Doublet Group distance statistics: 55540

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.005, 0.036, 0.066, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.036 std_dev=0.030
O4	A	0, -0.020, 0.041, 0.102, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.041 std_dev=0.061
O4'	A	0, 0.017, 0.105, 0.192, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.105 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.021, 0.149, 0.278, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.149 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.098, 0.227, 0.356, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.227 std_dev=0.129
C6	B	0, 0.150, 0.308, 0.466, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.308 std_dev=0.158
N1	B	0, 0.099, 0.275, 0.450, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.275 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.035, 0.217, 0.398, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.217 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.025, 0.216, 0.408, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.216 std_dev=0.191
C5	B	0, 0.142, 0.348, 0.554, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.348 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.125, 0.336, 0.547, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.336 std_dev=0.211
O6	B	0, 0.174, 0.397, 0.619, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.397 std_dev=0.223
O3'	A	0, 0.051, 0.277, 0.504, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.277 std_dev=0.226
C2	B	0, 0.104, 0.337, 0.570, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.337 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.102, 0.349, 0.596, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.349 std_dev=0.247
N2	B	0, 0.231, 0.527, 0.823, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.527 std_dev=0.296
O5'	A	0, 0.263, 0.580, 0.897, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.580 std_dev=0.317
C5'	A	0, 0.168, 0.489, 0.810, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.489 std_dev=0.321
N9	B	0, 0.114, 0.441, 0.767, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.441 std_dev=0.326
N7	B	0, 0.166, 0.500, 0.834, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.500 std_dev=0.334
C8	B	0, 0.144, 0.527, 0.910, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.527 std_dev=0.383
C4'	B	0, 0.257, 0.672, 1.087, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.672 std_dev=0.415
O4'	B	0, 0.179, 0.607, 1.036, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.607 std_dev=0.428
C5'	B	0, 0.359, 0.794, 1.228, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.794 std_dev=0.434
C1'	B	0, 0.093, 0.537, 0.981, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.537 std_dev=0.444
C2'	B	0, 0.131, 0.581, 1.031, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.581 std_dev=0.450
C3'	B	0, 0.132, 0.586, 1.040, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.586 std_dev=0.454
P	A	0, 0.145, 0.599, 1.053, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.599 std_dev=0.454
OP2	A	0, 0.361, 0.850, 1.340, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.850 std_dev=0.489
O3'	B	0, 0.241, 0.762, 1.282, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.762 std_dev=0.520
OP1	A	0, 0.310, 0.882, 1.455, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.882 std_dev=0.572
O2'	B	0, 0.180, 0.777, 1.373, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.777 std_dev=0.596
O5'	B	0, 0.441, 1.040, 1.639, 1.871 max_d=1.871 avg_d=1.040 std_dev=0.599
P	B	0, 0.621, 1.459, 2.297, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.459 std_dev=0.838
OP1	B	0, 0.720, 1.641, 2.561, 2.716 max_d=2.716 avg_d=1.641 std_dev=0.921
OP2	B	0, 0.685, 1.651, 2.616, 2.831 max_d=2.831 avg_d=1.651 std_dev=0.966

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.09	0.25	0.04
C2	0.03	0.00	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.24	0.13	0.18	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.04	0.13	0.00	0.03	0.05	0.01	0.22	0.19	0.17	0.11
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.12	0.03	0.02	0.12	0.02	0.01	0.08	0.01	0.32	0.26	0.13	0.19
C4	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.02	0.36	0.20	0.18	0.20
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.07	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.11	0.29	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.02	0.37	0.20	0.18	0.20
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.13	0.33	0.01
C6	0.00	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.14	0.00	0.02	0.31	0.14	0.17	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.23	0.11	0.20	0.08
N3	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.31	0.16	0.17	0.15
O2	0.05	0.01	0.13	0.12	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.12	0.02	0.05	0.21	0.13	0.18	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.05	0.14	0.00	0.05	0.03	0.01	0.11	0.16	0.19	0.05
O3'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.10	0.01	0.15	0.03	0.14	0.05	0.04	0.12	0.05	0.00	0.12	0.01	0.28	0.30	0.13	0.21
O4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.12	0.00	0.02	0.39	0.23	0.21	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.13	0.34	0.13
O5'	0.09	0.24	0.22	0.32	0.36	0.01	0.37	0.01	0.31	0.23	0.31	0.21	0.11	0.28	0.39	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.09	0.13	0.19	0.26	0.20	0.11	0.20	0.13	0.14	0.11	0.16	0.13	0.16	0.30	0.23	0.13	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.18	0.17	0.13	0.18	0.29	0.18	0.33	0.17	0.20	0.17	0.18	0.19	0.13	0.21	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.11	0.19	0.20	0.03	0.20	0.01	0.13	0.08	0.15	0.08	0.05	0.21	0.23	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.10	0.12	0.12	0.07	0.09	0.13	0.21	0.17	0.12	0.10	0.19	0.10	0.17	0.07	0.21	0.15	0.07	0.54	0.27	0.70	0.79	0.63
C2	0.07	0.10	0.11	0.14	0.06	0.12	0.14	0.26	0.17	0.14	0.07	0.21	0.08	0.19	0.07	0.16	0.16	0.07	0.57	0.29	0.70	0.78	0.65
C2'	0.18	0.13	0.20	0.18	0.14	0.17	0.18	0.22	0.21	0.17	0.14	0.21	0.15	0.21	0.14	0.29	0.21	0.16	0.37	0.31	0.50	0.61	0.44
C3'	0.18	0.13	0.19	0.18	0.14	0.17	0.18	0.24	0.21	0.18	0.13	0.21	0.15	0.23	0.15	0.28	0.21	0.16	0.39	0.31	0.51	0.64	0.47
C4	0.03	0.14	0.11	0.21	0.03	0.17	0.09	0.34	0.06	0.15	0.10	0.23	0.09	0.18	0.07	0.11	0.26	0.10	0.68	0.16	0.79	0.86	0.76
C4'	0.12	0.11	0.14	0.13	0.09	0.11	0.15	0.22	0.18	0.14	0.10	0.19	0.12	0.19	0.10	0.23	0.15	0.10	0.50	0.27	0.67	0.78	0.60
C5	0.03	0.12	0.11	0.20	0.02	0.16	0.10	0.33	0.08	0.15	0.07	0.22	0.08	0.18	0.06	0.13	0.25	0.08	0.68	0.17	0.82	0.89	0.78
C5'	0.15	0.14	0.15	0.16	0.12	0.15	0.16	0.27	0.18	0.17	0.12	0.21	0.14	0.21	0.13	0.24	0.17	0.13	0.51	0.26	0.68	0.80	0.62
C6	0.04	0.11	0.11	0.17	0.03	0.13	0.11	0.29	0.11	0.14	0.04	0.21	0.08	0.18	0.06	0.16	0.21	0.06	0.64	0.21	0.79	0.87	0.74
N1	0.07	0.10	0.11	0.14	0.05	0.11	0.13	0.25	0.15	0.13	0.06	0.21	0.09	0.18	0.06	0.18	0.17	0.06	0.59	0.26	0.73	0.82	0.68
N3	0.03	0.13	0.10	0.17	0.02	0.14	0.11	0.30	0.11	0.14	0.07	0.23	0.08	0.19	0.06	0.12	0.20	0.07	0.62	0.25	0.73	0.80	0.69
O2	0.12	0.12	0.13	0.14	0.12	0.13	0.19	0.24	0.24	0.17	0.16	0.21	0.11	0.22	0.12	0.20	0.15	0.11	0.51	0.33	0.64	0.72	0.57
O2'	0.23	0.17	0.24	0.23	0.18	0.22	0.20	0.23	0.24	0.19	0.19	0.21	0.19	0.22	0.19	0.34	0.26	0.22	0.29	0.32	0.42	0.55	0.37
O3'	0.19	0.11	0.20	0.18	0.13	0.18	0.19	0.22	0.22	0.19	0.13	0.18	0.14	0.24	0.15	0.31	0.21	0.18	0.32	0.32	0.43	0.57	0.39
O4	0.06	0.17	0.13	0.24	0.06	0.20	0.09	0.38	0.07	0.16	0.16	0.24	0.11	0.18	0.08	0.11	0.31	0.13	0.72	0.10	0.82	0.87	0.80
O4'	0.07	0.10	0.09	0.10	0.05	0.08	0.12	0.23	0.15	0.12	0.08	0.19	0.09	0.17	0.06	0.19	0.12	0.06	0.60	0.24	0.79	0.88	0.71
O5'	0.23	0.22	0.15	0.07	0.22	0.16	0.25	0.22	0.26	0.27	0.20	0.28	0.23	0.30	0.23	0.25	0.07	0.24	0.83	0.32	0.96	1.05	0.92
OP1	0.16	0.18	0.11	0.04	0.14	0.10	0.16	0.23	0.15	0.19	0.11	0.28	0.18	0.22	0.14	0.24	0.10	0.17	0.75	0.23	0.90	1.00	0.86
OP2	0.20	0.20	0.23	0.28	0.18	0.25	0.22	0.41	0.21	0.25	0.18	0.27	0.20	0.28	0.20	0.27	0.30	0.21	0.73	0.27	0.91	1.01	0.86
P	0.13	0.15	0.09	0.09	0.12	0.11	0.15	0.26	0.15	0.18	0.10	0.24	0.15	0.22	0.13	0.20	0.14	0.15	0.76	0.22	0.93	1.02	0.88

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.02	0.22	0.11	0.10
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.15	0.03	0.38	0.01	0.44	0.41	0.36
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.08	0.05	0.10	0.12	0.10	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.26	0.08	0.41	0.21	0.25
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.11	0.10	0.11	0.12	0.10	0.10	0.06	0.02	0.00	0.01	0.33	0.12	0.51	0.18	0.32
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.39	0.01	0.40	0.32	0.33
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.05	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.08	0.18	0.23	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.02	0.50	0.01	0.49	0.43	0.44
C5'	0.03	0.10	0.03	0.03	0.11	0.00	0.15	0.00	0.16	0.17	0.13	0.08	0.08	0.19	0.10	0.03	0.02	0.01	0.01	0.19	0.22	0.38	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.15	0.02	0.52	0.00	0.54	0.52	0.50
C8	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.47	0.01	0.40	0.23	0.35
N1	0.03	0.01	0.10	0.11	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.15	0.03	0.47	0.01	0.51	0.49	0.45
N2	0.04	0.01	0.12	0.12	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.16	0.03	0.35	0.01	0.42	0.41	0.34
N3	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.12	0.02	0.32	0.01	0.37	0.31	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.54	0.01	0.50	0.41	0.47
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.34	0.01	0.33	0.19	0.25
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.08	0.03	0.07	0.03	0.10	0.04	0.12	0.17	0.12	0.04	0.03	0.00	0.05	0.04	0.09	0.09	0.27	0.17	0.13
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.10	0.02	0.12	0.02	0.15	0.11	0.15	0.16	0.12	0.13	0.06	0.05	0.00	0.01	0.26	0.17	0.56	0.17	0.32
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.23	0.09
O5'	0.16	0.38	0.26	0.33	0.39	0.02	0.50	0.01	0.52	0.47	0.47	0.35	0.32	0.54	0.34	0.09	0.26	0.04	0.00	0.57	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.57	0.00	0.59	0.59	0.56
OP1	0.22	0.44	0.41	0.51	0.40	0.18	0.49	0.22	0.54	0.40	0.51	0.42	0.37	0.50	0.33	0.27	0.56	0.04	0.02	0.59	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.41	0.21	0.18	0.32	0.23	0.43	0.38	0.52	0.23	0.49	0.41	0.31	0.41	0.19	0.17	0.17	0.23	0.01	0.59	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.36	0.25	0.32	0.33	0.03	0.44	0.01	0.50	0.35	0.45	0.34	0.28	0.47	0.25	0.13	0.32	0.09	0.01	0.56	0.00	0.00	0.00