Doublet Group distance statistics: 55450

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.015, 0.025, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.018, 0.032, 0.045, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.021, 0.037, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.013, 0.030, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C5	B	0, 0.418, 0.648, 0.878, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.648 std_dev=0.230
C6	B	0, 0.486, 0.756, 1.025, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.756 std_dev=0.269
C4	B	0, 0.615, 0.930, 1.244, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.930 std_dev=0.315
O4'	A	0, 0.477, 0.824, 1.171, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.824 std_dev=0.347
O4	B	0, 0.680, 1.046, 1.411, 1.412 max_d=1.412 avg_d=1.046 std_dev=0.365
N1	B	0, 0.689, 1.065, 1.440, 1.364 max_d=1.364 avg_d=1.065 std_dev=0.375
C2'	A	0, 0.590, 0.981, 1.373, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.981 std_dev=0.391
N3	B	0, 0.826, 1.249, 1.673, 1.482 max_d=1.482 avg_d=1.249 std_dev=0.424
C2'	B	0, 0.774, 1.206, 1.637, 1.632 max_d=1.632 avg_d=1.206 std_dev=0.431
C1'	B	0, 0.802, 1.234, 1.667, 1.609 max_d=1.609 avg_d=1.234 std_dev=0.433
C3'	A	0, 0.784, 1.226, 1.669, 1.631 max_d=1.631 avg_d=1.226 std_dev=0.443
C2	B	0, 0.870, 1.324, 1.777, 1.590 max_d=1.590 avg_d=1.324 std_dev=0.454
C4'	A	0, 0.696, 1.152, 1.608, 1.610 max_d=1.610 avg_d=1.152 std_dev=0.456
C3'	B	0, 0.840, 1.377, 1.913, 1.718 max_d=1.718 avg_d=1.377 std_dev=0.537
O2	B	0, 1.100, 1.664, 2.229, 1.989 max_d=1.989 avg_d=1.664 std_dev=0.564
O3'	A	0, 1.147, 1.727, 2.307, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.727 std_dev=0.580
O2'	A	0, 0.962, 1.599, 2.235, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.599 std_dev=0.637
OP2	A	0, 1.058, 1.709, 2.360, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.709 std_dev=0.651
C5'	A	0, 0.979, 1.636, 2.294, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.636 std_dev=0.657
O3'	B	0, 0.969, 1.628, 2.287, 2.103 max_d=2.103 avg_d=1.628 std_dev=0.659
P	A	0, 1.287, 2.023, 2.759, 2.638 max_d=2.638 avg_d=2.023 std_dev=0.736
O5'	A	0, 1.298, 2.046, 2.794, 2.607 max_d=2.607 avg_d=2.046 std_dev=0.748
O4'	B	0, 1.271, 2.068, 2.866, 2.802 max_d=2.802 avg_d=2.068 std_dev=0.797
OP1	A	0, 1.455, 2.314, 3.173, 3.048 max_d=3.048 avg_d=2.314 std_dev=0.859
C4'	B	0, 1.353, 2.262, 3.171, 3.034 max_d=3.034 avg_d=2.262 std_dev=0.909
O2'	B	0, 1.716, 2.712, 3.709, 3.275 max_d=3.275 avg_d=2.712 std_dev=0.996
O5'	B	0, 1.578, 2.684, 3.789, 3.631 max_d=3.631 avg_d=2.684 std_dev=1.105
C5'	B	0, 2.116, 3.587, 5.058, 4.610 max_d=4.610 avg_d=3.587 std_dev=1.471
OP1	B	0, 2.286, 3.880, 5.474, 4.976 max_d=4.976 avg_d=3.880 std_dev=1.594
P	B	0, 2.192, 3.819, 5.447, 5.054 max_d=5.054 avg_d=3.819 std_dev=1.627
OP2	B	0, 2.751, 4.592, 6.432, 6.036 max_d=6.036 avg_d=4.592 std_dev=1.840

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.15	0.01	0.15	0.21	0.15
C2	0.03	0.00	0.14	0.09	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.22	0.12	0.10	0.01	0.10	0.20	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.13	0.06	0.08	0.10	0.16	0.14	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.28	0.04	0.34	0.37	0.31
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.14	0.00	0.22	0.01	0.21	0.27	0.15	0.06	0.07	0.28	0.16	0.01	0.01	0.01	0.09	0.24	0.18	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.16	0.11	0.06	0.10	0.01	0.11	0.20	0.14
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.13	0.05	0.10	0.07	0.12	0.05	0.20	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.08	0.02	0.12	0.00	0.14	0.22	0.16
C5'	0.06	0.08	0.13	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.09	0.06	0.10	0.08	0.10	0.04	0.08	0.15	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.21	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.04	0.12	0.00	0.16	0.23	0.17
C8	0.01	0.01	0.08	0.27	0.00	0.13	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.18	0.08	0.13	0.01	0.14	0.21	0.17
N1	0.03	0.00	0.10	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.13	0.09	0.10	0.01	0.12	0.22	0.14
N2	0.04	0.00	0.16	0.06	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.31	0.15	0.10	0.01	0.10	0.19	0.12
N3	0.03	0.00	0.14	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.24	0.12	0.10	0.00	0.11	0.19	0.13
N7	0.00	0.01	0.05	0.28	0.01	0.12	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.19	0.05	0.14	0.01	0.17	0.24	0.19
N9	0.00	0.01	0.01	0.16	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.06	0.01	0.11	0.01	0.11	0.20	0.14
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.16	0.20	0.20	0.08	0.22	0.20	0.21	0.24	0.20	0.23	0.12	0.00	0.04	0.14	0.20	0.24	0.30	0.41	0.25
O3'	0.20	0.22	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.15	0.07	0.18	0.13	0.31	0.24	0.19	0.06	0.04	0.00	0.14	0.23	0.11	0.37	0.27	0.27
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.09	0.15	0.12	0.05	0.01	0.14	0.14	0.00	0.07	0.03	0.07	0.15	0.12
O5'	0.15	0.10	0.28	0.09	0.10	0.01	0.12	0.01	0.12	0.13	0.10	0.10	0.10	0.14	0.11	0.20	0.23	0.07	0.00	0.14	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.04	0.24	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.11	0.03	0.14	0.00	0.20	0.26	0.19
OP1	0.15	0.10	0.34	0.18	0.11	0.06	0.14	0.06	0.16	0.14	0.12	0.10	0.11	0.17	0.11	0.30	0.37	0.07	0.02	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.20	0.37	0.14	0.20	0.06	0.22	0.03	0.23	0.21	0.22	0.19	0.19	0.24	0.20	0.41	0.27	0.15	0.02	0.26	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.13	0.31	0.10	0.14	0.03	0.16	0.02	0.17	0.17	0.14	0.12	0.13	0.19	0.14	0.25	0.27	0.12	0.01	0.19	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.15	0.10	0.38	0.19	0.16	0.25	0.22	0.22	0.17	0.16	0.17	0.52	0.31	0.22	0.10	0.22	0.30	0.26	0.22
C2	0.17	0.14	0.17	0.48	0.09	0.26	0.18	0.34	0.20	0.16	0.11	0.19	0.43	0.37	0.10	0.11	0.33	0.45	0.33	0.34
C2'	0.14	0.16	0.08	0.36	0.18	0.16	0.24	0.17	0.21	0.15	0.16	0.21	0.40	0.31	0.20	0.16	0.15	0.16	0.23	0.15
C3'	0.12	0.16	0.15	0.51	0.13	0.31	0.12	0.36	0.11	0.13	0.16	0.19	0.32	0.43	0.11	0.17	0.40	0.45	0.43	0.39
C4	0.15	0.14	0.10	0.41	0.11	0.23	0.21	0.32	0.21	0.15	0.13	0.17	0.58	0.34	0.10	0.06	0.31	0.41	0.34	0.32
C4'	0.09	0.10	0.07	0.42	0.11	0.23	0.17	0.31	0.15	0.10	0.11	0.13	0.51	0.36	0.09	0.10	0.33	0.43	0.39	0.35
C5	0.14	0.13	0.18	0.40	0.11	0.29	0.18	0.41	0.18	0.12	0.15	0.17	0.70	0.34	0.15	0.10	0.39	0.47	0.43	0.42
C5'	0.16	0.15	0.13	0.36	0.20	0.22	0.25	0.31	0.23	0.17	0.16	0.15	0.62	0.33	0.19	0.14	0.33	0.45	0.43	0.38
C6	0.13	0.14	0.18	0.44	0.15	0.36	0.18	0.49	0.18	0.10	0.17	0.18	0.75	0.37	0.17	0.16	0.47	0.56	0.49	0.50
C8	0.15	0.12	0.21	0.35	0.11	0.23	0.18	0.33	0.19	0.13	0.14	0.15	0.69	0.31	0.12	0.08	0.31	0.38	0.37	0.34
N1	0.14	0.13	0.10	0.49	0.09	0.34	0.16	0.44	0.19	0.12	0.13	0.19	0.59	0.39	0.11	0.11	0.41	0.53	0.41	0.43
N2	0.18	0.14	0.30	0.49	0.11	0.25	0.17	0.31	0.19	0.17	0.11	0.19	0.25	0.37	0.13	0.16	0.30	0.43	0.29	0.31
N3	0.17	0.15	0.12	0.44	0.14	0.22	0.21	0.29	0.22	0.17	0.14	0.18	0.45	0.34	0.14	0.11	0.29	0.40	0.30	0.29
N7	0.14	0.12	0.26	0.35	0.13	0.29	0.16	0.40	0.16	0.11	0.16	0.15	0.75	0.32	0.19	0.13	0.38	0.46	0.45	0.43
N9	0.16	0.14	0.13	0.38	0.14	0.20	0.22	0.28	0.21	0.16	0.14	0.16	0.60	0.32	0.13	0.06	0.27	0.36	0.31	0.29
O2'	0.47	0.45	0.28	0.10	0.62	0.33	0.65	0.37	0.59	0.50	0.49	0.38	0.62	0.18	0.70	0.54	0.35	0.34	0.50	0.45
O3'	0.11	0.12	0.11	0.33	0.06	0.13	0.07	0.19	0.08	0.10	0.10	0.15	0.48	0.19	0.08	0.09	0.27	0.34	0.37	0.29
O4'	0.16	0.14	0.13	0.38	0.15	0.20	0.22	0.29	0.21	0.16	0.14	0.17	0.60	0.33	0.13	0.08	0.29	0.40	0.35	0.31
O5'	0.22	0.20	0.23	0.30	0.24	0.21	0.30	0.30	0.28	0.23	0.20	0.19	0.70	0.30	0.23	0.18	0.33	0.44	0.44	0.39
O6	0.12	0.16	0.29	0.42	0.21	0.45	0.22	0.62	0.18	0.10	0.20	0.18	0.86	0.38	0.23	0.27	0.59	0.67	0.63	0.65
OP1	0.29	0.23	0.35	0.26	0.27	0.25	0.35	0.34	0.35	0.29	0.22	0.20	0.78	0.28	0.23	0.25	0.34	0.45	0.43	0.39
OP2	0.36	0.28	0.45	0.23	0.30	0.25	0.40	0.32	0.41	0.35	0.26	0.25	0.90	0.27	0.24	0.26	0.31	0.41	0.39	0.35
P	0.29	0.24	0.35	0.25	0.28	0.23	0.36	0.32	0.36	0.30	0.23	0.21	0.82	0.28	0.24	0.23	0.32	0.44	0.42	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.01	0.00	0.10	0.08	0.23	0.12
C2	0.01	0.00	0.19	0.25	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.01	0.13	0.11	0.09	0.24	0.14
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.04	0.02	0.14	0.13	0.18	0.02	0.14	0.33	0.00	0.01	0.07	0.01	0.33	0.27	0.46	0.35
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.30	0.00	0.25	0.02	0.19	0.19	0.30	0.23	0.02	0.01	0.32	0.02	0.11	0.09	0.12	0.09
C4	0.01	0.00	0.04	0.30	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.16	0.00	0.02	0.20	0.18	0.29	0.20
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.17	0.07	0.07	0.09	0.25	0.01	0.13	0.00	0.01	0.13	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.14	0.25	0.00	0.17	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.15	0.01	0.11	0.22	0.19	0.28	0.21
C5'	0.05	0.08	0.13	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.15	0.03	0.08	0.14	0.12	0.14	0.14	0.01	0.01	0.11	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.18	0.19	0.01	0.17	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.35	0.08	0.01	0.15	0.16	0.12	0.23	0.15
N1	0.00	0.00	0.02	0.19	0.00	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.04	0.01	0.01	0.09	0.06	0.22	0.11
N3	0.01	0.00	0.14	0.30	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.12	0.00	0.10	0.15	0.14	0.27	0.17
O2	0.01	0.00	0.33	0.23	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.08	0.01	0.22	0.12	0.10	0.24	0.16
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.28	0.25	0.37	0.12	0.35	0.15	0.18	0.25	0.00	0.05	0.32	0.18	0.20	0.18	0.44	0.24
O3'	0.19	0.06	0.01	0.01	0.16	0.01	0.15	0.14	0.08	0.04	0.12	0.08	0.05	0.00	0.20	0.12	0.12	0.31	0.19	0.18
O4	0.01	0.01	0.07	0.32	0.00	0.13	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.20	0.00	0.04	0.23	0.23	0.33	0.24
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.01	0.15	0.01	0.10	0.22	0.18	0.12	0.04	0.00	0.04	0.12	0.08	0.03
O5'	0.10	0.11	0.33	0.11	0.20	0.01	0.22	0.01	0.16	0.09	0.15	0.12	0.20	0.12	0.23	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.09	0.27	0.09	0.18	0.13	0.19	0.11	0.12	0.06	0.14	0.10	0.18	0.31	0.23	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.24	0.46	0.12	0.29	0.05	0.28	0.05	0.23	0.22	0.27	0.24	0.44	0.19	0.33	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.14	0.35	0.09	0.20	0.03	0.21	0.01	0.15	0.11	0.17	0.16	0.24	0.18	0.24	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00