Doublet Group distance statistics: 55478

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 14, 14, 15, 12, 6, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.007, 0.029, 0.050, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.027 std_dev=0.022
C5	A	0, -0.001, 0.021, 0.044, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.021 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.007, 0.030, 0.052, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.001, 0.031, 0.061, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.031 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.011, 0.046, 0.080, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.046 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.003, 0.041, 0.080, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.041 std_dev=0.039
O6	A	0, 0.004, 0.045, 0.085, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.045 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.049, 0.097, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.049 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.005, 0.118, 0.230, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.118 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.026, 0.157, 0.287, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.157 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.046, 0.184, 0.322, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.184 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.018, 0.169, 0.320, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.169 std_dev=0.151
C5'	A	0, 0.085, 0.264, 0.444, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.264 std_dev=0.179
N1	B	0, 0.069, 0.289, 0.508, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.289 std_dev=0.219
O6	B	0, 0.101, 0.322, 0.542, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.322 std_dev=0.221
C6	B	0, 0.091, 0.314, 0.538, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.314 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.067, 0.301, 0.536, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.301 std_dev=0.235
C5	B	0, 0.109, 0.355, 0.601, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.355 std_dev=0.246
N3	B	0, 0.086, 0.335, 0.584, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.335 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.109, 0.361, 0.614, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.361 std_dev=0.252
N2	B	0, 0.044, 0.300, 0.556, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.300 std_dev=0.256
N7	B	0, 0.131, 0.411, 0.691, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.411 std_dev=0.280
N9	B	0, 0.130, 0.417, 0.704, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.417 std_dev=0.287
C2'	B	0, 0.152, 0.453, 0.754, 2.115 max_d=2.115 avg_d=0.453 std_dev=0.301
C8	B	0, 0.141, 0.446, 0.750, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.446 std_dev=0.304
C1'	B	0, 0.134, 0.455, 0.775, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.455 std_dev=0.320
O2'	A	0, -0.005, 0.316, 0.637, 2.144 max_d=2.144 avg_d=0.316 std_dev=0.321
O2'	B	0, 0.106, 0.441, 0.777, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.441 std_dev=0.335
C3'	B	0, 0.200, 0.538, 0.875, 2.561 max_d=2.561 avg_d=0.538 std_dev=0.338
O3'	A	0, -0.083, 0.257, 0.598, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.257 std_dev=0.341
O3'	B	0, 0.216, 0.575, 0.935, 2.814 max_d=2.814 avg_d=0.575 std_dev=0.359
O5'	A	0, -0.019, 0.365, 0.748, 2.598 max_d=2.598 avg_d=0.365 std_dev=0.384
O4'	B	0, 0.132, 0.520, 0.907, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.520 std_dev=0.387
C4'	B	0, 0.187, 0.578, 0.969, 2.719 max_d=2.719 avg_d=0.578 std_dev=0.391
O5'	B	0, 0.306, 0.714, 1.122, 2.183 max_d=2.183 avg_d=0.714 std_dev=0.408
OP2	B	0, 0.296, 0.720, 1.143, 2.409 max_d=2.409 avg_d=0.720 std_dev=0.423
P	B	0, 0.315, 0.739, 1.163, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.739 std_dev=0.424
C5'	B	0, 0.234, 0.670, 1.106, 2.722 max_d=2.722 avg_d=0.670 std_dev=0.436
OP1	B	0, 0.372, 0.846, 1.320, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.846 std_dev=0.474
P	A	0, -0.029, 0.448, 0.924, 3.023 max_d=3.023 avg_d=0.448 std_dev=0.477
OP1	A	0, -0.086, 0.581, 1.249, 3.676 max_d=3.676 avg_d=0.581 std_dev=0.667
OP2	A	0, -0.066, 0.631, 1.328, 4.014 max_d=4.014 avg_d=0.631 std_dev=0.697

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.16	0.01	0.12	0.03	0.14	0.27	0.12
C2	0.04	0.00	0.10	0.08	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.28	0.06	0.14	0.02	0.20	0.39	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.10	0.05	0.07	0.07	0.12	0.10	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.18	0.05	0.18	0.26	0.15
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.08	0.06	0.10	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.05	0.15	0.19	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.03	0.18	0.02	0.17	0.42	0.18
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.04	0.09	0.06	0.08	0.03	0.08	0.02	0.01	0.02	0.05	0.07	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.04	0.24	0.01	0.19	0.53	0.26
C5'	0.04	0.07	0.10	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.10	0.13	0.08	0.08	0.06	0.14	0.08	0.05	0.09	0.01	0.01	0.13	0.12	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.04	0.24	0.01	0.19	0.55	0.26
C8	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.06	0.07	0.28	0.02	0.22	0.54	0.28
N1	0.04	0.01	0.07	0.06	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.25	0.05	0.18	0.01	0.18	0.47	0.21
N2	0.05	0.01	0.12	0.10	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.33	0.08	0.12	0.03	0.24	0.34	0.14
N3	0.04	0.01	0.10	0.07	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.27	0.07	0.13	0.01	0.21	0.34	0.14
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.08	0.06	0.30	0.02	0.24	0.60	0.32
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.13	0.02	0.19	0.02	0.17	0.41	0.19
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.09	0.08	0.15	0.05	0.16	0.16	0.14	0.15	0.11	0.19	0.09	0.00	0.05	0.04	0.19	0.20	0.20	0.29	0.18
O3'	0.16	0.28	0.04	0.01	0.19	0.02	0.15	0.09	0.19	0.06	0.25	0.33	0.27	0.08	0.13	0.05	0.00	0.10	0.06	0.17	0.16	0.20	0.09
O4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05	0.08	0.07	0.06	0.02	0.04	0.10	0.00	0.08	0.05	0.14	0.23	0.11
O5'	0.12	0.14	0.18	0.09	0.18	0.02	0.24	0.01	0.24	0.28	0.18	0.12	0.13	0.30	0.19	0.19	0.06	0.08	0.00	0.27	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.20	0.17	0.05	0.27	0.00	0.21	0.61	0.31
OP1	0.14	0.20	0.18	0.15	0.17	0.07	0.19	0.12	0.19	0.22	0.18	0.24	0.21	0.24	0.17	0.20	0.16	0.14	0.02	0.21	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.39	0.26	0.19	0.42	0.14	0.53	0.13	0.55	0.54	0.47	0.34	0.34	0.60	0.41	0.29	0.20	0.23	0.01	0.61	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.15	0.09	0.18	0.04	0.26	0.02	0.26	0.28	0.21	0.14	0.14	0.32	0.19	0.18	0.09	0.11	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.15	0.15	0.12	0.12	0.11	0.15	0.12	0.10	0.14	0.18	0.14	0.10	0.11	0.16	0.16	0.11	0.28	0.14	0.33	0.38	0.32
C2	0.13	0.12	0.13	0.13	0.10	0.13	0.10	0.16	0.10	0.10	0.10	0.14	0.12	0.10	0.11	0.16	0.15	0.15	0.28	0.12	0.32	0.39	0.33
C2'	0.20	0.22	0.23	0.22	0.21	0.18	0.22	0.19	0.24	0.21	0.23	0.23	0.21	0.22	0.20	0.23	0.24	0.18	0.23	0.26	0.28	0.34	0.28
C3'	0.11	0.13	0.11	0.11	0.10	0.13	0.10	0.20	0.11	0.11	0.12	0.16	0.12	0.11	0.10	0.11	0.12	0.12	0.35	0.13	0.40	0.43	0.39
C4	0.11	0.12	0.13	0.14	0.10	0.11	0.08	0.15	0.09	0.08	0.11	0.16	0.12	0.08	0.10	0.15	0.15	0.13	0.29	0.11	0.33	0.39	0.34
C4'	0.09	0.12	0.12	0.11	0.09	0.10	0.09	0.15	0.10	0.09	0.12	0.15	0.11	0.10	0.09	0.12	0.13	0.09	0.32	0.12	0.38	0.40	0.37
C5	0.13	0.13	0.14	0.15	0.11	0.13	0.10	0.16	0.10	0.10	0.11	0.16	0.13	0.10	0.11	0.15	0.16	0.14	0.30	0.12	0.34	0.40	0.34
C5'	0.14	0.17	0.17	0.16	0.15	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.18	0.16	0.15	0.14	0.18	0.19	0.13	0.32	0.17	0.37	0.39	0.36
C6	0.15	0.13	0.14	0.15	0.13	0.14	0.12	0.17	0.12	0.12	0.12	0.16	0.14	0.12	0.13	0.16	0.16	0.16	0.30	0.14	0.33	0.40	0.34
C8	0.13	0.16	0.15	0.16	0.12	0.13	0.10	0.17	0.11	0.09	0.15	0.19	0.15	0.09	0.11	0.16	0.17	0.13	0.30	0.12	0.35	0.40	0.35
N1	0.15	0.13	0.14	0.15	0.12	0.14	0.12	0.17	0.12	0.12	0.12	0.15	0.13	0.12	0.13	0.16	0.16	0.17	0.29	0.14	0.32	0.39	0.33
N2	0.13	0.11	0.13	0.13	0.11	0.13	0.10	0.16	0.10	0.11	0.10	0.14	0.12	0.11	0.11	0.16	0.15	0.16	0.28	0.13	0.32	0.39	0.33
N3	0.11	0.12	0.13	0.13	0.09	0.11	0.09	0.15	0.09	0.09	0.10	0.15	0.11	0.09	0.10	0.15	0.15	0.13	0.29	0.12	0.33	0.39	0.33
N7	0.13	0.15	0.15	0.15	0.12	0.13	0.10	0.17	0.10	0.10	0.13	0.18	0.14	0.10	0.11	0.16	0.17	0.14	0.31	0.12	0.35	0.40	0.35
N9	0.12	0.14	0.15	0.14	0.11	0.12	0.09	0.15	0.11	0.08	0.13	0.18	0.13	0.09	0.10	0.15	0.16	0.12	0.29	0.12	0.34	0.39	0.34
O2'	0.41	0.41	0.44	0.41	0.40	0.38	0.40	0.35	0.39	0.39	0.40	0.41	0.41	0.39	0.40	0.45	0.42	0.38	0.31	0.38	0.35	0.41	0.35
O3'	0.13	0.20	0.14	0.13	0.13	0.15	0.12	0.23	0.13	0.12	0.18	0.25	0.17	0.13	0.12	0.16	0.13	0.15	0.38	0.14	0.45	0.48	0.44
O4'	0.11	0.12	0.13	0.14	0.10	0.12	0.10	0.17	0.10	0.09	0.12	0.15	0.11	0.10	0.10	0.13	0.15	0.11	0.33	0.11	0.38	0.42	0.37
O5'	0.28	0.28	0.27	0.25	0.28	0.27	0.28	0.27	0.27	0.29	0.27	0.28	0.28	0.28	0.28	0.29	0.26	0.29	0.48	0.27	0.55	0.56	0.54
O6	0.17	0.15	0.15	0.17	0.15	0.16	0.15	0.19	0.15	0.15	0.14	0.16	0.16	0.15	0.16	0.17	0.17	0.18	0.30	0.16	0.33	0.40	0.34
OP1	0.37	0.31	0.34	0.34	0.35	0.38	0.36	0.40	0.33	0.41	0.31	0.30	0.33	0.41	0.38	0.35	0.33	0.40	0.66	0.33	0.76	0.75	0.74
OP2	0.65	0.65	0.66	0.62	0.66	0.61	0.65	0.57	0.65	0.64	0.64	0.64	0.66	0.64	0.65	0.67	0.63	0.63	0.74	0.63	0.75	0.73	0.75
P	0.35	0.35	0.35	0.32	0.35	0.33	0.35	0.33	0.34	0.36	0.34	0.34	0.35	0.36	0.36	0.36	0.33	0.36	0.56	0.34	0.63	0.63	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.03	0.10	0.15	0.09
C2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.12	0.03	0.20	0.02	0.21	0.27	0.21
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.10	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.05	0.13	0.13	0.10
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.07	0.07	0.08	0.10	0.08	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.14	0.07	0.17	0.11	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.21	0.02	0.22	0.26	0.22
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.06	0.07	0.12	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.28	0.02	0.29	0.33	0.29
C5'	0.02	0.06	0.01	0.03	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.05	0.05	0.13	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.12	0.09	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.08	0.03	0.28	0.01	0.31	0.36	0.31
C8	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.28	0.03	0.28	0.28	0.27
N1	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.10	0.03	0.25	0.02	0.27	0.33	0.27
N2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.15	0.04	0.17	0.03	0.18	0.26	0.19
N3	0.03	0.01	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.17	0.02	0.18	0.24	0.18
N7	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.32	0.03	0.33	0.36	0.33
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.20	0.02	0.19	0.22	0.19
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.08	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.07	0.06	0.10	0.10	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.08	0.07	0.10	0.15	0.11	0.07	0.03	0.05	0.00	0.02	0.11	0.08	0.17	0.09	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.06	0.17	0.08
O5'	0.09	0.20	0.11	0.14	0.21	0.02	0.28	0.01	0.28	0.28	0.25	0.17	0.17	0.32	0.20	0.07	0.11	0.06	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.07	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.08	0.04	0.31	0.00	0.36	0.40	0.35
OP1	0.10	0.21	0.13	0.17	0.22	0.07	0.29	0.09	0.31	0.28	0.27	0.18	0.18	0.33	0.19	0.10	0.17	0.06	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.27	0.13	0.11	0.26	0.12	0.33	0.16	0.36	0.28	0.33	0.26	0.24	0.36	0.22	0.10	0.09	0.17	0.02	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.21	0.10	0.12	0.22	0.02	0.29	0.02	0.31	0.27	0.27	0.19	0.18	0.33	0.19	0.05	0.09	0.08	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00