05	0.24	0.03	0.00	0.12	0.01	0.19	0.49	0.26	0.24
O4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.00	0.02	0.18	0.59	0.35	0.27
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.01	0.16	0.01	0.11	0.26	0.03	0.01	0.02	0.00	0.11	0.09	0.55	0.26
O5'	0.05	0.25	0.08	0.14	0.16	0.01	0.14	0.01	0.16	0.10	0.25	0.33	0.05	0.19	0.18	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.47	0.16	0.29	0.51	0.17	0.33	0.21	0.21	0.24	0.57	0.54	0.20	0.49	0.59	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.76	0.16	0.15	0.37	0.22	0.25	0.09	0.23	0.44	0.70	0.98	0.24	0.26	0.35	0.55	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.46	0.05	0.14	0.25	0.06	0.21	0.01	0.21	0.22	0.44	0.62	0.06	0.24	0.27	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00