Doublet Group distance statistics: 55479

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 19, 22, 6, 2, 3, 1, 2, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.024 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.008, 0.035, 0.063, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.035 std_dev=0.027
C2	B	0, 0.064, 0.291, 0.517, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.291 std_dev=0.226
N1	B	0, 0.065, 0.294, 0.524, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.294 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.064, 0.300, 0.536, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.300 std_dev=0.236
N2	B	0, 0.066, 0.323, 0.581, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.323 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.056, 0.328, 0.601, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.328 std_dev=0.273
C4	B	0, 0.046, 0.325, 0.604, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.325 std_dev=0.279
O6	B	0, 0.050, 0.356, 0.662, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.356 std_dev=0.306
C5	B	0, 0.034, 0.348, 0.661, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.348 std_dev=0.314
O4'	B	0, 0.034, 0.378, 0.723, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.378 std_dev=0.345
N9	B	0, 0.015, 0.365, 0.715, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.365 std_dev=0.350
C1'	B	0, 0.018, 0.376, 0.733, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.376 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.030, 0.412, 0.794, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.412 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.011, 0.418, 0.825, 2.227 max_d=2.227 avg_d=0.418 std_dev=0.407
N7	B	0, -0.008, 0.408, 0.823, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.408 std_dev=0.416
C8	B	0, -0.020, 0.414, 0.847, 2.067 max_d=2.067 avg_d=0.414 std_dev=0.433
C2'	A	0, -0.243, 0.220, 0.683, 2.138 max_d=2.138 avg_d=0.220 std_dev=0.463
C3'	B	0, -0.039, 0.426, 0.892, 3.202 max_d=3.202 avg_d=0.426 std_dev=0.465
O4'	A	0, -0.255, 0.221, 0.697, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.221 std_dev=0.476
O2'	B	0, -0.016, 0.461, 0.938, 2.354 max_d=2.354 avg_d=0.461 std_dev=0.477
C5'	B	0, 0.001, 0.481, 0.961, 3.067 max_d=3.067 avg_d=0.481 std_dev=0.480
O5'	B	0, -0.083, 0.506, 1.094, 3.971 max_d=3.971 avg_d=0.506 std_dev=0.588
C3'	A	0, -0.318, 0.277, 0.872, 2.415 max_d=2.415 avg_d=0.277 std_dev=0.595
O3'	B	0, -0.132, 0.488, 1.108, 4.129 max_d=4.129 avg_d=0.488 std_dev=0.620
C4'	A	0, -0.367, 0.304, 0.974, 2.646 max_d=2.646 avg_d=0.304 std_dev=0.671
P	B	0, -0.161, 0.542, 1.245, 4.964 max_d=4.964 avg_d=0.542 std_dev=0.703
O3'	A	0, -0.356, 0.379, 1.113, 3.062 max_d=3.062 avg_d=0.379 std_dev=0.734
O2'	A	0, -0.402, 0.348, 1.099, 3.765 max_d=3.765 avg_d=0.348 std_dev=0.751
OP1	B	0, -0.196, 0.575, 1.346, 5.734 max_d=5.734 avg_d=0.575 std_dev=0.771
OP2	B	0, -0.336, 0.618, 1.572, 6.751 max_d=6.751 avg_d=0.618 std_dev=0.954
C5'	A	0, -0.557, 0.483, 1.523, 4.365 max_d=4.365 avg_d=0.483 std_dev=1.040
O5'	A	0, -0.552, 0.581, 1.713, 6.548 max_d=6.548 avg_d=0.581 std_dev=1.133
P	A	0, -0.758, 0.688, 2.133, 9.331 max_d=9.331 avg_d=0.688 std_dev=1.446
OP1	A	0, -0.762, 0.762, 2.286, 9.321 max_d=9.321 avg_d=0.762 std_dev=1.524
OP2	A	0, -0.894, 0.773, 2.440, 11.388 max_d=11.388 avg_d=0.773 std_dev=1.667

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.24	0.01	0.10	0.02	0.11	0.11	0.09
C2	0.03	0.00	0.26	0.12	0.01	0.18	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.25	0.42	0.01	0.44	0.58	0.51
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.15	0.01	0.10	0.12	0.14	0.10	0.22	0.30	0.25	0.04	0.03	0.00	0.03	0.02	0.30	0.12	0.39	0.42	0.29
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.21	0.20	0.17	0.10	0.10	0.23	0.13	0.01	0.01	0.01	0.11	0.23	0.25	0.17	0.11
C4	0.01	0.01	0.15	0.14	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.16	0.13	0.20	0.01	0.24	0.30	0.29
C4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.17	0.12	0.24	0.17	0.14	0.05	0.17	0.03	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04	0.07
C5	0.01	0.01	0.10	0.20	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.10	0.07	0.21	0.01	0.31	0.41	0.36
C5'	0.04	0.30	0.12	0.01	0.13	0.01	0.10	0.00	0.13	0.23	0.23	0.41	0.28	0.20	0.07	0.06	0.12	0.01	0.00	0.13	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.21	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.12	0.25	0.00	0.35	0.47	0.40
C8	0.01	0.01	0.10	0.20	0.00	0.17	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.07	0.13	0.32	0.01	0.39	0.49	0.45
N1	0.02	0.00	0.22	0.17	0.01	0.12	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.20	0.34	0.00	0.38	0.53	0.45
N2	0.03	0.00	0.30	0.10	0.01	0.24	0.01	0.41	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.32	0.30	0.56	0.01	0.59	0.78	0.66
N3	0.02	0.00	0.25	0.10	0.00	0.17	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.27	0.25	0.38	0.01	0.38	0.46	0.43
N7	0.01	0.01	0.04	0.23	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.08	0.07	0.31	0.01	0.43	0.55	0.49
N9	0.00	0.01	0.03	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.01	0.14	0.01	0.19	0.24	0.23
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.06	0.17	0.12	0.06	0.09	0.29	0.12	0.31	0.21	0.26	0.12	0.00	0.05	0.10	0.25	0.12	0.35	0.49	0.27
O3'	0.24	0.25	0.03	0.01	0.16	0.03	0.10	0.12	0.12	0.07	0.18	0.32	0.27	0.08	0.12	0.05	0.00	0.15	0.14	0.10	0.13	0.15	0.09
O4'	0.01	0.25	0.02	0.01	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.13	0.20	0.30	0.25	0.07	0.01	0.10	0.15	0.00	0.06	0.10	0.20	0.14	0.21
O5'	0.10	0.42	0.30	0.11	0.20	0.01	0.21	0.00	0.25	0.32	0.34	0.56	0.38	0.31	0.14	0.25	0.14	0.06	0.00	0.27	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.12	0.23	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.10	0.27	0.00	0.40	0.53	0.44
OP1	0.11	0.44	0.39	0.25	0.24	0.11	0.31	0.06	0.35	0.39	0.38	0.59	0.38	0.43	0.19	0.35	0.13	0.20	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.58	0.42	0.17	0.30	0.04	0.41	0.02	0.47	0.49	0.53	0.78	0.46	0.55	0.24	0.49	0.15	0.14	0.02	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.51	0.29	0.11	0.29	0.07	0.36	0.01	0.40	0.45	0.45	0.66	0.43	0.49	0.23	0.27	0.09	0.21	0.00	0.44	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.27	0.26	0.14	0.13	0.15	0.16	0.16	0.14	0.15	0.17	0.14	0.16	0.13	0.28	0.34	0.10	0.30	0.20	0.41	0.58	0.41
C2	0.10	0.10	0.28	0.23	0.11	0.08	0.14	0.13	0.17	0.13	0.14	0.10	0.10	0.15	0.11	0.35	0.34	0.11	0.26	0.21	0.32	0.48	0.34
C2'	0.25	0.19	0.38	0.39	0.25	0.24	0.30	0.23	0.31	0.32	0.23	0.16	0.20	0.35	0.27	0.37	0.45	0.19	0.36	0.37	0.44	0.62	0.46
C3'	0.28	0.24	0.20	0.26	0.27	0.33	0.29	0.46	0.28	0.31	0.24	0.23	0.25	0.32	0.29	0.15	0.25	0.37	0.59	0.30	0.72	0.87	0.72
C4	0.12	0.12	0.28	0.24	0.12	0.10	0.14	0.14	0.16	0.13	0.13	0.14	0.12	0.15	0.11	0.32	0.33	0.09	0.28	0.20	0.36	0.52	0.37
C4'	0.25	0.17	0.22	0.28	0.25	0.30	0.30	0.43	0.28	0.33	0.20	0.15	0.19	0.35	0.27	0.18	0.30	0.33	0.57	0.34	0.72	0.89	0.72
C5	0.11	0.12	0.28	0.24	0.11	0.09	0.13	0.13	0.16	0.12	0.13	0.14	0.11	0.14	0.11	0.32	0.33	0.09	0.27	0.20	0.35	0.50	0.36
C5'	0.40	0.27	0.35	0.44	0.40	0.46	0.47	0.60	0.44	0.52	0.32	0.19	0.30	0.55	0.44	0.26	0.44	0.49	0.76	0.52	0.92	1.09	0.92
C6	0.10	0.10	0.28	0.23	0.10	0.08	0.14	0.14	0.17	0.12	0.15	0.10	0.09	0.14	0.10	0.35	0.33	0.11	0.26	0.21	0.32	0.46	0.33
C8	0.14	0.16	0.27	0.27	0.14	0.14	0.14	0.16	0.16	0.13	0.15	0.19	0.15	0.15	0.13	0.28	0.34	0.10	0.30	0.19	0.40	0.56	0.40
N1	0.10	0.10	0.28	0.23	0.11	0.09	0.14	0.14	0.17	0.12	0.15	0.09	0.09	0.15	0.10	0.36	0.34	0.12	0.26	0.21	0.31	0.46	0.33
N2	0.10	0.10	0.28	0.23	0.11	0.09	0.15	0.14	0.17	0.13	0.14	0.09	0.10	0.16	0.11	0.36	0.34	0.12	0.26	0.21	0.32	0.47	0.33
N3	0.11	0.11	0.28	0.24	0.11	0.09	0.14	0.13	0.16	0.13	0.14	0.12	0.11	0.15	0.11	0.33	0.33	0.09	0.27	0.21	0.34	0.51	0.36
N7	0.13	0.15	0.28	0.25	0.12	0.12	0.13	0.15	0.15	0.12	0.14	0.19	0.14	0.14	0.12	0.30	0.33	0.09	0.29	0.19	0.37	0.52	0.38
N9	0.13	0.14	0.27	0.26	0.13	0.12	0.14	0.15	0.16	0.14	0.15	0.17	0.14	0.15	0.13	0.29	0.34	0.09	0.30	0.20	0.39	0.55	0.40
O2'	0.55	0.45	0.66	0.65	0.55	0.52	0.62	0.44	0.61	0.64	0.51	0.36	0.47	0.67	0.58	0.65	0.70	0.48	0.47	0.68	0.47	0.60	0.51
O3'	0.22	0.15	0.21	0.24	0.21	0.29	0.25	0.43	0.23	0.29	0.16	0.15	0.17	0.30	0.24	0.21	0.25	0.32	0.55	0.26	0.70	0.86	0.70
O4'	0.16	0.14	0.21	0.24	0.16	0.19	0.20	0.30	0.19	0.22	0.14	0.18	0.14	0.24	0.17	0.21	0.30	0.21	0.46	0.25	0.60	0.76	0.59
O5'	0.53	0.38	0.46	0.55	0.53	0.59	0.60	0.73	0.58	0.65	0.45	0.28	0.43	0.68	0.57	0.33	0.52	0.62	0.89	0.66	1.03	1.22	1.04
O6	0.10	0.11	0.29	0.23	0.11	0.09	0.14	0.14	0.18	0.12	0.17	0.09	0.09	0.15	0.10	0.36	0.33	0.13	0.26	0.21	0.31	0.44	0.32
OP1	0.87	0.62	0.79	0.89	0.83	0.95	0.92	1.10	0.85	1.02	0.68	0.48	0.70	1.05	0.91	0.66	0.83	0.96	1.24	0.92	1.42	1.58	1.41
OP2	0.96	0.76	0.86	0.96	0.96	1.02	1.06	1.15	1.02	1.11	0.83	0.61	0.82	1.16	1.01	0.71	0.89	1.05	1.31	1.11	1.44	1.63	1.46
P	0.80	0.62	0.70	0.80	0.79	0.85	0.88	0.99	0.84	0.94	0.68	0.49	0.67	0.98	0.85	0.57	0.73	0.88	1.13	0.93	1.28	1.46	1.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.09	0.01	0.14	0.11	0.09
C2	0.03	0.00	0.23	0.17	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.25	0.12	0.29	0.01	0.36	0.47	0.36
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.11	0.18	0.28	0.23	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.07	0.19	0.08	0.09
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.09	0.15	0.13	0.21	0.16	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.11	0.09	0.20	0.08	0.09
C4	0.01	0.01	0.12	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.11	0.07	0.25	0.01	0.33	0.38	0.30
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.08	0.01
C5	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.04	0.29	0.01	0.42	0.48	0.37
C5'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.18	0.14	0.17	0.15	0.13	0.16	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.19	0.07	0.13	0.01
C6	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.06	0.32	0.00	0.46	0.55	0.42
C8	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.07	0.24	0.01	0.35	0.36	0.29
N1	0.02	0.00	0.18	0.13	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.19	0.10	0.32	0.01	0.42	0.54	0.41
N2	0.03	0.00	0.28	0.21	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.32	0.15	0.29	0.01	0.34	0.47	0.36
N3	0.02	0.00	0.23	0.16	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.22	0.12	0.25	0.01	0.30	0.38	0.30
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.28	0.01	0.44	0.47	0.37
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.20	0.01	0.27	0.27	0.23
O2'	0.02	0.29	0.00	0.02	0.15	0.06	0.10	0.06	0.15	0.08	0.23	0.35	0.27	0.05	0.04	0.00	0.04	0.06	0.09	0.13	0.15	0.06	0.08
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.11	0.02	0.09	0.03	0.12	0.17	0.19	0.32	0.22	0.14	0.06	0.04	0.00	0.02	0.11	0.11	0.21	0.15	0.10
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.05	0.06	0.07	0.07
O5'	0.09	0.29	0.09	0.11	0.25	0.01	0.29	0.01	0.32	0.24	0.32	0.29	0.25	0.28	0.20	0.09	0.11	0.05	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.05	0.33	0.00	0.51	0.61	0.46
OP1	0.14	0.36	0.19	0.20	0.33	0.07	0.42	0.07	0.46	0.35	0.42	0.34	0.30	0.44	0.27	0.15	0.21	0.06	0.01	0.51	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.47	0.08	0.08	0.38	0.08	0.48	0.13	0.55	0.36	0.54	0.47	0.38	0.47	0.27	0.06	0.15	0.07	0.01	0.61	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.36	0.09	0.09	0.30	0.01	0.37	0.01	0.42	0.29	0.41	0.36	0.30	0.37	0.23	0.08	0.10	0.07	0.00	0.46	0.01	0.00	0.00