Doublet Group distance statistics: 55487

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.006, 0.030, 0.054, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.030 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.005, 0.031, 0.057, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.031 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.004, 0.031, 0.057, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.031 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.008, 0.037, 0.067, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.030
C4	B	0, 0.088, 0.447, 0.805, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.447 std_dev=0.358
N3	B	0, 0.158, 0.542, 0.926, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.542 std_dev=0.384
C2	B	0, 0.173, 0.570, 0.967, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.570 std_dev=0.397
C5	B	0, 0.012, 0.439, 0.865, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.439 std_dev=0.426
N9	B	0, 0.080, 0.559, 1.038, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.559 std_dev=0.479
N1	B	0, 0.114, 0.603, 1.091, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.603 std_dev=0.488
N2	B	0, 0.233, 0.731, 1.229, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.731 std_dev=0.498
O4'	A	0, 0.091, 0.600, 1.109, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.600 std_dev=0.509
N7	B	0, 0.006, 0.515, 1.024, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.515 std_dev=0.509
C2'	A	0, 0.089, 0.598, 1.108, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.598 std_dev=0.509
C8	B	0, -0.001, 0.525, 1.052, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.525 std_dev=0.527
C6	B	0, 0.045, 0.581, 1.116, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.581 std_dev=0.536
C3'	B	0, 0.089, 0.651, 1.213, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.651 std_dev=0.562
O3'	B	0, 0.157, 0.739, 1.320, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.739 std_dev=0.581
O6	B	0, 0.197, 0.856, 1.515, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.856 std_dev=0.659
C1'	B	0, 0.158, 0.846, 1.533, 2.003 max_d=2.003 avg_d=0.846 std_dev=0.688
C2'	B	0, 0.251, 0.942, 1.634, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.942 std_dev=0.692
C4'	B	0, 0.107, 0.874, 1.641, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.874 std_dev=0.767
O4'	B	0, 0.164, 0.960, 1.755, 2.351 max_d=2.351 avg_d=0.960 std_dev=0.795
C3'	A	0, 0.147, 0.970, 1.793, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.970 std_dev=0.823
O2'	A	0, 0.089, 0.938, 1.787, 2.144 max_d=2.144 avg_d=0.938 std_dev=0.849
C4'	A	0, 0.155, 1.013, 1.872, 1.997 max_d=1.997 avg_d=1.013 std_dev=0.859
C5'	B	0, 0.353, 1.302, 2.252, 2.663 max_d=2.663 avg_d=1.302 std_dev=0.950
O2'	B	0, 0.332, 1.424, 2.517, 2.827 max_d=2.827 avg_d=1.424 std_dev=1.092
O3'	A	0, 0.185, 1.322, 2.459, 2.743 max_d=2.743 avg_d=1.322 std_dev=1.137
C5'	A	0, 0.256, 1.517, 2.777, 3.090 max_d=3.090 avg_d=1.517 std_dev=1.261
O5'	A	0, 0.260, 1.546, 2.833, 3.230 max_d=3.230 avg_d=1.546 std_dev=1.286
O5'	B	0, 0.394, 1.717, 3.040, 3.569 max_d=3.569 avg_d=1.717 std_dev=1.323
P	A	0, 0.433, 2.060, 3.687, 3.900 max_d=3.900 avg_d=2.060 std_dev=1.627
OP2	A	0, 0.542, 2.214, 3.885, 4.020 max_d=4.020 avg_d=2.214 std_dev=1.671
P	B	0, 0.430, 2.314, 4.199, 4.616 max_d=4.616 avg_d=2.314 std_dev=1.884
OP2	B	0, 0.535, 2.467, 4.400, 4.607 max_d=4.607 avg_d=2.467 std_dev=1.932
OP1	B	0, 0.891, 2.931, 4.971, 4.916 max_d=4.916 avg_d=2.931 std_dev=2.040
OP1	A	0, 0.623, 2.663, 4.704, 5.251 max_d=5.251 avg_d=2.663 std_dev=2.041

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.32	0.01	0.17	0.03	0.21	0.19	0.15
C2	0.04	0.00	0.38	0.34	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.39	0.18	0.27	0.01	0.41	0.33	0.29
C2'	0.00	0.38	0.00	0.01	0.21	0.02	0.11	0.19	0.18	0.15	0.30	0.45	0.38	0.08	0.04	0.01	0.06	0.03	0.22	0.14	0.25	0.24	0.22
C3'	0.02	0.34	0.01	0.00	0.32	0.01	0.38	0.01	0.42	0.28	0.40	0.31	0.29	0.36	0.24	0.03	0.01	0.03	0.27	0.44	0.35	0.10	0.20
C4	0.02	0.01	0.21	0.32	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.29	0.09	0.24	0.01	0.30	0.36	0.23
C4'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.13	0.22	0.06	0.10	0.06	0.22	0.10	0.28	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.21	0.02
C5	0.01	0.01	0.11	0.38	0.00	0.14	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.28	0.03	0.27	0.01	0.29	0.48	0.25
C5'	0.05	0.07	0.19	0.01	0.12	0.01	0.23	0.00	0.23	0.30	0.14	0.09	0.05	0.33	0.14	0.12	0.23	0.01	0.01	0.28	0.33	0.32	0.02
C6	0.02	0.01	0.18	0.42	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.32	0.07	0.27	0.01	0.33	0.51	0.27
C8	0.01	0.01	0.15	0.28	0.00	0.22	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.37	0.15	0.13	0.31	0.01	0.25	0.48	0.26
N1	0.03	0.00	0.30	0.40	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.36	0.13	0.27	0.01	0.38	0.43	0.28
N2	0.05	0.01	0.45	0.31	0.02	0.10	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.22	0.43	0.22	0.30	0.01	0.48	0.29	0.33
N3	0.03	0.01	0.38	0.29	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.38	0.18	0.26	0.01	0.38	0.28	0.27
N7	0.01	0.01	0.08	0.36	0.00	0.22	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.40	0.23	0.08	0.31	0.01	0.28	0.56	0.29
N9	0.00	0.02	0.04	0.24	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.20	0.21	0.01	0.23	0.02	0.24	0.33	0.20
O2'	0.03	0.13	0.01	0.03	0.15	0.28	0.29	0.12	0.27	0.37	0.16	0.22	0.13	0.40	0.20	0.00	0.10	0.19	0.28	0.33	0.33	0.17	0.15
O3'	0.32	0.39	0.06	0.01	0.29	0.01	0.28	0.23	0.32	0.15	0.36	0.43	0.38	0.23	0.21	0.10	0.00	0.17	0.27	0.33	0.47	0.35	0.30
O4'	0.01	0.18	0.03	0.03	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.13	0.13	0.22	0.18	0.08	0.01	0.19	0.17	0.00	0.12	0.04	0.19	0.19	0.10
O5'	0.17	0.27	0.22	0.27	0.24	0.01	0.27	0.01	0.27	0.31	0.27	0.30	0.26	0.31	0.23	0.28	0.27	0.12	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.14	0.44	0.01	0.16	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.33	0.33	0.04	0.29	0.00	0.33	0.58	0.28
OP1	0.21	0.41	0.25	0.35	0.30	0.19	0.29	0.33	0.33	0.25	0.38	0.48	0.38	0.28	0.24	0.33	0.47	0.19	0.01	0.33	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.33	0.24	0.10	0.36	0.21	0.48	0.32	0.51	0.48	0.43	0.29	0.28	0.56	0.33	0.17	0.35	0.19	0.01	0.58	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.29	0.22	0.20	0.23	0.02	0.25	0.02	0.27	0.26	0.28	0.33	0.27	0.29	0.20	0.15	0.30	0.10	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.21	0.15	0.28	0.18	0.15	0.41	0.23	0.46	0.44	0.21	0.49	0.16	0.57	0.22	0.10	0.29	0.13	0.14	0.72	0.75	0.60	0.23
C2	0.22	0.23	0.19	0.23	0.23	0.24	0.44	0.20	0.60	0.32	0.47	0.25	0.20	0.49	0.19	0.22	0.25	0.34	0.48	0.83	1.12	0.36	0.60
C2'	0.36	0.12	0.44	0.56	0.40	0.42	0.66	0.52	0.65	0.76	0.28	0.41	0.14	0.88	0.50	0.26	0.56	0.34	0.34	0.90	0.69	0.86	0.33
C3'	0.37	0.72	0.27	0.20	0.39	0.32	0.34	0.26	0.38	0.33	0.56	1.02	0.61	0.42	0.31	0.41	0.18	0.41	0.44	0.49	1.09	0.39	0.50
C4	0.15	0.18	0.15	0.23	0.22	0.14	0.45	0.13	0.59	0.37	0.39	0.35	0.17	0.53	0.20	0.15	0.26	0.23	0.30	0.83	0.92	0.42	0.41
C4'	0.43	0.71	0.31	0.20	0.43	0.34	0.34	0.28	0.38	0.30	0.57	0.95	0.63	0.34	0.36	0.45	0.15	0.46	0.48	0.41	1.09	0.32	0.55
C5	0.19	0.21	0.16	0.23	0.23	0.18	0.46	0.16	0.62	0.34	0.48	0.31	0.19	0.50	0.20	0.18	0.25	0.29	0.37	0.85	0.94	0.41	0.47
C5'	0.70	1.01	0.57	0.45	0.73	0.60	0.61	0.53	0.67	0.51	0.91	1.20	0.91	0.50	0.64	0.69	0.38	0.71	0.73	0.58	1.26	0.36	0.78
C6	0.27	0.29	0.20	0.24	0.26	0.28	0.45	0.25	0.63	0.30	0.56	0.26	0.22	0.45	0.21	0.24	0.26	0.40	0.52	0.83	1.08	0.39	0.63
C8	0.12	0.20	0.14	0.26	0.20	0.14	0.45	0.20	0.56	0.41	0.29	0.51	0.17	0.56	0.21	0.12	0.28	0.15	0.16	0.85	0.71	0.56	0.25
N1	0.27	0.28	0.22	0.24	0.25	0.30	0.44	0.27	0.62	0.30	0.54	0.26	0.22	0.46	0.21	0.26	0.26	0.41	0.56	0.83	1.16	0.38	0.68
N2	0.23	0.24	0.21	0.23	0.24	0.27	0.44	0.23	0.60	0.32	0.48	0.25	0.20	0.48	0.20	0.24	0.26	0.37	0.53	0.82	1.19	0.36	0.65
N3	0.16	0.19	0.16	0.23	0.22	0.16	0.44	0.13	0.58	0.36	0.40	0.31	0.17	0.52	0.19	0.16	0.25	0.25	0.36	0.82	1.01	0.38	0.47
N7	0.16	0.19	0.14	0.24	0.23	0.14	0.46	0.15	0.63	0.36	0.45	0.42	0.18	0.52	0.21	0.15	0.26	0.22	0.26	0.87	0.80	0.47	0.36
N9	0.11	0.18	0.14	0.26	0.20	0.12	0.44	0.18	0.54	0.41	0.29	0.45	0.16	0.56	0.21	0.11	0.28	0.15	0.18	0.81	0.79	0.52	0.28
O2'	0.81	0.46	0.85	0.93	0.78	0.84	0.93	0.90	0.86	1.06	0.58	0.32	0.57	1.11	0.88	0.72	0.92	0.79	0.75	1.00	0.79	1.15	0.71
O3'	0.43	0.70	0.30	0.26	0.43	0.44	0.37	0.42	0.40	0.36	0.56	0.95	0.62	0.42	0.37	0.40	0.22	0.53	0.65	0.45	1.35	0.50	0.77
O4'	0.29	0.47	0.18	0.14	0.27	0.20	0.29	0.17	0.31	0.30	0.34	0.71	0.41	0.39	0.24	0.32	0.14	0.30	0.30	0.49	0.87	0.45	0.37
O5'	0.57	0.81	0.50	0.39	0.59	0.44	0.51	0.36	0.55	0.47	0.74	0.98	0.73	0.47	0.53	0.59	0.37	0.54	0.47	0.48	1.04	0.42	0.61
O6	0.33	0.37	0.24	0.26	0.28	0.36	0.44	0.33	0.63	0.28	0.62	0.35	0.26	0.42	0.24	0.29	0.28	0.48	0.61	0.80	1.12	0.42	0.72
OP1	0.74	1.00	0.60	0.45	0.81	0.56	0.75	0.48	0.84	0.62	0.98	1.09	0.92	0.61	0.72	0.69	0.35	0.71	0.70	0.80	1.33	0.27	0.93
OP2	0.95	1.37	0.87	0.69	1.06	0.74	0.95	0.60	1.11	0.74	1.35	1.50	1.24	0.72	0.92	0.97	0.63	0.87	0.73	1.01	1.21	0.28	0.83
P	0.66	0.97	0.56	0.38	0.73	0.47	0.64	0.35	0.73	0.51	0.94	1.10	0.87	0.49	0.63	0.66	0.31	0.61	0.53	0.65	1.10	0.24	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.31	0.20	0.19
C2	0.03	0.00	0.28	0.27	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.35	0.18	0.34	0.01	0.93	0.18	0.57
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.16	0.01	0.08	0.01	0.14	0.13	0.23	0.33	0.28	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.14	0.17	0.12
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.17	0.01	0.14	0.03	0.19	0.11	0.25	0.31	0.25	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.19	0.15	0.07
C4	0.02	0.01	0.16	0.17	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.19	0.10	0.21	0.01	0.71	0.21	0.45
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.03	0.06	0.03	0.09	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.07	0.15	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.16	0.05	0.20	0.01	0.77	0.28	0.51
C5'	0.01	0.07	0.01	0.03	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.14	0.08	0.09	0.06	0.15	0.07	0.04	0.06	0.02	0.01	0.13	0.22	0.09	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.19	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.24	0.08	0.25	0.00	0.91	0.26	0.57
C8	0.01	0.01	0.13	0.11	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.11	0.17	0.01	0.46	0.42	0.40
N1	0.02	0.01	0.23	0.25	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.32	0.14	0.31	0.01	0.97	0.21	0.60
N2	0.04	0.00	0.33	0.31	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.41	0.22	0.39	0.02	0.99	0.20	0.61
N3	0.03	0.01	0.28	0.25	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.30	0.17	0.30	0.01	0.80	0.16	0.49
N7	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.06	0.18	0.01	0.63	0.41	0.48
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.49	0.26	0.33
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.11	0.04	0.06	0.04	0.11	0.10	0.18	0.28	0.22	0.06	0.02	0.00	0.06	0.05	0.05	0.09	0.11	0.16	0.06
O3'	0.03	0.35	0.02	0.01	0.19	0.04	0.16	0.06	0.24	0.12	0.32	0.41	0.30	0.09	0.05	0.06	0.00	0.03	0.06	0.23	0.40	0.14	0.07
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.11	0.14	0.22	0.17	0.06	0.01	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.28	0.18	0.15
O5'	0.06	0.34	0.02	0.02	0.21	0.01	0.20	0.01	0.25	0.17	0.31	0.39	0.30	0.18	0.12	0.05	0.06	0.06	0.00	0.25	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.11	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.23	0.05	0.25	0.00	0.95	0.30	0.61
OP1	0.31	0.93	0.14	0.19	0.71	0.15	0.77	0.22	0.91	0.46	0.97	0.99	0.80	0.63	0.49	0.11	0.40	0.28	0.03	0.95	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.18	0.17	0.15	0.21	0.11	0.28	0.09	0.26	0.42	0.21	0.20	0.16	0.41	0.26	0.16	0.14	0.18	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.57	0.12	0.07	0.45	0.03	0.51	0.01	0.57	0.40	0.60	0.61	0.49	0.48	0.33	0.06	0.07	0.15	0.00	0.61	0.00	0.01	0.00