Doublet Group distance statistics: 55530

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 5, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.040 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.009, 0.068, 0.126, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.068 std_dev=0.058
O4'	A	0, 0.042, 0.112, 0.182, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.112 std_dev=0.070
C2'	A	0, 0.041, 0.133, 0.225, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.133 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.070, 0.178, 0.286, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.178 std_dev=0.108
O2'	A	0, 0.098, 0.215, 0.332, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.215 std_dev=0.117
C3'	A	0, 0.075, 0.202, 0.329, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.202 std_dev=0.127
N3	B	0, 0.179, 0.319, 0.458, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.319 std_dev=0.139
O4'	B	0, 0.133, 0.284, 0.434, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.284 std_dev=0.150
C1'	B	0, 0.106, 0.262, 0.417, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.262 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.144, 0.303, 0.461, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.303 std_dev=0.159
C2	B	0, 0.215, 0.377, 0.539, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.377 std_dev=0.162
N9	B	0, 0.123, 0.295, 0.466, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.295 std_dev=0.172
O3'	A	0, 0.100, 0.288, 0.476, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.288 std_dev=0.188
C5'	A	0, 0.096, 0.287, 0.479, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.287 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.227, 0.421, 0.616, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.421 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.219, 0.420, 0.622, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.420 std_dev=0.202
O5'	A	0, 0.164, 0.368, 0.571, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.368 std_dev=0.203
C6	B	0, 0.266, 0.483, 0.699, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.483 std_dev=0.216
C8	B	0, 0.202, 0.418, 0.635, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.418 std_dev=0.217
N2	B	0, 0.230, 0.462, 0.694, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.462 std_dev=0.232
N7	B	0, 0.264, 0.508, 0.753, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.508 std_dev=0.244
O6	B	0, 0.364, 0.620, 0.876, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.620 std_dev=0.256
C2'	B	0, 0.145, 0.403, 0.660, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.403 std_dev=0.257
C4'	B	0, 0.114, 0.403, 0.692, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.403 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.174, 0.490, 0.806, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.490 std_dev=0.316
P	A	0, 0.203, 0.545, 0.888, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.545 std_dev=0.342
O2'	B	0, 0.215, 0.558, 0.900, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.558 std_dev=0.343
OP2	A	0, 0.301, 0.662, 1.024, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.662 std_dev=0.362
O3'	B	0, 0.255, 0.717, 1.179, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.717 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.185, 0.659, 1.134, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.659 std_dev=0.474
OP1	A	0, 0.264, 0.743, 1.223, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.743 std_dev=0.480
O5'	B	0, 0.268, 0.964, 1.659, 2.657 max_d=2.657 avg_d=0.964 std_dev=0.695
P	B	0, 0.334, 1.158, 1.982, 3.226 max_d=3.226 avg_d=1.158 std_dev=0.824
OP1	B	0, 0.382, 1.504, 2.626, 3.646 max_d=3.646 avg_d=1.504 std_dev=1.122
OP2	B	0, 0.239, 1.520, 2.800, 4.816 max_d=4.816 avg_d=1.520 std_dev=1.280

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.07	0.08	0.19	0.10
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.08	0.00	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.12	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.08	0.05	0.09	0.09	0.01	0.01	0.12	0.01	0.09	0.10	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.05	0.12	0.17	0.26	0.16
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.08	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.06	0.12	0.16	0.26	0.16
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.04	0.06	0.03	0.05	0.03	0.11	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.09	0.11	0.20	0.12
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.06	0.07	0.17	0.09
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.03	0.09	0.12	0.23	0.13
O2	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.06	0.06	0.18	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.03	0.07	0.09	0.00	0.03	0.08	0.04	0.06	0.11	0.10	0.07
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.13	0.02	0.12	0.03	0.09	0.05	0.11	0.10	0.03	0.00	0.15	0.02	0.11	0.16	0.17	0.13
O4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.06	0.14	0.21	0.29	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06	0.00	0.06	0.09	0.09	0.05
O5'	0.05	0.07	0.07	0.09	0.12	0.02	0.12	0.01	0.09	0.06	0.09	0.06	0.06	0.11	0.14	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.08	0.08	0.10	0.17	0.08	0.16	0.09	0.11	0.07	0.12	0.06	0.11	0.16	0.21	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.19	0.12	0.12	0.26	0.04	0.26	0.03	0.20	0.17	0.23	0.18	0.10	0.17	0.29	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.08	0.09	0.16	0.02	0.16	0.01	0.12	0.09	0.13	0.09	0.07	0.13	0.18	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.11	0.19	0.20	0.08	0.12	0.08	0.25	0.09	0.08	0.07	0.18	0.10	0.10	0.08	0.23	0.28	0.08	0.48	0.14	0.53	0.93	0.53
C2	0.08	0.13	0.15	0.17	0.08	0.11	0.07	0.27	0.08	0.08	0.09	0.20	0.11	0.10	0.07	0.19	0.22	0.07	0.52	0.13	0.56	1.01	0.58
C2'	0.16	0.17	0.28	0.27	0.14	0.17	0.13	0.24	0.14	0.13	0.14	0.22	0.17	0.13	0.14	0.33	0.35	0.13	0.44	0.15	0.46	0.86	0.46
C3'	0.17	0.18	0.28	0.27	0.16	0.17	0.14	0.23	0.14	0.14	0.15	0.23	0.18	0.13	0.15	0.34	0.34	0.14	0.45	0.15	0.45	0.90	0.46
C4	0.09	0.15	0.14	0.17	0.09	0.14	0.09	0.34	0.09	0.10	0.13	0.20	0.12	0.11	0.09	0.16	0.21	0.09	0.57	0.09	0.65	1.17	0.67
C4'	0.11	0.11	0.21	0.22	0.09	0.13	0.09	0.24	0.09	0.09	0.08	0.17	0.12	0.10	0.09	0.26	0.30	0.10	0.47	0.13	0.51	0.93	0.52
C5	0.09	0.14	0.15	0.17	0.09	0.13	0.09	0.33	0.09	0.10	0.12	0.20	0.12	0.11	0.09	0.18	0.21	0.09	0.57	0.10	0.65	1.16	0.66
C5'	0.09	0.10	0.19	0.20	0.08	0.12	0.09	0.25	0.10	0.09	0.07	0.16	0.10	0.11	0.08	0.24	0.27	0.09	0.49	0.14	0.54	1.00	0.55
C6	0.09	0.13	0.16	0.17	0.09	0.12	0.08	0.29	0.08	0.09	0.10	0.19	0.12	0.10	0.08	0.20	0.22	0.08	0.54	0.11	0.61	1.09	0.62
N1	0.08	0.12	0.16	0.17	0.08	0.11	0.08	0.27	0.08	0.08	0.08	0.19	0.11	0.10	0.08	0.20	0.23	0.08	0.52	0.12	0.57	1.02	0.58
N3	0.08	0.15	0.14	0.16	0.09	0.13	0.08	0.31	0.08	0.09	0.12	0.20	0.12	0.10	0.08	0.17	0.20	0.08	0.55	0.10	0.61	1.10	0.63
O2	0.07	0.12	0.16	0.18	0.06	0.10	0.07	0.25	0.08	0.07	0.06	0.20	0.10	0.09	0.06	0.20	0.24	0.07	0.49	0.15	0.52	0.92	0.53
O2'	0.19	0.17	0.30	0.31	0.17	0.22	0.17	0.29	0.17	0.17	0.16	0.20	0.18	0.17	0.18	0.34	0.39	0.18	0.41	0.19	0.46	0.78	0.43
O3'	0.22	0.23	0.34	0.32	0.20	0.22	0.18	0.25	0.17	0.18	0.20	0.27	0.23	0.17	0.20	0.40	0.39	0.19	0.43	0.17	0.43	0.84	0.42
O4	0.10	0.15	0.14	0.18	0.10	0.17	0.10	0.38	0.11	0.11	0.15	0.20	0.13	0.12	0.10	0.15	0.22	0.10	0.60	0.11	0.69	1.23	0.71
O4'	0.09	0.11	0.17	0.19	0.08	0.12	0.09	0.26	0.10	0.09	0.07	0.18	0.11	0.10	0.08	0.21	0.26	0.09	0.50	0.14	0.57	0.97	0.57
O5'	0.10	0.10	0.18	0.18	0.10	0.12	0.12	0.27	0.12	0.12	0.09	0.15	0.10	0.14	0.10	0.23	0.25	0.10	0.50	0.16	0.53	1.07	0.57
OP1	0.12	0.11	0.19	0.19	0.11	0.13	0.14	0.30	0.14	0.15	0.10	0.15	0.11	0.17	0.12	0.24	0.25	0.12	0.49	0.18	0.53	1.11	0.58
OP2	0.20	0.16	0.20	0.24	0.20	0.24	0.23	0.41	0.23	0.25	0.19	0.16	0.16	0.27	0.21	0.20	0.26	0.22	0.59	0.27	0.62	1.28	0.71
P	0.12	0.11	0.16	0.19	0.12	0.15	0.15	0.33	0.15	0.16	0.11	0.15	0.11	0.18	0.13	0.20	0.24	0.13	0.53	0.18	0.58	1.15	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.02	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.02	0.25	0.31	0.20
C2	0.05	0.00	0.13	0.13	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.17	0.04	0.38	0.01	0.38	0.67	0.38
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.08	0.05	0.11	0.16	0.13	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.24	0.07	0.33	0.19	0.22
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.14	0.12	0.16	0.12	0.14	0.07	0.02	0.01	0.02	0.33	0.13	0.44	0.18	0.28
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.40	0.01	0.39	0.66	0.38
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.16	0.08	0.09	0.06	0.16	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.13	0.20	0.22	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.12	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.49	0.01	0.49	0.87	0.50
C5'	0.07	0.19	0.03	0.02	0.22	0.01	0.30	0.00	0.30	0.33	0.25	0.16	0.16	0.36	0.21	0.06	0.06	0.02	0.01	0.35	0.31	0.33	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.12	0.01	0.11	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.50	0.00	0.53	0.94	0.54
C8	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.16	0.01	0.33	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.04	0.49	0.02	0.46	0.78	0.46
N1	0.04	0.01	0.11	0.12	0.01	0.08	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.15	0.03	0.44	0.01	0.47	0.83	0.47
N2	0.07	0.00	0.16	0.16	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.24	0.22	0.06	0.35	0.03	0.36	0.60	0.34
N3	0.05	0.00	0.13	0.12	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.18	0.15	0.04	0.34	0.01	0.34	0.56	0.32
N7	0.02	0.01	0.04	0.14	0.01	0.16	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.04	0.54	0.02	0.55	0.97	0.56
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.38	0.01	0.35	0.57	0.34
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.10	0.05	0.07	0.06	0.11	0.04	0.16	0.24	0.18	0.03	0.03	0.00	0.04	0.07	0.09	0.10	0.21	0.14	0.09
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.09	0.01	0.11	0.06	0.13	0.15	0.15	0.22	0.15	0.15	0.06	0.04	0.00	0.01	0.39	0.15	0.53	0.35	0.33
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.29	0.03	0.28	0.31	0.23
O5'	0.25	0.38	0.24	0.33	0.40	0.01	0.49	0.01	0.50	0.49	0.44	0.35	0.34	0.54	0.38	0.09	0.39	0.29	0.00	0.54	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.13	0.01	0.35	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.15	0.03	0.54	0.00	0.60	1.06	0.61
OP1	0.25	0.38	0.33	0.44	0.39	0.20	0.49	0.31	0.53	0.46	0.47	0.36	0.34	0.55	0.35	0.21	0.53	0.28	0.02	0.60	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.67	0.19	0.18	0.66	0.22	0.87	0.33	0.94	0.78	0.83	0.60	0.56	0.97	0.57	0.14	0.35	0.31	0.02	1.06	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.38	0.22	0.28	0.38	0.02	0.50	0.02	0.54	0.46	0.47	0.34	0.32	0.56	0.34	0.09	0.33	0.23	0.01	0.61	0.01	0.01	0.00