Doublet Group distance statistics: 55446

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 3, 0, 3, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.004, 0.022, 0.041, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.009, 0.036, 0.062, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.036 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.007, 0.038, 0.068, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.038 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.002, 0.044, 0.086, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.044 std_dev=0.042
C8	A	0, 0.003, 0.050, 0.096, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.050 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.045, 0.125, 0.205, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.125 std_dev=0.080
C3'	A	0, 0.065, 0.156, 0.247, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.156 std_dev=0.091
C4'	A	0, 0.077, 0.187, 0.297, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.187 std_dev=0.110
O3'	A	0, 0.050, 0.192, 0.333, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.192 std_dev=0.141
C2'	A	0, -0.006, 0.144, 0.294, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.144 std_dev=0.150
C5	B	0, 0.135, 0.344, 0.553, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.344 std_dev=0.209
O4	B	0, 0.170, 0.385, 0.599, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.385 std_dev=0.214
C4	B	0, 0.113, 0.328, 0.542, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.328 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.091, 0.307, 0.524, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.307 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.143, 0.379, 0.615, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.379 std_dev=0.236
N1	B	0, 0.144, 0.397, 0.651, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.397 std_dev=0.253
N3	B	0, 0.098, 0.357, 0.616, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.357 std_dev=0.259
C2	B	0, 0.117, 0.389, 0.661, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.389 std_dev=0.272
P	A	0, 0.066, 0.344, 0.622, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.344 std_dev=0.278
OP1	A	0, 0.068, 0.351, 0.635, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.351 std_dev=0.284
C1'	B	0, 0.198, 0.487, 0.776, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.487 std_dev=0.289
O2'	A	0, -0.062, 0.231, 0.523, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.231 std_dev=0.293
O5'	A	0, 0.053, 0.352, 0.651, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.352 std_dev=0.299
OP2	A	0, 0.084, 0.385, 0.687, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.385 std_dev=0.301
O2	B	0, 0.118, 0.435, 0.753, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.435 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.150, 0.496, 0.842, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.496 std_dev=0.346
OP1	B	0, 0.259, 0.622, 0.985, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.622 std_dev=0.363
O4'	B	0, 0.242, 0.622, 1.002, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.622 std_dev=0.380
P	B	0, 0.155, 0.547, 0.939, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.547 std_dev=0.392
C4'	B	0, 0.186, 0.580, 0.973, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.580 std_dev=0.394
O5'	B	0, 0.190, 0.588, 0.987, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.588 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.084, 0.519, 0.955, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.519 std_dev=0.435
OP2	B	0, 0.257, 0.711, 1.166, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.711 std_dev=0.454
C5'	B	0, 0.177, 0.689, 1.200, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.689 std_dev=0.512
O3'	B	0, 0.154, 0.673, 1.192, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.673 std_dev=0.519
O2'	B	0, -0.170, 0.790, 1.749, 3.106 max_d=3.106 avg_d=0.790 std_dev=0.959

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.12	0.04	0.07	0.27	0.08
C2	0.04	0.00	0.10	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.17	0.14	0.06	0.21	0.01	0.09	0.20	0.07
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.11	0.05	0.08	0.08	0.13	0.10	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.05	0.20	0.23	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.04	0.09	0.24	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.24	0.02	0.10	0.21	0.09
C4'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.10	0.07	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.21	0.06
C5	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.12	0.02	0.30	0.02	0.14	0.18	0.14
C5'	0.04	0.04	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.11	0.17	0.07	0.06	0.04	0.17	0.09	0.06	0.08	0.02	0.01	0.12	0.18	0.09	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.13	0.03	0.30	0.01	0.14	0.17	0.15
C8	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.11	0.04	0.32	0.03	0.15	0.21	0.16
N1	0.04	0.00	0.08	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.04	0.26	0.01	0.11	0.17	0.11
N2	0.05	0.00	0.13	0.09	0.01	0.10	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.14	0.07	0.18	0.02	0.08	0.20	0.06
N3	0.04	0.00	0.10	0.06	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.06	0.18	0.01	0.08	0.22	0.07
N7	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.11	0.03	0.34	0.03	0.17	0.18	0.19
N9	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.23	0.03	0.10	0.23	0.09
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.07	0.06	0.08	0.06	0.09	0.14	0.13	0.23	0.16	0.13	0.05	0.00	0.06	0.03	0.16	0.10	0.23	0.24	0.17
O3'	0.12	0.14	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.08	0.13	0.11	0.13	0.14	0.13	0.11	0.12	0.06	0.00	0.10	0.12	0.13	0.07	0.24	0.12
O4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.03	0.01	0.03	0.10	0.00	0.09	0.03	0.08	0.33	0.14
O5'	0.12	0.21	0.16	0.11	0.24	0.02	0.30	0.01	0.30	0.32	0.26	0.18	0.18	0.34	0.23	0.16	0.12	0.09	0.00	0.31	0.01	0.02	0.00
O6	0.04	0.01	0.05	0.04	0.02	0.02	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.10	0.13	0.03	0.31	0.00	0.16	0.17	0.17
OP1	0.07	0.09	0.20	0.09	0.10	0.12	0.14	0.18	0.14	0.15	0.11	0.08	0.08	0.17	0.10	0.23	0.07	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.20	0.23	0.24	0.21	0.21	0.18	0.09	0.17	0.21	0.17	0.20	0.22	0.18	0.23	0.24	0.24	0.33	0.02	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.07	0.15	0.11	0.09	0.06	0.14	0.02	0.15	0.16	0.11	0.06	0.07	0.19	0.09	0.17	0.12	0.14	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.19	0.27	0.27	0.18	0.19	0.19	0.23	0.19	0.19	0.20	0.20	0.73	0.27	0.21	0.22	0.41	0.25	0.23	0.23
C2	0.24	0.16	0.29	0.26	0.13	0.16	0.17	0.22	0.18	0.18	0.12	0.19	0.92	0.27	0.17	0.13	0.43	0.25	0.25	0.23
C2'	0.13	0.13	0.21	0.27	0.12	0.18	0.15	0.19	0.15	0.13	0.13	0.14	0.56	0.26	0.13	0.21	0.39	0.25	0.24	0.22
C3'	0.16	0.15	0.22	0.26	0.14	0.17	0.17	0.19	0.17	0.16	0.15	0.15	0.59	0.23	0.15	0.20	0.40	0.26	0.25	0.23
C4	0.19	0.17	0.34	0.27	0.12	0.20	0.14	0.26	0.15	0.16	0.15	0.19	0.86	0.30	0.16	0.21	0.42	0.25	0.21	0.22
C4'	0.17	0.18	0.25	0.28	0.16	0.19	0.17	0.23	0.17	0.16	0.18	0.19	0.71	0.29	0.18	0.21	0.41	0.26	0.24	0.23
C5	0.18	0.15	0.40	0.29	0.13	0.28	0.15	0.34	0.15	0.14	0.14	0.17	0.91	0.37	0.16	0.28	0.40	0.25	0.18	0.21
C5'	0.22	0.19	0.35	0.21	0.18	0.18	0.21	0.19	0.23	0.21	0.19	0.20	0.81	0.24	0.18	0.25	0.36	0.30	0.25	0.22
C6	0.20	0.14	0.44	0.31	0.15	0.31	0.18	0.38	0.19	0.16	0.14	0.16	0.98	0.41	0.18	0.29	0.38	0.23	0.16	0.18
C8	0.18	0.17	0.38	0.28	0.15	0.28	0.16	0.33	0.17	0.17	0.17	0.18	0.82	0.34	0.17	0.31	0.40	0.28	0.23	0.24
N1	0.22	0.13	0.37	0.29	0.15	0.23	0.19	0.30	0.19	0.16	0.13	0.15	1.02	0.35	0.18	0.18	0.39	0.23	0.21	0.19
N2	0.30	0.20	0.22	0.26	0.15	0.16	0.18	0.21	0.21	0.23	0.14	0.23	0.86	0.27	0.18	0.18	0.44	0.27	0.29	0.26
N3	0.23	0.19	0.28	0.26	0.12	0.16	0.16	0.22	0.17	0.19	0.16	0.22	0.85	0.26	0.17	0.16	0.44	0.25	0.25	0.24
N7	0.18	0.16	0.42	0.29	0.14	0.32	0.16	0.39	0.17	0.16	0.16	0.17	0.86	0.39	0.16	0.34	0.39	0.28	0.22	0.24
N9	0.18	0.18	0.33	0.27	0.15	0.22	0.16	0.27	0.17	0.17	0.18	0.20	0.80	0.30	0.18	0.24	0.42	0.25	0.22	0.23
O2'	0.14	0.11	0.17	0.21	0.09	0.12	0.19	0.16	0.19	0.13	0.12	0.13	0.44	0.18	0.11	0.19	0.37	0.27	0.33	0.25
O3'	0.26	0.24	0.27	0.19	0.25	0.17	0.27	0.16	0.27	0.26	0.24	0.24	0.63	0.17	0.26	0.26	0.36	0.24	0.26	0.21
O4'	0.20	0.22	0.30	0.27	0.19	0.21	0.18	0.26	0.18	0.20	0.23	0.25	0.81	0.29	0.23	0.22	0.42	0.27	0.24	0.24
O5'	0.33	0.25	0.49	0.22	0.21	0.24	0.28	0.21	0.32	0.30	0.22	0.25	0.91	0.24	0.19	0.34	0.33	0.34	0.26	0.24
O6	0.23	0.16	0.50	0.33	0.18	0.39	0.21	0.49	0.22	0.19	0.16	0.17	0.98	0.50	0.19	0.36	0.35	0.22	0.16	0.17
OP1	0.21	0.18	0.42	0.15	0.16	0.16	0.18	0.18	0.20	0.19	0.17	0.19	0.84	0.23	0.17	0.26	0.32	0.30	0.25	0.20
OP2	0.17	0.15	0.44	0.25	0.16	0.25	0.16	0.27	0.17	0.15	0.17	0.16	0.84	0.35	0.20	0.31	0.34	0.28	0.24	0.19
P	0.20	0.13	0.43	0.16	0.09	0.17	0.15	0.19	0.18	0.16	0.11	0.14	0.88	0.25	0.11	0.27	0.31	0.29	0.22	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.27	0.03	0.00	0.21	0.08	0.36	0.05
C2	0.02	0.00	0.16	0.20	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.17	0.02	0.10	0.35	0.14	0.24	0.12
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.05	0.01	0.15	0.18	0.18	0.03	0.10	0.31	0.00	0.02	0.06	0.01	0.51	0.46	0.42	0.40
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.25	0.00	0.23	0.01	0.19	0.16	0.23	0.18	0.02	0.00	0.25	0.02	0.22	0.23	0.25	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.25	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.17	0.00	0.02	0.47	0.21	0.21	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.06	0.07	0.26	0.03	0.10	0.00	0.02	0.12	0.39	0.10
C5	0.02	0.01	0.15	0.23	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.18	0.01	0.09	0.50	0.23	0.20	0.26
C5'	0.06	0.12	0.18	0.01	0.20	0.01	0.23	0.00	0.20	0.12	0.15	0.10	0.10	0.18	0.21	0.03	0.00	0.14	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.18	0.19	0.01	0.12	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.15	0.01	0.11	0.46	0.18	0.21	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.16	0.02	0.01	0.35	0.13	0.26	0.10
N3	0.02	0.01	0.10	0.23	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.16	0.02	0.06	0.41	0.17	0.20	0.18
O2	0.04	0.00	0.31	0.18	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.22	0.03	0.17	0.28	0.12	0.26	0.08
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.28	0.26	0.34	0.10	0.30	0.16	0.18	0.20	0.00	0.05	0.31	0.17	0.31	0.36	0.42	0.28
O3'	0.27	0.17	0.02	0.00	0.17	0.03	0.18	0.18	0.15	0.16	0.16	0.22	0.05	0.00	0.18	0.19	0.05	0.17	0.31	0.10
O4	0.03	0.02	0.06	0.25	0.00	0.10	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.03	0.31	0.18	0.00	0.02	0.49	0.24	0.23	0.28
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.03	0.11	0.01	0.06	0.17	0.17	0.19	0.02	0.00	0.13	0.23	0.56	0.25
O5'	0.21	0.35	0.51	0.22	0.47	0.02	0.50	0.00	0.46	0.35	0.41	0.28	0.31	0.05	0.49	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.08	0.14	0.46	0.23	0.21	0.12	0.23	0.14	0.18	0.13	0.17	0.12	0.36	0.17	0.24	0.23	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.24	0.42	0.25	0.21	0.39	0.20	0.25	0.21	0.26	0.20	0.26	0.42	0.31	0.23	0.56	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.40	0.11	0.24	0.10	0.26	0.01	0.19	0.10	0.18	0.08	0.28	0.10	0.28	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00