Doublet Group distance statistics: 55509

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.004, 0.023, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.007, 0.032, 0.058, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.026
N7	A	0, -0.003, 0.034, 0.071, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.034 std_dev=0.037
C8	A	0, -0.002, 0.037, 0.077, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.037 std_dev=0.040
P	B	0, 0.177, 0.673, 1.169, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.673 std_dev=0.496
C5'	B	0, 0.195, 0.716, 1.237, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.716 std_dev=0.521
OP2	B	0, 0.251, 0.909, 1.566, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.909 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.179, 0.848, 1.518, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.848 std_dev=0.670
O5'	B	0, 0.226, 0.902, 1.577, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.902 std_dev=0.676
C4'	B	0, 0.269, 1.076, 1.883, 1.943 max_d=1.943 avg_d=1.076 std_dev=0.807
O4'	A	0, 0.225, 1.037, 1.849, 1.982 max_d=1.982 avg_d=1.037 std_dev=0.812
C2'	A	0, 0.255, 1.083, 1.911, 2.010 max_d=2.010 avg_d=1.083 std_dev=0.828
C3'	B	0, 0.313, 1.431, 2.550, 2.730 max_d=2.730 avg_d=1.431 std_dev=1.119
C3'	A	0, 0.420, 1.549, 2.679, 2.660 max_d=2.660 avg_d=1.549 std_dev=1.129
O2'	A	0, 0.381, 1.589, 2.797, 2.927 max_d=2.927 avg_d=1.589 std_dev=1.208
C4'	A	0, 0.404, 1.627, 2.850, 2.950 max_d=2.950 avg_d=1.627 std_dev=1.223
O4'	B	0, 0.547, 1.891, 3.235, 3.002 max_d=3.002 avg_d=1.891 std_dev=1.344
O3'	A	0, 0.563, 1.924, 3.285, 2.908 max_d=2.908 avg_d=1.924 std_dev=1.361
C2'	B	0, 0.682, 2.417, 4.151, 3.988 max_d=3.988 avg_d=2.417 std_dev=1.734
O3'	B	0, 0.332, 2.079, 3.826, 4.275 max_d=4.275 avg_d=2.079 std_dev=1.747
O5'	A	0, 0.456, 2.224, 3.991, 4.324 max_d=4.324 avg_d=2.224 std_dev=1.768
C1'	B	0, 0.730, 2.511, 4.291, 3.936 max_d=3.936 avg_d=2.511 std_dev=1.781
C5'	A	0, 0.509, 2.330, 4.152, 4.446 max_d=4.446 avg_d=2.330 std_dev=1.821
OP2	A	0, 0.319, 2.160, 4.002, 4.500 max_d=4.500 avg_d=2.160 std_dev=1.842
P	A	0, 0.378, 2.384, 4.389, 4.907 max_d=4.907 avg_d=2.384 std_dev=2.006
O2'	B	0, 0.680, 2.779, 4.878, 5.072 max_d=5.072 avg_d=2.779 std_dev=2.099
C6	B	0, 0.872, 3.117, 5.362, 5.200 max_d=5.200 avg_d=3.117 std_dev=2.245
N1	B	0, 0.966, 3.440, 5.914, 5.711 max_d=5.711 avg_d=3.440 std_dev=2.474
OP1	A	0, 0.522, 3.351, 6.179, 6.918 max_d=6.918 avg_d=3.351 std_dev=2.828
C5	B	0, 1.076, 4.001, 6.926, 6.910 max_d=6.910 avg_d=4.001 std_dev=2.925
C2	B	0, 1.300, 4.733, 8.166, 8.036 max_d=8.036 avg_d=4.733 std_dev=3.433
O2	B	0, 1.389, 5.025, 8.661, 8.481 max_d=8.481 avg_d=5.025 std_dev=3.636
C4	B	0, 1.411, 5.315, 9.219, 9.266 max_d=9.266 avg_d=5.315 std_dev=3.904
N3	B	0, 1.521, 5.657, 9.794, 9.774 max_d=9.774 avg_d=5.657 std_dev=4.136
N4	B	0, 1.632, 6.268, 10.904, 11.068 max_d=11.068 avg_d=6.268 std_dev=4.636

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.11	0.08	0.09	0.02
C2	0.04	0.00	0.28	0.23	0.00	0.22	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.09	0.33	0.13	0.19	0.43	0.19
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.14	0.01	0.06	0.14	0.12	0.16	0.21	0.27	0.08	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.28	0.33	0.28	0.27
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.20	0.00	0.23	0.02	0.25	0.15	0.25	0.19	0.27	0.20	0.14	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.17	0.09
C4	0.02	0.00	0.14	0.20	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.07	0.17	0.05	0.13	0.39	0.17
C4'	0.00	0.22	0.01	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.07	0.19	0.16	0.22	0.06	0.15	0.05	0.17	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.23	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.06	0.09	0.26	0.55	0.27
C5'	0.05	0.27	0.14	0.02	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.21	0.19	0.27	0.06	0.17	0.02	0.06	0.14	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.25	0.00	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.10	0.13	0.09	0.28	0.60	0.28
C8	0.01	0.00	0.16	0.15	0.00	0.19	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.37	0.05	0.20	0.20	0.32	0.45	0.33
N1	0.03	0.00	0.21	0.25	0.00	0.16	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.09	0.24	0.09	0.22	0.54	0.23
N3	0.04	0.00	0.27	0.19	0.00	0.22	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.30	0.11	0.33	0.14	0.17	0.34	0.17
N6	0.00	0.00	0.08	0.27	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.16	0.13	0.07	0.15	0.38	0.70	0.35
N7	0.00	0.00	0.09	0.20	0.00	0.15	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.32	0.09	0.12	0.20	0.40	0.62	0.38
N9	0.00	0.00	0.01	0.14	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.07	0.01	0.02	0.09	0.29	0.14
O2'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.12	0.17	0.16	0.06	0.14	0.37	0.20	0.30	0.16	0.32	0.14	0.00	0.03	0.13	0.24	0.31	0.41	0.28
O3'	0.21	0.09	0.02	0.00	0.07	0.01	0.08	0.14	0.10	0.05	0.09	0.11	0.13	0.09	0.07	0.03	0.00	0.15	0.19	0.09	0.23	0.18
O4'	0.00	0.33	0.01	0.01	0.17	0.01	0.06	0.01	0.13	0.20	0.24	0.33	0.07	0.12	0.01	0.13	0.15	0.00	0.06	0.01	0.20	0.11
O5'	0.11	0.13	0.28	0.07	0.05	0.01	0.09	0.01	0.09	0.20	0.09	0.14	0.15	0.20	0.02	0.24	0.19	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.19	0.33	0.12	0.13	0.11	0.26	0.12	0.28	0.32	0.22	0.17	0.38	0.40	0.09	0.31	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.43	0.28	0.17	0.39	0.07	0.55	0.01	0.60	0.45	0.54	0.34	0.70	0.62	0.29	0.41	0.23	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.19	0.27	0.09	0.17	0.03	0.27	0.01	0.28	0.33	0.23	0.17	0.35	0.38	0.14	0.28	0.18	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.90	1.76	0.72	0.29	1.84	0.29	1.48	0.35	1.22	1.35	1.98	1.94	1.76	0.67	0.17	0.60	0.46	0.19	0.32	0.28
C2	0.87	1.74	0.83	0.34	2.21	0.06	1.76	0.43	1.31	1.32	2.16	2.58	1.67	1.22	0.34	0.47	0.40	0.18	0.16	0.18
C2'	0.67	1.55	0.61	0.22	1.73	0.07	1.35	0.26	1.04	1.12	1.84	1.92	1.56	0.62	0.18	0.31	0.48	0.16	0.35	0.27
C3'	0.62	1.32	0.60	0.24	1.48	0.17	1.21	0.19	0.97	1.00	1.54	1.63	1.31	0.48	0.14	0.39	0.48	0.23	0.45	0.37
C4	0.78	1.63	0.70	0.28	2.00	0.15	1.64	0.41	1.26	1.26	1.97	2.19	1.53	0.95	0.24	0.46	0.44	0.17	0.24	0.24
C4'	0.60	1.15	0.59	0.29	1.17	0.33	0.95	0.40	0.79	0.88	1.27	1.25	1.19	0.45	0.18	0.44	0.38	0.21	0.36	0.28
C5	0.62	1.32	0.63	0.24	1.72	0.15	1.49	0.46	1.12	1.05	1.63	1.90	1.21	0.88	0.21	0.33	0.37	0.19	0.21	0.21
C5'	0.27	0.63	0.36	0.20	0.70	0.24	0.58	0.33	0.46	0.48	0.73	0.77	0.63	0.27	0.14	0.21	0.30	0.18	0.34	0.23
C6	0.63	1.29	0.71	0.25	1.73	0.11	1.48	0.48	1.08	1.01	1.61	1.99	1.19	1.02	0.22	0.28	0.30	0.23	0.16	0.14
C8	0.64	1.26	0.52	0.29	1.47	0.31	1.30	0.41	1.09	1.06	1.45	1.54	1.15	0.52	0.28	0.46	0.43	0.17	0.32	0.27
N1	0.77	1.52	0.81	0.31	2.00	0.04	1.64	0.45	1.21	1.18	1.90	2.35	1.44	1.19	0.30	0.38	0.34	0.21	0.14	0.14
N3	0.89	1.81	0.79	0.32	2.23	0.11	1.75	0.40	1.33	1.37	2.23	2.52	1.75	1.12	0.32	0.52	0.45	0.17	0.21	0.22
N6	0.48	1.01	0.65	0.20	1.41	0.17	1.23	0.50	0.88	0.80	1.29	1.64	0.92	0.94	0.18	0.15	0.18	0.29	0.19	0.10
N7	0.48	1.07	0.45	0.20	1.37	0.27	1.24	0.48	0.98	0.88	1.29	1.48	0.95	0.59	0.24	0.32	0.36	0.17	0.26	0.24
N9	0.80	1.61	0.65	0.28	1.82	0.24	1.51	0.38	1.23	1.27	1.86	1.92	1.52	0.72	0.21	0.52	0.46	0.18	0.30	0.27
O2'	0.86	1.83	0.78	0.33	1.94	0.13	1.48	0.29	1.17	1.31	2.13	2.15	1.93	0.78	0.22	0.45	0.60	0.32	0.46	0.41
O3'	0.60	1.28	0.58	0.25	1.41	0.21	1.12	0.23	0.89	0.95	1.49	1.57	1.31	0.46	0.22	0.39	0.48	0.13	0.43	0.32
O4'	0.84	1.44	0.73	0.39	1.39	0.46	1.13	0.53	0.99	1.14	1.53	1.44	1.50	0.60	0.25	0.63	0.42	0.24	0.34	0.30
O5'	0.11	0.49	0.21	0.03	0.65	0.21	0.54	0.25	0.39	0.35	0.63	0.73	0.44	0.30	0.01	0.09	0.24	0.12	0.32	0.18
OP1	0.25	0.18	0.03	0.01	0.19	0.12	0.24	0.18	0.15	0.08	0.15	0.26	0.36	0.11	0.00	0.23	0.36	0.32	0.57	0.43
OP2	0.15	0.29	0.06	0.01	0.64	0.31	0.67	0.15	0.51	0.30	0.47	0.73	0.09	0.08	0.01	0.32	0.39	0.48	0.51	0.50
P	0.13	0.15	0.07	0.01	0.38	0.19	0.40	0.14	0.28	0.12	0.27	0.45	0.13	0.12	0.00	0.20	0.31	0.28	0.45	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.06	0.08	0.37	0.10
C2	0.00	0.00	0.10	0.16	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.13	0.05	0.18	0.27	0.25	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.12	0.09	0.00	0.08	0.01	0.18	0.00	0.03	0.02	0.39	0.25	0.50	0.33
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.24	0.00	0.24	0.04	0.20	0.15	0.21	0.26	0.10	0.01	0.00	0.01	0.35	0.03	0.44	0.24
C4	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.12	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.11	0.04	0.34	0.43	0.13	0.32
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.12	0.00	0.18	0.01	0.17	0.07	0.06	0.14	0.06	0.17	0.02	0.01	0.01	0.22	0.32	0.01
C5	0.00	0.00	0.07	0.24	0.00	0.18	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.13	0.07	0.35	0.43	0.09	0.33
C5'	0.07	0.11	0.12	0.04	0.26	0.01	0.32	0.00	0.28	0.15	0.17	0.28	0.03	0.08	0.13	0.02	0.01	0.38	0.38	0.02
C6	0.00	0.00	0.09	0.20	0.00	0.17	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.08	0.09	0.26	0.30	0.16	0.21
N1	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.08	0.02	0.15	0.22	0.27	0.12
N3	0.00	0.00	0.08	0.21	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.10	0.04	0.27	0.36	0.19	0.24
N4	0.00	0.00	0.01	0.26	0.00	0.14	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.13	0.04	0.38	0.48	0.15	0.38
O2	0.00	0.00	0.18	0.10	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.23	0.09	0.11	0.22	0.30	0.10
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.24	0.17	0.27	0.08	0.24	0.15	0.18	0.27	0.07	0.00	0.05	0.12	0.42	0.29	0.49	0.36
O3'	0.21	0.13	0.03	0.00	0.11	0.02	0.13	0.13	0.08	0.08	0.10	0.13	0.23	0.05	0.00	0.14	0.31	0.13	0.46	0.27
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.04	0.04	0.09	0.12	0.14	0.00	0.14	0.20	0.34	0.03
O5'	0.06	0.18	0.39	0.35	0.34	0.01	0.35	0.01	0.26	0.15	0.27	0.38	0.11	0.42	0.31	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.27	0.25	0.03	0.43	0.22	0.43	0.38	0.30	0.22	0.36	0.48	0.22	0.29	0.13	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.37	0.25	0.50	0.44	0.13	0.32	0.09	0.38	0.16	0.27	0.19	0.15	0.30	0.49	0.46	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.15	0.33	0.24	0.32	0.01	0.33	0.02	0.21	0.12	0.24	0.38	0.10	0.36	0.27	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00