Doublet Group distance statistics: 55521

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 17, 24, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.037 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.023, 0.061, 0.099, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.061 std_dev=0.038
C4	B	0, 0.197, 0.292, 0.387, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.292 std_dev=0.095
C6	B	0, 0.217, 0.324, 0.431, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.324 std_dev=0.107
N1	B	0, 0.194, 0.312, 0.429, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.312 std_dev=0.118
C5	B	0, 0.227, 0.364, 0.500, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.364 std_dev=0.136
N9	B	0, 0.246, 0.385, 0.524, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.385 std_dev=0.139
N3	B	0, 0.233, 0.383, 0.533, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.383 std_dev=0.150
O4'	A	0, -0.006, 0.156, 0.318, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.156 std_dev=0.162
C1'	B	0, 0.256, 0.427, 0.598, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.427 std_dev=0.171
O6	B	0, 0.268, 0.441, 0.614, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.441 std_dev=0.173
C2'	A	0, -0.006, 0.186, 0.379, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.186 std_dev=0.192
C2	B	0, 0.227, 0.420, 0.613, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.420 std_dev=0.193
O4'	B	0, 0.289, 0.509, 0.728, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.509 std_dev=0.220
C2'	B	0, 0.368, 0.594, 0.821, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.594 std_dev=0.227
C8	B	0, 0.308, 0.560, 0.811, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.560 std_dev=0.252
C4'	A	0, 0.055, 0.310, 0.564, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.310 std_dev=0.255
C3'	A	0, 0.056, 0.331, 0.606, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.331 std_dev=0.275
N7	B	0, 0.299, 0.575, 0.851, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.575 std_dev=0.276
O2'	B	0, 0.424, 0.718, 1.012, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.718 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.362, 0.674, 0.987, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.674 std_dev=0.313
C3'	B	0, 0.414, 0.727, 1.041, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.727 std_dev=0.314
O2'	A	0, -0.046, 0.271, 0.589, 2.169 max_d=2.169 avg_d=0.271 std_dev=0.318
C5'	A	0, 0.134, 0.489, 0.844, 2.362 max_d=2.362 avg_d=0.489 std_dev=0.355
N2	B	0, 0.281, 0.646, 1.011, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.646 std_dev=0.365
O3'	A	0, 0.111, 0.524, 0.938, 2.635 max_d=2.635 avg_d=0.524 std_dev=0.413
C5'	B	0, 0.430, 0.849, 1.268, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.849 std_dev=0.419
O5'	B	0, 0.440, 0.862, 1.285, 2.367 max_d=2.367 avg_d=0.862 std_dev=0.423
O3'	B	0, 0.466, 0.889, 1.312, 2.087 max_d=2.087 avg_d=0.889 std_dev=0.423
P	A	0, 0.209, 0.720, 1.232, 2.829 max_d=2.829 avg_d=0.720 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.041, 0.564, 1.086, 2.410 max_d=2.410 avg_d=0.564 std_dev=0.523
OP1	A	0, 0.305, 0.843, 1.381, 3.114 max_d=3.114 avg_d=0.843 std_dev=0.538
OP2	A	0, 0.261, 0.804, 1.347, 2.926 max_d=2.926 avg_d=0.804 std_dev=0.543
P	B	0, 0.489, 1.122, 1.755, 3.332 max_d=3.332 avg_d=1.122 std_dev=0.633
OP2	B	0, 0.521, 1.226, 1.930, 3.831 max_d=3.831 avg_d=1.226 std_dev=0.704
OP1	B	0, 0.444, 1.411, 2.377, 4.185 max_d=4.185 avg_d=1.411 std_dev=0.967

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.02	0.00	0.11	0.12	0.30	0.13
C2	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.05	0.27	0.22	0.31	0.23
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.02	0.09	0.07	0.10	0.03	0.07	0.15	0.00	0.02	0.07	0.01	0.19	0.27	0.42	0.27
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.15	0.00	0.14	0.02	0.12	0.09	0.14	0.13	0.02	0.01	0.16	0.01	0.21	0.22	0.22	0.18
C4	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.14	0.01	0.02	0.41	0.35	0.39	0.37
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.04	0.05	0.11	0.02	0.07	0.00	0.02	0.10	0.23	0.04
C5	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.14	0.01	0.05	0.43	0.36	0.38	0.37
C5'	0.03	0.06	0.07	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.11	0.01	0.01	0.16	0.23	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.12	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.11	0.01	0.06	0.38	0.29	0.31	0.29
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.01	0.26	0.21	0.29	0.21
N3	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.01	0.03	0.34	0.29	0.34	0.30
O2	0.02	0.01	0.15	0.13	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.16	0.02	0.08	0.20	0.17	0.29	0.18
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.14	0.11	0.18	0.06	0.16	0.07	0.09	0.10	0.00	0.04	0.15	0.08	0.11	0.24	0.45	0.24
O3'	0.10	0.11	0.02	0.01	0.14	0.02	0.14	0.07	0.11	0.06	0.12	0.16	0.04	0.00	0.16	0.07	0.17	0.26	0.19	0.17
O4	0.02	0.02	0.07	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.16	0.00	0.03	0.44	0.39	0.43	0.41
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.08	0.08	0.07	0.03	0.00	0.10	0.11	0.27	0.10
O5'	0.11	0.27	0.19	0.21	0.41	0.02	0.43	0.01	0.38	0.26	0.34	0.20	0.11	0.17	0.44	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.22	0.27	0.22	0.35	0.10	0.36	0.16	0.29	0.21	0.29	0.17	0.24	0.26	0.39	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.31	0.42	0.22	0.39	0.23	0.38	0.23	0.31	0.29	0.34	0.29	0.45	0.19	0.43	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.23	0.27	0.18	0.37	0.04	0.37	0.02	0.29	0.21	0.30	0.18	0.24	0.17	0.41	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.15	0.16	0.11	0.11	0.11	0.16	0.12	0.11	0.11	0.19	0.13	0.13	0.11	0.20	0.21	0.12	0.29	0.17	0.60	0.54	0.40
C2	0.13	0.16	0.14	0.14	0.12	0.11	0.12	0.18	0.12	0.12	0.13	0.21	0.15	0.13	0.12	0.18	0.18	0.12	0.31	0.16	0.64	0.56	0.43
C2'	0.28	0.29	0.30	0.28	0.24	0.26	0.20	0.24	0.19	0.21	0.23	0.35	0.29	0.19	0.24	0.35	0.33	0.27	0.32	0.18	0.55	0.54	0.40
C3'	0.25	0.25	0.27	0.25	0.22	0.23	0.19	0.23	0.18	0.20	0.21	0.29	0.25	0.19	0.23	0.31	0.29	0.25	0.33	0.18	0.59	0.55	0.43
C4	0.14	0.18	0.14	0.16	0.14	0.13	0.13	0.22	0.13	0.14	0.17	0.22	0.16	0.14	0.13	0.17	0.19	0.13	0.35	0.13	0.74	0.62	0.49
C4'	0.14	0.15	0.17	0.18	0.12	0.13	0.11	0.17	0.12	0.11	0.12	0.19	0.15	0.12	0.12	0.22	0.24	0.14	0.30	0.15	0.63	0.55	0.42
C5	0.13	0.17	0.14	0.15	0.13	0.12	0.13	0.21	0.13	0.13	0.16	0.22	0.16	0.14	0.13	0.17	0.19	0.13	0.34	0.14	0.74	0.62	0.49
C5'	0.14	0.15	0.16	0.17	0.12	0.13	0.12	0.19	0.12	0.12	0.12	0.19	0.15	0.13	0.12	0.20	0.23	0.14	0.33	0.15	0.68	0.59	0.46
C6	0.13	0.16	0.14	0.14	0.12	0.11	0.12	0.19	0.12	0.12	0.14	0.21	0.15	0.13	0.12	0.18	0.18	0.12	0.33	0.14	0.70	0.60	0.46
N1	0.12	0.15	0.14	0.14	0.12	0.11	0.11	0.17	0.12	0.12	0.12	0.21	0.14	0.13	0.11	0.18	0.19	0.12	0.31	0.15	0.65	0.57	0.44
N3	0.13	0.18	0.14	0.15	0.13	0.12	0.13	0.20	0.13	0.13	0.16	0.21	0.16	0.14	0.13	0.17	0.18	0.13	0.33	0.14	0.70	0.59	0.46
O2	0.13	0.15	0.14	0.14	0.12	0.10	0.12	0.16	0.13	0.12	0.12	0.20	0.14	0.13	0.11	0.19	0.18	0.12	0.29	0.18	0.59	0.52	0.39
O2'	0.24	0.25	0.29	0.27	0.20	0.23	0.17	0.21	0.17	0.17	0.19	0.33	0.25	0.16	0.20	0.35	0.34	0.23	0.29	0.19	0.52	0.51	0.38
O3'	0.30	0.28	0.33	0.32	0.25	0.29	0.21	0.28	0.20	0.23	0.22	0.33	0.29	0.21	0.26	0.37	0.37	0.29	0.36	0.18	0.65	0.55	0.46
O4	0.15	0.19	0.15	0.17	0.15	0.14	0.14	0.24	0.15	0.15	0.18	0.22	0.17	0.15	0.14	0.17	0.21	0.14	0.36	0.14	0.78	0.64	0.51
O4'	0.11	0.13	0.14	0.17	0.11	0.12	0.13	0.19	0.14	0.13	0.12	0.16	0.12	0.15	0.11	0.18	0.22	0.11	0.32	0.18	0.67	0.57	0.44
O5'	0.25	0.24	0.21	0.20	0.26	0.23	0.30	0.28	0.31	0.31	0.26	0.24	0.24	0.33	0.27	0.25	0.21	0.27	0.39	0.36	0.68	0.63	0.48
OP1	0.21	0.21	0.19	0.18	0.23	0.20	0.26	0.27	0.27	0.27	0.22	0.23	0.21	0.30	0.23	0.23	0.19	0.23	0.40	0.32	0.76	0.66	0.53
OP2	0.31	0.30	0.28	0.28	0.32	0.31	0.35	0.39	0.34	0.36	0.31	0.30	0.30	0.38	0.33	0.29	0.27	0.34	0.51	0.38	0.89	0.74	0.64
P	0.23	0.21	0.18	0.18	0.24	0.21	0.28	0.29	0.28	0.29	0.23	0.22	0.21	0.32	0.25	0.21	0.17	0.25	0.43	0.33	0.78	0.67	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.02	0.17	0.18	0.13
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02	0.22	0.01	0.44	0.37	0.28
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.12	0.06	0.19	0.14	0.10
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.10	0.08	0.11	0.14	0.11	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.26	0.13	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.22	0.01	0.42	0.34	0.28
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.27	0.01	0.54	0.43	0.35
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.17	0.16	0.14	0.10	0.09	0.19	0.10	0.06	0.04	0.01	0.01	0.20	0.19	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.28	0.00	0.59	0.47	0.38
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.26	0.02	0.47	0.34	0.32
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.25	0.01	0.53	0.44	0.34
N2	0.04	0.01	0.12	0.14	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.19	0.03	0.20	0.01	0.41	0.36	0.26
N3	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.02	0.19	0.01	0.37	0.32	0.24
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.29	0.02	0.59	0.45	0.39
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.19	0.01	0.34	0.27	0.23
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.03	0.10	0.14	0.10	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.08	0.07	0.17	0.12	0.08
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.11	0.09	0.14	0.19	0.13	0.09	0.05	0.06	0.00	0.02	0.15	0.12	0.40	0.19	0.19
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.03	0.12	0.20	0.13
O5'	0.10	0.22	0.12	0.15	0.22	0.02	0.27	0.01	0.28	0.26	0.25	0.20	0.19	0.29	0.19	0.08	0.15	0.07	0.00	0.30	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.30	0.00	0.66	0.52	0.42
OP1	0.17	0.44	0.19	0.26	0.42	0.13	0.54	0.19	0.59	0.47	0.53	0.41	0.37	0.59	0.34	0.17	0.40	0.12	0.02	0.66	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.37	0.14	0.13	0.34	0.14	0.43	0.20	0.47	0.34	0.44	0.36	0.32	0.45	0.27	0.12	0.19	0.20	0.02	0.52	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.28	0.10	0.13	0.28	0.03	0.35	0.01	0.38	0.32	0.34	0.26	0.24	0.39	0.23	0.08	0.19	0.13	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00