Doublet Group distance statistics: 55449

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.020 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.007, 0.030, 0.052, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.032 std_dev=0.025
N7	A	0, -0.004, 0.033, 0.069, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.033 std_dev=0.037
C8	A	0, -0.003, 0.042, 0.086, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.042 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.020, 0.219, 0.419, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.219 std_dev=0.200
C4	B	0, 0.167, 0.386, 0.605, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.386 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.125, 0.355, 0.586, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.355 std_dev=0.230
C2'	A	0, 0.050, 0.294, 0.538, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.294 std_dev=0.244
C6	B	0, 0.166, 0.413, 0.659, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.413 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.200, 0.462, 0.724, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.462 std_dev=0.262
O4	B	0, 0.220, 0.483, 0.746, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.483 std_dev=0.263
C2	B	0, 0.177, 0.468, 0.760, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.468 std_dev=0.291
N3	B	0, 0.126, 0.425, 0.724, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.425 std_dev=0.299
O2'	B	0, 0.166, 0.476, 0.786, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.476 std_dev=0.310
C4'	A	0, 0.101, 0.429, 0.757, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.429 std_dev=0.328
C1'	B	0, 0.231, 0.595, 0.959, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.595 std_dev=0.364
O2	B	0, 0.204, 0.574, 0.944, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.574 std_dev=0.370
OP1	A	0, 0.348, 0.720, 1.093, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.720 std_dev=0.373
C2'	B	0, 0.219, 0.592, 0.966, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.592 std_dev=0.373
C3'	A	0, 0.084, 0.462, 0.840, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.462 std_dev=0.378
O2'	A	0, 0.090, 0.472, 0.854, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.472 std_dev=0.382
P	A	0, 0.260, 0.692, 1.125, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.692 std_dev=0.433
O5'	A	0, 0.179, 0.646, 1.113, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.646 std_dev=0.467
O4'	B	0, 0.301, 0.803, 1.305, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.803 std_dev=0.502
O3'	B	0, 0.223, 0.730, 1.236, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.730 std_dev=0.507
C3'	B	0, 0.254, 0.763, 1.271, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.763 std_dev=0.509
OP2	A	0, 0.373, 0.908, 1.443, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.908 std_dev=0.535
O3'	A	0, 0.196, 0.742, 1.288, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.742 std_dev=0.546
C5'	A	0, 0.154, 0.733, 1.312, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.733 std_dev=0.579
C4'	B	0, 0.305, 0.892, 1.479, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.892 std_dev=0.587
C5'	B	0, 0.420, 1.098, 1.776, 2.530 max_d=2.530 avg_d=1.098 std_dev=0.678
O5'	B	0, 0.491, 1.227, 1.964, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.227 std_dev=0.737
OP1	B	0, 0.533, 1.336, 2.139, 2.588 max_d=2.588 avg_d=1.336 std_dev=0.803
P	B	0, 0.415, 1.274, 2.132, 2.957 max_d=2.957 avg_d=1.274 std_dev=0.858
OP2	B	0, 0.318, 1.513, 2.708, 4.342 max_d=4.342 avg_d=1.513 std_dev=1.195

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.09	0.02	0.11	0.23	0.12
C2	0.03	0.00	0.15	0.10	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.25	0.06	0.23	0.01	0.19	0.20	0.17
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.12	0.17	0.15	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.20	0.08	0.29	0.16	0.16
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.12	0.03	0.11	0.20	0.09	0.14	0.10	0.19	0.08	0.01	0.01	0.01	0.29	0.14	0.39	0.26	0.28
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.20	0.03	0.24	0.01	0.19	0.20	0.16
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.08	0.13	0.04	0.04	0.03	0.13	0.06	0.06	0.05	0.00	0.02	0.10	0.14	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.25	0.03	0.32	0.01	0.24	0.22	0.22
C5'	0.04	0.11	0.03	0.03	0.13	0.01	0.19	0.00	0.19	0.21	0.15	0.09	0.09	0.23	0.12	0.05	0.14	0.01	0.01	0.23	0.11	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.29	0.04	0.34	0.00	0.26	0.24	0.25
C8	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.22	0.02	0.32	0.02	0.22	0.21	0.19
N1	0.03	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.28	0.05	0.29	0.01	0.23	0.22	0.21
N2	0.03	0.00	0.17	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.27	0.07	0.20	0.02	0.17	0.20	0.15
N3	0.03	0.00	0.15	0.10	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.22	0.05	0.19	0.01	0.16	0.20	0.14
N7	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.13	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.27	0.02	0.37	0.01	0.26	0.22	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.01	0.21	0.02	0.17	0.21	0.14
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.12	0.06	0.08	0.05	0.12	0.06	0.18	0.28	0.21	0.04	0.02	0.00	0.26	0.06	0.15	0.11	0.32	0.17	0.15
O3'	0.05	0.25	0.06	0.01	0.20	0.05	0.25	0.14	0.29	0.22	0.28	0.27	0.22	0.27	0.15	0.26	0.00	0.06	0.25	0.32	0.50	0.51	0.35
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.15	0.04	0.15	0.37	0.24
O5'	0.09	0.23	0.20	0.29	0.24	0.02	0.32	0.01	0.34	0.32	0.29	0.20	0.19	0.37	0.21	0.15	0.25	0.15	0.00	0.38	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.32	0.04	0.38	0.00	0.30	0.27	0.29
OP1	0.11	0.19	0.29	0.39	0.19	0.14	0.24	0.11	0.26	0.22	0.23	0.17	0.16	0.26	0.17	0.32	0.50	0.15	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.20	0.16	0.26	0.20	0.20	0.22	0.25	0.24	0.21	0.22	0.20	0.20	0.22	0.21	0.17	0.51	0.37	0.02	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.17	0.16	0.28	0.16	0.04	0.22	0.01	0.25	0.19	0.21	0.15	0.14	0.25	0.14	0.15	0.35	0.24	0.01	0.29	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.17	0.17	0.18	0.16	0.14	0.22	0.16	0.20	0.11	0.20	0.25	0.21	0.21	0.19	0.12	0.27	0.17	0.27	0.13
C2	0.15	0.15	0.15	0.14	0.19	0.15	0.24	0.13	0.21	0.14	0.12	0.25	0.15	0.17	0.21	0.15	0.07	0.12	0.49	0.15
C2'	0.22	0.22	0.23	0.23	0.21	0.24	0.30	0.24	0.29	0.23	0.22	0.23	0.22	0.25	0.17	0.24	0.38	0.28	0.31	0.23
C3'	0.25	0.21	0.27	0.29	0.23	0.30	0.33	0.34	0.33	0.25	0.21	0.20	0.23	0.26	0.21	0.29	0.48	0.34	0.21	0.31
C4	0.10	0.12	0.14	0.15	0.09	0.11	0.21	0.12	0.20	0.08	0.10	0.23	0.17	0.19	0.12	0.09	0.17	0.15	0.35	0.12
C4'	0.20	0.16	0.25	0.27	0.20	0.27	0.32	0.34	0.31	0.19	0.18	0.19	0.22	0.23	0.19	0.24	0.46	0.33	0.19	0.30
C5	0.17	0.13	0.19	0.20	0.11	0.18	0.22	0.20	0.23	0.15	0.09	0.22	0.20	0.23	0.11	0.17	0.21	0.25	0.36	0.20
C5'	0.25	0.17	0.33	0.36	0.23	0.37	0.36	0.46	0.37	0.24	0.18	0.18	0.27	0.27	0.21	0.32	0.56	0.45	0.34	0.44
C6	0.20	0.14	0.19	0.19	0.17	0.20	0.24	0.20	0.25	0.19	0.12	0.19	0.17	0.21	0.17	0.20	0.19	0.28	0.40	0.22
C8	0.19	0.16	0.24	0.27	0.08	0.23	0.17	0.27	0.21	0.15	0.15	0.23	0.28	0.29	0.09	0.19	0.30	0.24	0.31	0.23
N1	0.17	0.13	0.17	0.17	0.19	0.17	0.24	0.17	0.23	0.17	0.12	0.20	0.16	0.18	0.20	0.17	0.11	0.20	0.46	0.17
N2	0.19	0.20	0.18	0.18	0.22	0.21	0.24	0.19	0.20	0.17	0.18	0.29	0.16	0.19	0.25	0.21	0.12	0.10	0.59	0.21
N3	0.10	0.14	0.13	0.12	0.16	0.10	0.24	0.08	0.20	0.10	0.14	0.25	0.15	0.16	0.19	0.10	0.11	0.10	0.44	0.12
N7	0.23	0.17	0.26	0.29	0.10	0.27	0.19	0.29	0.24	0.19	0.13	0.23	0.29	0.31	0.10	0.24	0.31	0.31	0.37	0.28
N9	0.11	0.14	0.17	0.19	0.07	0.14	0.18	0.16	0.18	0.08	0.15	0.23	0.22	0.22	0.11	0.10	0.23	0.15	0.29	0.13
O2'	0.29	0.30	0.27	0.28	0.34	0.31	0.39	0.32	0.36	0.30	0.32	0.31	0.24	0.29	0.32	0.32	0.47	0.40	0.46	0.36
O3'	0.54	0.42	0.56	0.58	0.40	0.61	0.53	0.64	0.57	0.51	0.38	0.40	0.49	0.53	0.33	0.59	0.79	0.74	0.43	0.63
O4'	0.16	0.14	0.25	0.27	0.15	0.23	0.26	0.28	0.26	0.13	0.17	0.22	0.28	0.27	0.18	0.17	0.37	0.27	0.20	0.23
O5'	0.29	0.27	0.34	0.37	0.22	0.36	0.25	0.40	0.29	0.27	0.26	0.29	0.33	0.34	0.21	0.31	0.42	0.22	0.49	0.36
O6	0.26	0.18	0.24	0.24	0.19	0.27	0.24	0.26	0.27	0.24	0.16	0.19	0.21	0.25	0.18	0.27	0.27	0.39	0.43	0.30
OP1	0.18	0.19	0.24	0.31	0.21	0.28	0.16	0.32	0.16	0.15	0.23	0.21	0.26	0.29	0.26	0.20	0.34	0.21	0.39	0.26
OP2	0.19	0.19	0.23	0.29	0.21	0.27	0.21	0.26	0.21	0.18	0.20	0.20	0.26	0.29	0.23	0.22	0.28	0.23	0.31	0.22
P	0.18	0.16	0.23	0.29	0.14	0.26	0.15	0.29	0.17	0.15	0.17	0.18	0.25	0.27	0.16	0.20	0.31	0.17	0.37	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.19	0.29	0.08
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.16	0.20	0.43	0.14
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.17	0.24	0.05
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.24	0.21	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.20	0.21	0.53	0.19
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.25	0.18	0.08
C5	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.18	0.25	0.52	0.21
C5'	0.03	0.05	0.04	0.02	0.11	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.12	0.01	0.01	0.14	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.04	0.16	0.20	0.45	0.17
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.14	0.14	0.40	0.11
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.00	0.02	0.19	0.19	0.49	0.16
O2	0.04	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.11	0.02	0.03	0.16	0.30	0.40	0.16
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.04	0.08	0.01	0.03	0.11	0.00	0.05	0.05	0.00	0.05	0.19	0.24	0.06
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.11	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.33	0.21	0.09
O4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.00	0.04	0.22	0.24	0.56	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.11	0.22	0.29	0.10
O5'	0.10	0.16	0.06	0.03	0.20	0.01	0.18	0.01	0.16	0.14	0.19	0.16	0.05	0.09	0.22	0.11	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.19	0.20	0.17	0.24	0.21	0.25	0.25	0.14	0.20	0.14	0.19	0.30	0.19	0.33	0.24	0.22	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.43	0.24	0.21	0.53	0.18	0.52	0.19	0.45	0.40	0.49	0.40	0.24	0.21	0.56	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.05	0.07	0.19	0.08	0.21	0.01	0.17	0.11	0.16	0.16	0.06	0.09	0.21	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00