Doublet Group distance statistics: 55456

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.015, 0.034, 0.053, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.034 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.031 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.007, 0.033, 0.059, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.010, 0.038, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.038 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.009, 0.037, 0.065, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.037 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.007, 0.040, 0.073, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.040 std_dev=0.033
C1'	A	0, 0.006, 0.041, 0.075, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.041 std_dev=0.035
N2	A	0, 0.019, 0.077, 0.135, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.077 std_dev=0.058
P	B	0, 0.140, 0.375, 0.610, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.375 std_dev=0.235
O2	B	0, 0.142, 0.382, 0.622, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.382 std_dev=0.240
C2	B	0, 0.098, 0.350, 0.603, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.350 std_dev=0.252
OP2	B	0, 0.011, 0.266, 0.520, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.266 std_dev=0.254
O4'	A	0, 0.035, 0.298, 0.561, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.298 std_dev=0.263
OP1	B	0, 0.203, 0.494, 0.784, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.494 std_dev=0.290
N3	B	0, 0.066, 0.366, 0.665, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.366 std_dev=0.299
N1	B	0, 0.061, 0.363, 0.665, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.363 std_dev=0.302
C2'	B	0, 0.116, 0.419, 0.722, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.419 std_dev=0.303
C5'	B	0, 0.176, 0.490, 0.804, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.490 std_dev=0.314
P	A	0, 0.090, 0.425, 0.760, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.425 std_dev=0.335
C3'	A	0, -0.034, 0.303, 0.640, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.303 std_dev=0.337
C1'	B	0, 0.092, 0.430, 0.768, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.430 std_dev=0.338
C3'	B	0, 0.140, 0.479, 0.819, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.479 std_dev=0.339
O3'	B	0, 0.160, 0.516, 0.872, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.516 std_dev=0.356
O5'	B	0, 0.199, 0.562, 0.925, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.562 std_dev=0.363
O5'	A	0, 0.097, 0.464, 0.830, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.464 std_dev=0.366
C4'	B	0, 0.132, 0.511, 0.890, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.511 std_dev=0.379
O2'	B	0, 0.109, 0.494, 0.880, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.494 std_dev=0.386
C2'	A	0, -0.033, 0.353, 0.739, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.353 std_dev=0.386
C4'	A	0, 0.045, 0.432, 0.819, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.432 std_dev=0.387
OP1	A	0, 0.187, 0.576, 0.965, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.576 std_dev=0.389
O3'	A	0, -0.079, 0.311, 0.701, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.311 std_dev=0.390
C6	B	0, -0.056, 0.349, 0.753, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.349 std_dev=0.404
C4	B	0, -0.020, 0.386, 0.792, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.386 std_dev=0.406
O4'	B	0, 0.096, 0.503, 0.910, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.503 std_dev=0.407
OP2	A	0, 0.189, 0.647, 1.105, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.647 std_dev=0.458
O4	B	0, 0.025, 0.487, 0.949, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.487 std_dev=0.462
C5	B	0, -0.130, 0.341, 0.811, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.341 std_dev=0.470
O2'	A	0, -0.031, 0.634, 1.300, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.634 std_dev=0.665
C5'	A	0, 0.047, 0.757, 1.467, 2.046 max_d=2.046 avg_d=0.757 std_dev=0.710

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.08	0.04	0.01	0.08	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.18	0.04	0.31	0.27	0.10
C2	0.09	0.00	0.24	0.13	0.02	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.30	0.11	0.07	0.22	0.02	0.33	0.34	0.20
C2'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.11	0.01	0.05	0.15	0.10	0.11	0.19	0.30	0.23	0.06	0.00	0.00	0.06	0.02	0.40	0.07	0.39	0.43	0.33
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.11	0.09	0.13	0.16	0.12	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.20	0.12	0.24	0.38	0.10
C4	0.04	0.02	0.11	0.08	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.05	0.28	0.02	0.32	0.35	0.22
C4'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.11	0.03	0.08	0.05	0.09	0.04	0.13	0.02	0.01	0.01	0.05	0.36	0.26	0.13
C5	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.07	0.02	0.37	0.01	0.35	0.44	0.30
C5'	0.08	0.12	0.15	0.01	0.15	0.01	0.22	0.00	0.21	0.27	0.16	0.10	0.10	0.28	0.17	0.03	0.17	0.02	0.01	0.24	0.13	0.26	0.02
C6	0.04	0.02	0.10	0.11	0.02	0.03	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.04	0.37	0.00	0.36	0.47	0.33
C8	0.01	0.01	0.11	0.09	0.01	0.11	0.00	0.27	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.25	0.06	0.08	0.41	0.02	0.33	0.40	0.27
N1	0.08	0.00	0.19	0.13	0.04	0.03	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.19	0.07	0.05	0.30	0.02	0.34	0.41	0.27
N2	0.12	0.00	0.30	0.16	0.03	0.08	0.01	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.42	0.13	0.09	0.17	0.04	0.34	0.31	0.17
N3	0.08	0.01	0.23	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.29	0.12	0.08	0.19	0.01	0.32	0.30	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.06	0.05	0.44	0.03	0.36	0.47	0.34
N9	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.17	0.03	0.00	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.28	0.03	0.31	0.32	0.19
O2'	0.01	0.30	0.00	0.02	0.09	0.13	0.08	0.03	0.07	0.25	0.19	0.42	0.29	0.21	0.10	0.00	0.13	0.05	0.32	0.07	0.31	0.50	0.30
O3'	0.15	0.11	0.06	0.01	0.11	0.02	0.07	0.17	0.07	0.06	0.07	0.13	0.12	0.06	0.10	0.13	0.00	0.10	0.09	0.06	0.36	0.42	0.14
O4'	0.00	0.07	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.05	0.09	0.08	0.05	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.03	0.36	0.27	0.13
O5'	0.18	0.22	0.40	0.20	0.28	0.01	0.37	0.01	0.37	0.41	0.30	0.17	0.19	0.44	0.28	0.32	0.09	0.05	0.00	0.42	0.01	0.01	0.01
O6	0.04	0.02	0.07	0.12	0.02	0.05	0.01	0.24	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.06	0.03	0.42	0.00	0.40	0.53	0.38
OP1	0.31	0.33	0.39	0.24	0.32	0.36	0.35	0.13	0.36	0.33	0.34	0.34	0.32	0.36	0.31	0.31	0.36	0.36	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.34	0.43	0.38	0.35	0.26	0.44	0.26	0.47	0.40	0.41	0.31	0.30	0.47	0.32	0.50	0.42	0.27	0.01	0.53	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.20	0.33	0.10	0.22	0.13	0.30	0.02	0.33	0.27	0.27	0.17	0.16	0.34	0.19	0.30	0.14	0.13	0.01	0.38	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.07	0.14	0.25	0.23	0.30	0.06	0.18	0.13	0.10	0.20	0.07	0.09	0.22	0.39	0.40	0.15	0.17	0.10	0.11
C2	0.20	0.12	0.22	0.25	0.07	0.26	0.27	0.16	0.28	0.17	0.12	0.18	0.21	0.21	0.08	0.30	0.19	0.15	0.15	0.13
C2'	0.30	0.09	0.19	0.27	0.14	0.34	0.09	0.22	0.21	0.19	0.09	0.09	0.13	0.27	0.28	0.47	0.20	0.30	0.18	0.18
C3'	0.41	0.11	0.29	0.43	0.14	0.52	0.07	0.41	0.26	0.26	0.08	0.13	0.19	0.43	0.33	0.62	0.38	0.25	0.39	0.33
C4	0.17	0.10	0.15	0.24	0.21	0.26	0.05	0.14	0.14	0.07	0.22	0.12	0.12	0.19	0.33	0.33	0.15	0.16	0.15	0.13
C4'	0.27	0.06	0.16	0.29	0.19	0.37	0.08	0.28	0.19	0.15	0.16	0.05	0.08	0.28	0.35	0.48	0.27	0.24	0.29	0.26
C5	0.10	0.14	0.12	0.21	0.24	0.21	0.14	0.12	0.08	0.05	0.24	0.14	0.12	0.16	0.31	0.26	0.15	0.17	0.19	0.16
C5'	0.36	0.33	0.35	0.39	0.38	0.44	0.34	0.44	0.36	0.33	0.37	0.32	0.36	0.39	0.46	0.48	0.47	0.51	0.49	0.51
C6	0.07	0.13	0.14	0.21	0.17	0.19	0.12	0.14	0.09	0.03	0.20	0.16	0.17	0.16	0.20	0.19	0.19	0.19	0.21	0.18
C8	0.12	0.17	0.09	0.20	0.33	0.23	0.25	0.12	0.13	0.09	0.28	0.14	0.11	0.18	0.42	0.29	0.10	0.17	0.14	0.14
N1	0.14	0.07	0.20	0.24	0.11	0.22	0.20	0.15	0.20	0.11	0.10	0.16	0.21	0.19	0.13	0.24	0.20	0.16	0.18	0.16
N2	0.23	0.17	0.25	0.27	0.22	0.27	0.38	0.17	0.34	0.22	0.14	0.23	0.26	0.23	0.17	0.31	0.20	0.13	0.13	0.12
N3	0.21	0.12	0.19	0.25	0.10	0.28	0.18	0.15	0.25	0.15	0.19	0.16	0.17	0.20	0.24	0.35	0.17	0.14	0.12	0.11
N7	0.10	0.20	0.09	0.18	0.32	0.19	0.26	0.10	0.17	0.14	0.28	0.17	0.14	0.16	0.37	0.23	0.12	0.18	0.20	0.17
N9	0.17	0.11	0.12	0.23	0.28	0.27	0.12	0.15	0.07	0.05	0.24	0.11	0.09	0.20	0.41	0.35	0.13	0.17	0.12	0.12
O2'	0.20	0.10	0.21	0.27	0.21	0.32	0.11	0.42	0.14	0.13	0.17	0.10	0.20	0.26	0.34	0.31	0.50	0.67	0.55	0.58
O3'	0.41	0.18	0.28	0.43	0.31	0.56	0.17	0.47	0.27	0.26	0.26	0.17	0.20	0.44	0.51	0.64	0.48	0.41	0.48	0.46
O4'	0.20	0.09	0.11	0.25	0.26	0.33	0.07	0.23	0.11	0.07	0.24	0.10	0.07	0.24	0.43	0.42	0.18	0.15	0.16	0.14
O5'	0.37	0.51	0.48	0.39	0.56	0.31	0.48	0.38	0.41	0.43	0.57	0.51	0.58	0.38	0.63	0.20	0.39	0.45	0.33	0.38
O6	0.05	0.18	0.11	0.18	0.18	0.14	0.13	0.16	0.09	0.10	0.21	0.20	0.20	0.14	0.19	0.10	0.21	0.21	0.23	0.21
OP1	0.27	0.47	0.39	0.28	0.57	0.21	0.48	0.27	0.37	0.37	0.55	0.46	0.52	0.25	0.66	0.09	0.25	0.29	0.22	0.22
OP2	0.41	0.48	0.47	0.42	0.52	0.42	0.45	0.42	0.41	0.43	0.52	0.49	0.56	0.39	0.58	0.41	0.40	0.35	0.40	0.37
P	0.25	0.42	0.38	0.26	0.50	0.19	0.41	0.23	0.32	0.33	0.50	0.43	0.50	0.23	0.58	0.10	0.22	0.23	0.18	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.09	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.14	0.14	0.18	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.01	0.03	0.29	0.32	0.36	0.33
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.14	0.05	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.05	0.01	0.17	0.20	0.22	0.19
C3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.03	0.08	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.09	0.12	0.05
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.33	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.48	0.54	0.57	0.55
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.14	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.13	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.05	0.52	0.57	0.58	0.58
C5'	0.09	0.19	0.14	0.03	0.33	0.01	0.36	0.00	0.32	0.20	0.25	0.12	0.11	0.05	0.35	0.04	0.01	0.06	0.07	0.01
C6	0.03	0.00	0.05	0.08	0.01	0.12	0.01	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.01	0.05	0.46	0.45	0.44	0.46
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.20	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.02	0.30	0.30	0.32	0.31
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.05	0.01	0.25	0.00	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.01	0.04	0.38	0.43	0.48	0.44
O2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.04	0.02	0.04	0.21	0.24	0.30	0.25
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.11	0.02	0.04	0.09	0.14	0.00	0.04	0.07	0.02	0.13	0.19	0.23	0.17
O3'	0.08	0.04	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.05	0.12	0.07	0.05	0.04	0.04	0.00	0.08	0.10	0.05	0.08	0.12	0.03
O4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.11	0.01	0.35	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.08	0.00	0.05	0.51	0.61	0.64	0.61
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.02	0.04	0.04	0.02	0.10	0.05	0.00	0.10	0.04	0.19	0.06
O5'	0.14	0.29	0.17	0.04	0.48	0.02	0.52	0.01	0.46	0.30	0.38	0.21	0.13	0.05	0.51	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.32	0.20	0.09	0.54	0.06	0.57	0.06	0.45	0.30	0.43	0.24	0.19	0.08	0.61	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.36	0.22	0.12	0.57	0.14	0.58	0.07	0.44	0.32	0.48	0.30	0.23	0.12	0.64	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.33	0.19	0.05	0.55	0.02	0.58	0.01	0.46	0.31	0.44	0.25	0.17	0.03	0.61	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00