Doublet Group distance statistics: 55437

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 11, 16, 7, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.016 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.033 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.011, 0.030, 0.048, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.013, 0.035, 0.058, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.082, 0.175, 0.269, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.175 std_dev=0.093
O4'	A	0, 0.066, 0.160, 0.254, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.160 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.103, 0.200, 0.297, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.200 std_dev=0.097
C5	B	0, 0.191, 0.331, 0.470, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.331 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.114, 0.255, 0.397, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.255 std_dev=0.141
C6	B	0, 0.174, 0.320, 0.467, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.320 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.130, 0.280, 0.430, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.280 std_dev=0.150
N1	B	0, 0.179, 0.344, 0.509, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.344 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.196, 0.361, 0.526, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.361 std_dev=0.165
C2	B	0, 0.192, 0.374, 0.556, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.374 std_dev=0.182
N3	B	0, 0.190, 0.374, 0.559, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.374 std_dev=0.184
O4	B	0, 0.247, 0.440, 0.633, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.440 std_dev=0.193
P	A	0, 0.211, 0.429, 0.646, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.429 std_dev=0.218
C1'	B	0, 0.193, 0.410, 0.628, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.410 std_dev=0.218
C5'	A	0, 0.178, 0.401, 0.624, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.401 std_dev=0.223
O3'	A	0, 0.203, 0.427, 0.650, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.427 std_dev=0.223
O2	B	0, 0.207, 0.436, 0.666, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.436 std_dev=0.230
O5'	A	0, 0.186, 0.420, 0.653, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.420 std_dev=0.234
OP2	A	0, 0.209, 0.454, 0.700, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.454 std_dev=0.246
P	B	0, 0.204, 0.456, 0.707, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.456 std_dev=0.252
O5'	B	0, 0.246, 0.515, 0.785, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.515 std_dev=0.269
O4'	B	0, 0.220, 0.505, 0.791, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.505 std_dev=0.286
OP1	A	0, 0.273, 0.576, 0.879, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.576 std_dev=0.303
OP2	B	0, 0.203, 0.525, 0.846, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.525 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.219, 0.553, 0.888, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.553 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.166, 0.513, 0.860, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.513 std_dev=0.347
C3'	B	0, 0.200, 0.560, 0.919, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.560 std_dev=0.359
C5'	B	0, 0.222, 0.598, 0.974, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.598 std_dev=0.376
OP1	B	0, 0.171, 0.554, 0.936, 2.187 max_d=2.187 avg_d=0.554 std_dev=0.382
O2'	B	0, 0.038, 0.651, 1.264, 2.792 max_d=2.792 avg_d=0.651 std_dev=0.613
O3'	B	0, 0.176, 0.812, 1.447, 3.696 max_d=3.696 avg_d=0.812 std_dev=0.636

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.08	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.03	0.10	0.01	0.12	0.19	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.10	0.07	0.03
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.07	0.10	0.07	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.13	0.11	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.10	0.01	0.12	0.17	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.01
C5	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.12	0.01	0.16	0.22	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.05	0.05	0.09	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.03	0.13	0.01	0.17	0.23	0.18
C8	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.13	0.02	0.15	0.18	0.16
N1	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.03	0.11	0.01	0.15	0.22	0.16
N2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.13	0.04	0.10	0.02	0.11	0.18	0.14
N3	0.03	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.09	0.01	0.10	0.16	0.13
N7	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.14	0.02	0.18	0.23	0.18
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.11	0.14	0.12
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.08	0.12	0.09	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.04	0.12	0.07	0.03
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.09	0.10	0.13	0.10	0.09	0.05	0.05	0.00	0.02	0.08	0.09	0.21	0.20	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.09	0.08
O5'	0.05	0.10	0.03	0.04	0.10	0.01	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11	0.10	0.09	0.14	0.10	0.04	0.08	0.05	0.00	0.14	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.04	0.14	0.00	0.20	0.26	0.19
OP1	0.06	0.12	0.10	0.13	0.12	0.09	0.16	0.07	0.17	0.15	0.15	0.11	0.10	0.18	0.11	0.12	0.21	0.06	0.02	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.19	0.07	0.11	0.17	0.03	0.22	0.02	0.23	0.18	0.22	0.18	0.16	0.23	0.14	0.07	0.20	0.09	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.03	0.06	0.14	0.01	0.17	0.02	0.18	0.16	0.16	0.14	0.13	0.18	0.12	0.03	0.13	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.17	0.15	0.25	0.15	0.17	0.16	0.16	0.15	0.14	0.18	0.20	0.51	0.26	0.20	0.15	0.24	0.23	0.26	0.19
C2	0.16	0.12	0.15	0.26	0.13	0.19	0.16	0.21	0.16	0.12	0.13	0.17	0.54	0.25	0.15	0.15	0.23	0.24	0.26	0.20
C2'	0.17	0.19	0.16	0.26	0.17	0.17	0.17	0.16	0.16	0.16	0.20	0.23	0.43	0.26	0.19	0.16	0.25	0.22	0.27	0.19
C3'	0.18	0.21	0.16	0.27	0.19	0.18	0.18	0.15	0.17	0.18	0.22	0.23	0.44	0.26	0.23	0.17	0.25	0.21	0.27	0.18
C4	0.15	0.14	0.17	0.25	0.13	0.18	0.15	0.17	0.15	0.13	0.15	0.17	0.57	0.27	0.17	0.15	0.23	0.23	0.26	0.19
C4'	0.16	0.18	0.16	0.26	0.18	0.17	0.18	0.16	0.17	0.16	0.20	0.21	0.50	0.28	0.23	0.16	0.24	0.22	0.25	0.17
C5	0.16	0.14	0.23	0.26	0.13	0.19	0.14	0.18	0.14	0.13	0.15	0.17	0.63	0.30	0.19	0.17	0.23	0.24	0.26	0.19
C5'	0.17	0.18	0.18	0.28	0.21	0.19	0.20	0.17	0.18	0.17	0.21	0.20	0.52	0.30	0.26	0.18	0.23	0.23	0.25	0.18
C6	0.17	0.14	0.27	0.26	0.13	0.20	0.15	0.21	0.15	0.13	0.14	0.17	0.67	0.31	0.16	0.19	0.22	0.25	0.27	0.20
C8	0.16	0.16	0.23	0.26	0.18	0.18	0.16	0.17	0.15	0.14	0.19	0.18	0.60	0.31	0.24	0.17	0.24	0.25	0.26	0.19
N1	0.17	0.14	0.19	0.25	0.13	0.20	0.16	0.22	0.16	0.13	0.14	0.18	0.64	0.26	0.15	0.17	0.23	0.25	0.27	0.20
N2	0.16	0.14	0.19	0.28	0.16	0.21	0.17	0.23	0.16	0.14	0.15	0.18	0.47	0.26	0.18	0.17	0.24	0.25	0.27	0.21
N3	0.15	0.13	0.14	0.25	0.12	0.18	0.16	0.18	0.15	0.13	0.13	0.17	0.52	0.25	0.16	0.15	0.23	0.23	0.26	0.19
N7	0.16	0.15	0.27	0.26	0.17	0.19	0.15	0.18	0.15	0.14	0.18	0.17	0.63	0.33	0.23	0.18	0.24	0.25	0.26	0.19
N9	0.15	0.16	0.18	0.25	0.16	0.17	0.16	0.17	0.15	0.14	0.18	0.19	0.56	0.28	0.21	0.15	0.23	0.23	0.26	0.19
O2'	0.18	0.20	0.16	0.26	0.16	0.18	0.16	0.18	0.15	0.17	0.19	0.25	0.40	0.26	0.18	0.16	0.26	0.22	0.28	0.19
O3'	0.21	0.24	0.18	0.28	0.21	0.20	0.19	0.16	0.19	0.20	0.25	0.28	0.39	0.27	0.23	0.19	0.27	0.22	0.29	0.19
O4'	0.16	0.17	0.17	0.26	0.17	0.18	0.17	0.17	0.16	0.14	0.18	0.20	0.55	0.29	0.22	0.15	0.23	0.23	0.25	0.18
O5'	0.18	0.19	0.20	0.29	0.22	0.20	0.21	0.18	0.19	0.18	0.22	0.20	0.53	0.32	0.28	0.20	0.24	0.25	0.25	0.19
O6	0.20	0.16	0.35	0.28	0.15	0.24	0.16	0.25	0.17	0.16	0.15	0.18	0.70	0.37	0.18	0.24	0.23	0.26	0.28	0.21
OP1	0.22	0.21	0.24	0.32	0.24	0.25	0.25	0.24	0.24	0.22	0.23	0.21	0.52	0.35	0.28	0.24	0.29	0.33	0.31	0.27
OP2	0.21	0.21	0.26	0.35	0.24	0.26	0.22	0.25	0.21	0.20	0.24	0.21	0.53	0.40	0.29	0.24	0.28	0.33	0.30	0.25
P	0.20	0.20	0.23	0.32	0.23	0.24	0.22	0.22	0.21	0.19	0.23	0.21	0.53	0.37	0.28	0.23	0.26	0.30	0.27	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.25	0.02	0.01	0.18	0.18	0.20	0.14
C2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.22	0.01	0.08	0.23	0.19	0.22	0.16
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.13	0.15	0.15	0.03	0.08	0.22	0.00	0.08	0.06	0.03	0.38	0.42	0.34	0.36
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.19	0.00	0.21	0.03	0.18	0.11	0.16	0.12	0.02	0.01	0.21	0.01	0.17	0.24	0.10	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.19	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.21	0.01	0.04	0.30	0.24	0.29	0.22
C4'	0.02	0.03	0.03	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.04	0.04	0.08	0.17	0.03	0.10	0.01	0.01	0.12	0.18	0.04
C5	0.02	0.01	0.13	0.21	0.01	0.12	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.22	0.02	0.08	0.32	0.25	0.29	0.24
C5'	0.07	0.08	0.15	0.03	0.15	0.01	0.17	0.00	0.15	0.09	0.10	0.09	0.06	0.13	0.16	0.01	0.01	0.11	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.15	0.18	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.20	0.02	0.10	0.29	0.22	0.24	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.19	0.02	0.02	0.24	0.19	0.21	0.16
N3	0.02	0.00	0.08	0.16	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.20	0.01	0.05	0.27	0.21	0.25	0.19
O2	0.04	0.00	0.22	0.12	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.26	0.29	0.01	0.14	0.20	0.17	0.20	0.14
O2'	0.04	0.17	0.00	0.02	0.24	0.17	0.28	0.06	0.25	0.14	0.20	0.26	0.00	0.10	0.26	0.11	0.28	0.40	0.42	0.33
O3'	0.25	0.22	0.08	0.01	0.21	0.03	0.22	0.13	0.20	0.19	0.20	0.29	0.10	0.00	0.21	0.17	0.12	0.27	0.20	0.16
O4	0.02	0.01	0.06	0.21	0.01	0.10	0.02	0.16	0.02	0.02	0.01	0.01	0.26	0.21	0.00	0.05	0.32	0.26	0.32	0.25
O4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.05	0.14	0.11	0.17	0.05	0.00	0.10	0.12	0.29	0.15
O5'	0.18	0.23	0.38	0.17	0.30	0.01	0.32	0.01	0.29	0.24	0.27	0.20	0.28	0.12	0.32	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.19	0.42	0.24	0.24	0.12	0.25	0.11	0.22	0.19	0.21	0.17	0.40	0.27	0.26	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.22	0.34	0.10	0.29	0.18	0.29	0.16	0.24	0.21	0.25	0.20	0.42	0.20	0.32	0.29	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.16	0.36	0.12	0.22	0.04	0.24	0.02	0.20	0.16	0.19	0.14	0.33	0.16	0.25	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00