Doublet Group distance statistics: 55496

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.013, 0.021, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.028, 0.062, 0.096, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.062 std_dev=0.034
O4	A	0, -0.002, 0.070, 0.142, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.070 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.052, 0.223, 0.394, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.223 std_dev=0.171
C4'	A	0, 0.180, 0.363, 0.547, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.363 std_dev=0.184
C2'	A	0, 0.054, 0.252, 0.451, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.252 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.211, 0.433, 0.654, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.433 std_dev=0.222
P	A	0, 0.478, 0.752, 1.026, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.752 std_dev=0.274
OP2	A	0, 0.464, 0.745, 1.025, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.745 std_dev=0.280
O5'	A	0, 0.292, 0.586, 0.880, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.586 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.336, 0.670, 1.003, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.670 std_dev=0.334
P	B	0, 0.434, 0.789, 1.144, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.789 std_dev=0.355
OP1	A	0, 0.558, 0.915, 1.273, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.915 std_dev=0.357
O3'	A	0, 0.177, 0.540, 0.904, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.540 std_dev=0.364
O2'	A	0, 0.125, 0.497, 0.870, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.497 std_dev=0.373
C5'	B	0, 0.318, 0.695, 1.072, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.695 std_dev=0.377
O5'	B	0, 0.558, 0.972, 1.385, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.972 std_dev=0.414
O4'	B	0, 0.186, 0.643, 1.100, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.643 std_dev=0.457
C4'	B	0, 0.166, 0.641, 1.116, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.641 std_dev=0.475
C8	B	0, 0.109, 0.592, 1.076, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.592 std_dev=0.483
C3'	B	0, 0.186, 0.698, 1.211, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.698 std_dev=0.513
N7	B	0, 0.028, 0.551, 1.074, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.551 std_dev=0.523
C1'	B	0, 0.125, 0.659, 1.192, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.659 std_dev=0.534
N6	B	0, 0.218, 0.773, 1.328, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.773 std_dev=0.555
N9	B	0, 0.030, 0.589, 1.147, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.589 std_dev=0.559
O3'	B	0, 0.235, 0.799, 1.363, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.799 std_dev=0.564
C6	B	0, 0.178, 0.757, 1.336, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.757 std_dev=0.579
N1	B	0, 0.386, 0.966, 1.546, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.966 std_dev=0.580
C2'	B	0, 0.145, 0.727, 1.309, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.727 std_dev=0.582
C2	B	0, 0.407, 1.002, 1.596, 1.952 max_d=1.952 avg_d=1.002 std_dev=0.594
N3	B	0, 0.270, 0.867, 1.464, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.867 std_dev=0.597
C5	B	0, -0.020, 0.583, 1.186, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.583 std_dev=0.603
C4	B	0, 0.042, 0.648, 1.254, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.648 std_dev=0.606
O2'	B	0, 0.164, 0.815, 1.465, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.815 std_dev=0.650
OP2	B	0, 0.657, 1.566, 2.475, 3.078 max_d=3.078 avg_d=1.566 std_dev=0.909
OP1	B	0, 0.110, 1.028, 1.946, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.028 std_dev=0.918

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.10	0.03	0.00	0.08	0.13	0.16	0.08
C2	0.03	0.00	0.13	0.09	0.01	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.21	0.01	0.07	0.16	0.15	0.11	0.09
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.06	0.11	0.02	0.10	0.24	0.00	0.08	0.04	0.02	0.13	0.31	0.11	0.16
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.15	0.02	0.15	0.02	0.04	0.20	0.03	0.02	0.06	0.01	0.13	0.36	0.13	0.21
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.13	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.09	0.00	0.04	0.30	0.21	0.11	0.18
C4'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.13	0.00	0.17	0.01	0.15	0.06	0.08	0.08	0.05	0.02	0.14	0.00	0.02	0.14	0.08	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.17	0.00	0.40	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.03	0.33	0.23	0.12	0.19
C5'	0.06	0.20	0.06	0.02	0.37	0.01	0.40	0.00	0.34	0.21	0.29	0.12	0.03	0.05	0.40	0.02	0.01	0.11	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.15	0.01	0.15	0.00	0.34	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.10	0.01	0.05	0.28	0.20	0.10	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.09	0.02	0.02	0.16	0.15	0.12	0.08
N3	0.03	0.01	0.10	0.04	0.01	0.08	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.18	0.01	0.06	0.22	0.18	0.09	0.12
O2	0.07	0.01	0.24	0.20	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.40	0.35	0.01	0.09	0.11	0.13	0.14	0.09
O2'	0.03	0.26	0.00	0.03	0.16	0.05	0.10	0.03	0.10	0.09	0.24	0.40	0.00	0.16	0.17	0.03	0.14	0.39	0.16	0.20
O3'	0.10	0.21	0.08	0.02	0.09	0.02	0.09	0.05	0.10	0.09	0.18	0.35	0.16	0.00	0.10	0.04	0.12	0.45	0.16	0.24
O4	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.14	0.01	0.40	0.01	0.02	0.01	0.01	0.17	0.10	0.00	0.05	0.32	0.23	0.16	0.21
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.09	0.03	0.04	0.05	0.00	0.20	0.16	0.34	0.25
O5'	0.08	0.16	0.13	0.13	0.30	0.02	0.33	0.01	0.28	0.16	0.22	0.11	0.14	0.12	0.32	0.20	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.13	0.15	0.31	0.36	0.21	0.14	0.23	0.11	0.20	0.15	0.18	0.13	0.39	0.45	0.23	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.11	0.11	0.13	0.11	0.08	0.12	0.03	0.10	0.12	0.09	0.14	0.16	0.16	0.16	0.34	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.16	0.21	0.18	0.03	0.19	0.01	0.13	0.08	0.12	0.09	0.20	0.24	0.21	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.08	0.37	0.37	0.12	0.37	0.08	0.29	0.20	0.25	0.17	0.11	0.34	0.07	0.26	0.36	0.37	0.42	0.33	0.08	1.26	0.44
C2	0.46	0.16	0.48	0.44	0.32	0.43	0.28	0.31	0.13	0.48	0.11	0.26	0.12	0.41	0.43	0.47	0.44	0.49	0.32	0.17	1.36	0.46
C2'	0.15	0.34	0.14	0.16	0.22	0.21	0.37	0.19	0.51	0.14	0.47	0.23	0.65	0.34	0.12	0.15	0.17	0.26	0.18	0.08	0.86	0.31
C3'	0.08	0.42	0.08	0.08	0.33	0.05	0.48	0.07	0.58	0.28	0.53	0.32	0.68	0.49	0.21	0.06	0.10	0.12	0.08	0.40	0.29	0.03
C4	0.48	0.22	0.49	0.44	0.36	0.43	0.34	0.31	0.23	0.52	0.19	0.30	0.20	0.45	0.47	0.49	0.42	0.51	0.35	0.06	1.26	0.41
C4'	0.15	0.23	0.11	0.10	0.16	0.14	0.28	0.09	0.35	0.14	0.32	0.15	0.44	0.29	0.11	0.14	0.10	0.22	0.19	0.74	0.48	0.08
C5	0.46	0.17	0.45	0.41	0.31	0.42	0.27	0.31	0.16	0.46	0.14	0.26	0.14	0.37	0.42	0.45	0.39	0.50	0.38	0.18	1.17	0.38
C5'	0.17	0.19	0.12	0.14	0.17	0.11	0.21	0.19	0.25	0.16	0.23	0.16	0.29	0.21	0.16	0.15	0.20	0.18	0.10	1.23	0.22	0.35
C6	0.42	0.12	0.42	0.39	0.26	0.40	0.19	0.30	0.10	0.41	0.10	0.21	0.15	0.28	0.38	0.42	0.38	0.48	0.37	0.19	1.15	0.38
N1	0.42	0.10	0.43	0.41	0.24	0.41	0.16	0.30	0.09	0.40	0.09	0.20	0.18	0.27	0.37	0.42	0.40	0.47	0.34	0.07	1.28	0.43
N3	0.48	0.22	0.50	0.45	0.37	0.44	0.36	0.32	0.23	0.52	0.18	0.30	0.19	0.48	0.47	0.50	0.45	0.51	0.33	0.13	1.33	0.45
O2	0.44	0.15	0.49	0.45	0.33	0.43	0.29	0.31	0.12	0.47	0.09	0.26	0.12	0.42	0.43	0.48	0.46	0.47	0.30	0.31	1.39	0.47
O2'	0.19	0.59	0.15	0.15	0.45	0.20	0.64	0.21	0.80	0.33	0.73	0.45	0.95	0.60	0.29	0.15	0.19	0.22	0.12	0.55	0.96	0.47
O3'	0.28	0.69	0.28	0.22	0.63	0.05	0.80	0.08	0.87	0.61	0.81	0.58	0.95	0.83	0.49	0.22	0.18	0.09	0.03	0.02	0.02	0.01
O4	0.50	0.27	0.50	0.45	0.40	0.44	0.39	0.32	0.30	0.54	0.25	0.34	0.28	0.50	0.49	0.51	0.43	0.52	0.36	0.06	1.26	0.41
O4'	0.49	0.18	0.47	0.43	0.28	0.45	0.16	0.32	0.10	0.39	0.11	0.28	0.17	0.19	0.41	0.48	0.40	0.54	0.43	0.36	1.06	0.32
O5'	0.15	0.14	0.11	0.09	0.10	0.09	0.16	0.11	0.22	0.11	0.20	0.10	0.29	0.15	0.11	0.13	0.11	0.18	0.12	0.97	0.36	0.21
OP1	0.20	0.16	0.18	0.17	0.14	0.19	0.17	0.18	0.22	0.15	0.20	0.14	0.28	0.18	0.16	0.20	0.18	0.23	0.27	1.04	0.22	0.25
OP2	0.14	0.18	0.10	0.10	0.12	0.11	0.18	0.13	0.25	0.11	0.25	0.13	0.33	0.15	0.12	0.13	0.12	0.18	0.13	0.94	0.29	0.22
P	0.16	0.16	0.13	0.11	0.12	0.12	0.17	0.13	0.23	0.12	0.22	0.12	0.30	0.16	0.13	0.16	0.12	0.19	0.17	1.02	0.29	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.10	0.37	0.62	0.24
C2	0.04	0.00	0.14	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.20	0.14	0.03	0.28	0.49	0.79	0.21
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.04	0.08	0.04	0.11	0.14	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.60	0.40	0.23
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.03	0.04	0.15	0.04	0.08	0.06	0.13	0.07	0.02	0.00	0.01	0.19	0.66	0.18	0.18
C4	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.28	0.36	0.81	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.15	0.01	0.06	0.08	0.14	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.35	0.17	0.15
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.01	0.37	0.24	0.85	0.16
C5'	0.05	0.08	0.04	0.03	0.13	0.01	0.22	0.00	0.21	0.28	0.15	0.06	0.25	0.30	0.15	0.05	0.03	0.02	0.01	0.12	0.14	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.04	0.01	0.05	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.03	0.01	0.38	0.27	0.84	0.16
C8	0.01	0.02	0.04	0.15	0.01	0.15	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.04	0.34	0.21	0.82	0.14
N1	0.03	0.00	0.11	0.04	0.00	0.01	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.08	0.01	0.34	0.38	0.81	0.18
N3	0.04	0.00	0.14	0.08	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.03	0.23	0.50	0.77	0.23
N6	0.03	0.02	0.06	0.06	0.02	0.08	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.05	0.01	0.42	0.21	0.82	0.18
N7	0.01	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.03	0.40	0.24	0.86	0.17
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.24	0.29	0.77	0.19
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.10	0.05	0.08	0.05	0.12	0.03	0.17	0.19	0.11	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.12	0.56	0.28	0.19
O3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.03	0.15	0.08	0.13	0.05	0.14	0.06	0.02	0.00	0.02	0.20	0.78	0.27	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.26	0.56	0.27
O5'	0.10	0.28	0.16	0.19	0.28	0.03	0.37	0.01	0.38	0.34	0.34	0.23	0.42	0.40	0.24	0.12	0.20	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.37	0.49	0.60	0.66	0.36	0.35	0.24	0.12	0.27	0.21	0.38	0.50	0.21	0.24	0.29	0.56	0.78	0.26	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.62	0.79	0.40	0.18	0.81	0.17	0.85	0.14	0.84	0.82	0.81	0.77	0.82	0.86	0.77	0.28	0.27	0.56	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.21	0.23	0.18	0.19	0.15	0.16	0.01	0.16	0.14	0.18	0.23	0.18	0.17	0.19	0.19	0.13	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00