Doublet Group distance statistics: 55451

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C4	A	0, -0.003, 0.009, 0.021, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.012
C2	A	0, -0.004, 0.008, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.008 std_dev=0.012
C1'	A	0, -0.003, 0.011, 0.025, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.011 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.020 std_dev=0.019
N2	A	0, -0.001, 0.022, 0.044, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.022 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.004, 0.063, 0.122, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.063 std_dev=0.059
C4'	A	0, 0.043, 0.111, 0.179, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.111 std_dev=0.068
C2'	A	0, -0.011, 0.068, 0.147, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.068 std_dev=0.079
C6	B	0, 0.055, 0.208, 0.360, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.208 std_dev=0.152
C5	B	0, 0.050, 0.207, 0.364, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.207 std_dev=0.157
C3'	A	0, -0.069, 0.167, 0.403, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.167 std_dev=0.236
N1	B	0, -0.010, 0.238, 0.486, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.238 std_dev=0.248
C5'	A	0, -0.038, 0.219, 0.476, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.219 std_dev=0.257
C4	B	0, -0.040, 0.247, 0.533, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.247 std_dev=0.286
C2'	B	0, -0.020, 0.271, 0.563, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.271 std_dev=0.292
C2	B	0, -0.072, 0.270, 0.612, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.270 std_dev=0.342
C1'	B	0, -0.045, 0.299, 0.642, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.299 std_dev=0.344
N3	B	0, -0.081, 0.270, 0.620, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.270 std_dev=0.351
O4	B	0, -0.095, 0.294, 0.683, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.294 std_dev=0.389
O2'	A	0, -0.197, 0.207, 0.611, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.207 std_dev=0.404
O4'	B	0, -0.075, 0.351, 0.777, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.351 std_dev=0.426
C3'	B	0, -0.112, 0.316, 0.745, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.316 std_dev=0.428
O5'	B	0, -0.060, 0.383, 0.827, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.383 std_dev=0.443
O2	B	0, -0.116, 0.336, 0.788, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.336 std_dev=0.452
O5'	A	0, -0.174, 0.316, 0.806, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.316 std_dev=0.490
O3'	A	0, -0.280, 0.298, 0.877, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.298 std_dev=0.579
C4'	B	0, -0.196, 0.417, 1.029, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.417 std_dev=0.613
OP2	B	0, -0.220, 0.422, 1.064, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.422 std_dev=0.642
OP2	A	0, -0.271, 0.374, 1.019, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.374 std_dev=0.645
P	A	0, -0.295, 0.383, 1.062, 2.292 max_d=2.292 avg_d=0.383 std_dev=0.679
P	B	0, -0.229, 0.456, 1.142, 2.365 max_d=2.365 avg_d=0.456 std_dev=0.685
O2'	B	0, -0.195, 0.494, 1.184, 2.385 max_d=2.385 avg_d=0.494 std_dev=0.689
O3'	B	0, -0.305, 0.462, 1.228, 2.604 max_d=2.604 avg_d=0.462 std_dev=0.767
OP1	B	0, -0.239, 0.553, 1.345, 2.759 max_d=2.759 avg_d=0.553 std_dev=0.792
C5'	B	0, -0.331, 0.487, 1.304, 2.780 max_d=2.780 avg_d=0.487 std_dev=0.818
OP1	A	0, -0.386, 0.460, 1.306, 2.841 max_d=2.841 avg_d=0.460 std_dev=0.846

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.07	0.01	0.34	0.20	0.20
C2	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.31	0.07	0.15	0.00	0.25	0.04	0.05
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.04	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.04	0.00	0.02	0.02	0.28	0.06	0.52	0.34	0.37
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.03	0.02	0.01	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.09	0.09	0.03
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.21	0.04	0.08	0.01	0.35	0.16	0.17
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.11	0.04
C5	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.14	0.02	0.07	0.01	0.41	0.23	0.23
C5'	0.03	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.06	0.11	0.08	0.14	0.09	0.10	0.05	0.03	0.14	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.18	0.04	0.10	0.00	0.36	0.16	0.18
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.03	0.03	0.13	0.01	0.55	0.40	0.39
N1	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.26	0.06	0.14	0.00	0.29	0.06	0.09
N2	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.37	0.09	0.18	0.01	0.19	0.10	0.05
N3	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.31	0.07	0.12	0.00	0.26	0.05	0.07
N7	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.04	0.02	0.09	0.01	0.53	0.37	0.35
N9	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.13	0.01	0.07	0.01	0.41	0.25	0.25
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.12	0.16	0.20	0.03	0.20	0.23	0.14	0.06	0.05	0.25	0.13	0.00	0.03	0.10	0.23	0.24	0.58	0.25	0.33
O3'	0.20	0.31	0.02	0.01	0.21	0.01	0.14	0.14	0.18	0.03	0.26	0.37	0.31	0.04	0.13	0.03	0.00	0.14	0.09	0.15	0.07	0.04	0.11
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.09	0.07	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.07	0.03	0.17	0.13	0.08
O5'	0.07	0.15	0.28	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.13	0.14	0.18	0.12	0.09	0.07	0.23	0.09	0.07	0.00	0.09	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.15	0.03	0.09	0.00	0.38	0.19	0.20
OP1	0.34	0.25	0.52	0.09	0.35	0.10	0.41	0.02	0.36	0.55	0.29	0.19	0.26	0.53	0.41	0.58	0.07	0.17	0.02	0.38	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.04	0.34	0.09	0.16	0.11	0.23	0.08	0.16	0.40	0.06	0.10	0.05	0.37	0.25	0.25	0.04	0.13	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.05	0.37	0.03	0.17	0.04	0.23	0.01	0.18	0.39	0.09	0.05	0.07	0.35	0.25	0.33	0.11	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.21	0.25	0.11	0.06	0.09	0.10	0.33	0.10	0.17	0.11	0.29	0.58	0.12	0.17	0.10	0.12	0.14	0.13	0.08
C2	0.29	0.11	0.29	0.08	0.20	0.15	0.11	0.07	0.07	0.15	0.11	0.22	0.73	0.18	0.36	0.22	0.27	0.13	0.12	0.19
C2'	0.13	0.18	0.16	0.21	0.04	0.20	0.12	0.45	0.08	0.11	0.13	0.25	0.44	0.22	0.09	0.08	0.11	0.22	0.22	0.17
C3'	0.28	0.29	0.34	0.04	0.15	0.06	0.15	0.29	0.21	0.26	0.23	0.33	0.60	0.07	0.08	0.16	0.16	0.08	0.08	0.06
C4	0.26	0.14	0.29	0.03	0.17	0.05	0.10	0.17	0.09	0.17	0.05	0.24	0.67	0.07	0.33	0.16	0.22	0.10	0.08	0.13
C4'	0.15	0.17	0.20	0.21	0.04	0.22	0.09	0.51	0.09	0.13	0.12	0.25	0.51	0.26	0.09	0.08	0.09	0.30	0.31	0.23
C5	0.25	0.05	0.29	0.04	0.24	0.07	0.12	0.13	0.06	0.13	0.16	0.13	0.67	0.09	0.38	0.16	0.25	0.13	0.11	0.17
C5'	0.08	0.05	0.07	0.38	0.16	0.44	0.23	0.75	0.18	0.09	0.06	0.09	0.35	0.46	0.20	0.27	0.28	0.57	0.59	0.50
C6	0.25	0.04	0.28	0.10	0.27	0.15	0.14	0.06	0.03	0.09	0.23	0.07	0.72	0.20	0.41	0.20	0.30	0.17	0.14	0.23
C8	0.19	0.12	0.24	0.11	0.15	0.08	0.10	0.29	0.10	0.14	0.07	0.17	0.52	0.12	0.27	0.08	0.16	0.10	0.09	0.08
N1	0.27	0.05	0.29	0.12	0.25	0.18	0.13	0.06	0.05	0.12	0.19	0.13	0.73	0.23	0.40	0.22	0.30	0.16	0.14	0.23
N2	0.30	0.12	0.29	0.10	0.20	0.17	0.11	0.06	0.07	0.16	0.10	0.23	0.74	0.22	0.35	0.24	0.28	0.14	0.12	0.20
N3	0.28	0.16	0.30	0.04	0.16	0.09	0.10	0.14	0.09	0.18	0.04	0.27	0.71	0.11	0.32	0.19	0.23	0.11	0.09	0.14
N7	0.20	0.05	0.26	0.06	0.23	0.03	0.12	0.20	0.06	0.11	0.16	0.09	0.56	0.06	0.34	0.10	0.22	0.11	0.09	0.14
N9	0.23	0.17	0.27	0.08	0.12	0.04	0.09	0.27	0.10	0.17	0.05	0.25	0.60	0.08	0.27	0.12	0.17	0.10	0.08	0.08
O2'	0.16	0.10	0.10	0.41	0.31	0.40	0.38	0.63	0.30	0.19	0.15	0.05	0.23	0.38	0.39	0.28	0.32	0.40	0.40	0.37
O3'	0.24	0.22	0.27	0.06	0.15	0.05	0.19	0.22	0.22	0.23	0.18	0.23	0.50	0.11	0.10	0.16	0.24	0.16	0.14	0.16
O4'	0.16	0.16	0.21	0.18	0.08	0.18	0.11	0.45	0.08	0.13	0.08	0.24	0.55	0.22	0.17	0.05	0.08	0.25	0.25	0.17
O5'	0.16	0.14	0.07	0.40	0.31	0.50	0.37	0.81	0.30	0.19	0.19	0.08	0.31	0.45	0.37	0.36	0.35	0.64	0.72	0.60
O6	0.21	0.14	0.25	0.15	0.31	0.19	0.16	0.09	0.03	0.04	0.31	0.12	0.70	0.28	0.42	0.19	0.33	0.20	0.17	0.26
OP1	0.74	0.75	0.53	0.90	0.84	1.05	0.88	1.30	0.85	0.78	0.78	0.68	0.31	0.95	0.82	0.93	0.79	0.99	1.13	1.01
OP2	0.46	0.43	0.33	0.77	0.56	0.88	0.61	1.19	0.57	0.49	0.47	0.35	0.07	0.87	0.58	0.69	0.68	1.04	1.06	0.94
P	0.51	0.47	0.34	0.77	0.59	0.90	0.66	1.20	0.62	0.53	0.50	0.39	0.09	0.85	0.59	0.74	0.71	1.01	1.09	0.97

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.09	0.10	0.19	0.17
C2	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.12	0.16	0.26	0.22
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.07	0.12	0.00	0.03	0.07	0.00	0.19	0.11	0.19	0.20
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.22	0.01	0.19	0.03	0.15	0.13	0.20	0.13	0.02	0.01	0.26	0.01	0.16	0.07	0.06	0.10
C4	0.01	0.00	0.04	0.22	0.00	0.12	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.19	0.01	0.02	0.15	0.19	0.26	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.13	0.06	0.07	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.02	0.09	0.08	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.19	0.01	0.14	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.01	0.04	0.15	0.17	0.23	0.18
C5'	0.02	0.10	0.02	0.03	0.22	0.01	0.25	0.00	0.21	0.12	0.15	0.04	0.11	0.09	0.25	0.01	0.01	0.08	0.21	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.13	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01	0.05	0.14	0.15	0.22	0.17
N1	0.00	0.01	0.01	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.00	0.12	0.14	0.23	0.20
N3	0.01	0.00	0.07	0.20	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.14	0.01	0.03	0.14	0.18	0.27	0.23
O2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.01	0.06	0.11	0.15	0.25	0.22
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.11	0.12	0.11	0.11	0.09	0.08	0.11	0.09	0.00	0.08	0.12	0.10	0.03	0.12	0.10	0.05
O3'	0.06	0.07	0.03	0.01	0.19	0.01	0.19	0.09	0.13	0.06	0.14	0.03	0.08	0.00	0.24	0.02	0.04	0.21	0.18	0.05
O4	0.01	0.01	0.07	0.26	0.01	0.14	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.24	0.00	0.02	0.15	0.20	0.25	0.20
O4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.03	0.06	0.10	0.02	0.02	0.00	0.04	0.07	0.14	0.13
O5'	0.09	0.12	0.19	0.16	0.15	0.02	0.15	0.01	0.14	0.12	0.14	0.11	0.03	0.04	0.15	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.10	0.16	0.11	0.07	0.19	0.09	0.17	0.08	0.15	0.14	0.18	0.15	0.12	0.21	0.20	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.26	0.19	0.06	0.26	0.08	0.23	0.21	0.22	0.23	0.27	0.25	0.10	0.18	0.25	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.22	0.20	0.10	0.21	0.03	0.18	0.02	0.17	0.20	0.23	0.22	0.05	0.05	0.20	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00