Doublet Group distance statistics: 55522

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 10, 10, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.014, 0.020, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.020, 0.026, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.013, 0.022, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.019, 0.028, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.016, 0.027, 0.039, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.028, 0.055, 0.082, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.055 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.017, 0.069, 0.120, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.069 std_dev=0.051
C5	B	0, 0.163, 0.277, 0.390, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.277 std_dev=0.114
C4	B	0, 0.179, 0.295, 0.411, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.295 std_dev=0.116
C6	B	0, 0.120, 0.237, 0.353, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.237 std_dev=0.117
O2'	A	0, 0.104, 0.234, 0.365, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.234 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.131, 0.262, 0.393, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.262 std_dev=0.131
O4'	A	0, 0.095, 0.229, 0.362, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.229 std_dev=0.133
N9	B	0, 0.214, 0.376, 0.539, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.376 std_dev=0.163
N1	B	0, 0.156, 0.324, 0.491, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.324 std_dev=0.168
O6	B	0, 0.135, 0.315, 0.496, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.315 std_dev=0.180
N3	B	0, 0.248, 0.432, 0.617, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.432 std_dev=0.185
C8	B	0, 0.304, 0.507, 0.709, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.507 std_dev=0.202
N7	B	0, 0.259, 0.467, 0.674, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.467 std_dev=0.208
C4'	A	0, 0.190, 0.398, 0.607, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.398 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.211, 0.427, 0.644, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.427 std_dev=0.216
C2	B	0, 0.257, 0.476, 0.695, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.476 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.239, 0.469, 0.699, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.469 std_dev=0.230
O4'	B	0, 0.387, 0.667, 0.948, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.667 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.170, 0.455, 0.739, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.455 std_dev=0.285
O3'	A	0, 0.334, 0.641, 0.947, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.641 std_dev=0.306
N2	B	0, 0.435, 0.765, 1.095, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.765 std_dev=0.330
C5'	A	0, 0.297, 0.636, 0.974, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.636 std_dev=0.338
C3'	B	0, 0.202, 0.553, 0.905, 2.259 max_d=2.259 avg_d=0.553 std_dev=0.351
C4'	B	0, 0.316, 0.673, 1.030, 2.065 max_d=2.065 avg_d=0.673 std_dev=0.357
O2'	B	0, 0.224, 0.584, 0.944, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.584 std_dev=0.360
O5'	A	0, 0.142, 0.534, 0.926, 2.169 max_d=2.169 avg_d=0.534 std_dev=0.392
C5'	B	0, 0.580, 0.998, 1.416, 2.371 max_d=2.371 avg_d=0.998 std_dev=0.418
P	A	0, 0.114, 0.605, 1.096, 2.485 max_d=2.485 avg_d=0.605 std_dev=0.491
O3'	B	0, 0.157, 0.695, 1.232, 3.350 max_d=3.350 avg_d=0.695 std_dev=0.538
OP2	A	0, 0.021, 0.652, 1.282, 3.090 max_d=3.090 avg_d=0.652 std_dev=0.631
OP1	A	0, 0.119, 0.778, 1.438, 2.740 max_d=2.740 avg_d=0.778 std_dev=0.659
O5'	B	0, 1.311, 2.192, 3.073, 4.505 max_d=4.505 avg_d=2.192 std_dev=0.881
P	B	0, 2.856, 4.138, 5.420, 5.435 max_d=5.435 avg_d=4.138 std_dev=1.282
OP2	B	0, 4.850, 6.382, 7.914, 7.765 max_d=7.765 avg_d=6.382 std_dev=1.532
OP1	B	0, 2.598, 4.175, 5.751, 6.713 max_d=6.713 avg_d=4.175 std_dev=1.576

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.19	0.16	0.15
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.26	0.33	0.34	0.26
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.10	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.14	0.12	0.09
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.09	0.04	0.08	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.08	0.15	0.13	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.35	0.50	0.53	0.38
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.13	0.10	0.02
C5	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.04	0.37	0.50	0.52	0.39
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.05	0.04	0.03	0.11	0.02	0.01	0.20	0.18	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.04	0.33	0.41	0.40	0.33
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.26	0.31	0.30	0.25
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.31	0.42	0.44	0.32
O2	0.04	0.01	0.10	0.09	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.11	0.02	0.05	0.21	0.28	0.29	0.22
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.06	0.10	0.00	0.05	0.05	0.03	0.05	0.11	0.10	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.09	0.05	0.09	0.11	0.05	0.00	0.12	0.02	0.13	0.19	0.25	0.15
O4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.00	0.03	0.36	0.54	0.58	0.41
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.00	0.15	0.18	0.12	0.15
O5'	0.16	0.26	0.10	0.08	0.35	0.02	0.37	0.01	0.33	0.26	0.31	0.21	0.05	0.13	0.36	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.19	0.33	0.14	0.15	0.50	0.13	0.50	0.20	0.41	0.31	0.42	0.28	0.11	0.19	0.54	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.34	0.12	0.13	0.53	0.10	0.52	0.18	0.40	0.30	0.44	0.29	0.10	0.25	0.58	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.26	0.09	0.09	0.38	0.02	0.39	0.01	0.33	0.25	0.32	0.22	0.05	0.15	0.41	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.23	0.24	0.13	0.14	0.11	0.20	0.11	0.11	0.12	0.22	0.16	0.12	0.12	0.21	0.23	0.16	0.65	0.15	0.86	1.11	0.76
C2	0.12	0.16	0.19	0.22	0.12	0.12	0.11	0.22	0.11	0.11	0.13	0.21	0.14	0.12	0.11	0.17	0.18	0.13	0.69	0.15	0.92	1.18	0.82
C2'	0.22	0.21	0.28	0.25	0.19	0.22	0.16	0.22	0.15	0.17	0.17	0.26	0.22	0.16	0.19	0.28	0.31	0.25	0.57	0.17	0.78	0.96	0.64
C3'	0.24	0.23	0.28	0.25	0.20	0.24	0.18	0.24	0.17	0.19	0.19	0.27	0.23	0.18	0.21	0.29	0.32	0.27	0.57	0.18	0.82	0.98	0.66
C4	0.10	0.15	0.14	0.22	0.10	0.13	0.10	0.26	0.10	0.11	0.14	0.19	0.12	0.12	0.10	0.16	0.18	0.12	0.77	0.10	1.07	1.35	0.95
C4'	0.17	0.18	0.25	0.23	0.14	0.16	0.12	0.19	0.12	0.12	0.13	0.23	0.18	0.12	0.14	0.24	0.26	0.19	0.62	0.15	0.85	1.08	0.73
C5	0.11	0.15	0.16	0.22	0.11	0.13	0.10	0.25	0.10	0.11	0.13	0.20	0.13	0.12	0.10	0.16	0.18	0.13	0.75	0.11	1.06	1.34	0.94
C5'	0.16	0.18	0.24	0.23	0.14	0.15	0.13	0.20	0.13	0.13	0.14	0.23	0.17	0.14	0.14	0.23	0.24	0.19	0.64	0.16	0.90	1.14	0.77
C6	0.12	0.16	0.18	0.22	0.11	0.12	0.10	0.23	0.10	0.11	0.13	0.21	0.14	0.11	0.11	0.17	0.19	0.13	0.72	0.12	0.99	1.27	0.88
N1	0.13	0.16	0.20	0.23	0.12	0.13	0.11	0.21	0.11	0.11	0.13	0.21	0.15	0.12	0.11	0.18	0.20	0.14	0.69	0.14	0.92	1.19	0.82
N3	0.11	0.15	0.15	0.22	0.11	0.12	0.10	0.24	0.10	0.11	0.14	0.19	0.13	0.12	0.10	0.16	0.17	0.12	0.74	0.12	1.00	1.27	0.89
O2	0.14	0.17	0.21	0.23	0.12	0.14	0.11	0.21	0.12	0.11	0.13	0.22	0.15	0.12	0.12	0.18	0.20	0.14	0.65	0.16	0.84	1.08	0.75
O2'	0.23	0.21	0.31	0.28	0.19	0.24	0.16	0.23	0.15	0.18	0.16	0.25	0.22	0.16	0.20	0.31	0.36	0.26	0.54	0.17	0.73	0.88	0.59
O3'	0.30	0.27	0.33	0.30	0.25	0.31	0.22	0.30	0.20	0.24	0.22	0.31	0.28	0.22	0.26	0.36	0.40	0.35	0.55	0.20	0.80	0.88	0.62
O4	0.11	0.14	0.13	0.23	0.10	0.15	0.10	0.29	0.11	0.12	0.14	0.18	0.12	0.12	0.11	0.17	0.20	0.13	0.80	0.10	1.14	1.42	1.01
O4'	0.15	0.16	0.24	0.25	0.13	0.14	0.11	0.21	0.12	0.12	0.12	0.22	0.16	0.12	0.12	0.21	0.23	0.15	0.68	0.15	0.91	1.17	0.81
O5'	0.26	0.25	0.29	0.31	0.26	0.26	0.28	0.33	0.28	0.28	0.26	0.27	0.25	0.30	0.26	0.27	0.31	0.29	0.67	0.32	0.95	1.18	0.81
OP1	0.37	0.33	0.30	0.31	0.36	0.39	0.40	0.43	0.39	0.41	0.35	0.33	0.34	0.43	0.38	0.36	0.39	0.45	0.71	0.43	1.00	1.15	0.84
OP2	0.36	0.32	0.43	0.47	0.37	0.38	0.42	0.49	0.42	0.44	0.36	0.30	0.33	0.47	0.39	0.32	0.36	0.34	0.75	0.48	1.06	1.39	0.94
P	0.27	0.26	0.28	0.31	0.27	0.29	0.30	0.37	0.30	0.31	0.27	0.27	0.26	0.33	0.28	0.27	0.31	0.31	0.68	0.34	1.00	1.22	0.84

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.23	0.01	0.35	0.31	0.22
C2	0.03	0.00	0.17	0.15	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.17	0.06	0.48	0.01	0.60	0.78	0.52
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.07	0.07	0.10	0.06	0.14	0.19	0.16	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.28	0.09	0.40	0.25	0.24
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.13	0.00	0.17	0.02	0.19	0.17	0.17	0.15	0.12	0.19	0.11	0.02	0.01	0.02	0.38	0.20	0.45	0.25	0.30
C4	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.50	0.01	0.59	0.75	0.53
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.13	0.06	0.07	0.05	0.12	0.06	0.13	0.02	0.00	0.02	0.10	0.31	0.26	0.11
C5	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.02	0.63	0.01	0.76	1.00	0.71
C5'	0.05	0.12	0.07	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.19	0.22	0.16	0.11	0.10	0.24	0.13	0.07	0.09	0.02	0.01	0.22	0.25	0.39	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.19	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.65	0.00	0.82	1.09	0.76
C8	0.01	0.02	0.06	0.17	0.01	0.13	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.14	0.12	0.05	0.62	0.02	0.71	0.87	0.68
N1	0.02	0.00	0.14	0.17	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.05	0.58	0.01	0.72	0.96	0.65
N2	0.05	0.00	0.19	0.15	0.02	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.22	0.08	0.43	0.02	0.57	0.71	0.46
N3	0.03	0.01	0.16	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.17	0.06	0.42	0.01	0.53	0.65	0.44
N7	0.01	0.02	0.05	0.19	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.13	0.04	0.69	0.02	0.86	1.09	0.81
N9	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.46	0.01	0.52	0.63	0.46
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.08	0.13	0.11	0.07	0.11	0.14	0.09	0.12	0.08	0.14	0.08	0.00	0.05	0.09	0.14	0.13	0.38	0.19	0.16
O3'	0.13	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.09	0.12	0.12	0.14	0.22	0.17	0.13	0.06	0.05	0.00	0.09	0.32	0.14	0.52	0.29	0.27
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.01	0.09	0.09	0.00	0.14	0.03	0.31	0.27	0.17
O5'	0.23	0.48	0.28	0.38	0.50	0.02	0.63	0.01	0.65	0.62	0.58	0.43	0.42	0.69	0.46	0.14	0.32	0.14	0.00	0.70	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.09	0.20	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.14	0.03	0.70	0.00	0.93	1.23	0.86
OP1	0.35	0.60	0.40	0.45	0.59	0.31	0.76	0.25	0.82	0.71	0.72	0.57	0.53	0.86	0.52	0.38	0.52	0.31	0.02	0.93	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.78	0.25	0.25	0.75	0.26	1.00	0.39	1.09	0.87	0.96	0.71	0.65	1.09	0.63	0.19	0.29	0.27	0.01	1.23	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.52	0.24	0.30	0.53	0.11	0.71	0.02	0.76	0.68	0.65	0.46	0.44	0.81	0.46	0.16	0.27	0.17	0.01	0.86	0.01	0.01	0.00