Doublet Group distance statistics: 55512

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N7	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N6	A	0, -0.002, 0.023, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.024
C5'	B	0, 0.069, 0.235, 0.402, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.235 std_dev=0.167
C4'	B	0, 0.078, 0.288, 0.497, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.288 std_dev=0.210
O5'	B	0, 0.090, 0.306, 0.523, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.306 std_dev=0.217
C2'	A	0, 0.023, 0.241, 0.459, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.241 std_dev=0.218
O4'	A	0, 0.041, 0.276, 0.510, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.276 std_dev=0.235
O4'	B	0, 0.105, 0.358, 0.611, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.358 std_dev=0.253
P	B	0, 0.083, 0.338, 0.593, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.338 std_dev=0.255
C3'	B	0, 0.104, 0.377, 0.651, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.377 std_dev=0.273
OP1	B	0, 0.042, 0.384, 0.726, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.384 std_dev=0.342
C4'	A	0, 0.153, 0.523, 0.894, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.523 std_dev=0.370
OP2	A	0, -0.003, 0.376, 0.756, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.376 std_dev=0.379
C1'	B	0, 0.151, 0.540, 0.929, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.540 std_dev=0.389
O3'	B	0, 0.062, 0.464, 0.865, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.464 std_dev=0.401
P	A	0, 0.010, 0.426, 0.842, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.426 std_dev=0.416
OP2	B	0, 0.071, 0.491, 0.912, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.491 std_dev=0.420
N1	B	0, 0.153, 0.579, 1.005, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.579 std_dev=0.426
C6	B	0, 0.159, 0.611, 1.063, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.611 std_dev=0.452
O2	B	0, 0.139, 0.598, 1.057, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.598 std_dev=0.459
C2	B	0, 0.156, 0.619, 1.082, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.619 std_dev=0.463
C5	B	0, 0.172, 0.670, 1.169, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.670 std_dev=0.499
N3	B	0, 0.166, 0.674, 1.181, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.674 std_dev=0.508
C4	B	0, 0.173, 0.694, 1.214, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.694 std_dev=0.521
OP1	A	0, 0.026, 0.551, 1.076, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.551 std_dev=0.525
C2'	B	0, 0.173, 0.710, 1.246, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.710 std_dev=0.537
N4	B	0, 0.190, 0.750, 1.310, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.750 std_dev=0.560
O5'	A	0, 0.073, 0.727, 1.381, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.727 std_dev=0.654
C5'	A	0, 0.286, 1.090, 1.894, 1.915 max_d=1.915 avg_d=1.090 std_dev=0.804
O2'	A	0, 0.341, 1.171, 2.000, 1.816 max_d=1.816 avg_d=1.171 std_dev=0.829
C3'	A	0, 0.350, 1.194, 2.039, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.194 std_dev=0.845
O2'	B	0, 0.251, 1.113, 1.975, 2.099 max_d=2.099 avg_d=1.113 std_dev=0.862
O3'	A	0, 0.676, 2.310, 3.944, 3.528 max_d=3.528 avg_d=2.310 std_dev=1.634

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.19	0.00	0.27	0.32	0.05	0.14
C2	0.01	0.00	0.02	0.33	0.00	0.16	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.43	0.12	0.43	0.24	0.11	0.22
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.50	0.50	0.22	0.35
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.26	0.00	0.26	0.00	0.30	0.14	0.33	0.30	0.30	0.20	0.16	0.00	0.00	0.01	0.37	0.48	0.32	0.39
C4	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.18	0.07	0.34	0.24	0.05	0.14
C4'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.12	0.00	0.12	0.00	0.14	0.09	0.16	0.15	0.14	0.10	0.07	0.19	0.01	0.00	0.02	0.28	0.20	0.06
C5	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.12	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.15	0.04	0.28	0.16	0.06	0.10
C5'	0.05	0.31	0.12	0.00	0.18	0.00	0.17	0.00	0.21	0.12	0.27	0.29	0.21	0.15	0.08	0.05	0.15	0.02	0.00	0.42	0.33	0.02
C6	0.01	0.00	0.01	0.30	0.01	0.14	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.26	0.06	0.30	0.14	0.05	0.11
C8	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.18	0.12	0.06	0.20	0.18	0.08	0.07
N1	0.01	0.00	0.01	0.33	0.00	0.16	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.39	0.10	0.37	0.17	0.07	0.16
N3	0.01	0.00	0.02	0.30	0.00	0.15	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.36	0.12	0.44	0.29	0.10	0.22
N6	0.02	0.01	0.02	0.30	0.01	0.14	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.29	0.24	0.05	0.26	0.09	0.05	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.20	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.23	0.03	0.04	0.21	0.14	0.08	0.07
N9	0.00	0.01	0.01	0.16	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.15	0.04	0.01	0.27	0.25	0.06	0.11
O2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.23	0.19	0.25	0.05	0.28	0.18	0.30	0.26	0.29	0.23	0.15	0.00	0.03	0.13	0.53	0.52	0.37	0.43
O3'	0.19	0.43	0.02	0.00	0.18	0.01	0.15	0.15	0.26	0.12	0.39	0.36	0.24	0.03	0.04	0.03	0.00	0.13	0.53	0.61	0.83	0.71
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.04	0.01	0.13	0.13	0.00	0.22	0.29	0.24	0.16
O5'	0.27	0.43	0.50	0.37	0.34	0.02	0.28	0.00	0.30	0.20	0.37	0.44	0.26	0.21	0.27	0.53	0.53	0.22	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.24	0.50	0.48	0.24	0.28	0.16	0.42	0.14	0.18	0.17	0.29	0.09	0.14	0.25	0.52	0.61	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.11	0.22	0.32	0.05	0.20	0.06	0.33	0.05	0.08	0.07	0.10	0.05	0.08	0.06	0.37	0.83	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.22	0.35	0.39	0.14	0.06	0.10	0.02	0.11	0.07	0.16	0.22	0.08	0.07	0.11	0.43	0.71	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.31	0.37	0.31	0.28	0.19	0.26	0.09	0.25	0.29	0.30	0.29	0.31	0.50	0.45	0.21	0.16	0.25	0.25	0.18
C2	0.18	0.13	0.24	0.25	0.11	0.16	0.10	0.09	0.11	0.13	0.12	0.11	0.12	0.34	0.43	0.12	0.10	0.28	0.14	0.14
C2'	0.34	0.33	0.40	0.35	0.29	0.25	0.26	0.13	0.26	0.31	0.32	0.29	0.35	0.54	0.51	0.25	0.16	0.25	0.21	0.16
C3'	0.53	0.53	0.55	0.51	0.49	0.48	0.46	0.44	0.46	0.51	0.52	0.49	0.53	0.65	0.57	0.49	0.42	0.43	0.42	0.40
C4	0.23	0.21	0.29	0.28	0.19	0.18	0.18	0.10	0.18	0.20	0.20	0.19	0.19	0.39	0.44	0.16	0.14	0.28	0.21	0.17
C4'	0.44	0.46	0.51	0.42	0.41	0.31	0.37	0.23	0.37	0.42	0.45	0.41	0.48	0.67	0.52	0.33	0.24	0.31	0.31	0.25
C5	0.19	0.16	0.25	0.24	0.16	0.16	0.15	0.10	0.15	0.17	0.17	0.16	0.14	0.32	0.38	0.14	0.14	0.29	0.22	0.17
C5'	0.53	0.56	0.58	0.50	0.48	0.38	0.42	0.28	0.42	0.50	0.55	0.48	0.60	0.76	0.61	0.41	0.27	0.31	0.31	0.26
C6	0.14	0.10	0.20	0.20	0.09	0.13	0.09	0.09	0.09	0.10	0.10	0.10	0.08	0.24	0.34	0.10	0.11	0.28	0.16	0.15
C8	0.25	0.25	0.31	0.27	0.25	0.16	0.23	0.08	0.22	0.24	0.26	0.25	0.23	0.39	0.38	0.18	0.17	0.24	0.27	0.18
N1	0.13	0.09	0.19	0.20	0.07	0.13	0.06	0.09	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.26	0.37	0.10	0.09	0.27	0.12	0.13
N3	0.22	0.19	0.29	0.28	0.17	0.18	0.16	0.10	0.16	0.19	0.19	0.17	0.19	0.40	0.46	0.16	0.12	0.29	0.18	0.16
N6	0.10	0.08	0.16	0.12	0.07	0.09	0.06	0.09	0.07	0.08	0.08	0.06	0.08	0.18	0.23	0.09	0.10	0.25	0.13	0.13
N7	0.21	0.19	0.26	0.24	0.20	0.15	0.19	0.08	0.18	0.19	0.20	0.20	0.17	0.32	0.33	0.15	0.16	0.25	0.26	0.18
N9	0.27	0.26	0.33	0.29	0.24	0.18	0.22	0.09	0.22	0.25	0.26	0.25	0.25	0.43	0.44	0.18	0.15	0.26	0.24	0.18
O2'	0.29	0.28	0.33	0.30	0.26	0.22	0.25	0.14	0.24	0.26	0.27	0.26	0.29	0.45	0.48	0.22	0.21	0.27	0.25	0.22
O3'	0.46	0.46	0.46	0.41	0.43	0.43	0.40	0.39	0.40	0.44	0.46	0.43	0.46	0.58	0.48	0.45	0.35	0.32	0.34	0.30
O4'	0.37	0.39	0.46	0.36	0.36	0.21	0.32	0.09	0.32	0.36	0.39	0.36	0.39	0.61	0.49	0.24	0.17	0.26	0.27	0.19
O5'	0.14	0.10	0.23	0.16	0.13	0.09	0.16	0.09	0.16	0.13	0.10	0.13	0.07	0.36	0.28	0.08	0.14	0.26	0.21	0.20
OP1	0.11	0.09	0.23	0.13	0.08	0.03	0.09	0.05	0.10	0.10	0.08	0.08	0.07	0.43	0.24	0.04	0.00	0.15	0.07	0.07
OP2	0.07	0.05	0.14	0.08	0.03	0.05	0.04	0.10	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.32	0.21	0.05	0.07	0.12	0.04	0.03
P	0.09	0.06	0.17	0.10	0.06	0.02	0.07	0.06	0.08	0.07	0.06	0.06	0.05	0.35	0.22	0.03	0.02	0.14	0.06	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.06	0.15	0.20	0.13
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.13	0.02	0.06	0.18	0.22	0.15
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.07	0.02	0.05	0.04	0.11	0.00	0.01	0.02	0.11	0.21	0.29	0.22
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.09	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.09	0.05
C4	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.12	0.08	0.05	0.03	0.16	0.21	0.12
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.02	0.02	0.06	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02
C5	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.04	0.08	0.03	0.15	0.22	0.11
C5'	0.02	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.02	0.07	0.08	0.04	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.04	0.08	0.04	0.16	0.24	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.08	0.02	0.06	0.17	0.23	0.15
N3	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.04	0.18	0.21	0.13
N4	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.06	0.03	0.15	0.19	0.10
O2	0.07	0.00	0.11	0.09	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.07	0.10	0.20	0.22	0.16
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.12	0.04	0.14	0.04	0.13	0.06	0.09	0.13	0.14	0.00	0.01	0.03	0.12	0.24	0.38	0.26
O3'	0.09	0.13	0.01	0.00	0.08	0.03	0.04	0.08	0.04	0.08	0.12	0.08	0.18	0.01	0.00	0.03	0.10	0.07	0.08	0.07
O4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.02	0.06	0.07	0.03	0.03	0.00	0.06	0.10	0.13	0.08
O5'	0.06	0.06	0.11	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.06	0.04	0.03	0.10	0.12	0.10	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.15	0.18	0.21	0.06	0.16	0.04	0.15	0.02	0.16	0.17	0.18	0.15	0.20	0.24	0.07	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.22	0.29	0.09	0.21	0.05	0.22	0.00	0.24	0.23	0.21	0.19	0.22	0.38	0.08	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.15	0.22	0.05	0.12	0.02	0.11	0.01	0.13	0.15	0.13	0.10	0.16	0.26	0.07	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00