Doublet Group distance statistics: 55452

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.018, 0.031, 0.045, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.031 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.022, 0.036, 0.051, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.019, 0.036, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.016, 0.035, 0.055, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.035 std_dev=0.020
O3'	A	0, 0.094, 0.225, 0.356, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.225 std_dev=0.131
C5	B	0, 0.235, 0.429, 0.622, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.429 std_dev=0.193
C6	B	0, 0.204, 0.413, 0.622, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.413 std_dev=0.209
C2'	A	0, 0.038, 0.248, 0.459, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.248 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.093, 0.305, 0.518, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.305 std_dev=0.213
C4	B	0, 0.272, 0.490, 0.708, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.490 std_dev=0.218
O4'	A	0, 0.085, 0.313, 0.541, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.313 std_dev=0.228
P	A	0, 0.262, 0.497, 0.732, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.497 std_dev=0.235
C4'	A	0, 0.121, 0.358, 0.595, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.358 std_dev=0.237
N1	B	0, 0.247, 0.488, 0.730, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.488 std_dev=0.242
C3'	B	0, 0.310, 0.558, 0.806, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.558 std_dev=0.248
O4	B	0, 0.278, 0.527, 0.777, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.527 std_dev=0.250
C2'	B	0, 0.307, 0.558, 0.810, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.558 std_dev=0.251
O5'	A	0, 0.197, 0.455, 0.713, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.455 std_dev=0.258
N3	B	0, 0.306, 0.577, 0.847, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.577 std_dev=0.271
O3'	B	0, 0.384, 0.655, 0.926, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.655 std_dev=0.271
OP1	A	0, 0.346, 0.639, 0.932, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.639 std_dev=0.293
C2	B	0, 0.302, 0.595, 0.889, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.595 std_dev=0.293
C1'	B	0, 0.297, 0.592, 0.886, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.592 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.378, 0.680, 0.982, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.680 std_dev=0.302
OP2	A	0, 0.335, 0.640, 0.945, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.640 std_dev=0.305
O4'	B	0, 0.349, 0.669, 0.988, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.669 std_dev=0.319
C5'	B	0, 0.421, 0.746, 1.072, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.746 std_dev=0.326
O2'	B	0, 0.372, 0.703, 1.034, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.703 std_dev=0.331
P	B	0, 0.431, 0.777, 1.123, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.777 std_dev=0.346
O2'	A	0, 0.064, 0.426, 0.788, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.426 std_dev=0.362
OP1	B	0, 0.452, 0.820, 1.187, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.820 std_dev=0.367
OP2	B	0, 0.418, 0.809, 1.200, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.809 std_dev=0.391
O2	B	0, 0.321, 0.727, 1.134, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.727 std_dev=0.406
C5'	A	0, 0.141, 0.624, 1.107, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.624 std_dev=0.483
O5'	B	0, 0.306, 0.809, 1.312, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.809 std_dev=0.503

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.16	0.01	0.08	0.29	0.06
C2	0.03	0.00	0.10	0.07	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.11	0.12	0.21	0.01	0.08	0.27	0.10
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.07	0.07	0.12	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.32	0.03	0.24	0.17	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.09	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.02	0.25	0.18	0.11
C4	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.05	0.07	0.23	0.01	0.08	0.26	0.09
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.11	0.28	0.07
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.04	0.27	0.01	0.10	0.24	0.10
C5'	0.02	0.13	0.03	0.03	0.11	0.01	0.13	0.00	0.14	0.10	0.14	0.12	0.11	0.12	0.08	0.03	0.04	0.02	0.02	0.15	0.12	0.22	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.06	0.27	0.01	0.11	0.23	0.11
C8	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.05	0.28	0.01	0.08	0.25	0.08
N1	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.09	0.09	0.24	0.01	0.09	0.25	0.11
N2	0.03	0.00	0.12	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.14	0.13	0.19	0.02	0.08	0.27	0.10
N3	0.03	0.00	0.09	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.12	0.20	0.01	0.08	0.28	0.09
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.29	0.01	0.10	0.21	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.23	0.01	0.07	0.28	0.07
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.11	0.02	0.07	0.03	0.10	0.08	0.17	0.26	0.20	0.06	0.03	0.00	0.04	0.02	0.35	0.08	0.31	0.17	0.20
O3'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.09	0.14	0.10	0.04	0.03	0.04	0.00	0.04	0.13	0.05	0.24	0.19	0.07
O4'	0.00	0.12	0.02	0.00	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.13	0.12	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.08	0.05	0.11	0.40	0.20
O5'	0.16	0.21	0.32	0.21	0.23	0.03	0.27	0.02	0.27	0.28	0.24	0.19	0.20	0.29	0.23	0.35	0.13	0.08	0.00	0.28	0.03	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.05	0.28	0.00	0.12	0.21	0.12
OP1	0.08	0.08	0.24	0.25	0.08	0.11	0.10	0.12	0.11	0.08	0.09	0.08	0.08	0.10	0.07	0.31	0.24	0.11	0.03	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.27	0.17	0.18	0.26	0.28	0.24	0.22	0.23	0.25	0.25	0.27	0.28	0.21	0.28	0.17	0.19	0.40	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.14	0.11	0.09	0.07	0.10	0.03	0.11	0.08	0.11	0.10	0.09	0.10	0.07	0.20	0.07	0.20	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.19	0.09	0.12	0.23	0.23	0.21	0.38	0.18	0.18	0.21	0.18	0.08	0.10	0.26	0.20	0.46	0.32	0.32	0.30
C2	0.14	0.21	0.13	0.15	0.08	0.20	0.12	0.35	0.12	0.15	0.18	0.27	0.14	0.13	0.05	0.15	0.42	0.41	0.34	0.30
C2'	0.15	0.12	0.12	0.13	0.12	0.20	0.15	0.33	0.16	0.15	0.12	0.11	0.12	0.12	0.14	0.21	0.47	0.28	0.29	0.27
C3'	0.13	0.11	0.09	0.11	0.12	0.19	0.15	0.32	0.15	0.13	0.11	0.09	0.09	0.09	0.12	0.19	0.48	0.27	0.29	0.27
C4	0.13	0.16	0.08	0.13	0.16	0.22	0.20	0.40	0.16	0.14	0.15	0.17	0.08	0.11	0.16	0.19	0.40	0.36	0.31	0.29
C4'	0.14	0.17	0.10	0.12	0.18	0.22	0.16	0.37	0.15	0.16	0.19	0.17	0.09	0.10	0.20	0.19	0.46	0.29	0.27	0.27
C5	0.13	0.14	0.10	0.14	0.15	0.24	0.21	0.42	0.16	0.13	0.12	0.17	0.11	0.13	0.16	0.21	0.33	0.37	0.27	0.26
C5'	0.16	0.17	0.11	0.14	0.17	0.25	0.17	0.41	0.17	0.17	0.18	0.17	0.09	0.12	0.18	0.23	0.46	0.32	0.26	0.29
C6	0.12	0.14	0.14	0.15	0.10	0.22	0.20	0.40	0.15	0.10	0.10	0.20	0.15	0.15	0.11	0.19	0.26	0.40	0.25	0.25
C8	0.15	0.16	0.09	0.13	0.22	0.25	0.23	0.42	0.19	0.16	0.17	0.15	0.08	0.12	0.25	0.24	0.36	0.32	0.26	0.26
N1	0.12	0.17	0.14	0.14	0.05	0.18	0.15	0.36	0.12	0.10	0.13	0.25	0.16	0.13	0.05	0.14	0.33	0.42	0.30	0.27
N2	0.21	0.29	0.19	0.20	0.12	0.21	0.10	0.32	0.14	0.21	0.25	0.37	0.19	0.18	0.11	0.19	0.44	0.42	0.36	0.31
N3	0.15	0.20	0.11	0.15	0.14	0.21	0.16	0.37	0.14	0.17	0.19	0.22	0.11	0.13	0.10	0.17	0.45	0.38	0.34	0.30
N7	0.15	0.14	0.11	0.15	0.19	0.26	0.23	0.43	0.18	0.15	0.14	0.15	0.11	0.14	0.21	0.25	0.30	0.35	0.24	0.26
N9	0.14	0.17	0.08	0.12	0.21	0.24	0.22	0.40	0.18	0.16	0.18	0.16	0.07	0.10	0.23	0.21	0.41	0.33	0.30	0.28
O2'	0.19	0.18	0.19	0.18	0.17	0.20	0.19	0.29	0.20	0.19	0.19	0.19	0.20	0.18	0.19	0.22	0.50	0.29	0.35	0.30
O3'	0.11	0.10	0.07	0.10	0.12	0.15	0.14	0.29	0.13	0.11	0.11	0.09	0.08	0.08	0.12	0.14	0.51	0.31	0.35	0.31
O4'	0.19	0.26	0.15	0.16	0.27	0.25	0.22	0.41	0.20	0.22	0.29	0.26	0.15	0.14	0.30	0.22	0.44	0.31	0.27	0.27
O5'	0.30	0.33	0.26	0.29	0.35	0.37	0.34	0.52	0.32	0.32	0.34	0.31	0.25	0.28	0.36	0.31	0.51	0.46	0.46	0.46
O6	0.14	0.13	0.17	0.18	0.11	0.23	0.20	0.41	0.16	0.10	0.08	0.21	0.19	0.19	0.12	0.21	0.17	0.41	0.20	0.21
OP1	0.18	0.21	0.11	0.15	0.24	0.28	0.20	0.44	0.19	0.19	0.24	0.21	0.11	0.13	0.28	0.25	0.39	0.30	0.27	0.29
OP2	0.32	0.27	0.28	0.29	0.25	0.39	0.28	0.50	0.30	0.30	0.25	0.27	0.28	0.28	0.25	0.40	0.38	0.34	0.29	0.32
P	0.19	0.18	0.11	0.17	0.21	0.30	0.21	0.46	0.20	0.19	0.20	0.17	0.10	0.15	0.24	0.27	0.38	0.32	0.28	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.02	0.03	0.01	0.21	0.08	0.36	0.15
C2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.02	0.03	0.32	0.14	0.42	0.20
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.19	0.01	0.03	0.04	0.01	0.19	0.14	0.32	0.13
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.12	0.03	0.13	0.04	0.07	0.17	0.02	0.01	0.06	0.02	0.22	0.26	0.27	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.39	0.25	0.47	0.27
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.06	0.10	0.05	0.02	0.11	0.00	0.03	0.17	0.30	0.12
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.13	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.02	0.05	0.40	0.26	0.44	0.28
C5'	0.03	0.13	0.02	0.03	0.23	0.01	0.27	0.00	0.23	0.14	0.17	0.12	0.05	0.04	0.25	0.02	0.01	0.31	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.13	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.02	0.05	0.39	0.21	0.39	0.22
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.32	0.13	0.39	0.18
N3	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.01	0.03	0.36	0.19	0.46	0.24
O2	0.07	0.00	0.19	0.17	0.01	0.10	0.02	0.12	0.02	0.03	0.01	0.00	0.19	0.21	0.02	0.06	0.30	0.14	0.41	0.20
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.10	0.19	0.00	0.05	0.08	0.02	0.09	0.13	0.31	0.15
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.06	0.02	0.13	0.04	0.14	0.04	0.07	0.21	0.05	0.00	0.05	0.02	0.18	0.31	0.23	0.13
O4	0.03	0.02	0.04	0.06	0.01	0.11	0.02	0.25	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.05	0.00	0.05	0.39	0.28	0.48	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.05	0.00	0.17	0.11	0.36	0.17
O5'	0.21	0.32	0.19	0.22	0.39	0.03	0.40	0.01	0.39	0.32	0.36	0.30	0.09	0.18	0.39	0.17	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.08	0.14	0.14	0.26	0.25	0.17	0.26	0.31	0.21	0.13	0.19	0.14	0.13	0.31	0.28	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.42	0.32	0.27	0.47	0.30	0.44	0.25	0.39	0.39	0.46	0.41	0.31	0.23	0.48	0.36	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.20	0.13	0.14	0.27	0.12	0.28	0.01	0.22	0.18	0.24	0.20	0.15	0.13	0.29	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00