Doublet Group distance statistics: 55455

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.016, 0.036, 0.055, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.003, 0.023, 0.043, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.018, 0.047, 0.076, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.047 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.013, 0.047, 0.080, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.032, 0.109, 0.186, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.109 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.035, 0.118, 0.201, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.118 std_dev=0.083
C3'	A	0, 0.096, 0.228, 0.360, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.228 std_dev=0.132
C4'	A	0, 0.125, 0.263, 0.401, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.263 std_dev=0.138
O2'	A	0, 0.044, 0.184, 0.324, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.184 std_dev=0.140
O3'	A	0, 0.143, 0.332, 0.521, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.332 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.107, 0.307, 0.507, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.307 std_dev=0.200
N3	B	0, 0.135, 0.348, 0.562, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.348 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.152, 0.371, 0.590, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.371 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.115, 0.334, 0.553, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.334 std_dev=0.219
O4	B	0, 0.141, 0.368, 0.596, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.368 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.122, 0.371, 0.620, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.371 std_dev=0.249
C5'	A	0, 0.185, 0.437, 0.689, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.437 std_dev=0.252
C6	B	0, 0.088, 0.360, 0.633, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.360 std_dev=0.272
N1	B	0, 0.069, 0.348, 0.628, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.348 std_dev=0.280
O2	B	0, 0.147, 0.434, 0.720, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.434 std_dev=0.286
O5'	A	0, 0.200, 0.513, 0.826, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.513 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.074, 0.409, 0.744, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.409 std_dev=0.335
O2'	B	0, 0.190, 0.556, 0.923, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.556 std_dev=0.366
C3'	B	0, 0.284, 0.685, 1.087, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.685 std_dev=0.401
P	A	0, 0.156, 0.561, 0.966, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.561 std_dev=0.405
C4'	B	0, 0.257, 0.697, 1.138, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.697 std_dev=0.441
O5'	B	0, 0.333, 0.791, 1.248, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.791 std_dev=0.457
O4'	B	0, 0.115, 0.575, 1.035, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.575 std_dev=0.460
OP2	A	0, 0.046, 0.534, 1.022, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.534 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.111, 0.651, 1.191, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.651 std_dev=0.540
OP1	B	0, 0.165, 0.708, 1.251, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.708 std_dev=0.543
P	B	0, 0.130, 0.685, 1.241, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.685 std_dev=0.556
OP1	A	0, 0.115, 0.704, 1.294, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.704 std_dev=0.589
OP2	B	0, 0.033, 0.650, 1.268, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.650 std_dev=0.618
O3'	B	0, 0.353, 1.048, 1.743, 2.228 max_d=2.228 avg_d=1.048 std_dev=0.695

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.05	0.07	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.18	0.02	0.16	0.22	0.06
C2	0.06	0.00	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.15	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.07	0.08	0.17	0.01	0.06	0.32	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.33	0.09
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.09	0.12	0.06	0.05	0.04	0.13	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.05	0.35	0.14
C4	0.03	0.02	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.19	0.01	0.06	0.29	0.06
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.09	0.15	0.06	0.07	0.06	0.15	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.12	0.17	0.23	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.04	0.22	0.02	0.12	0.30	0.12
C5'	0.04	0.15	0.02	0.01	0.16	0.00	0.23	0.00	0.24	0.26	0.19	0.14	0.12	0.29	0.15	0.07	0.04	0.01	0.00	0.28	0.26	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.10	0.05	0.22	0.00	0.16	0.32	0.15
C8	0.02	0.03	0.04	0.12	0.02	0.15	0.01	0.26	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.02	0.12	0.04	0.24	0.03	0.10	0.24	0.09
N1	0.05	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.07	0.06	0.20	0.01	0.12	0.33	0.12
N2	0.07	0.01	0.05	0.05	0.02	0.07	0.02	0.14	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.16	0.09	0.10	0.15	0.02	0.05	0.33	0.08
N3	0.06	0.01	0.05	0.04	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.13	0.07	0.08	0.17	0.01	0.05	0.31	0.06
N7	0.01	0.02	0.03	0.13	0.01	0.15	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.14	0.04	0.24	0.04	0.15	0.28	0.15
N9	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.15	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.21	0.03	0.09	0.25	0.05
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.08	0.05	0.07	0.08	0.02	0.12	0.16	0.13	0.02	0.02	0.00	0.06	0.06	0.04	0.07	0.11	0.31	0.09
O3'	0.02	0.07	0.03	0.00	0.06	0.01	0.10	0.04	0.10	0.12	0.07	0.09	0.07	0.14	0.06	0.06	0.00	0.01	0.26	0.13	0.13	0.41	0.26
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.06	0.10	0.08	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.24	0.05	0.28	0.13	0.16
O5'	0.18	0.17	0.04	0.08	0.19	0.01	0.22	0.00	0.22	0.24	0.20	0.15	0.17	0.24	0.21	0.04	0.26	0.24	0.00	0.26	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.03	0.12	0.01	0.12	0.02	0.28	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.07	0.13	0.05	0.26	0.00	0.23	0.33	0.21
OP1	0.16	0.06	0.06	0.05	0.06	0.17	0.12	0.26	0.16	0.10	0.12	0.05	0.05	0.15	0.09	0.11	0.13	0.28	0.02	0.23	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.32	0.33	0.35	0.29	0.23	0.30	0.20	0.32	0.24	0.33	0.33	0.31	0.28	0.25	0.31	0.41	0.13	0.01	0.33	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.09	0.14	0.06	0.03	0.12	0.01	0.15	0.09	0.12	0.08	0.06	0.15	0.05	0.09	0.26	0.16	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.20	0.32	0.14	0.18	0.20	0.13	0.19	0.13	0.12	0.11	0.05	0.30	0.16	0.13	0.16	0.07	0.07	0.09
C2	0.09	0.10	0.16	0.22	0.07	0.12	0.22	0.07	0.25	0.11	0.14	0.19	0.04	0.20	0.06	0.08	0.13	0.13	0.16	0.12
C2'	0.13	0.14	0.19	0.28	0.16	0.15	0.18	0.15	0.17	0.13	0.15	0.15	0.07	0.22	0.17	0.13	0.19	0.12	0.12	0.12
C3'	0.15	0.18	0.12	0.22	0.19	0.10	0.18	0.13	0.17	0.16	0.20	0.19	0.12	0.19	0.22	0.12	0.18	0.07	0.07	0.09
C4	0.06	0.07	0.18	0.32	0.04	0.17	0.19	0.09	0.18	0.06	0.10	0.12	0.08	0.30	0.09	0.08	0.15	0.06	0.05	0.06
C4'	0.12	0.13	0.15	0.28	0.16	0.13	0.19	0.10	0.18	0.14	0.15	0.14	0.10	0.28	0.20	0.09	0.13	0.05	0.04	0.04
C5	0.05	0.13	0.19	0.39	0.06	0.24	0.12	0.15	0.10	0.04	0.14	0.17	0.13	0.40	0.12	0.14	0.21	0.07	0.07	0.11
C5'	0.19	0.17	0.16	0.26	0.22	0.14	0.27	0.17	0.26	0.21	0.19	0.16	0.25	0.31	0.24	0.14	0.09	0.17	0.14	0.11
C6	0.09	0.18	0.20	0.41	0.10	0.27	0.13	0.17	0.12	0.09	0.18	0.24	0.16	0.44	0.12	0.19	0.22	0.09	0.11	0.13
C8	0.05	0.09	0.19	0.39	0.09	0.23	0.11	0.15	0.09	0.04	0.11	0.12	0.12	0.40	0.15	0.13	0.24	0.11	0.13	0.16
N1	0.04	0.19	0.18	0.30	0.10	0.17	0.18	0.06	0.21	0.09	0.19	0.26	0.10	0.30	0.10	0.10	0.18	0.13	0.16	0.13
N2	0.15	0.10	0.15	0.14	0.10	0.12	0.22	0.13	0.27	0.16	0.15	0.21	0.11	0.18	0.08	0.16	0.16	0.18	0.22	0.17
N3	0.11	0.04	0.17	0.24	0.07	0.13	0.23	0.10	0.24	0.12	0.08	0.11	0.05	0.22	0.06	0.10	0.11	0.09	0.12	0.08
N7	0.08	0.12	0.19	0.43	0.09	0.28	0.07	0.20	0.05	0.05	0.13	0.16	0.15	0.45	0.15	0.18	0.27	0.13	0.16	0.18
N9	0.08	0.06	0.19	0.34	0.09	0.19	0.18	0.11	0.16	0.08	0.09	0.09	0.09	0.33	0.13	0.09	0.17	0.07	0.06	0.09
O2'	0.18	0.18	0.28	0.33	0.20	0.22	0.23	0.21	0.22	0.18	0.18	0.19	0.14	0.25	0.21	0.19	0.23	0.17	0.17	0.17
O3'	0.18	0.23	0.14	0.21	0.21	0.13	0.18	0.16	0.17	0.19	0.24	0.25	0.15	0.16	0.24	0.16	0.21	0.10	0.09	0.11
O4'	0.11	0.09	0.20	0.34	0.13	0.19	0.17	0.12	0.17	0.11	0.11	0.11	0.09	0.35	0.16	0.11	0.17	0.07	0.07	0.09
O5'	0.15	0.16	0.21	0.34	0.15	0.20	0.12	0.16	0.12	0.15	0.17	0.17	0.19	0.30	0.19	0.16	0.36	0.25	0.26	0.28
O6	0.17	0.21	0.22	0.51	0.13	0.38	0.12	0.28	0.11	0.14	0.20	0.26	0.20	0.58	0.15	0.30	0.30	0.13	0.19	0.21
OP1	0.18	0.22	0.11	0.21	0.27	0.12	0.27	0.20	0.24	0.23	0.25	0.21	0.25	0.27	0.30	0.14	0.10	0.22	0.15	0.14
OP2	0.36	0.42	0.30	0.31	0.49	0.25	0.48	0.28	0.43	0.41	0.45	0.40	0.46	0.42	0.52	0.28	0.16	0.25	0.20	0.20
P	0.17	0.21	0.10	0.23	0.28	0.09	0.28	0.14	0.24	0.22	0.25	0.20	0.25	0.30	0.32	0.11	0.14	0.18	0.14	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.24	0.01	0.01	0.16	0.17	0.16	0.13
C2	0.02	0.00	0.13	0.04	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.21	0.01	0.14	0.18	0.16	0.19	0.14
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.10	0.03	0.12	0.15	0.13	0.04	0.13	0.19	0.00	0.06	0.09	0.02	0.32	0.24	0.30	0.30
C3'	0.03	0.04	0.00	0.00	0.14	0.00	0.19	0.03	0.17	0.05	0.08	0.10	0.01	0.02	0.14	0.01	0.18	0.09	0.16	0.08
C4	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.13	0.01	0.06	0.18	0.09	0.13	0.08
C4'	0.01	0.09	0.03	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.08	0.15	0.06	0.05	0.08	0.00	0.01	0.19	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.12	0.19	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.02	0.10	0.21	0.08	0.08	0.09
C5'	0.07	0.19	0.15	0.03	0.14	0.00	0.08	0.00	0.05	0.09	0.19	0.24	0.10	0.08	0.17	0.01	0.01	0.25	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.13	0.17	0.01	0.10	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.16	0.02	0.13	0.22	0.12	0.10	0.11
N1	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.18	0.02	0.01	0.19	0.15	0.16	0.12
N3	0.01	0.01	0.13	0.08	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.19	0.15	0.01	0.12	0.18	0.13	0.18	0.12
O2	0.04	0.01	0.19	0.10	0.02	0.15	0.02	0.24	0.01	0.01	0.02	0.00	0.41	0.32	0.02	0.23	0.17	0.17	0.21	0.16
O2'	0.03	0.24	0.00	0.01	0.05	0.06	0.18	0.10	0.23	0.06	0.19	0.41	0.00	0.09	0.06	0.04	0.36	0.34	0.44	0.39
O3'	0.24	0.21	0.06	0.02	0.13	0.05	0.16	0.08	0.16	0.18	0.15	0.32	0.09	0.00	0.12	0.19	0.15	0.20	0.21	0.06
O4	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.08	0.02	0.17	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.07	0.17	0.08	0.13	0.07
O4'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.12	0.23	0.04	0.19	0.07	0.00	0.25	0.27	0.10	0.15
O5'	0.16	0.18	0.32	0.18	0.18	0.01	0.21	0.01	0.22	0.19	0.18	0.17	0.36	0.15	0.17	0.25	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.16	0.24	0.09	0.09	0.19	0.08	0.25	0.12	0.15	0.13	0.17	0.34	0.20	0.08	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.19	0.30	0.16	0.13	0.11	0.08	0.09	0.10	0.16	0.18	0.21	0.44	0.21	0.13	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.14	0.30	0.08	0.08	0.02	0.09	0.01	0.11	0.12	0.12	0.16	0.39	0.06	0.07	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00