Doublet Group distance statistics: 55472

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, -0.001, 0.014, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C4	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.003, 0.015, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.003, 0.016, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.018
N3	A	0, -0.002, 0.019, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.001, 0.029, 0.057, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N7	A	0, 0.004, 0.054, 0.104, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.054 std_dev=0.050
C8	A	0, 0.006, 0.056, 0.106, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.056 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.008, 0.082, 0.157, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.082 std_dev=0.075
C2'	A	0, -0.001, 0.109, 0.218, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.109 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.007, 0.207, 0.407, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.207 std_dev=0.200
C3'	A	0, 0.009, 0.212, 0.415, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.212 std_dev=0.203
O5'	A	0, 0.027, 0.271, 0.516, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.271 std_dev=0.244
O2'	A	0, -0.067, 0.180, 0.427, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.180 std_dev=0.247
OP2	A	0, 0.046, 0.328, 0.611, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.328 std_dev=0.283
C5'	A	0, 0.015, 0.299, 0.583, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.299 std_dev=0.284
P	A	0, 0.029, 0.335, 0.641, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.335 std_dev=0.306
O3'	A	0, 0.000, 0.311, 0.622, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.311 std_dev=0.311
OP1	A	0, 0.001, 0.448, 0.895, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.448 std_dev=0.447
C2'	B	0, 0.036, 0.504, 0.971, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.504 std_dev=0.468
C2	B	0, 0.045, 0.514, 0.983, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.514 std_dev=0.469
O2	B	0, 0.047, 0.517, 0.988, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.517 std_dev=0.471
N3	B	0, 0.032, 0.515, 0.998, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.515 std_dev=0.483
N1	B	0, 0.044, 0.528, 1.013, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.528 std_dev=0.484
C6	B	0, 0.036, 0.530, 1.025, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.530 std_dev=0.494
C1'	B	0, 0.044, 0.560, 1.076, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.560 std_dev=0.516
C5	B	0, 0.016, 0.537, 1.057, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.537 std_dev=0.521
C4	B	0, 0.007, 0.530, 1.052, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.530 std_dev=0.523
O4'	B	0, 0.043, 0.614, 1.185, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.614 std_dev=0.571
N4	B	0, -0.043, 0.552, 1.148, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.552 std_dev=0.596
C4'	B	0, 0.026, 0.673, 1.321, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.673 std_dev=0.647
O5'	B	0, -0.007, 0.668, 1.343, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.668 std_dev=0.675
C5'	B	0, 0.006, 0.720, 1.433, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.720 std_dev=0.713
OP2	B	0, 0.029, 0.763, 1.497, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.763 std_dev=0.734
P	B	0, 0.021, 0.761, 1.501, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.761 std_dev=0.740
O2'	B	0, -0.059, 0.694, 1.447, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.694 std_dev=0.753
C3'	B	0, -0.041, 0.736, 1.513, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.736 std_dev=0.777
OP1	B	0, -0.008, 0.952, 1.911, 2.246 max_d=2.246 avg_d=0.952 std_dev=0.959
O3'	B	0, -0.154, 0.996, 2.147, 2.871 max_d=2.871 avg_d=0.996 std_dev=1.151

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.02	0.12	0.05
C2	0.04	0.00	0.11	0.11	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.13	0.09
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.08	0.13	0.11	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.11	0.09	0.14	0.11	0.11	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.07	0.05	0.06
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.12	0.08
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.05	0.08	0.06	0.11	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.11	0.04	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.02	0.02	0.14	0.12	0.12
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.07	0.04	0.03	0.15	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.17	0.04	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.05	0.01	0.18	0.14	0.16
C8	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.05	0.05	0.04	0.10	0.11	0.05
N1	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.13	0.13	0.13
N2	0.04	0.01	0.13	0.14	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.19	0.02	0.07	0.02	0.06	0.12	0.09
N3	0.04	0.00	0.11	0.11	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.02	0.07	0.01	0.05	0.13	0.08
N7	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.05	0.05	0.03	0.17	0.10	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.04	0.12	0.05
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.07	0.03	0.04	0.03	0.07	0.04	0.13	0.19	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04
O3'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.10	0.11	0.11	0.19	0.13	0.12	0.04	0.02	0.00	0.01	0.13	0.13	0.11	0.15	0.13
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.06	0.04	0.15	0.09
O5'	0.09	0.05	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.04	0.07	0.07	0.05	0.06	0.03	0.13	0.13	0.00	0.10	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.03	0.12	0.01	0.11	0.02	0.17	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.13	0.06	0.10	0.00	0.25	0.18	0.22
OP1	0.02	0.08	0.05	0.07	0.08	0.04	0.14	0.04	0.18	0.10	0.13	0.06	0.05	0.17	0.04	0.04	0.11	0.04	0.02	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.13	0.04	0.05	0.12	0.03	0.12	0.03	0.14	0.11	0.13	0.12	0.13	0.10	0.12	0.01	0.15	0.15	0.02	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.02	0.06	0.08	0.01	0.12	0.01	0.16	0.05	0.13	0.09	0.08	0.12	0.05	0.04	0.13	0.09	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.36	0.28	0.33	0.31	0.34	0.26	0.34	0.28	0.33	0.36	0.29	0.38	0.41	0.32	0.38	0.24	0.07	0.23	0.11
C2	0.39	0.38	0.31	0.49	0.37	0.44	0.37	0.45	0.38	0.38	0.38	0.36	0.38	0.34	0.48	0.44	0.36	0.11	0.19	0.20
C2'	0.41	0.45	0.35	0.35	0.45	0.38	0.37	0.37	0.37	0.41	0.48	0.47	0.46	0.54	0.37	0.43	0.28	0.20	0.16	0.01
C3'	0.49	0.54	0.43	0.41	0.52	0.46	0.44	0.44	0.44	0.49	0.56	0.54	0.55	0.61	0.46	0.51	0.36	0.34	0.11	0.10
C4	0.35	0.36	0.27	0.40	0.33	0.38	0.30	0.38	0.31	0.34	0.35	0.30	0.36	0.34	0.36	0.40	0.28	0.04	0.22	0.16
C4'	0.46	0.49	0.39	0.39	0.41	0.44	0.35	0.42	0.38	0.45	0.49	0.38	0.52	0.55	0.47	0.48	0.32	0.27	0.17	0.04
C5	0.35	0.35	0.26	0.41	0.30	0.38	0.28	0.37	0.30	0.34	0.33	0.25	0.36	0.30	0.37	0.40	0.27	0.08	0.26	0.18
C5'	0.49	0.51	0.42	0.42	0.39	0.48	0.33	0.45	0.39	0.47	0.49	0.31	0.56	0.57	0.55	0.52	0.36	0.36	0.19	0.12
C6	0.39	0.37	0.30	0.49	0.33	0.43	0.34	0.43	0.36	0.38	0.35	0.27	0.38	0.29	0.46	0.44	0.34	0.15	0.25	0.22
C8	0.30	0.31	0.23	0.29	0.21	0.31	0.17	0.30	0.21	0.28	0.28	0.14	0.33	0.33	0.30	0.34	0.18	0.09	0.32	0.17
N1	0.40	0.38	0.32	0.52	0.36	0.46	0.37	0.46	0.38	0.39	0.37	0.32	0.38	0.32	0.51	0.46	0.38	0.15	0.22	0.23
N2	0.38	0.38	0.30	0.50	0.38	0.44	0.38	0.45	0.38	0.38	0.38	0.37	0.37	0.33	0.51	0.44	0.38	0.13	0.21	0.22
N3	0.37	0.37	0.29	0.44	0.36	0.41	0.35	0.41	0.35	0.37	0.37	0.35	0.37	0.35	0.41	0.42	0.32	0.05	0.18	0.16
N7	0.31	0.31	0.23	0.33	0.22	0.33	0.18	0.31	0.23	0.29	0.28	0.17	0.34	0.29	0.31	0.36	0.19	0.10	0.34	0.20
N9	0.32	0.34	0.25	0.34	0.29	0.34	0.25	0.33	0.27	0.31	0.33	0.25	0.35	0.36	0.31	0.37	0.23	0.05	0.25	0.14
O2'	0.41	0.47	0.36	0.35	0.45	0.37	0.37	0.35	0.36	0.41	0.49	0.47	0.49	0.55	0.37	0.42	0.26	0.16	0.18	0.04
O3'	0.56	0.62	0.51	0.46	0.61	0.51	0.51	0.49	0.51	0.57	0.66	0.65	0.64	0.73	0.53	0.57	0.42	0.46	0.08	0.19
O4'	0.34	0.36	0.28	0.31	0.27	0.34	0.22	0.33	0.26	0.32	0.34	0.21	0.39	0.41	0.35	0.38	0.23	0.11	0.25	0.10
O5'	0.45	0.49	0.40	0.38	0.36	0.42	0.29	0.39	0.34	0.43	0.48	0.27	0.53	0.56	0.52	0.46	0.32	0.38	0.24	0.14
O6	0.42	0.39	0.32	0.53	0.32	0.47	0.34	0.45	0.38	0.40	0.35	0.25	0.40	0.29	0.52	0.47	0.37	0.22	0.30	0.27
OP1	0.52	0.50	0.44	0.48	0.27	0.53	0.25	0.49	0.36	0.46	0.42	0.09	0.58	0.54	0.68	0.55	0.40	0.47	0.19	0.20
OP2	0.45	0.48	0.40	0.41	0.22	0.42	0.18	0.39	0.29	0.41	0.43	0.04	0.55	0.55	0.57	0.45	0.32	0.45	0.22	0.15
P	0.51	0.52	0.45	0.46	0.30	0.49	0.27	0.46	0.36	0.47	0.46	0.11	0.58	0.57	0.63	0.52	0.38	0.45	0.20	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.00	0.11	0.27	0.20	0.14
C2	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.27	0.01	0.07	0.29	0.27	0.14
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.13	0.07	0.03	0.03	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.25	0.52	0.27	0.32
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.11	0.01	0.16	0.03	0.16	0.07	0.06	0.12	0.05	0.01	0.01	0.01	0.11	0.34	0.14	0.18
C4	0.00	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.28	0.12	0.02	0.04	0.23	0.31	0.15
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.04
C5	0.00	0.01	0.08	0.16	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.02	0.01	0.04	0.19	0.31	0.17
C5'	0.04	0.02	0.13	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.07	0.02	0.04	0.16	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.02	0.01	0.04	0.19	0.29	0.16
N1	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.16	0.01	0.07	0.25	0.26	0.14
N3	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.22	0.02	0.06	0.27	0.30	0.14
N4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.31	0.11	0.03	0.04	0.23	0.31	0.15
O2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.39	0.01	0.09	0.32	0.26	0.14
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.28	0.17	0.26	0.04	0.20	0.16	0.25	0.31	0.14	0.00	0.04	0.12	0.20	0.61	0.31	0.33
O3'	0.24	0.27	0.01	0.01	0.12	0.01	0.02	0.16	0.02	0.16	0.22	0.11	0.39	0.04	0.00	0.16	0.25	0.52	0.32	0.33
O4'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.12	0.16	0.00	0.07	0.09	0.17	0.12
O5'	0.11	0.07	0.25	0.11	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04	0.09	0.20	0.25	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.27	0.29	0.52	0.34	0.23	0.08	0.19	0.10	0.19	0.25	0.27	0.23	0.32	0.61	0.52	0.09	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.20	0.27	0.27	0.14	0.31	0.03	0.31	0.08	0.29	0.26	0.30	0.31	0.26	0.31	0.32	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.14	0.32	0.18	0.15	0.04	0.17	0.02	0.16	0.14	0.14	0.15	0.14	0.33	0.33	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00