Doublet Group distance statistics: 55536

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.010, 0.021, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.007, 0.032, 0.058, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.032 std_dev=0.026
O2'	A	0, 0.069, 0.253, 0.437, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.253 std_dev=0.184
C6	B	0, 0.211, 0.426, 0.641, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.426 std_dev=0.215
O6	B	0, 0.231, 0.457, 0.682, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.457 std_dev=0.226
C5	B	0, 0.276, 0.508, 0.739, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.508 std_dev=0.231
C2'	A	0, 0.045, 0.285, 0.526, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.285 std_dev=0.240
C4	B	0, 0.264, 0.505, 0.747, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.505 std_dev=0.242
N1	B	0, 0.202, 0.456, 0.709, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.456 std_dev=0.254
N9	B	0, 0.316, 0.594, 0.872, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.594 std_dev=0.278
O4'	A	0, 0.013, 0.293, 0.572, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.293 std_dev=0.280
N3	B	0, 0.278, 0.559, 0.840, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.559 std_dev=0.281
C1'	B	0, 0.343, 0.648, 0.954, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.648 std_dev=0.305
C2	B	0, 0.256, 0.569, 0.882, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.569 std_dev=0.313
N7	B	0, 0.365, 0.680, 0.995, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.680 std_dev=0.315
O2'	B	0, 0.409, 0.731, 1.053, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.731 std_dev=0.322
C2'	B	0, 0.390, 0.719, 1.048, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.719 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.380, 0.714, 1.047, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.714 std_dev=0.334
O4'	B	0, 0.411, 0.797, 1.183, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.797 std_dev=0.386
C4'	B	0, 0.415, 0.864, 1.312, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.864 std_dev=0.449
N2	B	0, 0.299, 0.748, 1.198, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.748 std_dev=0.450
C3'	B	0, 0.380, 0.832, 1.285, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.832 std_dev=0.453
C3'	A	0, 0.038, 0.499, 0.960, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.499 std_dev=0.461
C4'	A	0, 0.000, 0.480, 0.959, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.480 std_dev=0.480
O5'	A	0, 0.160, 0.700, 1.240, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.700 std_dev=0.540
P	A	0, 0.287, 0.835, 1.383, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.835 std_dev=0.548
OP2	A	0, 0.301, 0.864, 1.428, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.864 std_dev=0.563
O3'	A	0, 0.102, 0.708, 1.315, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.708 std_dev=0.607
OP1	A	0, 0.356, 0.966, 1.577, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.966 std_dev=0.611
O3'	B	0, 0.389, 1.007, 1.625, 2.096 max_d=2.096 avg_d=1.007 std_dev=0.618
C5'	B	0, 0.363, 1.045, 1.728, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.045 std_dev=0.682
C5'	A	0, 0.011, 0.818, 1.624, 2.553 max_d=2.553 avg_d=0.818 std_dev=0.806
O5'	B	0, 0.899, 1.884, 2.869, 2.889 max_d=2.889 avg_d=1.884 std_dev=0.985
OP2	B	0, 1.454, 2.524, 3.593, 3.504 max_d=3.504 avg_d=2.524 std_dev=1.070
P	B	0, 1.222, 2.405, 3.588, 4.199 max_d=4.199 avg_d=2.405 std_dev=1.183
OP1	B	0, 1.583, 3.536, 5.490, 6.769 max_d=6.769 avg_d=3.536 std_dev=1.953

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.20	0.12	0.23	0.05
C2	0.02	0.00	0.13	0.19	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.20	0.02	0.04	0.31	0.18	0.17	0.11
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.11	0.18	0.01	0.01	0.06	0.01	0.21	0.27	0.09	0.07
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.18	0.01	0.11	0.04	0.06	0.10	0.21	0.20	0.02	0.01	0.19	0.01	0.24	0.39	0.06	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.18	0.00	0.16	0.00	0.35	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.20	0.01	0.03	0.37	0.22	0.20	0.21
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.16	0.00	0.17	0.00	0.14	0.09	0.13	0.05	0.03	0.04	0.17	0.00	0.02	0.13	0.29	0.09
C5	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.17	0.00	0.37	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.07	0.38	0.23	0.20	0.22
C5'	0.05	0.20	0.04	0.04	0.35	0.00	0.37	0.00	0.30	0.19	0.28	0.14	0.04	0.04	0.37	0.00	0.01	0.24	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.08	0.36	0.20	0.18	0.17
N1	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.09	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.31	0.17	0.18	0.10
N3	0.02	0.00	0.11	0.21	0.01	0.13	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.23	0.02	0.03	0.35	0.20	0.17	0.16
O2	0.03	0.00	0.18	0.20	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.23	0.02	0.08	0.28	0.16	0.18	0.09
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04	0.14	0.21	0.09
O3'	0.02	0.20	0.01	0.01	0.20	0.04	0.13	0.04	0.07	0.10	0.23	0.23	0.02	0.00	0.22	0.03	0.12	0.42	0.09	0.15
O4	0.02	0.02	0.06	0.19	0.01	0.17	0.01	0.37	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.22	0.00	0.03	0.38	0.24	0.22	0.23
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.03	0.08	0.04	0.03	0.03	0.00	0.08	0.03	0.34	0.15
O5'	0.20	0.31	0.21	0.24	0.37	0.02	0.38	0.01	0.36	0.31	0.35	0.28	0.04	0.12	0.38	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.18	0.27	0.39	0.22	0.13	0.23	0.24	0.20	0.17	0.20	0.16	0.14	0.42	0.24	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.17	0.09	0.06	0.20	0.29	0.20	0.33	0.18	0.18	0.17	0.18	0.21	0.09	0.22	0.34	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.07	0.16	0.21	0.09	0.22	0.01	0.17	0.10	0.16	0.09	0.09	0.15	0.23	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.22	0.23	0.29	0.21	0.21	0.19	0.19	0.18	0.20	0.20	0.25	0.23	0.19	0.21	0.21	0.40	0.24	0.64	0.17	0.95	1.40	0.88
C2	0.17	0.17	0.15	0.22	0.17	0.15	0.16	0.13	0.17	0.16	0.17	0.19	0.17	0.16	0.17	0.12	0.31	0.17	0.65	0.17	1.02	1.45	0.94
C2'	0.28	0.29	0.30	0.32	0.25	0.26	0.22	0.24	0.19	0.23	0.23	0.36	0.29	0.21	0.26	0.28	0.41	0.30	0.59	0.17	0.78	1.29	0.77
C3'	0.37	0.39	0.35	0.35	0.35	0.35	0.31	0.34	0.29	0.33	0.33	0.44	0.39	0.30	0.35	0.34	0.41	0.40	0.65	0.25	0.82	1.36	0.83
C4	0.12	0.15	0.10	0.15	0.12	0.10	0.12	0.09	0.12	0.13	0.14	0.17	0.13	0.13	0.12	0.09	0.22	0.12	0.66	0.13	1.12	1.59	1.06
C4'	0.25	0.27	0.22	0.26	0.23	0.21	0.19	0.19	0.18	0.20	0.22	0.31	0.27	0.18	0.23	0.21	0.38	0.27	0.64	0.15	0.92	1.42	0.88
C5	0.13	0.16	0.10	0.15	0.13	0.11	0.13	0.10	0.12	0.14	0.14	0.20	0.14	0.14	0.13	0.08	0.24	0.14	0.65	0.13	1.10	1.58	1.05
C5'	0.33	0.34	0.25	0.27	0.33	0.29	0.31	0.30	0.30	0.32	0.31	0.37	0.34	0.31	0.33	0.22	0.34	0.37	0.72	0.28	1.00	1.53	0.98
C6	0.16	0.17	0.12	0.18	0.15	0.13	0.14	0.11	0.14	0.15	0.15	0.21	0.17	0.15	0.15	0.11	0.28	0.17	0.65	0.14	1.05	1.53	0.99
N1	0.18	0.18	0.16	0.22	0.17	0.16	0.16	0.13	0.16	0.16	0.17	0.21	0.18	0.16	0.17	0.14	0.32	0.19	0.64	0.16	1.01	1.47	0.94
N3	0.13	0.15	0.11	0.17	0.13	0.12	0.14	0.09	0.14	0.14	0.15	0.16	0.14	0.14	0.13	0.09	0.25	0.13	0.66	0.15	1.08	1.52	1.01
O2	0.19	0.20	0.18	0.26	0.19	0.19	0.19	0.17	0.19	0.19	0.21	0.20	0.19	0.18	0.19	0.15	0.36	0.20	0.64	0.18	0.97	1.37	0.89
O2'	0.28	0.25	0.32	0.36	0.24	0.28	0.22	0.25	0.20	0.24	0.20	0.29	0.26	0.22	0.26	0.31	0.48	0.31	0.55	0.19	0.72	1.17	0.67
O3'	0.47	0.46	0.44	0.43	0.43	0.44	0.38	0.44	0.35	0.41	0.38	0.52	0.47	0.38	0.44	0.44	0.48	0.50	0.66	0.30	0.73	1.29	0.77
O4	0.10	0.14	0.10	0.14	0.11	0.10	0.11	0.09	0.11	0.12	0.14	0.16	0.12	0.12	0.11	0.10	0.20	0.10	0.66	0.11	1.16	1.63	1.10
O4'	0.24	0.24	0.24	0.30	0.22	0.22	0.19	0.19	0.18	0.19	0.21	0.27	0.24	0.18	0.22	0.23	0.43	0.24	0.67	0.17	1.03	1.46	0.94
O5'	0.27	0.25	0.36	0.43	0.27	0.32	0.31	0.31	0.31	0.31	0.27	0.26	0.25	0.34	0.28	0.33	0.54	0.27	0.61	0.37	1.09	1.44	0.94
OP1	0.22	0.21	0.30	0.35	0.21	0.25	0.22	0.21	0.22	0.23	0.20	0.25	0.21	0.25	0.22	0.30	0.45	0.21	0.55	0.25	1.03	1.43	0.89
OP2	0.14	0.21	0.20	0.23	0.13	0.16	0.12	0.14	0.12	0.13	0.17	0.29	0.18	0.14	0.13	0.18	0.32	0.13	0.56	0.13	1.08	1.49	0.95
P	0.15	0.18	0.23	0.29	0.14	0.19	0.15	0.17	0.15	0.16	0.14	0.24	0.16	0.18	0.15	0.20	0.39	0.15	0.59	0.18	1.09	1.49	0.95

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.02	0.30	0.34	0.09
C2	0.03	0.00	0.19	0.22	0.01	0.10	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.30	0.03	0.39	0.01	0.58	0.90	0.47
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.01	0.10	0.08	0.15	0.23	0.19	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.24	0.08	0.37	0.33	0.12
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.12	0.01	0.11	0.01	0.13	0.16	0.19	0.27	0.21	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.31	0.12	0.36	0.30	0.20
C4	0.01	0.01	0.10	0.12	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.42	0.01	0.51	0.89	0.50
C4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.09	0.09	0.13	0.09	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.36	0.09	0.14
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.15	0.01	0.53	0.01	0.70	1.17	0.73
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.13	0.07	0.11	0.07	0.11	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.06	0.13	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.19	0.01	0.55	0.00	0.78	1.27	0.78
C8	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.54	0.01	0.59	1.04	0.69
N1	0.03	0.00	0.15	0.19	0.01	0.09	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.26	0.02	0.48	0.01	0.69	1.12	0.65
N2	0.04	0.00	0.23	0.27	0.01	0.13	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.38	0.04	0.35	0.01	0.58	0.81	0.39
N3	0.02	0.01	0.19	0.21	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.26	0.02	0.34	0.01	0.50	0.75	0.37
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.02	0.60	0.01	0.78	1.30	0.86
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.39	0.01	0.39	0.75	0.42
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.08	0.05	0.05	0.05	0.08	0.05	0.13	0.22	0.16	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.10	0.06	0.53	0.11	0.16
O3'	0.01	0.30	0.02	0.01	0.15	0.02	0.15	0.03	0.19	0.17	0.26	0.38	0.26	0.16	0.06	0.03	0.00	0.01	0.25	0.18	0.42	0.18	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.01	0.31	0.14	0.11
O5'	0.18	0.39	0.24	0.31	0.42	0.01	0.53	0.01	0.55	0.54	0.48	0.35	0.34	0.60	0.39	0.10	0.25	0.09	0.00	0.60	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.60	0.00	0.91	1.43	0.91
OP1	0.30	0.58	0.37	0.36	0.51	0.36	0.70	0.13	0.78	0.59	0.69	0.58	0.50	0.78	0.39	0.53	0.42	0.31	0.02	0.91	0.00	0.00	0.01
OP2	0.34	0.90	0.33	0.30	0.89	0.09	1.17	0.16	1.27	1.04	1.12	0.81	0.75	1.30	0.75	0.11	0.18	0.14	0.02	1.43	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.47	0.12	0.20	0.50	0.14	0.73	0.02	0.78	0.69	0.65	0.39	0.37	0.86	0.42	0.16	0.15	0.11	0.00	0.91	0.01	0.00	0.00