Doublet Group distance statistics: 55441

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 7, 8, 5, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.012, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.019 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.002, 0.014, 0.029, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.020, 0.044, 0.068, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.006, 0.031, 0.057, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.031 std_dev=0.026
O4'	A	0, -0.006, 0.118, 0.242, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.118 std_dev=0.124
C2'	A	0, 0.008, 0.158, 0.307, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.158 std_dev=0.150
N1	B	0, 0.206, 0.374, 0.542, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.374 std_dev=0.168
C2	B	0, 0.234, 0.407, 0.580, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.407 std_dev=0.173
C6	B	0, 0.221, 0.397, 0.574, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.397 std_dev=0.177
N3	B	0, 0.227, 0.413, 0.598, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.413 std_dev=0.185
C1'	B	0, 0.207, 0.403, 0.600, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.403 std_dev=0.197
C4	B	0, 0.204, 0.408, 0.612, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.408 std_dev=0.204
C5	B	0, 0.211, 0.417, 0.622, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.417 std_dev=0.206
O2	B	0, 0.250, 0.473, 0.697, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.473 std_dev=0.224
C4'	A	0, -0.018, 0.220, 0.457, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.220 std_dev=0.237
O4	B	0, 0.216, 0.460, 0.704, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.460 std_dev=0.244
O5'	A	0, 0.107, 0.381, 0.656, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.381 std_dev=0.275
O4'	B	0, 0.195, 0.472, 0.748, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.472 std_dev=0.276
C5'	A	0, 0.033, 0.318, 0.604, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.318 std_dev=0.285
C3'	A	0, -0.063, 0.279, 0.621, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.279 std_dev=0.342
O2'	A	0, -0.018, 0.324, 0.667, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.324 std_dev=0.343
P	A	0, 0.120, 0.472, 0.824, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.472 std_dev=0.352
C4'	B	0, 0.124, 0.522, 0.920, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.522 std_dev=0.398
OP2	A	0, 0.094, 0.512, 0.930, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.512 std_dev=0.418
C2'	B	0, 0.072, 0.531, 0.989, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.531 std_dev=0.458
C3'	B	0, 0.053, 0.514, 0.974, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.514 std_dev=0.460
OP1	A	0, 0.085, 0.560, 1.034, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.560 std_dev=0.474
O3'	B	0, 0.006, 0.535, 1.064, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.535 std_dev=0.529
C5'	B	0, -0.021, 0.646, 1.314, 2.764 max_d=2.764 avg_d=0.646 std_dev=0.667
O3'	A	0, -0.183, 0.488, 1.158, 2.191 max_d=2.191 avg_d=0.488 std_dev=0.670
O5'	B	0, -0.037, 0.660, 1.358, 2.554 max_d=2.554 avg_d=0.660 std_dev=0.698
O2'	B	0, -0.112, 0.681, 1.474, 2.908 max_d=2.908 avg_d=0.681 std_dev=0.793
P	B	0, -0.073, 0.822, 1.716, 3.413 max_d=3.413 avg_d=0.822 std_dev=0.894
OP2	B	0, -0.048, 0.854, 1.756, 3.508 max_d=3.508 avg_d=0.854 std_dev=0.902
OP1	B	0, -0.150, 0.938, 2.027, 4.061 max_d=4.061 avg_d=0.938 std_dev=1.088

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.14	0.02	0.14	0.20	0.14
C2	0.04	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.07	0.13	0.01	0.15	0.26	0.16
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.12	0.06	0.08	0.09	0.15	0.12	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.24	0.06	0.30	0.35	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.21	0.22	0.17	0.12	0.11	0.24	0.15	0.02	0.01	0.02	0.07	0.23	0.07	0.08	0.04
C4	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.08	0.04	0.13	0.01	0.16	0.25	0.17
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.09	0.04	0.06	0.05	0.08	0.05	0.23	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.02	0.15	0.01	0.20	0.29	0.20
C5'	0.05	0.05	0.12	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.12	0.06	0.06	0.04	0.12	0.06	0.11	0.15	0.01	0.01	0.10	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.21	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.04	0.15	0.01	0.21	0.31	0.21
C8	0.01	0.01	0.08	0.22	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.16	0.04	0.16	0.02	0.20	0.25	0.21
N1	0.03	0.00	0.09	0.17	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.11	0.06	0.13	0.01	0.18	0.29	0.19
N2	0.05	0.00	0.15	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.23	0.08	0.12	0.02	0.14	0.26	0.15
N3	0.04	0.00	0.12	0.11	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.17	0.06	0.12	0.01	0.13	0.24	0.14
N7	0.01	0.01	0.06	0.24	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.18	0.02	0.16	0.02	0.23	0.30	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.04	0.01	0.13	0.02	0.15	0.22	0.16
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.15	0.23	0.20	0.11	0.20	0.18	0.18	0.13	0.12	0.21	0.13	0.00	0.04	0.16	0.14	0.22	0.18	0.34	0.19
O3'	0.16	0.16	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.15	0.10	0.16	0.11	0.23	0.17	0.18	0.04	0.04	0.00	0.12	0.22	0.14	0.25	0.27	0.24
O4'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.16	0.12	0.00	0.07	0.03	0.05	0.09	0.05
O5'	0.14	0.13	0.24	0.07	0.13	0.01	0.15	0.01	0.15	0.16	0.13	0.12	0.12	0.16	0.13	0.14	0.22	0.07	0.00	0.16	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.22	0.14	0.03	0.16	0.00	0.24	0.33	0.23
OP1	0.14	0.15	0.30	0.07	0.16	0.04	0.20	0.04	0.21	0.20	0.18	0.14	0.13	0.23	0.15	0.18	0.25	0.05	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.26	0.35	0.08	0.25	0.03	0.29	0.02	0.31	0.25	0.29	0.26	0.24	0.30	0.22	0.34	0.27	0.09	0.02	0.33	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.16	0.28	0.04	0.17	0.01	0.20	0.01	0.21	0.21	0.19	0.15	0.14	0.23	0.16	0.19	0.24	0.05	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.16	0.20	0.44	0.10	0.26	0.08	0.26	0.08	0.11	0.16	0.20	0.40	0.38	0.13	0.12	0.41	0.37	0.29	0.30
C2	0.12	0.15	0.24	0.48	0.14	0.29	0.15	0.34	0.11	0.10	0.14	0.22	0.42	0.40	0.16	0.09	0.46	0.50	0.40	0.40
C2'	0.14	0.20	0.20	0.43	0.10	0.23	0.07	0.20	0.07	0.13	0.20	0.26	0.25	0.33	0.10	0.13	0.33	0.22	0.15	0.18
C3'	0.26	0.30	0.28	0.56	0.33	0.41	0.29	0.42	0.27	0.28	0.33	0.31	0.20	0.45	0.35	0.30	0.51	0.50	0.48	0.46
C4	0.14	0.14	0.20	0.45	0.11	0.28	0.12	0.32	0.10	0.11	0.13	0.18	0.52	0.39	0.17	0.12	0.47	0.46	0.38	0.39
C4'	0.13	0.19	0.18	0.46	0.20	0.29	0.14	0.31	0.12	0.14	0.22	0.22	0.38	0.39	0.25	0.17	0.43	0.42	0.38	0.37
C5	0.19	0.15	0.25	0.43	0.14	0.31	0.16	0.37	0.14	0.15	0.13	0.18	0.67	0.42	0.20	0.17	0.52	0.52	0.47	0.47
C5'	0.10	0.13	0.14	0.35	0.15	0.20	0.13	0.24	0.11	0.10	0.16	0.16	0.53	0.32	0.20	0.12	0.36	0.36	0.33	0.32
C6	0.20	0.14	0.28	0.44	0.13	0.34	0.17	0.43	0.14	0.14	0.09	0.19	0.76	0.45	0.17	0.18	0.57	0.60	0.54	0.54
C8	0.18	0.18	0.24	0.40	0.19	0.28	0.17	0.32	0.16	0.17	0.19	0.20	0.61	0.39	0.25	0.18	0.47	0.43	0.40	0.40
N1	0.16	0.14	0.21	0.48	0.13	0.33	0.16	0.41	0.13	0.11	0.10	0.21	0.63	0.44	0.15	0.13	0.53	0.57	0.48	0.48
N2	0.12	0.20	0.34	0.49	0.18	0.28	0.17	0.32	0.14	0.14	0.19	0.28	0.26	0.38	0.18	0.11	0.43	0.49	0.38	0.37
N3	0.11	0.13	0.23	0.47	0.12	0.27	0.12	0.30	0.09	0.09	0.13	0.20	0.39	0.38	0.16	0.09	0.44	0.45	0.35	0.36
N7	0.21	0.18	0.29	0.40	0.20	0.31	0.20	0.36	0.18	0.18	0.18	0.19	0.71	0.41	0.25	0.21	0.51	0.50	0.48	0.47
N9	0.15	0.16	0.20	0.43	0.13	0.27	0.11	0.29	0.11	0.13	0.16	0.19	0.51	0.38	0.19	0.13	0.45	0.41	0.35	0.36
O2'	0.29	0.27	0.21	0.19	0.40	0.23	0.43	0.27	0.39	0.32	0.30	0.21	0.44	0.19	0.46	0.35	0.35	0.25	0.30	0.31
O3'	0.21	0.24	0.23	0.45	0.30	0.32	0.29	0.35	0.26	0.23	0.27	0.23	0.30	0.28	0.34	0.25	0.45	0.47	0.47	0.44
O4'	0.14	0.15	0.21	0.43	0.12	0.26	0.09	0.28	0.09	0.11	0.16	0.19	0.49	0.40	0.17	0.13	0.43	0.42	0.36	0.36
O5'	0.17	0.14	0.23	0.25	0.15	0.15	0.17	0.20	0.17	0.15	0.14	0.15	0.66	0.25	0.18	0.13	0.33	0.34	0.32	0.30
O6	0.25	0.14	0.39	0.42	0.14	0.38	0.19	0.50	0.17	0.17	0.09	0.19	0.89	0.47	0.18	0.24	0.63	0.70	0.66	0.65
OP1	0.29	0.22	0.37	0.15	0.23	0.16	0.30	0.22	0.31	0.27	0.20	0.20	0.77	0.19	0.21	0.24	0.29	0.32	0.31	0.29
OP2	0.38	0.29	0.52	0.18	0.26	0.21	0.33	0.24	0.37	0.35	0.25	0.28	0.93	0.21	0.21	0.27	0.31	0.33	0.32	0.30
P	0.26	0.20	0.36	0.18	0.19	0.14	0.25	0.20	0.27	0.24	0.17	0.19	0.79	0.22	0.18	0.19	0.31	0.32	0.31	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.01	0.00	0.11	0.09	0.29	0.14
C2	0.01	0.00	0.16	0.20	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.01	0.10	0.14	0.07	0.21	0.09
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.01	0.11	0.13	0.15	0.02	0.12	0.27	0.00	0.02	0.07	0.01	0.30	0.30	0.40	0.31
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.27	0.01	0.25	0.01	0.20	0.16	0.25	0.16	0.02	0.01	0.29	0.02	0.15	0.15	0.13	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.27	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.16	0.00	0.02	0.23	0.12	0.15	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.14	0.06	0.05	0.07	0.21	0.04	0.11	0.00	0.01	0.07	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.11	0.25	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.32	0.18	0.01	0.08	0.26	0.14	0.16	0.13
C5'	0.05	0.07	0.13	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.05	0.07	0.11	0.09	0.15	0.12	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.15	0.20	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.30	0.12	0.01	0.12	0.21	0.10	0.20	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.16	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.07	0.01	0.01	0.13	0.07	0.23	0.09
N3	0.01	0.00	0.12	0.25	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.11	0.01	0.07	0.18	0.09	0.16	0.08
O2	0.02	0.00	0.27	0.16	0.01	0.07	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.17	0.01	0.17	0.12	0.08	0.23	0.12
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.24	0.21	0.32	0.09	0.30	0.14	0.13	0.18	0.00	0.04	0.26	0.14	0.20	0.24	0.41	0.23
O3'	0.19	0.10	0.02	0.01	0.16	0.04	0.18	0.15	0.12	0.07	0.11	0.17	0.04	0.00	0.20	0.13	0.21	0.36	0.24	0.24
O4	0.01	0.01	0.07	0.29	0.00	0.11	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.20	0.00	0.02	0.26	0.15	0.15	0.13
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.07	0.17	0.14	0.13	0.02	0.00	0.06	0.09	0.30	0.14
O5'	0.11	0.14	0.30	0.15	0.23	0.01	0.26	0.01	0.21	0.13	0.18	0.12	0.20	0.21	0.26	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.07	0.30	0.15	0.12	0.07	0.14	0.07	0.10	0.07	0.09	0.08	0.24	0.36	0.15	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.21	0.40	0.13	0.15	0.20	0.16	0.16	0.20	0.23	0.16	0.23	0.41	0.24	0.15	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.09	0.31	0.07	0.10	0.04	0.13	0.01	0.09	0.09	0.08	0.12	0.23	0.24	0.13	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00