Doublet Group distance statistics: 55519

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 18, 20, 12, 3, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.022 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.018, 0.045, 0.072, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.045 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.029, 0.101, 0.173, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.101 std_dev=0.072
N1	B	0, 0.158, 0.276, 0.395, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.276 std_dev=0.118
C6	B	0, 0.171, 0.290, 0.410, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.290 std_dev=0.120
C4	B	0, 0.151, 0.290, 0.429, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.290 std_dev=0.139
O6	B	0, 0.219, 0.365, 0.511, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.365 std_dev=0.146
O4'	A	0, -0.010, 0.138, 0.286, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.138 std_dev=0.148
C5	B	0, 0.168, 0.320, 0.472, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.320 std_dev=0.152
N3	B	0, 0.154, 0.307, 0.459, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.307 std_dev=0.153
C2'	A	0, 0.009, 0.162, 0.315, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.162 std_dev=0.153
C2	B	0, 0.162, 0.319, 0.475, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.319 std_dev=0.157
N9	B	0, 0.171, 0.368, 0.565, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.368 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.013, 0.240, 0.466, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.240 std_dev=0.226
C1'	B	0, 0.194, 0.423, 0.652, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.423 std_dev=0.229
N7	B	0, 0.226, 0.456, 0.686, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.456 std_dev=0.230
N2	B	0, 0.220, 0.454, 0.687, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.454 std_dev=0.233
C8	B	0, 0.220, 0.470, 0.720, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.470 std_dev=0.250
C3'	A	0, 0.011, 0.261, 0.512, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.261 std_dev=0.251
O2'	A	0, -0.018, 0.244, 0.506, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.244 std_dev=0.262
O4'	B	0, 0.173, 0.507, 0.840, 2.245 max_d=2.245 avg_d=0.507 std_dev=0.334
C5'	A	0, 0.034, 0.376, 0.718, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.376 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.036, 0.412, 0.788, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.412 std_dev=0.376
C2'	B	0, 0.160, 0.542, 0.923, 2.546 max_d=2.546 avg_d=0.542 std_dev=0.382
O2'	B	0, 0.268, 0.665, 1.062, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.665 std_dev=0.397
O3'	A	0, 0.013, 0.410, 0.808, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.410 std_dev=0.397
P	A	0, 0.153, 0.570, 0.988, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.570 std_dev=0.417
OP2	A	0, 0.119, 0.601, 1.083, 2.828 max_d=2.828 avg_d=0.601 std_dev=0.482
C4'	B	0, 0.110, 0.609, 1.108, 3.390 max_d=3.390 avg_d=0.609 std_dev=0.499
OP1	A	0, 0.224, 0.724, 1.224, 2.601 max_d=2.601 avg_d=0.724 std_dev=0.500
C3'	B	0, 0.086, 0.610, 1.134, 3.417 max_d=3.417 avg_d=0.610 std_dev=0.524
C5'	B	0, 0.192, 0.818, 1.444, 4.233 max_d=4.233 avg_d=0.818 std_dev=0.626
O3'	B	0, 0.100, 0.774, 1.449, 4.122 max_d=4.122 avg_d=0.774 std_dev=0.675
O5'	B	0, 0.311, 1.190, 2.070, 4.545 max_d=4.545 avg_d=1.190 std_dev=0.879
P	B	0, 0.385, 1.497, 2.609, 6.347 max_d=6.347 avg_d=1.497 std_dev=1.112
OP2	B	0, 0.415, 1.653, 2.891, 7.204 max_d=7.204 avg_d=1.653 std_dev=1.238
OP1	B	0, 0.320, 1.734, 3.148, 7.905 max_d=7.905 avg_d=1.734 std_dev=1.414

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.10	0.02	0.01	0.14	0.15	0.18	0.12
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.04	0.25	0.27	0.28	0.22
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.06	0.07	0.03	0.08	0.15	0.00	0.02	0.07	0.01	0.18	0.21	0.20	0.18
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.16	0.01	0.17	0.02	0.15	0.09	0.13	0.12	0.02	0.01	0.17	0.02	0.16	0.20	0.10	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.16	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.15	0.01	0.03	0.35	0.40	0.42	0.34
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.06	0.05	0.10	0.02	0.10	0.00	0.02	0.09	0.15	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.17	0.01	0.11	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.01	0.05	0.36	0.40	0.41	0.35
C5'	0.04	0.10	0.06	0.02	0.18	0.01	0.20	0.00	0.18	0.11	0.13	0.08	0.06	0.08	0.19	0.02	0.01	0.16	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.01	0.05	0.32	0.32	0.31	0.28
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.02	0.24	0.25	0.25	0.20
N3	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.13	0.02	0.03	0.30	0.34	0.36	0.28
O2	0.03	0.01	0.15	0.12	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.17	0.03	0.06	0.20	0.23	0.25	0.18
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.12	0.10	0.13	0.06	0.11	0.07	0.10	0.14	0.00	0.04	0.13	0.07	0.11	0.16	0.20	0.12
O3'	0.10	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.17	0.08	0.14	0.07	0.13	0.17	0.04	0.00	0.18	0.07	0.16	0.25	0.18	0.18
O4	0.02	0.02	0.07	0.17	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.02	0.03	0.13	0.18	0.00	0.04	0.37	0.44	0.47	0.37
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.07	0.07	0.04	0.00	0.11	0.11	0.20	0.12
O5'	0.14	0.25	0.18	0.16	0.35	0.02	0.36	0.01	0.32	0.24	0.30	0.20	0.11	0.16	0.37	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.27	0.21	0.20	0.40	0.09	0.40	0.16	0.32	0.25	0.34	0.23	0.16	0.25	0.44	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.28	0.20	0.10	0.42	0.15	0.41	0.20	0.31	0.25	0.36	0.25	0.20	0.18	0.47	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.22	0.18	0.14	0.34	0.03	0.35	0.02	0.28	0.20	0.28	0.18	0.12	0.18	0.37	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.15	0.24	0.26	0.11	0.14	0.12	0.21	0.13	0.12	0.11	0.23	0.15	0.14	0.11	0.24	0.26	0.15	0.62	0.20	0.71	0.96	0.74
C2	0.12	0.16	0.19	0.24	0.11	0.12	0.12	0.22	0.12	0.12	0.12	0.24	0.14	0.14	0.11	0.19	0.21	0.14	0.65	0.19	0.73	0.99	0.77
C2'	0.26	0.27	0.30	0.30	0.23	0.28	0.20	0.29	0.20	0.21	0.22	0.33	0.27	0.20	0.23	0.33	0.37	0.31	0.57	0.22	0.66	0.85	0.67
C3'	0.26	0.25	0.28	0.27	0.23	0.30	0.21	0.32	0.20	0.22	0.21	0.30	0.26	0.21	0.24	0.30	0.36	0.34	0.60	0.21	0.70	0.88	0.71
C4	0.11	0.16	0.15	0.23	0.11	0.14	0.12	0.26	0.11	0.15	0.14	0.22	0.13	0.16	0.11	0.17	0.20	0.14	0.71	0.13	0.82	1.11	0.87
C4'	0.15	0.16	0.23	0.23	0.13	0.18	0.13	0.24	0.13	0.13	0.12	0.22	0.16	0.14	0.13	0.24	0.27	0.22	0.62	0.18	0.73	0.96	0.75
C5	0.11	0.16	0.16	0.23	0.11	0.13	0.12	0.25	0.11	0.14	0.13	0.23	0.14	0.16	0.11	0.18	0.20	0.14	0.70	0.14	0.82	1.11	0.86
C5'	0.17	0.17	0.22	0.23	0.15	0.20	0.15	0.28	0.15	0.16	0.14	0.23	0.18	0.17	0.15	0.24	0.26	0.25	0.67	0.19	0.79	1.03	0.81
C6	0.11	0.16	0.18	0.23	0.11	0.12	0.12	0.23	0.11	0.13	0.12	0.24	0.14	0.15	0.11	0.19	0.21	0.15	0.68	0.16	0.79	1.07	0.83
N1	0.12	0.16	0.20	0.24	0.11	0.13	0.12	0.22	0.12	0.12	0.12	0.24	0.15	0.14	0.11	0.20	0.22	0.15	0.65	0.18	0.74	1.01	0.78
N3	0.11	0.16	0.16	0.23	0.11	0.13	0.11	0.23	0.11	0.13	0.14	0.22	0.13	0.15	0.11	0.17	0.20	0.13	0.68	0.16	0.77	1.05	0.82
O2	0.13	0.16	0.22	0.25	0.12	0.14	0.12	0.21	0.14	0.12	0.11	0.24	0.15	0.14	0.12	0.21	0.23	0.15	0.61	0.21	0.68	0.92	0.72
O2'	0.23	0.23	0.30	0.31	0.20	0.26	0.20	0.28	0.21	0.19	0.20	0.29	0.24	0.20	0.20	0.32	0.40	0.28	0.53	0.25	0.62	0.81	0.63
O3'	0.33	0.30	0.34	0.35	0.29	0.39	0.25	0.41	0.23	0.28	0.24	0.35	0.32	0.26	0.30	0.36	0.47	0.42	0.62	0.23	0.73	0.85	0.72
O4	0.12	0.16	0.15	0.24	0.11	0.17	0.12	0.29	0.11	0.16	0.15	0.21	0.13	0.17	0.13	0.19	0.22	0.15	0.72	0.12	0.86	1.14	0.90
O4'	0.12	0.14	0.24	0.27	0.11	0.14	0.12	0.24	0.13	0.12	0.10	0.22	0.14	0.15	0.11	0.23	0.25	0.15	0.66	0.20	0.77	1.03	0.80
O5'	0.24	0.23	0.30	0.31	0.23	0.22	0.26	0.27	0.27	0.26	0.24	0.26	0.23	0.28	0.24	0.28	0.27	0.25	0.67	0.31	0.79	1.05	0.81
OP1	0.30	0.27	0.27	0.27	0.29	0.31	0.32	0.35	0.32	0.34	0.28	0.29	0.28	0.35	0.31	0.32	0.31	0.37	0.72	0.36	0.86	1.05	0.86
OP2	0.33	0.31	0.35	0.37	0.33	0.33	0.36	0.40	0.36	0.38	0.32	0.32	0.31	0.40	0.34	0.31	0.27	0.35	0.80	0.40	0.92	1.22	0.96
P	0.24	0.23	0.26	0.27	0.23	0.22	0.26	0.29	0.26	0.27	0.23	0.26	0.23	0.29	0.24	0.26	0.23	0.28	0.72	0.30	0.85	1.11	0.87

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.13	0.01	0.20	0.02	0.22	0.21	0.18
C2	0.04	0.00	0.19	0.20	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.20	0.07	0.45	0.02	0.46	0.63	0.49
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.08	0.10	0.08	0.16	0.23	0.19	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.09	0.31	0.27	0.26
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.15	0.01	0.18	0.03	0.20	0.16	0.20	0.21	0.17	0.18	0.11	0.02	0.01	0.01	0.35	0.21	0.39	0.21	0.29
C4	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.04	0.47	0.01	0.45	0.58	0.48
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.07	0.08	0.06	0.10	0.05	0.13	0.03	0.00	0.02	0.09	0.18	0.25	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.03	0.59	0.01	0.59	0.79	0.64
C5'	0.04	0.12	0.08	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.16	0.15	0.12	0.10	0.18	0.10	0.06	0.09	0.01	0.01	0.19	0.20	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.20	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.61	0.00	0.64	0.88	0.69
C8	0.01	0.02	0.08	0.16	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.13	0.05	0.57	0.02	0.54	0.65	0.59
N1	0.03	0.01	0.16	0.20	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.06	0.55	0.01	0.56	0.78	0.61
N2	0.04	0.01	0.23	0.21	0.01	0.08	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.25	0.09	0.41	0.03	0.43	0.58	0.44
N3	0.03	0.00	0.19	0.17	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.18	0.07	0.39	0.02	0.39	0.51	0.40
N7	0.01	0.01	0.06	0.18	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.14	0.03	0.65	0.02	0.66	0.85	0.72
N9	0.00	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.42	0.01	0.38	0.46	0.41
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.08	0.13	0.11	0.06	0.11	0.14	0.12	0.18	0.13	0.15	0.08	0.00	0.05	0.09	0.12	0.13	0.17	0.29	0.14
O3'	0.13	0.20	0.02	0.01	0.11	0.03	0.12	0.09	0.15	0.13	0.17	0.25	0.18	0.14	0.07	0.05	0.00	0.10	0.31	0.16	0.43	0.27	0.29
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.09	0.07	0.03	0.01	0.09	0.10	0.00	0.10	0.04	0.17	0.22	0.10
O5'	0.20	0.45	0.28	0.35	0.47	0.02	0.59	0.01	0.61	0.57	0.55	0.41	0.39	0.65	0.42	0.12	0.31	0.10	0.00	0.67	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.21	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.16	0.04	0.67	0.00	0.73	1.00	0.79
OP1	0.22	0.46	0.31	0.39	0.45	0.18	0.59	0.20	0.64	0.54	0.56	0.43	0.39	0.66	0.38	0.17	0.43	0.17	0.01	0.73	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.63	0.27	0.21	0.58	0.25	0.79	0.35	0.88	0.65	0.78	0.58	0.51	0.85	0.46	0.29	0.27	0.22	0.02	1.00	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.49	0.26	0.29	0.48	0.06	0.64	0.02	0.69	0.59	0.61	0.44	0.40	0.72	0.41	0.14	0.29	0.10	0.01	0.79	0.01	0.01	0.00