Doublet Group distance statistics: 55535

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.016, 0.058, 0.100, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.058 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.064, 0.207, 0.350, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.207 std_dev=0.143
C2'	A	0, 0.075, 0.223, 0.371, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.223 std_dev=0.148
O2'	A	0, 0.102, 0.263, 0.423, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.263 std_dev=0.160
N3	B	0, 0.158, 0.324, 0.489, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.324 std_dev=0.166
C2	B	0, 0.150, 0.343, 0.536, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.343 std_dev=0.193
C4	B	0, 0.156, 0.365, 0.574, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.365 std_dev=0.209
C4'	A	0, 0.110, 0.328, 0.547, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.328 std_dev=0.219
N1	B	0, 0.158, 0.385, 0.612, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.385 std_dev=0.227
N2	B	0, 0.197, 0.426, 0.656, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.426 std_dev=0.230
C3'	A	0, 0.120, 0.355, 0.590, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.355 std_dev=0.235
C1'	B	0, 0.193, 0.442, 0.691, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.442 std_dev=0.249
N9	B	0, 0.174, 0.427, 0.680, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.427 std_dev=0.253
C2'	B	0, 0.224, 0.479, 0.733, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.479 std_dev=0.254
C6	B	0, 0.194, 0.457, 0.719, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.457 std_dev=0.263
C5	B	0, 0.187, 0.453, 0.718, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.453 std_dev=0.266
O6	B	0, 0.229, 0.549, 0.869, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.549 std_dev=0.320
C3'	B	0, 0.287, 0.614, 0.942, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.614 std_dev=0.327
OP2	A	0, 0.167, 0.497, 0.827, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.497 std_dev=0.330
O3'	A	0, 0.171, 0.512, 0.853, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.512 std_dev=0.341
C8	B	0, 0.205, 0.556, 0.906, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.556 std_dev=0.350
N7	B	0, 0.217, 0.577, 0.937, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.577 std_dev=0.360
C5'	A	0, 0.181, 0.549, 0.916, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.549 std_dev=0.367
O2'	B	0, 0.319, 0.703, 1.086, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.703 std_dev=0.384
O5'	A	0, 0.082, 0.477, 0.872, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.477 std_dev=0.395
O3'	B	0, 0.289, 0.727, 1.164, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.727 std_dev=0.437
O4'	B	0, 0.219, 0.658, 1.097, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.658 std_dev=0.439
P	A	0, 0.075, 0.517, 0.958, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.517 std_dev=0.441
C4'	B	0, 0.273, 0.756, 1.240, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.756 std_dev=0.483
OP1	A	0, 0.117, 0.719, 1.322, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.719 std_dev=0.602
C5'	B	0, 0.272, 1.106, 1.941, 2.764 max_d=2.764 avg_d=1.106 std_dev=0.834
O5'	B	0, 0.793, 2.243, 3.693, 4.063 max_d=4.063 avg_d=2.243 std_dev=1.450
P	B	0, 1.380, 3.790, 6.200, 6.530 max_d=6.530 avg_d=3.790 std_dev=2.410
OP1	B	0, 1.237, 3.675, 6.113, 7.151 max_d=7.151 avg_d=3.675 std_dev=2.438
OP2	B	0, 2.156, 5.574, 8.991, 8.615 max_d=8.615 avg_d=5.574 std_dev=3.417

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.14	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.02	0.09	0.10	0.20	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.07	0.10	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.08	0.05	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.02	0.15	0.20	0.27	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.16	0.20	0.27	0.21
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.10	0.05	0.08	0.04	0.04	0.02	0.13	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.13	0.15	0.21	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.09	0.18	0.12
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.02	0.12	0.15	0.24	0.17
O2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.02	0.03	0.08	0.08	0.19	0.12
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.08	0.05	0.02
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.07	0.03	0.09	0.12	0.03	0.00	0.09	0.01	0.08	0.16	0.11	0.10
O4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.00	0.03	0.16	0.23	0.29	0.23
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.14	0.09
O5'	0.06	0.09	0.03	0.04	0.15	0.01	0.16	0.01	0.13	0.09	0.12	0.08	0.02	0.08	0.16	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.10	0.06	0.08	0.20	0.06	0.20	0.06	0.15	0.09	0.15	0.08	0.08	0.16	0.23	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.20	0.07	0.05	0.27	0.04	0.27	0.02	0.21	0.18	0.24	0.19	0.05	0.11	0.29	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.04	0.03	0.21	0.02	0.21	0.01	0.16	0.12	0.17	0.12	0.02	0.10	0.23	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.21	0.28	0.28	0.13	0.20	0.09	0.26	0.11	0.10	0.12	0.32	0.21	0.12	0.13	0.39	0.36	0.15	0.72	0.19	0.69	1.15	0.92
C2	0.15	0.22	0.22	0.20	0.11	0.13	0.07	0.22	0.08	0.08	0.15	0.32	0.19	0.11	0.10	0.30	0.26	0.09	0.77	0.17	0.72	1.29	1.02
C2'	0.31	0.29	0.37	0.36	0.24	0.29	0.19	0.28	0.18	0.20	0.21	0.38	0.30	0.18	0.24	0.46	0.44	0.27	0.60	0.20	0.53	0.93	0.74
C3'	0.31	0.29	0.37	0.35	0.25	0.29	0.19	0.27	0.19	0.20	0.22	0.38	0.31	0.19	0.25	0.47	0.43	0.27	0.61	0.20	0.54	0.98	0.77
C4	0.11	0.25	0.19	0.14	0.12	0.08	0.05	0.21	0.10	0.04	0.22	0.33	0.20	0.06	0.07	0.26	0.20	0.05	0.89	0.04	0.93	1.68	1.27
C4'	0.25	0.24	0.30	0.29	0.16	0.22	0.11	0.26	0.12	0.12	0.14	0.34	0.25	0.12	0.16	0.43	0.37	0.20	0.70	0.18	0.67	1.12	0.89
C5	0.12	0.24	0.21	0.17	0.11	0.11	0.04	0.24	0.07	0.05	0.19	0.33	0.20	0.07	0.07	0.29	0.23	0.06	0.89	0.04	0.94	1.65	1.26
C5'	0.21	0.22	0.27	0.26	0.14	0.19	0.11	0.28	0.12	0.12	0.13	0.34	0.23	0.15	0.14	0.40	0.33	0.16	0.76	0.20	0.75	1.26	0.99
C6	0.14	0.22	0.23	0.21	0.11	0.14	0.06	0.25	0.06	0.07	0.15	0.33	0.20	0.10	0.09	0.32	0.28	0.08	0.84	0.10	0.86	1.48	1.15
N1	0.16	0.22	0.24	0.23	0.12	0.16	0.08	0.25	0.08	0.08	0.13	0.32	0.20	0.11	0.10	0.33	0.30	0.10	0.78	0.16	0.76	1.31	1.03
N3	0.12	0.24	0.19	0.15	0.11	0.09	0.05	0.20	0.07	0.05	0.20	0.32	0.20	0.08	0.08	0.26	0.20	0.06	0.84	0.07	0.82	1.49	1.15
O2	0.17	0.22	0.23	0.22	0.12	0.15	0.10	0.21	0.12	0.10	0.12	0.32	0.19	0.13	0.11	0.31	0.28	0.12	0.70	0.23	0.61	1.10	0.88
O2'	0.35	0.29	0.41	0.40	0.25	0.34	0.18	0.31	0.16	0.20	0.18	0.37	0.32	0.16	0.27	0.52	0.48	0.32	0.56	0.18	0.51	0.83	0.66
O3'	0.38	0.33	0.43	0.41	0.30	0.36	0.24	0.31	0.22	0.26	0.25	0.40	0.36	0.23	0.31	0.53	0.48	0.35	0.53	0.22	0.48	0.83	0.65
O4	0.11	0.26	0.19	0.13	0.14	0.08	0.09	0.20	0.15	0.04	0.25	0.32	0.21	0.05	0.08	0.24	0.19	0.06	0.93	0.12	1.01	1.83	1.37
O4'	0.18	0.19	0.24	0.25	0.10	0.18	0.07	0.29	0.10	0.08	0.09	0.31	0.19	0.12	0.10	0.37	0.33	0.12	0.78	0.19	0.78	1.25	1.00
O5'	0.21	0.24	0.25	0.22	0.17	0.17	0.15	0.26	0.15	0.15	0.17	0.35	0.23	0.18	0.16	0.36	0.27	0.17	0.78	0.20	0.77	1.34	1.05
OP1	0.23	0.26	0.26	0.22	0.19	0.19	0.18	0.26	0.18	0.19	0.20	0.36	0.26	0.21	0.19	0.38	0.27	0.20	0.77	0.22	0.79	1.39	1.07
OP2	0.29	0.34	0.32	0.27	0.28	0.27	0.27	0.33	0.27	0.27	0.30	0.42	0.32	0.29	0.27	0.40	0.30	0.27	0.76	0.28	0.85	1.50	1.13
P	0.22	0.26	0.25	0.21	0.20	0.20	0.19	0.30	0.19	0.20	0.21	0.36	0.25	0.23	0.19	0.36	0.25	0.19	0.80	0.23	0.85	1.46	1.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.32	0.02	0.12	0.24	0.19
C2	0.05	0.00	0.13	0.18	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.22	0.05	0.59	0.01	0.38	0.71	0.62
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.09	0.16	0.13	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.06	0.11	0.50	0.20
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.02	0.08	0.11	0.14	0.22	0.17	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.23	0.08	0.16	0.46	0.24
C4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.63	0.01	0.37	0.73	0.66
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.07	0.09	0.06	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.19	0.51	0.20
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.79	0.01	0.60	1.16	0.95
C5'	0.03	0.14	0.02	0.02	0.12	0.00	0.15	0.00	0.17	0.14	0.16	0.14	0.11	0.16	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.20	0.06	0.18	0.02
C6	0.03	0.00	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.81	0.00	0.67	1.26	1.01
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.80	0.02	0.54	1.08	0.93
N1	0.04	0.00	0.09	0.14	0.02	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.17	0.04	0.71	0.01	0.54	1.01	0.84
N2	0.06	0.00	0.16	0.22	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.29	0.06	0.52	0.02	0.32	0.62	0.52
N3	0.05	0.01	0.13	0.17	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.20	0.05	0.51	0.01	0.28	0.55	0.49
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.87	0.02	0.71	1.41	1.12
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.60	0.01	0.30	0.60	0.58
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.04	0.11	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.05	0.03	0.11	0.08	0.33	0.95	0.42
O3'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.10	0.02	0.08	0.04	0.11	0.12	0.17	0.29	0.20	0.10	0.03	0.05	0.00	0.02	0.38	0.11	0.23	0.89	0.50
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.31	0.03	0.19	0.15	0.14
O5'	0.32	0.59	0.20	0.23	0.63	0.01	0.79	0.01	0.81	0.80	0.71	0.52	0.51	0.87	0.60	0.11	0.38	0.31	0.00	0.89	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.89	0.00	0.81	1.53	1.18
OP1	0.12	0.38	0.11	0.16	0.37	0.19	0.60	0.06	0.67	0.54	0.54	0.32	0.28	0.71	0.30	0.33	0.23	0.19	0.02	0.81	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.71	0.50	0.46	0.73	0.51	1.16	0.18	1.26	1.08	1.01	0.62	0.55	1.41	0.60	0.95	0.89	0.15	0.01	1.53	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.62	0.20	0.24	0.66	0.20	0.95	0.02	1.01	0.93	0.84	0.52	0.49	1.12	0.58	0.42	0.50	0.14	0.01	1.18	0.01	0.01	0.00