Doublet Group distance statistics: 55528

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 3, 0, 4, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.012, 0.046, 0.080, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.046 std_dev=0.034
O4	A	0, 0.021, 0.080, 0.140, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.080 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.032, 0.122, 0.212, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.122 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.018, 0.140, 0.261, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.140 std_dev=0.121
C3'	A	0, 0.069, 0.239, 0.409, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.239 std_dev=0.170
O2'	A	0, 0.089, 0.259, 0.430, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.259 std_dev=0.171
C4'	A	0, 0.061, 0.236, 0.412, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.236 std_dev=0.175
N9	B	0, 0.219, 0.404, 0.588, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.404 std_dev=0.185
C5	B	0, 0.243, 0.445, 0.648, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.445 std_dev=0.202
C4	B	0, 0.205, 0.411, 0.617, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.411 std_dev=0.206
C8	B	0, 0.238, 0.448, 0.658, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.448 std_dev=0.210
C1'	B	0, 0.192, 0.408, 0.625, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.408 std_dev=0.216
N7	B	0, 0.258, 0.479, 0.699, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.479 std_dev=0.220
C2'	B	0, 0.249, 0.476, 0.704, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.476 std_dev=0.227
N3	B	0, 0.177, 0.442, 0.707, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.442 std_dev=0.265
C6	B	0, 0.222, 0.494, 0.767, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.494 std_dev=0.272
O2'	B	0, 0.232, 0.514, 0.795, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.514 std_dev=0.281
O4'	B	0, 0.297, 0.580, 0.862, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.580 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.329, 0.638, 0.947, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.638 std_dev=0.309
C2	B	0, 0.185, 0.494, 0.803, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.494 std_dev=0.309
N1	B	0, 0.182, 0.501, 0.820, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.501 std_dev=0.319
O6	B	0, 0.250, 0.572, 0.893, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.572 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.326, 0.655, 0.985, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.655 std_dev=0.329
C5'	A	0, 0.078, 0.412, 0.747, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.412 std_dev=0.335
N2	B	0, 0.231, 0.592, 0.953, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.592 std_dev=0.361
O3'	A	0, 0.034, 0.411, 0.787, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.411 std_dev=0.376
OP2	A	0, 0.228, 0.654, 1.079, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.654 std_dev=0.425
O3'	B	0, 0.320, 0.749, 1.178, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.749 std_dev=0.429
P	A	0, 0.162, 0.605, 1.048, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.605 std_dev=0.443
O5'	A	0, 0.048, 0.508, 0.968, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.508 std_dev=0.460
OP1	A	0, 0.238, 0.803, 1.368, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.803 std_dev=0.565
C5'	B	0, 0.367, 0.935, 1.503, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.935 std_dev=0.568
O5'	B	0, 0.669, 1.384, 2.099, 2.540 max_d=2.540 avg_d=1.384 std_dev=0.715
P	B	0, 0.742, 1.581, 2.420, 3.016 max_d=3.016 avg_d=1.581 std_dev=0.839
OP2	B	0, 0.719, 1.608, 2.497, 3.123 max_d=3.123 avg_d=1.608 std_dev=0.889
OP1	B	0, 0.938, 1.957, 2.977, 3.788 max_d=3.788 avg_d=1.957 std_dev=1.019

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.20	0.20	0.15	0.13
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.13	0.02	0.03	0.27	0.20	0.23	0.18
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.04	0.06	0.05	0.10	0.10	0.01	0.04	0.12	0.01	0.18	0.21	0.13	0.13
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.16	0.01	0.16	0.04	0.14	0.10	0.14	0.10	0.02	0.01	0.19	0.02	0.19	0.23	0.12	0.13
C4	0.03	0.01	0.10	0.16	0.00	0.13	0.01	0.34	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.24	0.01	0.05	0.32	0.26	0.32	0.26
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.13	0.00	0.16	0.01	0.15	0.08	0.09	0.05	0.06	0.05	0.15	0.00	0.03	0.14	0.23	0.04
C5	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.16	0.00	0.37	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.23	0.02	0.06	0.32	0.26	0.31	0.26
C5'	0.07	0.21	0.04	0.04	0.34	0.01	0.37	0.00	0.32	0.21	0.27	0.15	0.05	0.07	0.36	0.03	0.01	0.20	0.36	0.04
C6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.15	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.03	0.05	0.30	0.22	0.23	0.21
N1	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.08	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.03	0.26	0.20	0.20	0.17
N3	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.09	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.19	0.02	0.04	0.30	0.23	0.28	0.22
O2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.12	0.02	0.05	0.25	0.20	0.21	0.16
O2'	0.03	0.12	0.01	0.02	0.11	0.06	0.07	0.05	0.05	0.06	0.13	0.16	0.00	0.11	0.13	0.07	0.07	0.15	0.14	0.06
O3'	0.02	0.13	0.04	0.01	0.24	0.05	0.23	0.07	0.18	0.11	0.19	0.12	0.11	0.00	0.28	0.04	0.13	0.19	0.17	0.10
O4	0.04	0.02	0.12	0.19	0.01	0.15	0.02	0.36	0.03	0.03	0.02	0.02	0.13	0.28	0.00	0.05	0.33	0.29	0.36	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.00	0.19	0.21	0.17	0.13
O5'	0.20	0.27	0.18	0.19	0.32	0.03	0.32	0.01	0.30	0.26	0.30	0.25	0.07	0.13	0.33	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.20	0.21	0.23	0.26	0.14	0.26	0.20	0.22	0.20	0.23	0.20	0.15	0.19	0.29	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.23	0.13	0.12	0.32	0.23	0.31	0.36	0.23	0.20	0.28	0.21	0.14	0.17	0.36	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.18	0.13	0.13	0.26	0.04	0.26	0.04	0.21	0.17	0.22	0.16	0.06	0.10	0.29	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.23	0.23	0.14	0.15	0.16	0.19	0.18	0.15	0.14	0.22	0.17	0.18	0.14	0.26	0.32	0.15	0.44	0.26	0.47	0.76	0.48
C2	0.15	0.20	0.20	0.19	0.14	0.14	0.15	0.19	0.16	0.15	0.14	0.28	0.18	0.18	0.14	0.24	0.26	0.15	0.45	0.26	0.52	0.78	0.51
C2'	0.14	0.16	0.25	0.24	0.15	0.15	0.19	0.17	0.23	0.17	0.18	0.22	0.16	0.22	0.14	0.29	0.34	0.15	0.35	0.31	0.39	0.65	0.35
C3'	0.16	0.18	0.26	0.25	0.16	0.17	0.19	0.21	0.21	0.18	0.17	0.24	0.18	0.22	0.16	0.30	0.33	0.16	0.33	0.28	0.43	0.64	0.35
C4	0.17	0.26	0.20	0.18	0.18	0.15	0.16	0.24	0.17	0.16	0.24	0.32	0.22	0.17	0.16	0.22	0.22	0.17	0.52	0.17	0.65	0.90	0.61
C4'	0.15	0.16	0.24	0.24	0.15	0.15	0.16	0.19	0.18	0.16	0.15	0.21	0.17	0.18	0.14	0.28	0.33	0.16	0.41	0.24	0.48	0.74	0.45
C5	0.17	0.24	0.20	0.18	0.17	0.15	0.16	0.24	0.16	0.16	0.21	0.31	0.21	0.17	0.16	0.23	0.23	0.16	0.51	0.18	0.64	0.89	0.61
C5'	0.24	0.25	0.27	0.28	0.25	0.24	0.27	0.32	0.28	0.27	0.25	0.28	0.25	0.29	0.25	0.28	0.34	0.26	0.47	0.32	0.62	0.78	0.56
C6	0.16	0.21	0.21	0.19	0.16	0.15	0.15	0.22	0.15	0.16	0.17	0.28	0.19	0.18	0.15	0.24	0.25	0.16	0.48	0.20	0.59	0.85	0.57
N1	0.15	0.19	0.21	0.20	0.14	0.14	0.15	0.20	0.16	0.15	0.14	0.26	0.18	0.18	0.14	0.25	0.27	0.15	0.46	0.24	0.53	0.80	0.52
N3	0.16	0.25	0.20	0.18	0.16	0.14	0.15	0.22	0.15	0.15	0.21	0.31	0.21	0.17	0.15	0.23	0.23	0.16	0.49	0.21	0.58	0.84	0.56
O2	0.16	0.17	0.21	0.20	0.14	0.14	0.17	0.18	0.21	0.16	0.15	0.26	0.17	0.19	0.15	0.25	0.28	0.16	0.42	0.31	0.45	0.71	0.45
O2'	0.22	0.25	0.29	0.28	0.25	0.22	0.29	0.20	0.32	0.26	0.29	0.25	0.24	0.30	0.24	0.33	0.38	0.23	0.38	0.39	0.36	0.66	0.36
O3'	0.21	0.20	0.31	0.29	0.21	0.20	0.24	0.22	0.26	0.24	0.21	0.24	0.21	0.27	0.21	0.36	0.37	0.19	0.32	0.32	0.37	0.58	0.27
O4	0.18	0.28	0.19	0.18	0.20	0.17	0.18	0.26	0.21	0.17	0.28	0.33	0.24	0.18	0.18	0.22	0.21	0.18	0.55	0.20	0.70	0.94	0.66
O4'	0.17	0.17	0.23	0.24	0.16	0.17	0.16	0.20	0.17	0.16	0.15	0.22	0.18	0.18	0.16	0.27	0.33	0.17	0.48	0.23	0.52	0.81	0.53
O5'	0.23	0.21	0.30	0.30	0.24	0.25	0.29	0.29	0.30	0.30	0.24	0.21	0.21	0.33	0.25	0.33	0.36	0.23	0.50	0.37	0.54	0.87	0.55
OP1	0.20	0.18	0.28	0.27	0.20	0.21	0.23	0.24	0.24	0.25	0.19	0.21	0.18	0.28	0.21	0.32	0.34	0.19	0.49	0.30	0.55	0.90	0.56
OP2	0.27	0.25	0.32	0.33	0.27	0.29	0.30	0.34	0.29	0.32	0.25	0.28	0.25	0.34	0.28	0.33	0.37	0.27	0.56	0.34	0.70	0.97	0.68
P	0.17	0.15	0.24	0.25	0.17	0.19	0.21	0.25	0.22	0.23	0.16	0.18	0.15	0.26	0.18	0.28	0.31	0.17	0.50	0.28	0.59	0.90	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.04	0.16	0.29	0.16
C2	0.03	0.00	0.19	0.21	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.21	0.28	0.04	0.38	0.03	0.33	0.63	0.38
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.02	0.10	0.08	0.15	0.23	0.19	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.19	0.10	0.23	0.22	0.17
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.03	0.09	0.12	0.16	0.26	0.19	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.28	0.07	0.31	0.25	0.26
C4	0.02	0.01	0.10	0.10	0.00	0.04	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.38	0.03	0.34	0.58	0.37
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.06	0.11	0.08	0.09	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.16	0.16	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.03	0.46	0.02	0.47	0.73	0.49
C5'	0.04	0.13	0.02	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.20	0.15	0.13	0.11	0.22	0.12	0.04	0.05	0.03	0.01	0.20	0.12	0.25	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.09	0.02	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.14	0.14	0.03	0.48	0.01	0.51	0.80	0.53
C8	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.45	0.02	0.45	0.61	0.45
N1	0.03	0.01	0.15	0.16	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.23	0.03	0.44	0.03	0.43	0.73	0.47
N2	0.04	0.00	0.23	0.26	0.01	0.11	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.36	0.04	0.35	0.04	0.28	0.59	0.34
N3	0.03	0.00	0.19	0.19	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.19	0.25	0.04	0.33	0.04	0.27	0.54	0.32
N7	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.04	0.51	0.02	0.55	0.78	0.55
N9	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.34	0.02	0.29	0.48	0.31
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.11	0.04	0.09	0.04	0.14	0.05	0.18	0.26	0.19	0.06	0.04	0.00	0.03	0.05	0.06	0.14	0.25	0.12	0.09
O3'	0.01	0.28	0.02	0.01	0.13	0.02	0.08	0.05	0.14	0.13	0.23	0.36	0.25	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.31	0.12	0.41	0.37	0.32
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.21	0.03	0.19	0.31	0.21
O5'	0.19	0.38	0.19	0.28	0.38	0.02	0.46	0.01	0.48	0.45	0.44	0.35	0.33	0.51	0.34	0.06	0.31	0.21	0.00	0.51	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.03	0.10	0.07	0.03	0.05	0.02	0.20	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.02	0.14	0.12	0.03	0.51	0.00	0.60	0.88	0.60
OP1	0.16	0.33	0.23	0.31	0.34	0.16	0.47	0.12	0.51	0.45	0.43	0.28	0.27	0.55	0.29	0.25	0.41	0.19	0.02	0.60	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.63	0.22	0.25	0.58	0.16	0.73	0.25	0.80	0.61	0.73	0.59	0.54	0.78	0.48	0.12	0.37	0.31	0.02	0.88	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.38	0.17	0.26	0.37	0.05	0.49	0.01	0.53	0.45	0.47	0.34	0.32	0.55	0.31	0.09	0.32	0.21	0.01	0.60	0.01	0.01	0.00