Doublet Group distance statistics: 55543

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.009, 0.045, 0.081, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.045 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.006, 0.053, 0.100, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.047
C5	B	0, 0.172, 0.425, 0.677, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.425 std_dev=0.253
N7	B	0, 0.163, 0.420, 0.678, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.420 std_dev=0.257
C4	B	0, 0.192, 0.461, 0.730, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.461 std_dev=0.269
N9	B	0, 0.193, 0.469, 0.745, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.469 std_dev=0.276
C8	B	0, 0.174, 0.456, 0.738, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.456 std_dev=0.282
C6	B	0, 0.214, 0.518, 0.823, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.518 std_dev=0.305
N3	B	0, 0.237, 0.564, 0.891, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.564 std_dev=0.327
C1'	B	0, 0.226, 0.568, 0.909, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.568 std_dev=0.342
O6	B	0, 0.226, 0.567, 0.909, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.567 std_dev=0.342
N1	B	0, 0.258, 0.628, 0.999, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.628 std_dev=0.370
C2	B	0, 0.266, 0.646, 1.026, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.646 std_dev=0.380
O4'	A	0, 0.199, 0.581, 0.962, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.581 std_dev=0.381
C2'	A	0, 0.201, 0.587, 0.973, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.587 std_dev=0.386
C2'	B	0, 0.209, 0.598, 0.988, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.598 std_dev=0.390
O4'	B	0, 0.227, 0.628, 1.028, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.628 std_dev=0.400
C4'	B	0, 0.293, 0.728, 1.163, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.728 std_dev=0.435
C3'	B	0, 0.247, 0.687, 1.128, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.687 std_dev=0.441
O2'	B	0, 0.248, 0.711, 1.175, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.711 std_dev=0.464
N2	B	0, 0.309, 0.787, 1.266, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.787 std_dev=0.478
O2'	A	0, 0.158, 0.640, 1.121, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.640 std_dev=0.481
C4'	A	0, 0.318, 0.842, 1.367, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.842 std_dev=0.525
C5'	B	0, 0.367, 0.898, 1.429, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.898 std_dev=0.531
O3'	B	0, 0.237, 0.810, 1.384, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.810 std_dev=0.574
C3'	A	0, 0.332, 0.916, 1.500, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.916 std_dev=0.584
O5'	A	0, 0.401, 1.123, 1.846, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.123 std_dev=0.723
O3'	A	0, 0.474, 1.260, 2.046, 2.145 max_d=2.145 avg_d=1.260 std_dev=0.786
P	A	0, 0.566, 1.373, 2.180, 1.966 max_d=1.966 avg_d=1.373 std_dev=0.807
OP2	A	0, 0.538, 1.444, 2.351, 2.430 max_d=2.430 avg_d=1.444 std_dev=0.907
C5'	A	0, 0.520, 1.496, 2.472, 2.587 max_d=2.587 avg_d=1.496 std_dev=0.976
OP1	A	0, 0.691, 1.696, 2.701, 2.593 max_d=2.593 avg_d=1.696 std_dev=1.005
O5'	B	0, -0.024, 1.389, 2.802, 3.752 max_d=3.752 avg_d=1.389 std_dev=1.413
P	B	0, 0.180, 1.971, 3.763, 4.812 max_d=4.812 avg_d=1.971 std_dev=1.791
OP1	B	0, 0.284, 2.225, 4.166, 5.286 max_d=5.286 avg_d=2.225 std_dev=1.941
OP2	B	0, 0.241, 2.192, 4.143, 5.120 max_d=5.120 avg_d=2.192 std_dev=1.951

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.09	0.61	0.18
C2	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.33	0.04	0.55	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.02	0.09	0.02	0.05	0.16	0.00	0.01	0.05	0.01	0.21	0.23	0.48	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.01	0.16	0.03	0.16	0.06	0.07	0.16	0.02	0.01	0.11	0.01	0.28	0.35	0.35	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.14	0.00	0.07	0.50	0.03	0.38	0.06
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.03	0.08	0.08	0.03	0.07	0.00	0.01	0.23	0.49	0.10
C5	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.19	0.01	0.09	0.53	0.03	0.37	0.07
C5'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.11	0.01	0.11	0.00	0.08	0.02	0.08	0.09	0.09	0.05	0.12	0.01	0.01	0.30	0.38	0.03
C6	0.04	0.00	0.09	0.16	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.18	0.02	0.07	0.47	0.03	0.50	0.11
N1	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.33	0.03	0.57	0.15
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.09	0.01	0.02	0.41	0.03	0.48	0.10
O2	0.09	0.00	0.16	0.16	0.02	0.08	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.17	0.18	0.02	0.08	0.26	0.05	0.59	0.17
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.03	0.08	0.03	0.09	0.04	0.01	0.08	0.17	0.00	0.02	0.05	0.05	0.11	0.30	0.47	0.06
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.14	0.03	0.19	0.05	0.18	0.06	0.09	0.18	0.02	0.00	0.15	0.02	0.23	0.48	0.24	0.17
O4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.15	0.00	0.07	0.53	0.04	0.29	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02	0.07	0.00	0.14	0.13	0.65	0.24
O5'	0.16	0.33	0.21	0.28	0.50	0.01	0.53	0.01	0.47	0.33	0.41	0.26	0.11	0.23	0.53	0.14	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.04	0.23	0.35	0.03	0.23	0.03	0.30	0.03	0.03	0.03	0.05	0.30	0.48	0.04	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.61	0.55	0.48	0.35	0.38	0.49	0.37	0.38	0.50	0.57	0.48	0.59	0.47	0.24	0.29	0.65	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.18	0.14	0.08	0.13	0.06	0.10	0.07	0.03	0.11	0.15	0.10	0.17	0.06	0.17	0.05	0.24	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.15	0.15	0.18	0.11	0.15	0.09	0.26	0.10	0.09	0.11	0.20	0.15	0.10	0.11	0.20	0.21	0.12	0.69	0.14	0.80	1.12	0.86
C2	0.14	0.18	0.15	0.16	0.13	0.16	0.11	0.28	0.12	0.11	0.14	0.23	0.17	0.11	0.12	0.20	0.17	0.13	0.66	0.15	0.77	1.06	0.83
C2'	0.30	0.31	0.29	0.31	0.27	0.31	0.23	0.38	0.22	0.23	0.26	0.36	0.31	0.21	0.27	0.31	0.32	0.29	0.49	0.19	0.55	0.88	0.62
C3'	0.37	0.35	0.33	0.34	0.33	0.36	0.28	0.42	0.25	0.29	0.29	0.40	0.36	0.26	0.33	0.35	0.33	0.37	0.44	0.20	0.52	0.85	0.58
C4	0.12	0.19	0.13	0.19	0.12	0.20	0.11	0.37	0.12	0.11	0.17	0.23	0.16	0.12	0.11	0.15	0.22	0.12	0.85	0.11	1.01	1.26	1.06
C4'	0.20	0.20	0.17	0.19	0.18	0.20	0.16	0.30	0.15	0.16	0.17	0.24	0.20	0.15	0.18	0.20	0.20	0.21	0.59	0.15	0.71	1.04	0.76
C5	0.12	0.18	0.14	0.20	0.12	0.19	0.11	0.37	0.11	0.11	0.16	0.23	0.16	0.12	0.11	0.16	0.22	0.12	0.85	0.11	1.03	1.30	1.08
C5'	0.25	0.24	0.17	0.19	0.23	0.25	0.22	0.36	0.20	0.23	0.21	0.26	0.24	0.22	0.23	0.21	0.18	0.27	0.56	0.20	0.70	1.02	0.74
C6	0.13	0.18	0.14	0.18	0.13	0.17	0.11	0.32	0.11	0.11	0.15	0.22	0.16	0.11	0.11	0.19	0.20	0.11	0.77	0.12	0.93	1.23	0.99
N1	0.14	0.17	0.15	0.17	0.13	0.15	0.11	0.28	0.11	0.10	0.14	0.22	0.17	0.11	0.12	0.21	0.19	0.12	0.70	0.14	0.82	1.13	0.88
N3	0.12	0.19	0.14	0.18	0.13	0.17	0.11	0.32	0.11	0.11	0.17	0.23	0.16	0.11	0.11	0.17	0.19	0.11	0.74	0.13	0.87	1.14	0.93
O2	0.16	0.18	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.24	0.14	0.14	0.14	0.22	0.17	0.14	0.15	0.22	0.15	0.16	0.55	0.18	0.62	0.93	0.69
O2'	0.27	0.28	0.28	0.33	0.25	0.29	0.23	0.38	0.23	0.23	0.26	0.33	0.28	0.22	0.24	0.26	0.34	0.25	0.48	0.24	0.52	0.85	0.60
O3'	0.44	0.41	0.41	0.41	0.38	0.44	0.32	0.48	0.28	0.34	0.33	0.46	0.43	0.30	0.39	0.43	0.40	0.44	0.36	0.21	0.40	0.74	0.47
O4	0.12	0.19	0.12	0.21	0.12	0.22	0.11	0.41	0.13	0.12	0.19	0.23	0.16	0.13	0.12	0.12	0.23	0.14	0.91	0.12	1.09	1.32	1.14
O4'	0.09	0.11	0.13	0.16	0.07	0.11	0.06	0.24	0.08	0.06	0.07	0.15	0.11	0.08	0.07	0.19	0.20	0.08	0.74	0.13	0.88	1.20	0.93
O5'	0.31	0.31	0.34	0.28	0.31	0.26	0.31	0.15	0.31	0.31	0.31	0.32	0.31	0.31	0.31	0.39	0.29	0.30	0.89	0.32	1.07	1.42	1.13
OP1	0.19	0.21	0.16	0.16	0.17	0.18	0.14	0.31	0.13	0.15	0.17	0.26	0.21	0.14	0.17	0.24	0.17	0.19	0.68	0.13	0.88	1.19	0.91
OP2	0.55	0.57	0.51	0.59	0.54	0.60	0.52	0.75	0.52	0.51	0.55	0.59	0.56	0.50	0.53	0.46	0.60	0.55	0.92	0.49	1.08	1.32	1.10
P	0.18	0.21	0.16	0.24	0.17	0.23	0.15	0.38	0.15	0.15	0.19	0.25	0.20	0.15	0.16	0.14	0.27	0.17	0.83	0.14	1.02	1.33	1.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.31	0.03	0.25	0.30	0.25
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.02	0.03	0.03	0.12	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.13	0.05	0.03	0.54	0.01	0.53	0.78	0.61
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.09	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.00	0.23	0.25	0.23
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.09	0.12	0.06	0.06	0.05	0.12	0.08	0.01	0.01	0.00	0.32	0.11	0.30	0.15	0.26
C4	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.59	0.02	0.57	0.73	0.63
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.12	0.05	0.06	0.03	0.12	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.20	0.07
C5	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.75	0.02	0.79	0.96	0.85
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.16	0.00	0.22	0.00	0.23	0.24	0.18	0.09	0.10	0.27	0.15	0.03	0.01	0.01	0.01	0.27	0.29	0.36	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.77	0.01	0.84	1.07	0.91
C8	0.02	0.03	0.04	0.12	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.14	0.03	0.76	0.02	0.75	0.77	0.79
N1	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.05	0.02	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.67	0.01	0.70	0.96	0.78
N2	0.06	0.01	0.09	0.06	0.04	0.06	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.18	0.07	0.06	0.47	0.01	0.44	0.73	0.53
N3	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.11	0.05	0.02	0.47	0.02	0.44	0.65	0.51
N7	0.02	0.03	0.03	0.12	0.01	0.12	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.15	0.04	0.85	0.02	0.90	1.02	0.96
N9	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.55	0.03	0.51	0.58	0.54
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.11	0.18	0.11	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.14	0.07	0.11
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.14	0.07	0.07	0.05	0.15	0.08	0.02	0.00	0.01	0.36	0.13	0.29	0.10	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.27	0.05	0.19	0.23	0.15
O5'	0.31	0.54	0.25	0.32	0.59	0.01	0.75	0.01	0.77	0.76	0.67	0.47	0.47	0.85	0.55	0.05	0.36	0.27	0.00	0.86	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.00	0.11	0.02	0.12	0.02	0.27	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.13	0.05	0.86	0.00	0.98	1.22	1.04
OP1	0.25	0.53	0.23	0.30	0.57	0.08	0.79	0.29	0.84	0.75	0.70	0.44	0.44	0.90	0.51	0.14	0.29	0.19	0.01	0.98	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.78	0.25	0.15	0.73	0.20	0.96	0.36	1.07	0.77	0.96	0.73	0.65	1.02	0.58	0.07	0.10	0.23	0.01	1.22	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.61	0.23	0.26	0.63	0.07	0.85	0.01	0.91	0.79	0.78	0.53	0.51	0.96	0.54	0.11	0.28	0.15	0.01	1.04	0.01	0.00	0.00