Doublet Group distance statistics: 55527

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 6, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.013 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.021, 0.036, 0.052, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.008, 0.027, 0.045, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.026, 0.047, 0.069, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.047 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.036, 0.058, 0.080, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.058 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.065, 0.117, 0.169, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.117 std_dev=0.052
O4	A	0, 0.038, 0.110, 0.182, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.110 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.106, 0.228, 0.349, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.228 std_dev=0.122
C5	B	0, 0.193, 0.321, 0.449, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.321 std_dev=0.128
C4	B	0, 0.269, 0.401, 0.532, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.401 std_dev=0.131
C6	B	0, 0.189, 0.322, 0.455, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.322 std_dev=0.133
N9	B	0, 0.244, 0.383, 0.523, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.383 std_dev=0.139
N7	B	0, 0.227, 0.368, 0.510, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.368 std_dev=0.141
O6	B	0, 0.144, 0.292, 0.439, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.292 std_dev=0.148
C8	B	0, 0.225, 0.375, 0.524, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.375 std_dev=0.149
C4'	A	0, 0.252, 0.405, 0.557, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.405 std_dev=0.153
N1	B	0, 0.267, 0.437, 0.607, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.437 std_dev=0.170
C2'	A	0, 0.147, 0.334, 0.521, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.334 std_dev=0.187
C1'	B	0, 0.248, 0.454, 0.660, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.454 std_dev=0.206
N3	B	0, 0.319, 0.529, 0.739, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.529 std_dev=0.210
O4'	B	0, 0.227, 0.437, 0.647, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.437 std_dev=0.210
C3'	A	0, 0.345, 0.568, 0.792, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.568 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.315, 0.545, 0.775, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.545 std_dev=0.230
O2'	A	0, 0.290, 0.547, 0.804, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.547 std_dev=0.257
C5'	A	0, 0.460, 0.748, 1.036, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.748 std_dev=0.288
O5'	A	0, 0.619, 0.920, 1.222, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.920 std_dev=0.301
C4'	B	0, 0.267, 0.571, 0.875, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.571 std_dev=0.304
C2'	B	0, 0.415, 0.722, 1.029, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.722 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.506, 0.849, 1.192, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.849 std_dev=0.343
N2	B	0, 0.340, 0.693, 1.045, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.693 std_dev=0.352
P	A	0, 0.764, 1.122, 1.481, 1.496 max_d=1.496 avg_d=1.122 std_dev=0.359
C3'	B	0, 0.368, 0.731, 1.094, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.731 std_dev=0.363
O2'	B	0, 0.485, 0.868, 1.252, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.868 std_dev=0.383
C5'	B	0, 0.468, 0.927, 1.387, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.927 std_dev=0.459
O3'	B	0, 0.536, 1.031, 1.526, 1.710 max_d=1.710 avg_d=1.031 std_dev=0.495
OP1	A	0, 0.668, 1.427, 2.186, 3.213 max_d=3.213 avg_d=1.427 std_dev=0.759
OP2	A	0, 0.661, 1.422, 2.183, 3.267 max_d=3.267 avg_d=1.422 std_dev=0.761
O5'	B	0, 0.630, 1.413, 2.197, 3.092 max_d=3.092 avg_d=1.413 std_dev=0.783
P	B	0, 0.674, 1.882, 3.091, 5.352 max_d=5.352 avg_d=1.882 std_dev=1.208
OP1	B	0, 0.674, 2.099, 3.524, 5.230 max_d=5.230 avg_d=2.099 std_dev=1.425
OP2	B	0, 0.594, 2.453, 4.312, 7.744 max_d=7.744 avg_d=2.453 std_dev=1.859

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.39	0.23	0.13
C2	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.03	0.19	0.59	0.15	0.13
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.06	0.13	0.01	0.02	0.07	0.01	0.18	0.22	0.08	0.06
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.01	0.11	0.03	0.11	0.04	0.07	0.13	0.02	0.01	0.09	0.01	0.26	0.14	0.20	0.15
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.25	0.75	0.18	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.08	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.15	0.14	0.05
C5	0.03	0.02	0.08	0.11	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.02	0.06	0.25	0.74	0.17	0.14
C5'	0.02	0.09	0.02	0.03	0.12	0.01	0.13	0.00	0.10	0.07	0.11	0.10	0.04	0.05	0.14	0.01	0.01	0.10	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.12	0.02	0.05	0.22	0.64	0.15	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.17	0.55	0.16	0.13
N3	0.03	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.03	0.22	0.68	0.15	0.13
O2	0.07	0.01	0.13	0.13	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.15	0.02	0.07	0.18	0.53	0.16	0.13
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.08	0.13	0.00	0.04	0.07	0.03	0.08	0.17	0.13	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.14	0.05	0.12	0.05	0.08	0.15	0.04	0.00	0.12	0.02	0.24	0.21	0.29	0.22
O4	0.02	0.02	0.07	0.09	0.01	0.06	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.12	0.00	0.05	0.27	0.78	0.22	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.03	0.02	0.05	0.00	0.10	0.36	0.37	0.20
O5'	0.08	0.19	0.18	0.26	0.25	0.02	0.25	0.01	0.22	0.17	0.22	0.18	0.08	0.24	0.27	0.10	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.39	0.59	0.22	0.14	0.75	0.15	0.74	0.10	0.64	0.55	0.68	0.53	0.17	0.21	0.78	0.36	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.15	0.08	0.20	0.18	0.14	0.17	0.06	0.15	0.16	0.15	0.16	0.13	0.29	0.22	0.37	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.06	0.15	0.14	0.05	0.14	0.01	0.13	0.13	0.13	0.13	0.06	0.22	0.16	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.15	0.18	0.21	0.12	0.16	0.10	0.25	0.10	0.11	0.11	0.19	0.15	0.11	0.12	0.26	0.28	0.13	0.78	0.11	1.00	1.04	0.91
C2	0.11	0.13	0.15	0.17	0.09	0.12	0.08	0.24	0.08	0.09	0.10	0.17	0.12	0.09	0.09	0.22	0.23	0.09	0.79	0.11	1.04	1.10	0.95
C2'	0.23	0.23	0.25	0.26	0.20	0.23	0.16	0.29	0.15	0.17	0.18	0.27	0.23	0.16	0.20	0.31	0.31	0.22	0.65	0.13	0.94	0.97	0.80
C3'	0.24	0.25	0.26	0.26	0.21	0.23	0.17	0.30	0.15	0.18	0.19	0.29	0.25	0.16	0.21	0.32	0.30	0.24	0.67	0.13	0.97	1.02	0.84
C4	0.10	0.14	0.14	0.16	0.10	0.15	0.10	0.30	0.10	0.11	0.13	0.17	0.12	0.12	0.10	0.18	0.22	0.11	0.86	0.10	1.25	1.36	1.14
C4'	0.16	0.16	0.19	0.21	0.13	0.16	0.11	0.25	0.10	0.12	0.12	0.20	0.17	0.12	0.13	0.28	0.29	0.15	0.76	0.11	0.99	1.05	0.90
C5	0.10	0.14	0.14	0.17	0.10	0.14	0.09	0.29	0.09	0.10	0.12	0.17	0.12	0.11	0.09	0.20	0.23	0.10	0.87	0.10	1.24	1.34	1.14
C5'	0.16	0.16	0.18	0.20	0.14	0.15	0.13	0.25	0.13	0.13	0.13	0.20	0.16	0.14	0.14	0.27	0.28	0.15	0.79	0.15	1.03	1.14	0.96
C6	0.10	0.13	0.15	0.18	0.09	0.13	0.09	0.27	0.08	0.09	0.10	0.17	0.12	0.10	0.09	0.22	0.24	0.09	0.85	0.10	1.15	1.24	1.07
N1	0.11	0.13	0.16	0.18	0.10	0.13	0.08	0.25	0.08	0.09	0.10	0.17	0.12	0.10	0.09	0.23	0.25	0.10	0.80	0.10	1.06	1.13	0.98
N3	0.10	0.14	0.14	0.16	0.10	0.13	0.09	0.27	0.09	0.10	0.12	0.16	0.12	0.11	0.09	0.19	0.21	0.10	0.82	0.10	1.15	1.22	1.04
O2	0.11	0.12	0.16	0.17	0.09	0.12	0.07	0.21	0.08	0.08	0.07	0.16	0.11	0.09	0.08	0.23	0.23	0.10	0.74	0.13	0.93	0.98	0.85
O2'	0.26	0.24	0.28	0.30	0.22	0.26	0.19	0.31	0.17	0.21	0.19	0.27	0.25	0.20	0.23	0.34	0.35	0.26	0.62	0.16	0.89	0.90	0.74
O3'	0.30	0.29	0.31	0.31	0.26	0.29	0.20	0.33	0.18	0.22	0.22	0.34	0.30	0.19	0.26	0.38	0.35	0.30	0.61	0.14	0.94	0.97	0.78
O4	0.11	0.14	0.14	0.18	0.11	0.18	0.11	0.34	0.11	0.13	0.14	0.16	0.12	0.14	0.11	0.17	0.22	0.14	0.88	0.11	1.35	1.46	1.22
O4'	0.14	0.15	0.19	0.22	0.12	0.16	0.11	0.25	0.10	0.11	0.11	0.19	0.15	0.11	0.12	0.27	0.31	0.13	0.83	0.12	1.03	1.10	0.97
O5'	0.25	0.25	0.24	0.24	0.25	0.23	0.24	0.31	0.24	0.25	0.24	0.27	0.25	0.25	0.25	0.30	0.29	0.25	0.89	0.25	1.17	1.22	1.07
OP1	0.58	0.52	0.55	0.58	0.58	0.59	0.63	0.67	0.63	0.65	0.56	0.45	0.53	0.67	0.60	0.55	0.56	0.60	0.90	0.68	1.18	1.48	1.19
OP2	0.21	0.23	0.24	0.24	0.19	0.20	0.17	0.31	0.18	0.16	0.21	0.26	0.22	0.16	0.18	0.30	0.30	0.19	0.80	0.18	1.19	1.30	1.09
P	0.18	0.20	0.19	0.20	0.17	0.17	0.15	0.29	0.16	0.15	0.17	0.23	0.19	0.15	0.16	0.27	0.26	0.17	0.82	0.16	1.15	1.29	1.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.09	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.03	0.45	0.39	0.21
C2	0.07	0.00	0.13	0.14	0.01	0.07	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.20	0.19	0.05	0.55	0.02	0.70	0.66	0.56
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.05	0.10	0.15	0.12	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.28	0.07	0.43	0.45	0.23
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.09	0.10	0.12	0.17	0.13	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.38	0.10	0.46	0.45	0.30
C4	0.03	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.09	0.02	0.55	0.02	0.71	0.67	0.57
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.06	0.10	0.07	0.10	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.36	0.39	0.14
C5	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.65	0.03	0.91	0.91	0.77
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.21	0.19	0.17	0.12	0.10	0.22	0.11	0.05	0.04	0.01	0.01	0.25	0.33	0.37	0.02
C6	0.03	0.02	0.07	0.09	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.12	0.12	0.03	0.69	0.01	0.97	0.98	0.83
C8	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.10	0.01	0.19	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.60	0.06	0.86	0.87	0.71
N1	0.05	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.02	0.17	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.17	0.16	0.03	0.64	0.01	0.85	0.84	0.72
N2	0.09	0.01	0.15	0.17	0.02	0.10	0.02	0.12	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.24	0.23	0.08	0.52	0.04	0.65	0.61	0.49
N3	0.07	0.01	0.12	0.13	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.17	0.16	0.06	0.49	0.01	0.62	0.56	0.46
N7	0.02	0.02	0.04	0.08	0.02	0.10	0.01	0.22	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.10	0.05	0.68	0.06	1.01	1.06	0.87
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.49	0.03	0.65	0.59	0.49
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.10	0.05	0.09	0.05	0.12	0.04	0.17	0.24	0.17	0.05	0.04	0.00	0.03	0.04	0.09	0.11	0.45	0.66	0.29
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.12	0.11	0.16	0.23	0.16	0.10	0.05	0.03	0.00	0.02	0.38	0.12	0.53	0.70	0.42
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.08	0.06	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.23	0.06	0.41	0.39	0.20
O5'	0.26	0.55	0.28	0.38	0.55	0.01	0.65	0.01	0.69	0.60	0.64	0.52	0.49	0.68	0.49	0.09	0.38	0.23	0.00	0.74	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.07	0.10	0.02	0.11	0.03	0.25	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.11	0.12	0.06	0.74	0.00	1.11	1.15	0.96
OP1	0.45	0.70	0.43	0.46	0.71	0.36	0.91	0.33	0.97	0.86	0.85	0.65	0.62	1.01	0.65	0.45	0.53	0.41	0.02	1.11	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.66	0.45	0.45	0.67	0.39	0.91	0.37	0.98	0.87	0.84	0.61	0.56	1.06	0.59	0.66	0.70	0.39	0.02	1.15	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.56	0.23	0.30	0.57	0.14	0.77	0.02	0.83	0.71	0.72	0.49	0.46	0.87	0.49	0.29	0.42	0.20	0.00	0.96	0.01	0.01	0.00