Doublet Group distance statistics: 55443

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 1, 2, 3, 5, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.006 std_dev=0.007
N1	A	0, -0.001, 0.009, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.011
C1'	A	0, -0.002, 0.010, 0.021, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C5	A	0, -0.002, 0.012, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C4	A	0, -0.002, 0.012, 0.025, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.012 std_dev=0.014
N3	A	0, -0.005, 0.010, 0.025, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.010 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N7	A	0, -0.001, 0.023, 0.047, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.023 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O6	A	0, -0.007, 0.020, 0.047, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.020 std_dev=0.027
O4'	A	0, -0.005, 0.112, 0.228, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.112 std_dev=0.117
C2'	A	0, -0.022, 0.111, 0.244, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.111 std_dev=0.133
O2'	A	0, -0.012, 0.124, 0.260, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.124 std_dev=0.136
C4'	A	0, 0.039, 0.229, 0.419, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.229 std_dev=0.190
O5'	A	0, 0.136, 0.340, 0.544, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.340 std_dev=0.204
C3'	A	0, 0.008, 0.226, 0.443, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.226 std_dev=0.217
P	A	0, 0.219, 0.440, 0.661, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.440 std_dev=0.221
C2	B	0, 0.215, 0.437, 0.659, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.437 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.152, 0.377, 0.602, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.377 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.124, 0.363, 0.603, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.363 std_dev=0.239
C1'	B	0, 0.094, 0.360, 0.627, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.360 std_dev=0.266
O2	B	0, 0.239, 0.508, 0.777, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.508 std_dev=0.269
O2'	B	0, 0.129, 0.399, 0.669, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.399 std_dev=0.270
N3	B	0, 0.217, 0.492, 0.768, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.492 std_dev=0.276
OP1	A	0, 0.291, 0.568, 0.846, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.568 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.175, 0.456, 0.736, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.456 std_dev=0.280
C5'	A	0, 0.077, 0.366, 0.654, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.366 std_dev=0.288
OP2	A	0, 0.221, 0.524, 0.828, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.524 std_dev=0.303
O3'	A	0, 0.006, 0.333, 0.661, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.333 std_dev=0.328
O5'	B	0, 0.066, 0.405, 0.744, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.405 std_dev=0.339
C5	B	0, 0.182, 0.523, 0.864, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.523 std_dev=0.341
C4	B	0, 0.172, 0.515, 0.858, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.515 std_dev=0.343
O4'	B	0, 0.082, 0.433, 0.784, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.433 std_dev=0.351
C3'	B	0, 0.097, 0.472, 0.846, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.472 std_dev=0.375
C4'	B	0, 0.076, 0.491, 0.907, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.491 std_dev=0.416
O4	B	0, 0.160, 0.586, 1.011, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.586 std_dev=0.426
C5'	B	0, 0.067, 0.528, 0.990, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.528 std_dev=0.462
O3'	B	0, 0.086, 0.572, 1.059, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.572 std_dev=0.487
P	B	0, -0.002, 0.592, 1.186, 2.247 max_d=2.247 avg_d=0.592 std_dev=0.594
OP1	B	0, -0.052, 0.927, 1.906, 3.310 max_d=3.310 avg_d=0.927 std_dev=0.979
OP2	B	0, 0.005, 1.034, 2.062, 4.017 max_d=4.017 avg_d=1.034 std_dev=1.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.25	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.17	0.03	0.13	0.01	0.07	0.23	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.03	0.07	0.02	0.09	0.05	0.11	0.13	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.12	0.08	0.15	0.18	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.12	0.11	0.14	0.15	0.12	0.12	0.07	0.01	0.01	0.02	0.19	0.13	0.20	0.15	0.09
C4	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.13	0.01	0.07	0.24	0.12
C4'	0.02	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06	0.06	0.05	0.08	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.20	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.03	0.19	0.01	0.11	0.23	0.15
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.07	0.05	0.05	0.11	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.14	0.03	0.20	0.00	0.13	0.22	0.16
C8	0.02	0.02	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.18	0.03	0.10	0.23	0.14
N1	0.02	0.00	0.11	0.14	0.00	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.17	0.03	0.17	0.01	0.10	0.23	0.14
N2	0.02	0.00	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.19	0.03	0.11	0.02	0.06	0.24	0.12
N3	0.02	0.00	0.12	0.12	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.14	0.03	0.10	0.01	0.06	0.24	0.11
N7	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.22	0.03	0.14	0.23	0.16
N9	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.12	0.01	0.06	0.25	0.11
O2'	0.04	0.11	0.00	0.01	0.06	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.09	0.12	0.10	0.05	0.04	0.00	0.05	0.07	0.04	0.06	0.13	0.19	0.03
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.01	0.14	0.10	0.17	0.19	0.14	0.12	0.05	0.05	0.00	0.03	0.19	0.15	0.29	0.14	0.15
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.07	0.03	0.00	0.09	0.05	0.07	0.29	0.14
O5'	0.05	0.13	0.12	0.19	0.13	0.01	0.19	0.01	0.20	0.18	0.17	0.11	0.10	0.22	0.12	0.04	0.19	0.09	0.00	0.24	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.15	0.05	0.24	0.00	0.16	0.23	0.18
OP1	0.05	0.07	0.15	0.20	0.07	0.08	0.11	0.06	0.13	0.10	0.10	0.06	0.06	0.14	0.06	0.13	0.29	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00
OP2	0.25	0.23	0.18	0.15	0.24	0.20	0.23	0.17	0.22	0.23	0.23	0.24	0.24	0.23	0.25	0.19	0.14	0.29	0.02	0.23	0.02	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.05	0.09	0.12	0.03	0.15	0.01	0.16	0.14	0.14	0.12	0.11	0.16	0.11	0.03	0.15	0.14	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.22	0.18	0.19	0.12	0.15	0.14	0.16	0.16	0.16	0.21	0.28	0.22	0.22	0.13	0.16	0.17	0.51	0.24	0.14
C2	0.14	0.18	0.14	0.14	0.24	0.13	0.29	0.14	0.23	0.15	0.21	0.25	0.21	0.18	0.30	0.15	0.12	0.86	0.20	0.29
C2'	0.16	0.18	0.16	0.17	0.14	0.17	0.13	0.22	0.14	0.15	0.17	0.22	0.19	0.17	0.15	0.15	0.23	0.56	0.10	0.23
C3'	0.11	0.14	0.12	0.15	0.17	0.10	0.20	0.09	0.18	0.12	0.16	0.16	0.15	0.16	0.19	0.13	0.09	0.25	0.22	0.05
C4	0.13	0.21	0.15	0.15	0.18	0.11	0.25	0.10	0.21	0.13	0.22	0.29	0.22	0.19	0.22	0.12	0.11	0.69	0.20	0.17
C4'	0.18	0.17	0.20	0.27	0.12	0.22	0.16	0.17	0.18	0.14	0.16	0.22	0.19	0.30	0.14	0.22	0.15	0.10	0.49	0.12
C5	0.13	0.21	0.17	0.17	0.25	0.13	0.28	0.09	0.24	0.12	0.26	0.30	0.24	0.23	0.29	0.12	0.11	0.66	0.29	0.13
C5'	0.27	0.21	0.27	0.38	0.15	0.35	0.20	0.32	0.24	0.21	0.19	0.26	0.23	0.43	0.16	0.33	0.29	0.19	0.78	0.29
C6	0.15	0.19	0.18	0.18	0.32	0.15	0.32	0.11	0.26	0.15	0.27	0.27	0.26	0.26	0.38	0.14	0.12	0.74	0.25	0.19
C8	0.13	0.23	0.16	0.17	0.16	0.12	0.18	0.09	0.17	0.11	0.24	0.33	0.23	0.23	0.19	0.11	0.13	0.43	0.47	0.08
N1	0.14	0.16	0.16	0.16	0.29	0.13	0.32	0.11	0.24	0.14	0.22	0.24	0.24	0.23	0.38	0.14	0.10	0.83	0.20	0.25
N2	0.15	0.18	0.14	0.14	0.23	0.15	0.28	0.18	0.23	0.16	0.20	0.23	0.20	0.17	0.29	0.17	0.14	0.92	0.27	0.35
N3	0.16	0.21	0.15	0.15	0.20	0.14	0.27	0.16	0.23	0.16	0.22	0.27	0.21	0.18	0.22	0.16	0.14	0.80	0.16	0.26
N7	0.13	0.24	0.18	0.20	0.23	0.16	0.24	0.12	0.22	0.13	0.27	0.34	0.26	0.26	0.26	0.13	0.14	0.51	0.44	0.10
N9	0.15	0.22	0.16	0.16	0.14	0.11	0.17	0.09	0.17	0.13	0.22	0.30	0.22	0.20	0.16	0.12	0.12	0.55	0.29	0.08
O2'	0.21	0.24	0.18	0.20	0.23	0.23	0.22	0.30	0.22	0.22	0.25	0.26	0.19	0.20	0.24	0.22	0.27	0.64	0.19	0.33
O3'	0.09	0.15	0.10	0.13	0.25	0.07	0.27	0.05	0.22	0.15	0.20	0.12	0.12	0.14	0.27	0.13	0.03	0.01	0.01	0.01
O4'	0.21	0.22	0.24	0.28	0.11	0.21	0.13	0.17	0.17	0.17	0.20	0.30	0.26	0.32	0.13	0.21	0.15	0.29	0.44	0.07
O5'	0.20	0.28	0.18	0.21	0.22	0.26	0.20	0.32	0.21	0.22	0.27	0.35	0.12	0.20	0.22	0.26	0.29	0.22	0.91	0.41
O6	0.18	0.22	0.21	0.22	0.35	0.19	0.33	0.15	0.27	0.19	0.32	0.29	0.29	0.32	0.40	0.18	0.15	0.73	0.29	0.18
OP1	0.21	0.23	0.19	0.25	0.14	0.25	0.10	0.30	0.10	0.17	0.21	0.31	0.24	0.40	0.14	0.24	0.22	0.36	1.00	0.43
OP2	0.27	0.26	0.26	0.30	0.26	0.29	0.29	0.25	0.29	0.25	0.26	0.31	0.26	0.35	0.27	0.28	0.18	0.26	0.77	0.26
P	0.18	0.21	0.17	0.25	0.14	0.24	0.15	0.26	0.15	0.15	0.19	0.29	0.19	0.33	0.15	0.22	0.20	0.18	0.92	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.02	0.00	0.09	0.48	0.11	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.11	0.01	0.07	0.13	0.68	0.11	0.19
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.08	0.06	0.09	0.03	0.06	0.14	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.32	0.33	0.08
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.09	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.21	0.32	0.11
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.00	0.02	0.15	0.78	0.21	0.25
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.19	0.10	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.05	0.01	0.06	0.16	0.77	0.20	0.25
C5'	0.03	0.07	0.06	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.12	0.07	0.08	0.06	0.05	0.03	0.10	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03
C6	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.01	0.07	0.16	0.70	0.12	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.01	0.14	0.63	0.09	0.17
N3	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.10	0.01	0.05	0.14	0.75	0.16	0.23
O2	0.03	0.00	0.14	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.16	0.01	0.11	0.12	0.63	0.10	0.17
O2'	0.03	0.15	0.00	0.02	0.09	0.02	0.12	0.05	0.13	0.07	0.13	0.26	0.00	0.04	0.10	0.02	0.11	0.32	0.44	0.11
O3'	0.07	0.11	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.10	0.16	0.04	0.00	0.07	0.07	0.06	0.20	0.32	0.11
O4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.00	0.03	0.15	0.80	0.25	0.27
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.05	0.11	0.02	0.07	0.03	0.00	0.06	0.44	0.13	0.19
O5'	0.09	0.13	0.10	0.04	0.15	0.01	0.16	0.01	0.16	0.14	0.14	0.12	0.11	0.06	0.15	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.48	0.68	0.32	0.21	0.78	0.19	0.77	0.09	0.70	0.63	0.75	0.63	0.32	0.20	0.80	0.44	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.11	0.33	0.32	0.21	0.10	0.20	0.13	0.12	0.09	0.16	0.10	0.44	0.32	0.25	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.19	0.08	0.11	0.25	0.06	0.25	0.03	0.21	0.17	0.23	0.17	0.11	0.11	0.27	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00