Doublet Group distance statistics: 55475

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 8, 3, 2, 2, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.013, 0.021, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.011, 0.020, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.016, 0.026, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.013, 0.031, 0.048, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.033, 0.052, 0.071, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.052 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.020, 0.046, 0.071, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.046 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.008, 0.038, 0.068, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.038 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.004, 0.039, 0.075, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.039 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.192, 0.304, 0.416, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.304 std_dev=0.112
O4'	A	0, 0.181, 0.301, 0.422, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.301 std_dev=0.121
O2'	A	0, 0.175, 0.313, 0.451, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.313 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.308, 0.525, 0.742, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.525 std_dev=0.217
C4'	A	0, 0.276, 0.495, 0.714, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.495 std_dev=0.219
N9	B	0, 0.204, 0.429, 0.654, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.429 std_dev=0.225
O2'	B	0, 0.337, 0.574, 0.812, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.574 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.210, 0.454, 0.698, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.454 std_dev=0.244
C8	B	0, 0.306, 0.561, 0.817, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.561 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.164, 0.427, 0.690, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.427 std_dev=0.263
N7	B	0, 0.307, 0.573, 0.838, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.573 std_dev=0.265
C4	B	0, 0.100, 0.367, 0.635, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.367 std_dev=0.268
C5'	A	0, 0.363, 0.681, 0.999, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.681 std_dev=0.318
N3	B	0, 0.104, 0.425, 0.745, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.425 std_dev=0.320
O3'	A	0, 0.434, 0.768, 1.102, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.768 std_dev=0.334
C2'	B	0, 0.175, 0.513, 0.852, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.513 std_dev=0.338
C6	B	0, 0.058, 0.404, 0.750, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.404 std_dev=0.346
C2	B	0, 0.132, 0.488, 0.845, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.488 std_dev=0.356
N1	B	0, 0.038, 0.426, 0.815, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.426 std_dev=0.388
N6	B	0, 0.061, 0.467, 0.873, 2.128 max_d=2.128 avg_d=0.467 std_dev=0.406
O4'	B	0, 0.218, 0.706, 1.193, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.706 std_dev=0.488
C3'	B	0, 0.080, 0.710, 1.339, 2.336 max_d=2.336 avg_d=0.710 std_dev=0.630
C4'	B	0, 0.152, 0.807, 1.461, 2.937 max_d=2.937 avg_d=0.807 std_dev=0.655
O5'	A	0, -0.010, 0.659, 1.329, 3.720 max_d=3.720 avg_d=0.659 std_dev=0.669
OP2	B	0, 0.065, 0.815, 1.565, 4.083 max_d=4.083 avg_d=0.815 std_dev=0.750
O5'	B	0, 0.270, 1.070, 1.870, 4.242 max_d=4.242 avg_d=1.070 std_dev=0.800
O3'	B	0, 0.067, 0.882, 1.698, 3.132 max_d=3.132 avg_d=0.882 std_dev=0.816
P	B	0, 0.041, 0.861, 1.680, 4.463 max_d=4.463 avg_d=0.861 std_dev=0.819
OP1	B	0, 0.384, 1.247, 2.110, 4.954 max_d=4.954 avg_d=1.247 std_dev=0.863
P	A	0, -0.374, 0.583, 1.541, 5.081 max_d=5.081 avg_d=0.583 std_dev=0.957
C5'	B	0, 0.144, 1.111, 2.078, 4.358 max_d=4.358 avg_d=1.111 std_dev=0.967
OP1	A	0, -0.317, 0.742, 1.800, 5.631 max_d=5.631 avg_d=0.742 std_dev=1.058
OP2	A	0, -0.378, 0.717, 1.813, 5.863 max_d=5.863 avg_d=0.717 std_dev=1.095

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.01	0.08	0.12	0.12
C2	0.02	0.00	0.13	0.18	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.07	0.10	0.02	0.16	0.31	0.24
C2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.09	0.01	0.08	0.04	0.10	0.04	0.12	0.15	0.12	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.14	0.10	0.12	0.22	0.15
C3'	0.01	0.18	0.02	0.00	0.14	0.01	0.17	0.04	0.19	0.11	0.20	0.18	0.15	0.15	0.09	0.04	0.01	0.01	0.20	0.21	0.16	0.24	0.17
C4	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.15	0.05	0.14	0.01	0.20	0.32	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.04	0.03	0.11	0.05	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.08	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.20	0.05	0.21	0.02	0.31	0.45	0.40
C5'	0.02	0.06	0.04	0.04	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.05	0.05	0.16	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.15	0.08	0.05	0.02
C6	0.01	0.02	0.10	0.19	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.24	0.06	0.21	0.01	0.32	0.47	0.40
C8	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.06	0.26	0.02	0.33	0.44	0.44
N1	0.01	0.01	0.12	0.20	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.24	0.07	0.16	0.02	0.24	0.39	0.32
N2	0.02	0.01	0.15	0.18	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.08	0.08	0.02	0.13	0.27	0.20
N3	0.02	0.01	0.12	0.15	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.06	0.08	0.01	0.13	0.26	0.20
N7	0.02	0.01	0.04	0.15	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.06	0.28	0.02	0.39	0.53	0.50
N9	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.03	0.15	0.02	0.19	0.28	0.27
O2'	0.02	0.10	0.01	0.04	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.04	0.09	0.12	0.10	0.04	0.03	0.00	0.08	0.05	0.10	0.07	0.11	0.16	0.09
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.15	0.02	0.20	0.03	0.24	0.12	0.24	0.21	0.16	0.18	0.09	0.08	0.00	0.02	0.21	0.26	0.21	0.25	0.15
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.14	0.05	0.12	0.07	0.09
O5'	0.08	0.10	0.14	0.20	0.14	0.02	0.21	0.01	0.21	0.26	0.16	0.08	0.08	0.28	0.15	0.10	0.21	0.14	0.00	0.24	0.03	0.04	0.01
O6	0.01	0.02	0.10	0.21	0.01	0.09	0.02	0.15	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.26	0.05	0.24	0.00	0.38	0.53	0.46
OP1	0.08	0.16	0.12	0.16	0.20	0.08	0.31	0.08	0.32	0.33	0.24	0.13	0.13	0.39	0.19	0.11	0.21	0.12	0.03	0.38	0.00	0.04	0.01
OP2	0.12	0.31	0.22	0.24	0.32	0.04	0.45	0.05	0.47	0.44	0.39	0.27	0.26	0.53	0.28	0.16	0.25	0.07	0.04	0.53	0.04	0.00	0.00
P	0.12	0.24	0.15	0.17	0.28	0.03	0.40	0.02	0.40	0.44	0.32	0.20	0.20	0.50	0.27	0.09	0.15	0.09	0.01	0.46	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.43	0.22	0.25	0.26	0.18	0.21	0.22	0.27	0.15	0.40	0.36	0.21	0.15	0.20	0.23	0.31	0.18	0.28	0.45	0.44	0.36
C2	0.22	0.33	0.22	0.22	0.19	0.16	0.11	0.14	0.10	0.12	0.21	0.31	0.18	0.14	0.17	0.24	0.28	0.23	0.19	0.30	0.36	0.24
C2'	0.22	0.47	0.20	0.18	0.28	0.14	0.20	0.17	0.28	0.13	0.44	0.40	0.20	0.12	0.20	0.24	0.23	0.19	0.24	0.42	0.43	0.33
C3'	0.26	0.54	0.17	0.07	0.34	0.11	0.29	0.09	0.39	0.15	0.53	0.46	0.35	0.15	0.25	0.25	0.10	0.22	0.15	0.37	0.38	0.27
C4	0.22	0.40	0.22	0.23	0.24	0.17	0.16	0.17	0.19	0.14	0.34	0.35	0.11	0.14	0.19	0.23	0.29	0.20	0.24	0.37	0.40	0.30
C4'	0.20	0.47	0.14	0.13	0.29	0.09	0.26	0.14	0.36	0.13	0.47	0.39	0.35	0.15	0.21	0.20	0.20	0.16	0.21	0.42	0.40	0.32
C5	0.22	0.41	0.21	0.23	0.23	0.17	0.15	0.17	0.16	0.13	0.34	0.35	0.12	0.14	0.19	0.23	0.27	0.20	0.23	0.35	0.38	0.29
C5'	0.24	0.50	0.16	0.09	0.35	0.09	0.34	0.15	0.44	0.20	0.53	0.42	0.47	0.24	0.26	0.23	0.15	0.18	0.23	0.44	0.39	0.32
C6	0.21	0.35	0.20	0.20	0.19	0.16	0.11	0.14	0.10	0.12	0.22	0.31	0.24	0.14	0.16	0.22	0.25	0.22	0.19	0.29	0.35	0.24
C8	0.22	0.45	0.22	0.25	0.28	0.20	0.22	0.23	0.30	0.17	0.44	0.38	0.24	0.16	0.22	0.23	0.29	0.20	0.29	0.43	0.44	0.37
N1	0.22	0.31	0.21	0.21	0.17	0.16	0.10	0.14	0.10	0.11	0.17	0.29	0.24	0.14	0.16	0.23	0.26	0.24	0.18	0.28	0.34	0.23
N2	0.22	0.29	0.22	0.22	0.17	0.16	0.10	0.14	0.10	0.11	0.17	0.28	0.21	0.14	0.16	0.24	0.28	0.24	0.18	0.28	0.35	0.23
N3	0.22	0.37	0.22	0.23	0.22	0.16	0.14	0.15	0.15	0.13	0.28	0.33	0.12	0.13	0.18	0.23	0.29	0.21	0.22	0.35	0.38	0.28
N7	0.23	0.45	0.22	0.24	0.27	0.19	0.20	0.21	0.26	0.16	0.43	0.37	0.16	0.15	0.21	0.23	0.27	0.20	0.26	0.39	0.41	0.33
N9	0.22	0.43	0.22	0.24	0.26	0.18	0.20	0.21	0.26	0.16	0.40	0.37	0.18	0.15	0.21	0.23	0.29	0.19	0.27	0.42	0.43	0.34
O2'	0.21	0.43	0.21	0.20	0.25	0.15	0.18	0.18	0.24	0.13	0.38	0.37	0.16	0.12	0.19	0.24	0.26	0.18	0.25	0.42	0.42	0.33
O3'	0.34	0.60	0.24	0.13	0.42	0.21	0.36	0.18	0.45	0.24	0.58	0.52	0.41	0.25	0.33	0.31	0.09	0.32	0.17	0.35	0.39	0.28
O4'	0.21	0.42	0.20	0.26	0.27	0.20	0.24	0.25	0.32	0.17	0.42	0.35	0.29	0.17	0.21	0.20	0.33	0.18	0.30	0.47	0.44	0.38
O5'	0.43	0.67	0.31	0.17	0.55	0.23	0.56	0.16	0.66	0.42	0.71	0.60	0.71	0.47	0.47	0.36	0.12	0.39	0.17	0.26	0.26	0.19
O6	0.21	0.32	0.20	0.19	0.16	0.16	0.11	0.15	0.14	0.11	0.15	0.30	0.33	0.16	0.15	0.22	0.24	0.23	0.18	0.26	0.32	0.22
OP1	0.67	0.84	0.58	0.44	0.78	0.47	0.81	0.39	0.88	0.71	0.88	0.79	0.94	0.77	0.71	0.62	0.35	0.60	0.39	0.34	0.38	0.35
OP2	0.75	0.96	0.59	0.42	0.90	0.51	0.96	0.41	1.05	0.81	1.02	0.90	1.14	0.90	0.82	0.63	0.29	0.69	0.40	0.24	0.37	0.34
P	0.69	0.89	0.57	0.40	0.81	0.46	0.86	0.37	0.94	0.72	0.94	0.83	1.01	0.79	0.74	0.61	0.29	0.62	0.36	0.26	0.34	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.19	0.10	0.10
C2	0.02	0.00	0.18	0.17	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.17	0.22	0.12	0.13	0.20	0.20	0.14
C2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.11	0.01	0.07	0.03	0.10	0.09	0.15	0.18	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.30	0.15	0.13
C3'	0.01	0.17	0.02	0.00	0.11	0.01	0.10	0.03	0.12	0.07	0.16	0.15	0.12	0.07	0.05	0.04	0.01	0.02	0.17	0.32	0.19	0.19
C4	0.01	0.01	0.11	0.11	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.06	0.11	0.19	0.18	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.04	0.05	0.06	0.09	0.03	0.09	0.02	0.01	0.03	0.16	0.05	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.04	0.13	0.19	0.22	0.16
C5'	0.01	0.08	0.03	0.03	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.13	0.07	0.08	0.09	0.13	0.04	0.08	0.04	0.01	0.01	0.12	0.04	0.03
C6	0.02	0.02	0.10	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.05	0.14	0.20	0.24	0.17
C8	0.01	0.01	0.09	0.07	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.11	0.16	0.18	0.19	0.16
N1	0.02	0.01	0.15	0.16	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.09	0.14	0.20	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.18	0.15	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.12	0.12	0.20	0.18	0.12
N6	0.01	0.02	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.04	0.15	0.21	0.26	0.19
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.08	0.16	0.19	0.23	0.18
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.10	0.19	0.15	0.12
O2'	0.02	0.17	0.01	0.04	0.09	0.09	0.08	0.08	0.11	0.08	0.14	0.16	0.10	0.08	0.03	0.00	0.06	0.07	0.05	0.28	0.10	0.11
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.04	0.16	0.08	0.21	0.19	0.15	0.08	0.04	0.06	0.00	0.01	0.22	0.39	0.24	0.25
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.11	0.09	0.12	0.04	0.08	0.03	0.07	0.01	0.00	0.16	0.19	0.14	0.17
O5'	0.08	0.13	0.09	0.17	0.11	0.03	0.13	0.01	0.14	0.16	0.14	0.12	0.15	0.16	0.10	0.05	0.22	0.16	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.19	0.20	0.30	0.32	0.19	0.16	0.19	0.12	0.20	0.18	0.20	0.20	0.21	0.19	0.19	0.28	0.39	0.19	0.03	0.00	0.04	0.01
OP2	0.10	0.20	0.15	0.19	0.18	0.05	0.22	0.04	0.24	0.19	0.22	0.18	0.26	0.23	0.15	0.10	0.24	0.14	0.03	0.04	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.13	0.19	0.13	0.06	0.16	0.03	0.17	0.16	0.16	0.12	0.19	0.18	0.12	0.11	0.25	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00