Doublet Group distance statistics: 55531

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 2, 2, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.011, 0.020, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.029, 0.061, 0.093, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.061 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.029, 0.062, 0.094, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.062 std_dev=0.032
N3	B	0, 0.146, 0.337, 0.529, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.337 std_dev=0.191
C2'	A	0, 0.268, 0.478, 0.687, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.478 std_dev=0.210
O4'	A	0, 0.190, 0.402, 0.614, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.402 std_dev=0.212
N1	B	0, 0.148, 0.363, 0.578, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.363 std_dev=0.215
C6	B	0, 0.192, 0.415, 0.638, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.415 std_dev=0.223
C4	B	0, 0.141, 0.376, 0.611, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.376 std_dev=0.235
C2	B	0, 0.119, 0.371, 0.623, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.371 std_dev=0.252
C5	B	0, 0.233, 0.488, 0.742, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.488 std_dev=0.254
O6	B	0, 0.269, 0.538, 0.806, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.538 std_dev=0.269
O2'	A	0, 0.424, 0.702, 0.979, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.702 std_dev=0.278
C4'	A	0, 0.309, 0.606, 0.903, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.606 std_dev=0.297
N9	B	0, 0.222, 0.553, 0.885, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.553 std_dev=0.332
C3'	A	0, 0.426, 0.758, 1.089, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.758 std_dev=0.332
C2'	B	0, 0.337, 0.689, 1.040, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.689 std_dev=0.351
C1'	B	0, 0.275, 0.627, 0.978, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.627 std_dev=0.351
O4'	B	0, 0.328, 0.720, 1.112, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.720 std_dev=0.392
O2'	B	0, 0.466, 0.859, 1.252, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.859 std_dev=0.393
N7	B	0, 0.344, 0.740, 1.136, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.740 std_dev=0.396
N2	B	0, 0.161, 0.565, 0.969, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.565 std_dev=0.404
C8	B	0, 0.342, 0.780, 1.218, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.780 std_dev=0.438
C3'	B	0, 0.321, 0.761, 1.200, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.761 std_dev=0.440
C4'	B	0, 0.369, 0.818, 1.268, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.818 std_dev=0.450
O3'	A	0, 0.707, 1.193, 1.680, 1.768 max_d=1.768 avg_d=1.193 std_dev=0.486
C5'	A	0, 0.544, 1.058, 1.572, 1.683 max_d=1.683 avg_d=1.058 std_dev=0.514
O3'	B	0, 0.348, 0.864, 1.381, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.864 std_dev=0.516
C5'	B	0, 0.406, 0.933, 1.461, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.933 std_dev=0.528
O5'	B	0, 0.305, 0.851, 1.397, 2.352 max_d=2.352 avg_d=0.851 std_dev=0.546
O5'	A	0, 0.576, 1.213, 1.849, 1.865 max_d=1.865 avg_d=1.213 std_dev=0.637
OP2	A	0, 1.114, 1.876, 2.638, 2.655 max_d=2.655 avg_d=1.876 std_dev=0.762
P	A	0, 0.953, 1.771, 2.590, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.771 std_dev=0.819
P	B	0, 0.346, 1.168, 1.990, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.168 std_dev=0.822
OP2	B	0, 0.475, 1.399, 2.323, 3.290 max_d=3.290 avg_d=1.399 std_dev=0.924
OP1	A	0, 1.195, 2.252, 3.308, 3.435 max_d=3.435 avg_d=2.252 std_dev=1.056
OP1	B	0, 0.359, 1.517, 2.674, 3.663 max_d=3.663 avg_d=1.517 std_dev=1.157

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.13	0.08	0.37	0.11
C2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.20	0.10	0.40	0.15
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.06	0.09	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.08	0.41	0.17
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.05	0.08	0.08	0.02	0.01	0.10	0.01	0.12	0.10	0.36	0.18
C4	0.03	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.12	0.01	0.04	0.24	0.23	0.41	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.00	0.02	0.16	0.26	0.07
C5	0.02	0.02	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.03	0.25	0.24	0.41	0.22
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.10	0.02	0.01	0.23	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.13	0.02	0.04	0.22	0.15	0.41	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.19	0.09	0.40	0.14
N3	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.22	0.16	0.41	0.19
O2	0.04	0.01	0.09	0.08	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.09	0.02	0.08	0.18	0.08	0.39	0.14
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.03	0.07	0.11	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.13	0.37	0.14
O3'	0.03	0.07	0.03	0.01	0.12	0.02	0.14	0.03	0.13	0.06	0.10	0.09	0.06	0.00	0.13	0.02	0.23	0.19	0.37	0.23
O4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.00	0.04	0.26	0.28	0.41	0.24
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02	0.04	0.00	0.17	0.14	0.31	0.09
O5'	0.13	0.20	0.05	0.12	0.24	0.02	0.25	0.01	0.22	0.19	0.22	0.18	0.05	0.23	0.26	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.10	0.08	0.10	0.23	0.16	0.24	0.23	0.15	0.09	0.16	0.08	0.13	0.19	0.28	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.40	0.41	0.36	0.41	0.26	0.41	0.13	0.41	0.40	0.41	0.39	0.37	0.37	0.41	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.15	0.17	0.18	0.22	0.07	0.22	0.02	0.17	0.14	0.19	0.14	0.14	0.23	0.24	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.22	0.26	0.13	0.17	0.19	0.24	0.22	0.19	0.13	0.24	0.14	0.24	0.14	0.28	0.32	0.11	0.37	0.34	0.89	0.65	0.49
C2	0.11	0.18	0.18	0.23	0.11	0.17	0.16	0.26	0.16	0.18	0.12	0.29	0.15	0.22	0.12	0.22	0.28	0.12	0.38	0.28	0.93	0.66	0.51
C2'	0.16	0.19	0.23	0.24	0.13	0.16	0.17	0.17	0.22	0.15	0.15	0.31	0.19	0.20	0.13	0.30	0.30	0.14	0.26	0.34	0.83	0.50	0.36
C3'	0.19	0.21	0.24	0.24	0.15	0.18	0.17	0.18	0.21	0.16	0.16	0.32	0.21	0.21	0.15	0.32	0.30	0.17	0.25	0.32	0.85	0.51	0.35
C4	0.11	0.22	0.12	0.22	0.12	0.19	0.13	0.31	0.11	0.18	0.20	0.31	0.17	0.20	0.12	0.15	0.26	0.15	0.43	0.13	1.06	0.68	0.57
C4'	0.13	0.15	0.23	0.26	0.12	0.15	0.18	0.20	0.22	0.16	0.14	0.23	0.15	0.22	0.12	0.30	0.33	0.10	0.33	0.33	0.88	0.62	0.45
C5	0.10	0.20	0.14	0.22	0.11	0.18	0.14	0.30	0.12	0.19	0.16	0.31	0.16	0.21	0.12	0.16	0.26	0.14	0.42	0.17	1.06	0.68	0.56
C5'	0.12	0.15	0.22	0.25	0.11	0.14	0.16	0.20	0.19	0.15	0.13	0.23	0.15	0.21	0.11	0.30	0.33	0.09	0.33	0.30	0.89	0.66	0.46
C6	0.10	0.19	0.17	0.23	0.11	0.16	0.15	0.26	0.14	0.18	0.13	0.30	0.16	0.22	0.12	0.21	0.28	0.11	0.39	0.23	1.00	0.66	0.53
N1	0.11	0.17	0.19	0.24	0.11	0.16	0.16	0.25	0.17	0.18	0.11	0.28	0.15	0.22	0.12	0.24	0.29	0.11	0.38	0.28	0.94	0.66	0.51
N3	0.10	0.21	0.14	0.22	0.11	0.18	0.13	0.29	0.11	0.18	0.18	0.31	0.16	0.21	0.12	0.17	0.26	0.13	0.41	0.18	1.00	0.67	0.54
O2	0.13	0.15	0.20	0.25	0.12	0.18	0.18	0.26	0.20	0.19	0.09	0.27	0.14	0.23	0.14	0.24	0.30	0.13	0.37	0.33	0.86	0.65	0.49
O2'	0.19	0.18	0.25	0.25	0.15	0.19	0.18	0.18	0.24	0.15	0.17	0.28	0.20	0.20	0.15	0.34	0.31	0.18	0.24	0.35	0.77	0.46	0.33
O3'	0.26	0.23	0.28	0.28	0.19	0.25	0.20	0.23	0.23	0.20	0.18	0.34	0.25	0.23	0.20	0.37	0.33	0.25	0.23	0.35	0.82	0.44	0.30
O4	0.12	0.24	0.12	0.22	0.13	0.22	0.13	0.35	0.14	0.19	0.24	0.32	0.18	0.19	0.13	0.13	0.26	0.17	0.45	0.14	1.12	0.70	0.61
O4'	0.15	0.14	0.25	0.30	0.15	0.20	0.21	0.27	0.23	0.21	0.14	0.21	0.15	0.26	0.16	0.30	0.36	0.14	0.41	0.34	0.92	0.71	0.54
O5'	0.14	0.15	0.16	0.23	0.13	0.14	0.20	0.20	0.22	0.21	0.13	0.24	0.15	0.27	0.14	0.23	0.28	0.14	0.32	0.33	0.90	0.63	0.43
OP1	0.17	0.21	0.19	0.19	0.15	0.12	0.13	0.17	0.15	0.12	0.17	0.29	0.21	0.15	0.13	0.28	0.26	0.16	0.31	0.22	0.87	0.71	0.44
OP2	0.47	0.57	0.47	0.42	0.47	0.42	0.41	0.44	0.42	0.38	0.51	0.66	0.54	0.37	0.44	0.54	0.43	0.45	0.52	0.38	0.94	0.91	0.63
P	0.22	0.28	0.24	0.25	0.21	0.19	0.19	0.25	0.20	0.19	0.23	0.37	0.27	0.21	0.20	0.31	0.29	0.20	0.39	0.24	0.91	0.79	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.29	0.19	0.12
C2	0.04	0.00	0.15	0.16	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.18	0.21	0.03	0.15	0.02	0.53	0.38	0.21
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.01	0.07	0.05	0.11	0.18	0.14	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.18	0.29	0.14
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.11	0.01	0.10	0.01	0.12	0.12	0.14	0.19	0.15	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.22	0.29	0.17
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.15	0.01	0.53	0.34	0.21
C4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.05	0.09	0.07	0.09	0.04	0.07	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.23	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.02	0.20	0.01	0.66	0.46	0.28
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.16	0.10	0.07	0.06	0.18	0.09	0.07	0.04	0.01	0.01	0.17	0.23	0.28	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.21	0.00	0.70	0.53	0.30
C8	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.20	0.02	0.62	0.35	0.25
N1	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.02	0.18	0.01	0.63	0.47	0.27
N2	0.05	0.00	0.18	0.19	0.01	0.09	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.22	0.26	0.04	0.13	0.03	0.49	0.36	0.20
N3	0.04	0.00	0.14	0.15	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.18	0.03	0.12	0.01	0.47	0.31	0.18
N7	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.23	0.02	0.73	0.49	0.31
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.13	0.01	0.47	0.26	0.18
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.04	0.15	0.22	0.16	0.03	0.02	0.00	0.04	0.07	0.06	0.10	0.15	0.28	0.11
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.12	0.02	0.13	0.04	0.15	0.13	0.19	0.26	0.18	0.13	0.07	0.04	0.00	0.01	0.17	0.15	0.40	0.35	0.22
O4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.11	0.03	0.27	0.25	0.15
O5'	0.07	0.15	0.06	0.11	0.15	0.01	0.20	0.01	0.21	0.20	0.18	0.13	0.12	0.23	0.13	0.06	0.17	0.11	0.00	0.24	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.12	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.15	0.03	0.24	0.00	0.77	0.61	0.35
OP1	0.29	0.53	0.18	0.22	0.53	0.13	0.66	0.23	0.70	0.62	0.63	0.49	0.47	0.73	0.47	0.15	0.40	0.27	0.02	0.77	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.38	0.29	0.29	0.34	0.23	0.46	0.28	0.53	0.35	0.47	0.36	0.31	0.49	0.26	0.28	0.35	0.25	0.02	0.61	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.21	0.14	0.17	0.21	0.05	0.28	0.01	0.30	0.25	0.27	0.20	0.18	0.31	0.18	0.11	0.22	0.15	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00