Doublet Group distance statistics: 55526

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 4, 9, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.016, 0.044, 0.071, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.044 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.009, 0.070, 0.132, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.070 std_dev=0.061
C2'	A	0, 0.077, 0.170, 0.263, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.170 std_dev=0.093
O4'	A	0, 0.080, 0.178, 0.277, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.178 std_dev=0.098
C4	B	0, 0.210, 0.317, 0.424, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.317 std_dev=0.107
C5	B	0, 0.181, 0.295, 0.409, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.295 std_dev=0.114
N9	B	0, 0.217, 0.338, 0.459, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.338 std_dev=0.121
N7	B	0, 0.195, 0.349, 0.503, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.349 std_dev=0.154
C6	B	0, 0.239, 0.394, 0.548, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.394 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.139, 0.295, 0.450, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.295 std_dev=0.155
C1'	B	0, 0.307, 0.466, 0.626, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.466 std_dev=0.159
N3	B	0, 0.286, 0.450, 0.613, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.450 std_dev=0.163
C8	B	0, 0.193, 0.362, 0.530, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.362 std_dev=0.169
O6	B	0, 0.304, 0.491, 0.679, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.491 std_dev=0.188
N1	B	0, 0.299, 0.493, 0.687, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.493 std_dev=0.194
C2'	B	0, 0.276, 0.473, 0.669, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.473 std_dev=0.196
C2	B	0, 0.329, 0.527, 0.725, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.527 std_dev=0.198
C3'	B	0, 0.360, 0.601, 0.841, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.601 std_dev=0.240
C5'	A	0, 0.224, 0.465, 0.705, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.465 std_dev=0.241
O4'	B	0, 0.388, 0.630, 0.871, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.630 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.103, 0.352, 0.601, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.352 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.443, 0.700, 0.956, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.700 std_dev=0.256
O2'	B	0, 0.307, 0.573, 0.839, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.573 std_dev=0.266
O2'	A	0, -0.048, 0.220, 0.487, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.220 std_dev=0.268
N2	B	0, 0.451, 0.719, 0.987, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.719 std_dev=0.268
O5'	A	0, 0.276, 0.547, 0.819, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.547 std_dev=0.272
OP2	A	0, 0.438, 0.745, 1.051, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.745 std_dev=0.307
P	A	0, 0.363, 0.684, 1.005, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.684 std_dev=0.321
O3'	B	0, 0.377, 0.733, 1.089, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.733 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.410, 0.808, 1.206, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.808 std_dev=0.398
C5'	B	0, 0.479, 0.947, 1.415, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.947 std_dev=0.468
O3'	A	0, 0.121, 0.617, 1.113, 2.691 max_d=2.691 avg_d=0.617 std_dev=0.496
O5'	B	0, 0.359, 0.919, 1.479, 2.895 max_d=2.895 avg_d=0.919 std_dev=0.560
P	B	0, 0.383, 1.362, 2.340, 5.275 max_d=5.275 avg_d=1.362 std_dev=0.979
OP1	B	0, 0.702, 1.836, 2.971, 5.351 max_d=5.351 avg_d=1.836 std_dev=1.134
OP2	B	0, 0.260, 1.667, 3.074, 7.607 max_d=7.607 avg_d=1.667 std_dev=1.407

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.02	0.00	0.07	0.06	0.21	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.11	0.01	0.03	0.14	0.12	0.25	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.09	0.05	0.02	0.05	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.08	0.22	0.08
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.17	0.00	0.19	0.02	0.17	0.11	0.14	0.09	0.02	0.01	0.19	0.01	0.18	0.15	0.10	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.17	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.00	0.03	0.19	0.21	0.30	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.04	0.03	0.15	0.02	0.06	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.19	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.01	0.04	0.20	0.21	0.29	0.21
C5'	0.04	0.06	0.09	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.06	0.08	0.06	0.07	0.10	0.10	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.04	0.17	0.16	0.25	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.01	0.13	0.11	0.23	0.13
N3	0.02	0.00	0.05	0.14	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.11	0.01	0.03	0.17	0.17	0.28	0.18
O2	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.21	0.02	0.04	0.11	0.10	0.25	0.13
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.16	0.15	0.12	0.07	0.08	0.09	0.18	0.19	0.00	0.05	0.18	0.11	0.12	0.10	0.19	0.05
O3'	0.14	0.11	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.10	0.11	0.05	0.11	0.21	0.05	0.00	0.16	0.11	0.23	0.31	0.19	0.23
O4	0.02	0.01	0.05	0.19	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.00	0.04	0.20	0.23	0.31	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.11	0.11	0.04	0.00	0.08	0.06	0.20	0.09
O5'	0.07	0.14	0.06	0.18	0.19	0.01	0.20	0.01	0.17	0.13	0.17	0.11	0.12	0.23	0.20	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.12	0.08	0.15	0.21	0.06	0.21	0.07	0.16	0.11	0.17	0.10	0.10	0.31	0.23	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.25	0.22	0.10	0.30	0.11	0.29	0.12	0.25	0.23	0.28	0.25	0.19	0.19	0.31	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.08	0.13	0.21	0.02	0.21	0.01	0.16	0.13	0.18	0.13	0.05	0.23	0.22	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.13	0.20	0.21	0.12	0.15	0.15	0.27	0.16	0.15	0.12	0.18	0.13	0.17	0.12	0.28	0.28	0.12	0.47	0.22	0.53	0.78	0.51
C2	0.13	0.15	0.18	0.19	0.14	0.16	0.16	0.32	0.16	0.17	0.13	0.20	0.14	0.19	0.14	0.24	0.23	0.14	0.51	0.22	0.58	0.88	0.59
C2'	0.17	0.19	0.28	0.26	0.15	0.18	0.15	0.24	0.16	0.15	0.16	0.26	0.19	0.16	0.15	0.37	0.35	0.15	0.42	0.21	0.42	0.72	0.42
C3'	0.18	0.21	0.28	0.26	0.17	0.18	0.16	0.25	0.17	0.16	0.17	0.28	0.20	0.18	0.16	0.38	0.34	0.16	0.44	0.21	0.43	0.76	0.45
C4	0.16	0.17	0.17	0.21	0.15	0.22	0.18	0.41	0.16	0.21	0.16	0.21	0.15	0.23	0.17	0.20	0.22	0.18	0.58	0.19	0.72	1.11	0.76
C4'	0.13	0.14	0.22	0.22	0.12	0.15	0.15	0.26	0.16	0.14	0.12	0.19	0.14	0.17	0.12	0.31	0.30	0.12	0.45	0.22	0.51	0.77	0.50
C5	0.15	0.16	0.17	0.20	0.15	0.20	0.17	0.39	0.16	0.20	0.15	0.21	0.15	0.22	0.16	0.22	0.22	0.17	0.57	0.20	0.71	1.07	0.73
C5'	0.12	0.14	0.19	0.19	0.13	0.14	0.16	0.28	0.17	0.16	0.13	0.19	0.14	0.19	0.13	0.28	0.26	0.12	0.49	0.23	0.57	0.85	0.56
C6	0.14	0.15	0.18	0.19	0.14	0.17	0.16	0.35	0.16	0.18	0.13	0.20	0.14	0.20	0.15	0.24	0.23	0.15	0.53	0.21	0.64	0.98	0.66
N1	0.13	0.15	0.19	0.19	0.13	0.16	0.16	0.31	0.16	0.17	0.13	0.20	0.14	0.19	0.14	0.25	0.24	0.13	0.50	0.22	0.58	0.88	0.59
N3	0.15	0.16	0.17	0.20	0.15	0.20	0.17	0.37	0.16	0.19	0.15	0.21	0.15	0.21	0.16	0.21	0.22	0.16	0.55	0.21	0.65	1.01	0.68
O2	0.13	0.15	0.19	0.20	0.13	0.15	0.15	0.28	0.16	0.15	0.12	0.20	0.14	0.16	0.13	0.25	0.25	0.12	0.47	0.21	0.51	0.78	0.52
O2'	0.23	0.24	0.33	0.32	0.24	0.25	0.27	0.28	0.28	0.26	0.26	0.25	0.24	0.28	0.24	0.41	0.41	0.22	0.48	0.32	0.52	0.70	0.46
O3'	0.31	0.35	0.44	0.42	0.30	0.32	0.27	0.34	0.27	0.27	0.30	0.41	0.34	0.26	0.29	0.52	0.51	0.27	0.51	0.27	0.55	0.76	0.48
O4	0.17	0.17	0.18	0.24	0.16	0.26	0.18	0.46	0.16	0.23	0.17	0.20	0.15	0.24	0.18	0.19	0.25	0.20	0.61	0.18	0.79	1.21	0.83
O4'	0.13	0.14	0.19	0.20	0.13	0.16	0.16	0.29	0.18	0.17	0.13	0.18	0.14	0.19	0.14	0.27	0.27	0.13	0.49	0.23	0.58	0.81	0.56
O5'	0.16	0.16	0.18	0.18	0.15	0.16	0.18	0.32	0.18	0.19	0.15	0.22	0.16	0.22	0.16	0.27	0.23	0.16	0.51	0.24	0.58	0.94	0.62
OP1	0.14	0.16	0.17	0.17	0.15	0.15	0.19	0.32	0.19	0.20	0.15	0.20	0.15	0.23	0.16	0.26	0.21	0.16	0.53	0.24	0.61	1.00	0.65
OP2	0.28	0.28	0.27	0.24	0.28	0.27	0.30	0.41	0.29	0.32	0.28	0.32	0.28	0.33	0.29	0.34	0.24	0.30	0.60	0.32	0.70	1.12	0.74
P	0.16	0.17	0.17	0.16	0.16	0.17	0.19	0.34	0.19	0.21	0.16	0.22	0.17	0.24	0.17	0.26	0.18	0.18	0.54	0.24	0.64	1.02	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.28	0.02	0.18	0.33	0.20
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.15	0.04	0.37	0.01	0.31	0.53	0.33
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.06	0.19	0.26	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.15	0.10	0.14	0.11	0.15	0.08	0.02	0.01	0.02	0.11	0.11	0.22	0.26	0.12
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.02	0.40	0.01	0.31	0.57	0.37
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.16	0.07	0.06	0.04	0.16	0.08	0.06	0.02	0.00	0.01	0.13	0.15	0.29	0.10
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.11	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.02	0.47	0.01	0.43	0.79	0.52
C5'	0.07	0.19	0.03	0.02	0.22	0.01	0.30	0.00	0.30	0.34	0.25	0.15	0.16	0.36	0.21	0.06	0.06	0.02	0.01	0.34	0.17	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.11	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.48	0.00	0.47	0.83	0.54
C8	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.16	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.04	0.49	0.02	0.40	0.77	0.52
N1	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.03	0.43	0.01	0.40	0.69	0.44
N2	0.04	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.20	0.05	0.34	0.02	0.28	0.48	0.27
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.04	0.35	0.01	0.26	0.46	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.16	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.04	0.52	0.02	0.50	0.94	0.61
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.39	0.01	0.26	0.51	0.34
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.10	0.06	0.08	0.06	0.11	0.04	0.15	0.21	0.16	0.04	0.03	0.00	0.04	0.07	0.06	0.10	0.22	0.50	0.22
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.02	0.11	0.06	0.12	0.17	0.13	0.20	0.14	0.16	0.07	0.04	0.00	0.02	0.28	0.13	0.29	0.58	0.32
O4'	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.30	0.03	0.21	0.35	0.25
O5'	0.28	0.37	0.13	0.11	0.40	0.01	0.47	0.01	0.48	0.49	0.43	0.34	0.35	0.52	0.39	0.06	0.28	0.30	0.00	0.51	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.13	0.01	0.34	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.13	0.03	0.51	0.00	0.56	0.97	0.63
OP1	0.18	0.31	0.19	0.22	0.31	0.15	0.43	0.17	0.47	0.40	0.40	0.28	0.26	0.50	0.26	0.22	0.29	0.21	0.02	0.56	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.53	0.26	0.26	0.57	0.29	0.79	0.17	0.83	0.77	0.69	0.48	0.46	0.94	0.51	0.50	0.58	0.35	0.02	0.97	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.33	0.09	0.12	0.37	0.10	0.52	0.02	0.54	0.52	0.44	0.27	0.28	0.61	0.34	0.22	0.32	0.25	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00